... PCR tinh giảitrìnhtự MACROGEN Phân tích trìnhtựgen chương trình Seqman DNASTAR Kiểm tra trìnhtự chương trình ClustalX (Thompson et al, 1997) Nhận dạng trìnhtự tính toán chương trình BioEdit ... rút vàng xoăn Trìnhtự đoạn gen CP giảimãtừ sản phẩm PCR TYLCV mẫu cà chua thu huyện Đơn Dương tỉnh Lâm Đồng sau: Bảng So sánh tính đồng hai đoạn trìnhtự phiên mã xuôi /ngược gen CP vi vi rút ... Bảng Kết phân tích protein chương trình ORF-DNA CLUB so sánh với nòi xuất nước lân cận Việt Nam Kết phân tích protein (bảng 4) cho thấy trìnhtựgiảimã vi rút mẫu cà chua thu Đức Trọng tương tự...
... sánh trìnhtựgen Phân tích trìnhtự nucleotide gen thu được: So sánh trìnhtự thu đƣợc với trìnhtựgen BLAST NCBI để xác nhận gen tách dòng đƣợc đoạn gen quan tâm Sau so sánh trìnhtựgen tỉnh ... 2.2.10 Xác định trìnhtự so sánh trìnhtựgen thu đƣợc với trìnhtự tƣơng ứng GenBank 33 CHƢƠNG III: KẾTQUẢ VÀ THẢO LUẬN 35 3.1 KẾTQUẢ TÁCH DÒNG GEN VÀ XÁC ĐỊNH TRÌNHTỰ NUCLEOTIDE ... giảitrìnhtự Số hóa trung tâm học liệu http://www.lrc.tnu.edu.vn/ Comment [SCD15]: plasmid 33 2.2.10 Xác định trìnhtự so sánh trìnhtựgen thu đƣợc với trìnhtự tƣơng ứng GenBank Xác định trình...
... vi khuẩn giảimã máy giảimãtrìnhtựtự động Để đảm bảo nucleotit hệ gengiải mã, người ta phải tiến hành giảimã riêng rẽ khoảng triệu phân đoạn ADN khác Với kích thước phân đoạn giảimã xác ... thành trìnhtự phân đoạn ADN ngắn cuối có trìnhtự liên tục nhất, gọi contig Kỹ thuật giảimãtrìnhtự kiểu shotgun cho phép ”ráp nối” phần hệ gen lớn Như trình bày việc giảimã đoạn trìnhtự ADN ... phân đoạn ADN tái tổ hợp riêng rẽ giảimãtrìnhtự riêng rẽ máy giảimãtrìnhtựtự động sử dụng phương pháp ddNTP Phương pháp gọi phương pháp giảimãtrìnhtự kiểu ”shotgun” (bắn ngẫu nhiên)...
... vi khuẩn giảimã máy giảimãtrìnhtựtự động Để đảm bảo nucleotit hệ gengiải mã, người ta phải tiến hành giảimã riêng rẽ khoảng triệu phân đoạn ADN khác Với kích thước phân đoạn giảimã xác ... thành trìnhtự phân đoạn ADN ngắn cuối có trìnhtự liên tục nhất, gọi contig Kỹ thuật giảimãtrìnhtự kiểu shotgun cho phép ”ráp nối” phần hệ gen lớn Như trình bày việc giảimã đoạn trìnhtự ADN ... phân đoạn ADN tái tổ hợp riêng rẽ giảimãtrìnhtự riêng rẽ máy giảimãtrìnhtựtự động sử dụng phương pháp ddNTP Phương pháp gọi phương pháp giảimãtrìnhtự kiểu ”shotgun” (bắn ngẫu nhiên)...
... vi khuẩn giảimã máy giảimãtrìnhtựtự động Để đảm bảo nucleotit hệ gengiải mã, người ta phải tiến hành giảimã riêng rẽ khoảng triệu phân đoạn ADN khác Với kích thước phân đoạn giảimã xác ... thành trìnhtự phân đoạn ADN ngắn cuối có trìnhtự liên tục nhất, gọi contig Kỹ thuật giảimãtrìnhtự kiểu shotgun cho phép ”ráp nối” phần hệ gen lớn Như trình bày việc giảimã đoạn trìnhtự ADN ... trích từtrìnhtự cADN biết Các trìnhtự cADN ngẫu nhiên (có thể trìnhtự đầy đủ hay trìnhtự phần EST) xác định sử dụng phương pháp giảimãtrìnhtự ngẫu nhiên đối chiếu với đoạn khung hệ gen Các...
