... vậy, chúng tơi trình bày phần tách dòng xácđịnhtrìnhtự nucleotid gene mã hố kháng thể tái tổ hợp kháng lại lympho bào tách từ bệnh nhân ung thư vú Để tách dòng xácđịnhtrìnhtự gene mã hóa kháng ... vị trí ( trìnhtự ) xácđịnh Do đặc tính RE khả nhận biết cắt trìnhtựxácđịnhphântử DNA nên dựa vào khả này, người ta chia chúng làm ba loại: - Loại I: Khi enzyme nhận biết trình tự, di chuyển ... EcoRI ) Yêu cầu phảnứng cắt RE: - Mồi RE hoạt động tối ưu điều kiện phảnứngxác định, mặt dung dịch đệm Các dung dịch đệm dùng phảnứng RE thường khác nồng độ NaCl Do đó, phảnứng cần sử dùng...
... giải trìnhtrìnhtựxácđịnhgen EBNA – EBV 60 3.2.1 Kết kiểm tra DNA tổng số từ mẫu bệnh phẩm 60 3.2.2 Kết thực phảnứng PCR 61 3.2.3 Kết giải trìnhtự thu nhận chuỗi gen ... tái tổ hợp 47 2.4.5 Giải trìnhtrìnhtự xử lý số liệu 48 CHƢƠNG 3: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 51 3.1 Kết thu nhận, giải trìnhtrìnhtựxácđịnhgen E6 HPV-16 L1 HPV-18 ... điện di gen EBNA-1 61 Hình 3.11 Hình ảnh giản đồ (chromatogram) phầntrìnhtựgen EBNA-1 63 Hình 3.12 Kết chuỗi gen EBNA-1 EB17 thu nhận sau giải trìnhtự 63 Hình 3.13 So sánh phầntrìnhtự acid...
... 2.3.8 Phương pháp xácđịnhtrìnhtự nucleotid đoạn gen tách dòng Trìnhtự nucleotid đoạn gen tách dòng xácđịnh theo phương pháp tổng hợp Sanger cs [1], [12], [33] Thực phảnứng PCR ngồi thành ... đại gen cry1C chủng Bacillus thuringiensis subsp aizawai phương pháp PCR 43 3.2 Tách dòng đọc trìnhtựgen cry1C .44 3.2.1 Tách dòng gen cry1C 44 3.2.2 Xácđịnhtrìnhtự ... tăng độ phân giải gen Dùng tia laze quét để phát dideoxynucleotid đánh dấu Xử lý kết phần mềm PC/gene, sau tiến hành so sánh trìnhtựgen tách dòng với trìnhtự công bố ngân hàng gen quốc tế 2.4...
... Phƣơng pháp xácđịnhtrìnhtự nucleotide Các mẫu plasmid mang gen quan tâm có kích thước phù hợp với lý thuyết sử dụng để giải trìnhtự máy xácđịnhtrìnhtựtự động ABI PRISM® 3100-Avant Genetic ... mang gen IFS1 đạt kết tốt, đảm bảo chất lượng số lượng để tiến hành đọc trìnhtự nucleotide gen IFS1 3.4 KẾT QUẢ GIẢI TRÌNHTỰGENTrìnhtự nucleotide gen IFS1 tách dòng đọc thiết bị giải trìnhtự ... để khuếch đại trìnhtựgen IFS1 phảnứng PCR với cặp mồi IFS1-F IFS1-R thiết kế dựa trìnhtựgen IFS1 công bố ngân hàng gen quốc tế với mã số NM_001249093 Chúng tiến hành phảnứng PCR với điều...
... giải trìnhtrìnhtựxácđịnhgen EBNA – EBV 60 3.2.1 Kết kiểm tra DNA tổng số từ mẫu bệnh phẩm 60 3.2.2 Kết thực phảnứng PCR 61 3.2.3 Kết giải trìnhtự thu nhận chuỗi gen ... tái tổ hợp 47 2.4.5 Giải trìnhtrìnhtự xử lý số liệu 48 CHƢƠNG 3: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 51 3.1 Kết thu nhận, giải trìnhtrìnhtựxácđịnhgen E6 HPV-16 L1 HPV-18 ... điện di gen EBNA-1 61 Hình 3.11 Hình ảnh giản đồ (chromatogram) phầntrìnhtựgen EBNA-1 63 Hình 3.12 Kết chuỗi gen EBNA-1 EB17 thu nhận sau giải trìnhtự 63 Hình 3.13 So sánh phầntrìnhtự acid...
... đại gen cry1C chủng Bacillus thuringiensis subsp aizawai phương pháp PCR 43 3.2 Tách dòng đọc trìnhtựgen cry1C .44 3.2.1 Tách dòng gen cry1C 44 3.2.2 Xácđịnhtrìnhtự ... 30 2.3.6 Phương pháp PCR để khuếch đại gen cry1C 31 2.3.7 Phương pháp tách dòng gen cry1C 31 2.3.8 Phương pháp xácđịnhtrìnhtự nucleotid đoạn gen tách dòng 34 2.4 Địa điểm nghiên ... HỌC THÁI NGUYÊN TRƢỜNG ĐẠI HỌC SƢ PHẠM LÊ THỊ NGỌC THƢƠNG TUYỂN CHỌN, TÁCH DÒNG VÀ XÁC ĐỊNHTRÌNHTỰGEN cry1C MÃ HÓA PROTEIN TINH THỂ DIỆT CÔN TRÙNG BỘ CÁNH VẢY TỪ VI KHUẨN Bacillus thuringiensis...
