kết quả giải mã trình tự gen
GIẢI MÃ TRÌNH TỰ GENE MÃ HÓA PROTEIN VỎ VI RÚT VÀNG XOĂN LÁ CÀ CHUA (TYLCV) Ở MỘT SỐ TỈNH PHÍA NAM
... PCR tinh giải trình tự MACROGEN Phân tích trình tự gen chương trình Seqman DNASTAR Kiểm tra trình tự chương trình ClustalX (Thompson et al, 1997) Nhận dạng trình tự tính toán chương trình BioEdit ... rút vàng xoăn Trình tự đoạn gen CP giải mã từ sản phẩm PCR TYLCV mẫu cà chua thu huyện Đơn Dương tỉnh Lâm Đồng sau: Bảng So sánh tính đồng hai đoạn trình tự phiên mã xuôi /ngược gen CP vi vi rút ... Bảng Kết phân tích protein chương trình ORF-DNA CLUB so sánh với nòi xuất nước lân cận Việt Nam Kết phân tích protein (bảng 4) cho thấy trình tự giải mã vi rút mẫu cà chua thu Đức Trọng tương tự...
Ngày tải lên: 18/05/2015, 10:01
Nghiên cứu giải mã trình tự hệ Genome của chủng Virus xoăn lá thuốc lá (TLCV) phân lập tại Việt Nam
... sánh trình tự gen Phân tích trình tự nucleotide gen thu được: So sánh trình tự thu đƣợc với trình tự gen BLAST NCBI để xác nhận gen tách dòng đƣợc đoạn gen quan tâm Sau so sánh trình tự gen tỉnh ... 2.2.10 Xác định trình tự so sánh trình tự gen thu đƣợc với trình tự tƣơng ứng GenBank 33 CHƢƠNG III: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 35 3.1 KẾT QUẢ TÁCH DÒNG GEN VÀ XÁC ĐỊNH TRÌNH TỰ NUCLEOTIDE ... giải trình tự Số hóa trung tâm học liệu http://www.lrc.tnu.edu.vn/ Comment [SCD15]: plasmid 33 2.2.10 Xác định trình tự so sánh trình tự gen thu đƣợc với trình tự tƣơng ứng GenBank Xác định trình...
Ngày tải lên: 19/11/2014, 19:46
Giải mã trình tự ADN
... vi khuẩn giải mã máy giải mã trình tự tự động Để đảm bảo nucleotit hệ gen giải mã, người ta phải tiến hành giải mã riêng rẽ khoảng triệu phân đoạn ADN khác Với kích thước phân đoạn giải mã xác ... thành trình tự phân đoạn ADN ngắn cuối có trình tự liên tục nhất, gọi contig Kỹ thuật giải mã trình tự kiểu shotgun cho phép ”ráp nối” phần hệ gen lớn Như trình bày việc giải mã đoạn trình tự ADN ... phân đoạn ADN tái tổ hợp riêng rẽ giải mã trình tự riêng rẽ máy giải mã trình tự tự động sử dụng phương pháp ddNTP Phương pháp gọi phương pháp giải mã trình tự kiểu ”shotgun” (bắn ngẫu nhiên)...
Ngày tải lên: 24/10/2013, 12:15
Giải mã trình tự ADN potx
... vi khuẩn giải mã máy giải mã trình tự tự động Để đảm bảo nucleotit hệ gen giải mã, người ta phải tiến hành giải mã riêng rẽ khoảng triệu phân đoạn ADN khác Với kích thước phân đoạn giải mã xác ... thành trình tự phân đoạn ADN ngắn cuối có trình tự liên tục nhất, gọi contig Kỹ thuật giải mã trình tự kiểu shotgun cho phép ”ráp nối” phần hệ gen lớn Như trình bày việc giải mã đoạn trình tự ADN ... phân đoạn ADN tái tổ hợp riêng rẽ giải mã trình tự riêng rẽ máy giải mã trình tự tự động sử dụng phương pháp ddNTP Phương pháp gọi phương pháp giải mã trình tự kiểu ”shotgun” (bắn ngẫu nhiên)...
