Là một điểm du lịch tâm linh khá nổi tiếng, Chùa Thầy đã được đón nhiều du khách ở nhiều tỉnh, thành phố bằng các tuyến đường sau:
- …Hà Nội đường cao tốc Láng - Hòa Lạcđường 81Chùa Thầy
-…Hà Đôngđường 72 đường 80 đường 81 Chùa Thầy
-…Xuân Maiđường cao tốc Láng- Hòa Lạcđường 81Chùa Thầy
-…Sơn Tây đường 80 đường cao tốc đường 81 Chùa Thầy Và một số đường khác
Tóm lại: ở mọi nơi, mọi hướng, sau khi qua các tuyến quốc lộ, tỉnh lộ, du khách đến Chùa Thầy đều qua đường 81 là chính, một phần qua đường 46.
- Đường 81
Dài 5km, một đầu nối với tỉnh lộ 80 ở thị trấn Quốc Oai, chạy qua động hoàng xá, qua Nùi Thầy ở điểm cách Quốc Oai 4km, giao với đường cao tốc láng hòa lạc ở km 18, cách Chùa Thầy 2km, nhập với đường 46 ở Phúc Đức, cách Quốc Oai 5km.
Đường này đã được nâng cấp, tu bổ thành đường cấp 5 đồng bằng năm 1994. Do chưa giải phóng được mặt bằng ở khu đồng hương (thị trấn) và Đa phúc (Sài Sơn) nên chưa hoàn thiện. Do đó còn có những đoạn chật hẹp, có thể tắc nghẽn trong ngày hội chính. Phần đã làm đã bị hư hỏng, tuy đã được sửa chữa nhưng chưa đạt tiêu chuẩn cấp 5. Vì vậy nâng cấp đường 81 là một trong những nhiệm vụ chính để phát triển du lịch Chùa Thầy.
Là tuyến đường đê bờ phải sông đáy, giao với đường 32 (Hà Nội - Sơn Tây) ở điểm cách Sơn Tây 13km, qua các xã hiệp thuận, liên hiệp (Phúc Thọ) và gặp đường 81 tại thôn Phúc Đức (Sài Sơn), cách Chùa Thầy 1km về phía bắc (phần qua huyện Quốc Oai dài 7km)
Đây là đường đê, mặt đường dải đá cấp phối, đi lại khá khó khăn đang bị xuống cấp nghiêm trọng, khách qua tuyến này chỉ chiếm 1 phần nhỏ trong tổng lượng khách đến Chùa Thầy
- Các tuyến đường khác:
Ngoài hai tuyến kể trên, khách du lịch có thể đến Chùa Thầy bằng một số đường khác nhưng đó chỉ là đường liên thôn, liên xã, lượng khách qua các tuyến này cũng không lớn.
Hiện nay, hệ thống giao thông trên địa bàn huyện khá thuận lợi với đường cao tốc Láng - Hòa Lạc, quốc lộ 21A chạy qua cùng tỉnh lộ 80, 81.Nếu như ngày xưa ta phải mất hàng tiếng đồng hồ qua bãi nước, nương dâu, đồng mía, lên lên xuống xuống mãi mới tới Chùa Thầy thì bây giờ với con đường Láng - Hòa Lạc rộng thênh thang chỉ mất khoảng 30 phút đi xe máy từ Hà Nội là tới nơi. Chùa Thầy có lẽ là một địa điểm lý tưởng cho những ai muốn tranh thủ rời xa trốn đô thị để tận hưởng một chút sự yên bình của làng quê. Đây là điều kiện thuận lợi để huyện Quốc Oai - Chùa Thầy khai thác thị trường khách nội địa các vùng lân cận, đặc biệt là khách Hà Nội, một thị trường khá lớn. Hệ thống giao thông nông thôn của huyện cũng phát triển khá mạnh, các tuyến đường liên xã được đầu tư xây dựng với tổng chiều dài 52 km, hệ thống đường thôn xóm có tổng chiều dài 109km. Toàn bộ xã và thị trấn của huyện có đường ô tô trong đó 11 xã có đường nhựa. Hệ thống giao thông nông thôn của huyện trong thời gian qua đã góp phần không nhỏ vào quá trình phát triển kinh tế - xã hội và đời sống của nhân dân. Với sự phát triển hệ thống giao thông của huyện như hiện
nay đã làm giảm bớt đi tình trạng ách tắc giao thông nhất là trong những ngày diễn ra lễ hội Chùa Thầy. Năm 2005-2006, tỉnh và địa phương cùng nhà chùa đầu tư nâng cấp đường vào khu du lịch Chùa Thầy dài 3km với kinh phí 4 tỷ đồng.Tuy nhiên, hạn chế lớn nhất của hệ thống giao thông nông thôn Quốc Oai là chất lượng đường xá còn thấp do thiếu nguồn vốn đầu tư cũng làm ảnh hưởng không nhỏ tới hoạt động sản xuất và đời sống nhân đân, đồng thời cũng ảnh hưởng tới cảnh quan xung quanh Chùa Thầy nếu như tình trạng đường xuống cấp. Nó sẽ gây ra khó khăn về đi lại cho du khách trong chuyến hành trình thăm quan Chùa Thầy. Mặc dù trong những năm qua tỉnh cùng như huyện đã có những dự án đầu tư nâng cấp năng lực hệ thống giao thông trong huyện cũng như đoạn đường vào Chùa Thầy nhưng nhìn chung chưa đảm bảo được yêu cầu phát triển kinh tế - xã hội và du lịch