... dung 3: Xácđịnhtrìnhtự gene gltA tách dòng - Giải trìnhtự gene gltA tách dòng máy giải trìnhtựtự động Applied Biosystems - So sánh thành phần thiết yếu trìnhtự gene gltA giải trìnhtự với ... đoạn gene giải trìnhtự - So sánh trìnhtự gene gltA tách dòng với trìnhtự công bố ngân hàng gene NCBI (Gene bank) thơng qua chương trình Blast 37 3.4 Phương pháp nghiên cứu 3.4.1 Quy trình ... dòng gene gltA vi khuẩn E coli DH5α - Xácđịnhtrìnhtự gene gltA tách dòng so sánh với trìnhtự ngân hàng gene (Gene bank) 1.3 Yêu cầu đề tài - Nắm nguyên lí, kĩ thuật phương pháp thực q trình...
... tích kết 3.4.8 Phương pháp xácđịnhtrìnhtự gene crtY máy tự động Trìnhtự nucleotide gene crtY xácđịnh phương pháp xácđịnhtrìnhtự gene tự động máy xácđịnhtrìnhtự gene hãng Applied Biosystems ... cơng bố ngân hàng gene quốc tế + Xácđịnhtrìnhtự gene phương pháp giải trìnhtựtự động + So sánh trìnhtự gene crtY với trìnhtự công bố ngân hàng gene quốc tế thơng qua chương trình BLAST 18 ... pháp so sánh trìnhtự gene crtY với trìnhtự công bố ngân hàng gene quốc tế 27 Gene crtY sau xácđịnhtrìnhtự so sánh với trìnhtự cơng bố ngân hàng gene quốc tế thơng qua chương trình BLAST...
... trìnhphảnứng PCR cho giải trìnhtựtrình bày phần phương pháp nghiên cứu Quá trình giải trìnhtự thực máy giải trìnhtựtự động ABI 3100 Sau giải trìnhtựgen mã hóa kháng ngun HA virus H5N1, trình ... đoạn gen mã hóa kháng nguyên HA Để khẳng địnhxác chúng tơi tiến hành giải trìnhtựgen 3.4 Kết tinh plasmit tái tổ hợp Dòng plasmit tái tổ hợp cần tinh trước làm phảnứngxácđịnhtrìnhtự Để ... đọc trìnhtự 38 3.5 Kết xácđịnhtrìnhtự Sử dụng DNA plasmit cho phảnứng PCR giải trìnhtự với việc sử dụng sinh phẩm BigDyeR Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit Applied Biosystems, quy trình...
... đoạn ADN đặc hiệu gen cry1Ab vi khuẩn E coli nhân lên theo mong muốn Tuy nhiên để khẳng định cách chắn điều này, cần xácđịnhtrìnhtự đoạn ADN gắn vào vectơ II.4 Xácđịnhtrìnhtự nucleotid đoạn ... nhóm gen cry gây độc với số lồi trùng định Để sàng lọc chủng B thuringiensis có chứa gen cry mong muốn, tạo dòng xácđịnhtrìnhtựgen độc tố vấn đề cần thiết, làm sở cho nghiên cứu sâu gen cry ... loại RNaza nồng độ 100g/ml I.4 Phân tích trìnhtự đoạn ADN đặc hiệu gen cry1Ab Sau tách chiết tinh vectơ tái tổ hợp từ tế bào chủ, genxácđịnhtrìnhtự theo phương pháp enzim học Sanger nhờ...
... agarose 1% (Hinh 1) thi dupc tinh sach blng QIAquick Gel exfraction JCit (QIAGEN) Xacdinhtrinh ty gen 18S-rDNA Trinh ty gen 18S-rDNA dupc xacdinh theo phuomg phap tdng hop cua Sanger va dong tac ... used to analysis of phylogeny of Cunninghamia lanceolata by MP method, together with another species of the same genus, Cunninghamia konishii Hayata, and species of another genera of the same family ... vao nifrogen long trade dua ve luu giir ttong tti lanh ttong vdi loai thupc cac chi khac (Bang 1)fronghp sau -80°C tai phdng thi nghiem cho tdi tien hanh Hoang dan tit dii lieu fren GenBank bang...
... khử ion (3,5µl ) Tổng thể tích 10µl 2.3.10 Xácđịnhtrìnhtự so sánh trìnhtựgen thu đƣợc với trìnhtự tƣơng ứng GenBank Tách dòng xácđịnhtrìnhtự gen: Sản phẩm PCR đƣợc gắn vào vector tách ... gen quan tâm i) Thu thập trìnhtựgen quan tâm từ GenBank: Trƣớc thiết kế đoạn mồi đặc hiệu cho gentrìnhtự cần phân lập chủng virut nghiên cứu (Ví dụ: trìnhtựgen CP RGSV), trìnhtự đoạn gen ... so sánh với trìnhtựgen CP RGSV GenBank cao (96,5- 99%) Kết chứng tỏ trìnhtựgen CP-RGSV Các trìnhtự thu đƣợc đƣợc đăng ký vào GenBank với mã số nhƣ bảng 3.2 3.4 SO SÁNH TRÌNHTỰGEN CP-RGSV...
