Khi có kết quả cấy khuẩn và kháng sinh đồ điều trị nên được tập trung hoặc thu hẹp dựa trên các tác nhân gây bệnh phân lập được và tính nhạy cảm của nó với kháng sinh nhằm đạt được hiệu quả điều trị tối ưu đồng thời có thể giảm chi phí, giảm kháng thuốc. VPBV trong đó có VAP thường được gây ra bởi các VK đa kháng thuốc với tỷ lệ tử vong cao, việc lựa chọn kháng sinh khi các VK này được phân lập cần được đặc biệt chú ý:
P. aeruginosa có khả năng đề kháng kháng sinh nhanh chóng. Theo hướng dẫn của hội lồng ngực Hoa Kỳ nên sử dụng phác đồ phối hợp trong điều trị VAP do P. aeruginosa nhằm tránh điều trị không phù hợp và không hiệu quả cho bệnh nhân [50]. Các phác đồ phối hợp là β- lactam kháng P. aeruginosa (cefepim, ceftazidim), carbapenem, piperacillin/tazobactam với aminoglycosid và/hoặc fluoroquinolon [4], [50], [51]. Nếu bệnh nhân không đáp ứng, liệu pháp thay thế là polymyxin B, colistin (polymyxin E) [51].
A. baumannii: Carbapenem là kháng sinh được lựa chọn theo hướng dẫn của hội lồng ngực Hoa Kỳ. Khi các chủng này kháng carbapenem, colistin có thể là một điều trị thay thế [50].
S. aureus kháng Methicillin: Vancomycin, teicoplanin là kháng sinh đầu tay để điều trị VAP do MRSA. Vancomycin yêu cầu giám sát chặt chẽ huyết thanh, có độc tính cao với thận và tai. Teicoplanin có ít tác dụng phụ nghiêm trọng và không yêu cầu giám sát huyết thanh nhưng chi phí tốn kém hơn. Trong một nghiên cứu so sánh ngẫu nhiên, linezolid chứng minh hiệu quả tương đương hoặc tốt hơn vancomycin
trong điều trị VAP do MRSA và linezolid thường được dành riêng như một lựa chọn thay thế sau vancomycin, teicoplanin để tránh tạo các chủng kháng thuốc và làm mất giá trị của kháng sinh này [50] [51]. Ngoài ra, phác đồ phối hợp vancomycin + rifamicin là phác đồ hiệu quả chống lại MRSA đáp ứng kém với vancomycin đơn trị liệu [31].
Các vi khuẩn đường ruột (Enterobacteriaceae) sinh ESBL (E.coli và
K.pneumoniae): Việc các VK đường ruột tiết men EBSL là một đáp ứng biến đổi của các VK này với các cephalosporin thế hệ 3. Do đó, không nên sử dụng cephalosporin thế hệ 3 đơn trị liệu khi vi khuẩn phân lập được là VK đường ruột sinh EBSL và carbapenem là các thuốc được lựa chọn [50]. Piperacillin / tazobactam có thể là một sự lựa chọn thay thế. Nghiên cứu tại các nước châu Á đã cho thấy mức độ nhạy cảm cao của E. coli và K. pneumoniae sinh EBSL: ở Ấn Độ là 77 và 81%, ở Trung Quốc là 88% [51].