Ngày tải lên: 25/03/2014, 22:20
Di truyền phân tử ( phần 25 ) Giải mã trình tự ADN potx
... vi khuẩn giải mã máy giải mã trình tự tự động Để đảm bảo nucleotit hệ gen giải mã, người ta phải tiến hành giải mã riêng rẽ khoảng triệu phân đoạn ADN khác Với kích thước phân đoạn giải mã xác ... thành trình tự phân đoạn ADN ngắn cuối có trình tự liên tục nhất, gọi contig Kỹ thuật giải mã trình tự kiểu shotgun cho phép ”ráp nối” phần hệ gen lớn Như trình bày việc giải mã đoạn trình tự ADN ... trích từ trình tự cADN biết Các trình tự cADN ngẫu nhiên (có thể trình tự đầy đủ hay trình tự phần EST) xác định sử dụng phương pháp giải mã trình tự ngẫu nhiên đối chiếu với đoạn khung hệ gen Các...
Ngày tải lên: 12/07/2014, 04:21
Giải trình tự gen HP1125 mã hóa cho protein màng ngoài của helicobacter
... Hultman (6a) Phân tích trình tự đoạn ADN: Chương trình Blast trang Web sử dụng để phân tích trình tự protein cuar gen KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN Khuếch đại gen HP1125 phương pháp PCR Toàn gen HP1125 khuyếch ... Phân tích gen mức độ ADN protein A) Ở mức độ ADN Trình tự toàn gen HP1125 vừa giải mã so sánh với gen tương ứng chủng nước chương trình Blast Nhìn chung, gen Việt nam có tương đồng cao với gen tương ... tiếp không qua giai đoạn tạo dòng phân tử Kết trình bầy hình A B Gen HP1125 Việt Nam đệ trình vào quĩ gen có số mã AY513613 Hình Trình tự nucleotide gen HP1125(A) thành phần protein tương ứng...
Ngày tải lên: 30/01/2013, 14:43
Giaỉ trình tự Gen HP125 mã hóa cho Protein
... Hultman (6a) Phân tích trình tự đoạn ADN: Chương trình Blast trang Web sử dụng để phân tích trình tự protein cuar gen KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN Khuếch đại gen HP1125 phương pháp PCR Toàn gen HP1125 khuyếch ... Phân tích gen mức độ ADN protein A) Ở mức độ ADN Trình tự toàn gen HP1125 vừa giải mã so sánh với gen tương ứng chủng nước chương trình Blast Nhìn chung, gen Việt nam có tương đồng cao với gen tương ... tiếp không qua giai đoạn tạo dòng phân tử Kết trình bầy hình A B Gen HP1125 Việt Nam đệ trình vào quĩ gen có số mã AY513613 Hình Trình tự nucleotide gen HP1125(A) thành phần protein tương ứng...
Ngày tải lên: 15/03/2013, 17:19
SÀNG lọc và GIẢI TRÌNH tự GEN mã hóa ENDO 1,4 β GLUCANASE từ nấm mốc CHỊU NHIỆT thielavia spp
... Quảng Phương, Quảng Bình Quảng Xuân, Quảng Bình Quảng Đông, Quảng Bình Quảng Phương, Quảng Bình Quảng Phương, Quảng Bình Quảng Đông, Quảng Bình Quảng Đông, Quảng Bình Quảng Đông, Quảng Bình Quảng ... Đông, Quảng Bình Quảng Đông, Quảng Bình Quảng Long, Quảng Bình Quảng Phương, Quảng Bình Quảng Phương, Quảng Bình Quảng Phương, Quảng Bình Phong Nha, Quảng Bình Phong Nha, Quảng Bình Phong Nha, Quảng ... 18) Hình 18 So sánh trình tự DNA với trình tự protein nhóm Nhóm gồm trình tự chủng LPH209 với trình tự protein dài gồm 413 axit amin Trình tự protein chủng sai khác với trình tự protein Thite_72629...
Ngày tải lên: 01/07/2016, 13:02
Tách dòng và giải trình tự gene mã hóa enzyme feruloyl coa synthase từ chủng amycolatopsis sp HR104
... hai trình tự để sử lý lỗi đồng thời tìm trình tự chung hai 39 trình tự gene tổng hợp từ hai mồi để nối ghép thành trình tự gene hoàn chỉnh 3.4.9 So sánh trình tự DNA ngân hàng gene NCBI Gene ... fcs sau giải trình tự so sánh với trình tự gene fcs công bố ngân hàng gene NCBI thông qua trương trình BLAST 40 PHẦN KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 4.1 Kết nhân gene fcs phƣơng pháp PCR Kết nhân gene fcs ... ngược 48 Hình 4.8: Kết phân tích so sánh trình tự gene từ hai chiều 50 Hình 4.9: Kết trình tự đoạn gene fcs sau giải trình tự 51 Hình 4.10 Kết phân tích sai khác nucleotide...