... cứu trìnhtựphântử liên quan tới nhiều bệnh di truyền người Khi xácđịnhtrìnhtự trở nên đỡ tốn hơn, với trợ giúp cơng cụ tính tốn, nhà nghiên cứu xácđịnhgen nhiều sinh vật cách liên kết trình ... tự nhiều đoạn khác (quá trình gọi "lắp ráp gen" -genome [94] assembly) Những kỹ thuật sử dụng để xácđịnhgen người, hoàn thiện Dự án Bản đồ gen Người vào năm [39] 2003 Những kỹ thuật xácđịnh ... địnhtrìnhtự cao (highthroughput) đột ngột làm giảm chi phí xácđịnhtrìnhtự ADN, đem tới hy vọng cho nhiều nhà nghiên cứu thực việc với giá thành 1000 la [95] Mỹ Lượng lớn trìnhtựxác định...
... gen quan tâm i) Thu thập trìnhtựgen quan tâm từ GenBank: Trƣớc thiết kế đoạn mồi đặc hiệu cho gentrìnhtự cần phân lập chủng virut nghiên cứu (Ví dụ: trìnhtựgen CP RGSV), trìnhtự đoạn gen ... chƣơng trình Blast (NCBI), hệ số tƣơng đồng trìnhtự đem so sánh với trìnhtựgen CP RGSV GenBank cao (96,5- 99%) Kết chứng tỏ trìnhtựgen CP-RGSV Các trìnhtự thu đƣợc đƣợc đăng ký vào GenBank ... Avant Genetic Analyzer 3.3 XÁCĐỊNHTRÌNHTỰ NUCLEOTIT CỦA MỘT SỐ ĐOẠN TRONG GENOME CỦA RGSV Các trìnhtự RGSV thu đƣợc máy xácđịnhtrìnhtựtự động ABI PRISM® 3100 Avant Genetic Analyzer đƣợc phân...
... khử ion (3,5µl ) Tổng thể tích 10µl 2.3.10 Xácđịnhtrìnhtự so sánh trìnhtựgen thu đƣợc với trìnhtự tƣơng ứng GenBank Tách dòng xácđịnhtrìnhtự gen: Sản phẩm PCR đƣợc gắn vào vector tách ... gen quan tâm i) Thu thập trìnhtựgen quan tâm từ GenBank: Trƣớc thiết kế đoạn mồi đặc hiệu cho gentrìnhtự cần phân lập chủng virut nghiên cứu (Ví dụ: trìnhtựgen CP RGSV), trìnhtự đoạn gen ... so sánh với trìnhtựgen CP RGSV GenBank cao (96,5- 99%) Kết chứng tỏ trìnhtựgen CP-RGSV Các trìnhtự thu đƣợc đƣợc đăng ký vào GenBank với mã số nhƣ bảng 3.2 3.4 SO SÁNH TRÌNHTỰGEN CP-RGSV...
... giải tập Xácđịnhtrìnhtự nucleotit mạch gốc Xácđịnhtrìnhtự nucleotit mạch gốc Xácđịnhtrìnhtự nucleotit mạch ARN (theo nguyên tắc bổ sung) Theo NTBS: Các nuclêôtit gen liên kết với ... Một gen chứa đoạn mạch bổ sung với đoạn mạch mang mã gốc có trìnhtự nuclêơtit là: A - G - X - T - T - A - G - X - A Xácđịnhtrìnhtự ribơnuclêơtit tổng hợp từ đoạn gen Hướng dẫn giải tập Xác ... sung (thay T U) Ví dụ 3: Phântử mARN chứa đoạn mạch có trìnhtự nuclêơtit A- G - X - U - A - G - X - A Xácđịnhtrìnhtự nuclêơtit tương ứnggen Hướng dẫn giải tập mARN A - G - X - U - U - A -...
... Phương pháp xácđịnhtrìnhtự ADN •Là phương pháp dùng để xácđịnhtrìnhtự xếp nucleotides chuỗi đoạn DNA •Sử dụng phương pháp : Maxam-Gilbert (1977) Sanger (1977) Xácđịnhtrìnhtựtự động I.Phương ... tích Manual sequencing method III .Xác địnhtrình t bng phng phỏp t ng Nguyên tắc chung giải trìnhtựgentự động dựa theo sở phương pháp Sanger Nhưng : Quá trình tỉng hỵp AND thùc hiƯn nhê kú ... hay 35S Chạy điện di để tách đoạn ADN tổng hợp phảnứng Điện di riêng rẽ kết phảnứng gel Làm phim phóng xạ tự ghi cho gel điện di đọc trìnhtự nucleotit điện di đồ mẫu từ cực âm gel lên cực...