Ngày tải lên: 31/10/2016, 14:22
Tách dòng và giải trình tự Gene mã hóa Enzyme Nattokinase từ B. subtilis.
... sánh gene giải trình tự gene công bố Gen bank Query: Trình tự gene aprE sau giải trình tự Sbjct: Trình tự gene aprE mã số AB 734700 từ Gen bank 999 1059 780 1119 37 Kết so sánh cho thấy, hai gene ... 3: Xác định trình tự gene aprE tách dòng - Giải trình tự gene aprE tách dòng máy giải trình tự tự động Applied Biosystems - So sánh thành phần thiết yếu trình tự gene aprE giải trình tự với thiết ... hành dịch mã đoạn gene giải trình tự xem có bị stop codon hay không 38 4.6.2 Kết dịch mã gene aprE Kết dịch mã đoạn gene giải trình tự không xuất stop codon vô nghĩa tận cuối gene, dịch mã đầy...
Ngày tải lên: 23/11/2016, 08:52
Tách dòng, xác định và so sánh trình tự gen mã hoá Nuclear Inclusion Body protein (NIb) của một số dòng virus gây bệnh đốm vòng trên cây đu đủ (Papaya Ringspot virus-PRSV) ở Việt Nam
... sánh trình tự gen thu đợc Các bớc tiến hành nh sau: + So sánh trình tự gen đợc đọc từ hai đầu xuôi đầu ngợc để xác định trình tự đầy đủ gen + Xác định đợc vị trí, số lợng enzym hạn chế trình tự ... + Giải mã trình tự nucleotit sang trình tự axit amin theo khung đọc mở, xác định vị trí mở đầu kết thúc dịch mã + Lập phân loại bảng hệ số đồng dạng so sánh mức độ tơng đồng di truyền trình tự ... xác định trình tự máy đọc tự động ABI PRIMSđ 3100 Avant Genetic Analyzer Kết đọc hai chiều foward 3.5 kết so sánh trình tự 3.4.1 So sánh giống gen NIb mức độ nucleotit 3.4.2 So sánh giống gen NIb...
Ngày tải lên: 30/10/2012, 15:03
nghiên cứu giải trình tự gen kháng nguyên GP5 của virus gây hội chứng rối loạn sinh sản và hô hấp lợn việt nam và so sánh với một số chủng của thế giới
... chương trình tin – sinh h c ng d ng nghiên c u x lý, phân tích so sánh chu i gen thu nh n - Chương trình so sánh phân tích chu i gen GeneDoc m t chương trình Nicholas Nicholas (1997) [48] l p trình ... c) Ghi chú: ñ dài gen h gen tính b ng bp; 5’UTR 3’UTR: ph n không mã hóa ñ u cu i h gen; Lelystad: ch ng ñ i di n dòng châu Âu (genotype I); VR-2332: ch ng ñ i di n dòng B c M (genotype II); GD*: ... ngu n gen 2.3.6 Gi i trình t x lý chu i gen 2.3.6.1 Gi i trình t DNA 2.3.6.2 Tinh s ch s n ph m c a ph n ng gi i trình t 2.3.6.3 Thu nh n, x lý phân tích d li u chu i gen...
Ngày tải lên: 14/12/2013, 16:10
Tài liệu GIẢI TRÌNH TỰ GEN doc
... Các phương pháp giải trình tự gen Có phương pháp chính: Phương pháp hoá học Maxam Gilbert: phương pháp sử dụng để xác định trình tự gen không đựơc sử dụng phổ biến Phương ... phương pháp cải tiến Tạo điều kiện thuận lợi cho việc tự động hoá Giảm giá thành phản ứng Tăng tốc độ phản ứng => Nhiều trung tâm giải trình tự gen sử dụng phương pháp họ đọc hàng triệu bp ngày ... dTTP ddTTP C T A G Đoạn ADN cần giải trình tự Mồi Sequencing .CCTATGGAATGC- ống phản ứng A * * ** * phản ứng C ống * ** ống phản ứng G * * ống phản ứng T ** Phóng xạ tự ghi sợi AND đơn tổng hợp ống...
Ngày tải lên: 18/02/2014, 10:20
Phương pháp giải trình tự gen doc
... Thịnh NỘI DUNG Khái niệm giải trình tự gen ý nghĩa GTTG Phương pháp giải trình tự gen: 2.1 Phương pháp Maxam – Gilbert 2.2 Phương pháp Sanger 2.3 Phương pháp giải trình tự gen tự động So sánh phương ... Nạp sản phẩm PCR vào máy giải trình tự gen chạy máy giải trình tự gen Bước 4: Phân tích kết từ liệu máy tính cung cấp 2.3 Phương pháp giải trình tự gen tự động Đầu đọc laser máy kích hoạt chất ... phát màu, màu ứng với nucleotide hiển thị đỉnh 2.3 Phương pháp giải trình tự gen tự động Đọc kết 2.3 Phương pháp giải trình tự gen tự động ABI Automated Sequencers (contd.) ABI 310 Capillary ABI...
Ngày tải lên: 06/03/2014, 05:22
Giới thiệu kỹ thuật giải trình tự gen và Real - Time PCR pot
... ADN đợc xử lý vào máy giải trình tự gen để đọc tự động trình tự nucleotide FliC Có thể đọc sợi đọc đồng thời hai sợi để tăng độ xác trình tự đợc đọc Kết trình giải trình tự gen FliC đợc lu máy ... paratyphi B (Hình 1) Hình Gen FliC - b Salmonella paratyphi B GenBank (http: //www ncbi nlm nih gov) 27 TCNCYH phụ 32 (6) - 2004 Các gen FliC Salmonella khác đợc giải trình tự so sánh với để tìm ... dạng (hình ảnh chữ) Kết đợc so sánh với liệu loại có ngân hàng gen (GenBank, www ncbi nlm nih gov) đợc đăng ký công bố thức với số truy cập AY657000 AY657001 Sau xin giới thiệu gen FliC Salmonella...
Ngày tải lên: 10/03/2014, 22:20
KHẢO SÁT SỰ LƯU HÀNH VÀ BƯỚC ĐẦU GIẢI TRÌNH TỰ GENE CỦA VIRUS CÚM GIA CẦM SUBTYPE H5N1 TẠI TỈNH CÀ MAU VÀ SÓC TRĂNG ppt
... liệu chuỗi gene thu nhận với chuỗi có Ngân hàng gene quốc tế (GenBank) chương trình GENEDOC2.5 KẾT QUẢ THẢO LUẬN 3.1 Kết khảo sát lưu hành virus cúm gia cầm tỉnh Cà Mau Sóc Trăng Bảng 1: Kết xét ... dịch bảo quản) Sau đem huyễn dịch 20% ly tâm 3.500 g/10 phút, thu phần dịch bên tiến hành chiết xuất RNA Qiagen Kit thu nhận toàn gene H5 N1 phương pháp RT-PCR, tách dòng giải trình trình tự, phân ... bước đầu giải trình tự gene virus cúm gia cầm subtype H5N1 tỉnh Cà Mau Sóc Trăng” nhằm đạt mục tiêu khảo sát lưu hành virus cúm gia cầm tỉnh Cà Mau Sóc Trăng, bước đầu nghiên cứu trình tự gene HA...
Ngày tải lên: 25/03/2014, 07:22
Sẽ là vô nghĩa nếu chỉ đổ xô vào giải trình tự gene ppt
... Brenner tờ Nature 449 ông cổ vũ cho dự án giải mã trình tự genome James Watson Viện J Craig Venter Nhóm tác giả cho việc thu thập nhiều tốt trình tự gene tỏ quan trọng cảnh báo khác mà người ... sức vào giải mã trình tự gene theo đề xuất Brenner phí phạm vô nghĩa không tính đến nhân tố ngoại cảnh Điều không vấn đề hàn lâm lý thuyết Ngày nhiều nhà khoa học tập trung vào dự án genome Quỹ ... phần thưởng X công bố trao 10 triệu USD cho nhóm giải mã xác 100 genome người 10 ngày Liệu người trúng giải hiểu khám phá khoa học đằng sau trình tự lại vấn đề hoàn toàn độc lập? ...
Ngày tải lên: 07/07/2014, 09:20