... Hultman (6a) Phân tích trìnhtự đoạn ADN: Chương trình Blast trang Web sử dụng để phân tích trìnhtự protein cuar genKẾTQUẢ VÀ BÀN LUẬN Khuếch đại gen HP1125 phương pháp PCR Toàn gen HP1125 khuyếch ... Phân tích gen mức độ ADN protein A) Ở mức độ ADN Trìnhtự toàn gen HP1125 vừa giảimã so sánh với gen tương ứng chủng nước chương trình Blast Nhìn chung, gen Việt nam có tương đồng cao với gen tương ... tiếp không quagiai đoạn tạo dòng phân tửKếttrình bầy hình A B Gen HP1125 Việt Nam đệ trình vào quĩ gen có số mã AY513613 Hình Trìnhtự nucleotide gen HP1125(A) thành phần protein tương ứng...
... Hultman (6a) Phân tích trìnhtự đoạn ADN: Chương trình Blast trang Web sử dụng để phân tích trìnhtự protein cuar genKẾTQUẢ VÀ BÀN LUẬN Khuếch đại gen HP1125 phương pháp PCR Toàn gen HP1125 khuyếch ... Phân tích gen mức độ ADN protein A) Ở mức độ ADN Trìnhtự toàn gen HP1125 vừa giảimã so sánh với gen tương ứng chủng nước chương trình Blast Nhìn chung, gen Việt nam có tương đồng cao với gen tương ... tiếp không quagiai đoạn tạo dòng phân tửKếttrình bầy hình A B Gen HP1125 Việt Nam đệ trình vào quĩ gen có số mã AY513613 Hình Trìnhtự nucleotide gen HP1125(A) thành phần protein tương ứng...
... Quảng Phương, Quảng Bình Quảng Xuân, Quảng Bình Quảng Đông, Quảng Bình Quảng Phương, Quảng Bình Quảng Phương, Quảng Bình Quảng Đông, Quảng Bình Quảng Đông, Quảng Bình Quảng Đông, Quảng Bình Quảng ... Đông, Quảng Bình Quảng Đông, Quảng Bình Quảng Long, Quảng Bình Quảng Phương, Quảng Bình Quảng Phương, Quảng Bình Quảng Phương, Quảng Bình Phong Nha, Quảng Bình Phong Nha, Quảng Bình Phong Nha, Quảng ... 18) Hình 18 So sánh trìnhtự DNA với trìnhtự protein nhóm Nhóm gồm trìnhtự chủng LPH209 với trìnhtự protein dài gồm 413 axit amin Trìnhtự protein chủng sai khác với trìnhtự protein Thite_72629...
... hai trìnhtự để sử lý lỗi đồng thời tìm trìnhtự chung hai 39 trìnhtự gene tổng hợp từ hai mồi để nối ghép thành trìnhtự gene hoàn chỉnh 3.4.9 So sánh trìnhtự DNA ngân hàng gene NCBI Gene ... fcs sau giảitrìnhtự so sánh với trìnhtự gene fcs công bố ngân hàng gene NCBI thông qua trương trình BLAST 40 PHẦN KẾTQUẢ VÀ THẢO LUẬN 4.1 Kết nhân gene fcs phƣơng pháp PCR Kết nhân gene fcs ... ngược 48 Hình 4.8: Kết phân tích so sánh trìnhtự gene từ hai chiều 50 Hình 4.9: Kếttrìnhtự đoạn gene fcs sau giảitrìnhtự 51 Hình 4.10 Kết phân tích sai khác nucleotide...
... sánh gene giảitrìnhtự gene công bố Gen bank Query: Trìnhtự gene aprE sau giảitrìnhtự Sbjct: Trìnhtự gene aprE mã số AB 734700 từGen bank 999 1059 780 1119 37 Kết so sánh cho thấy, hai gene ... 3: Xác định trìnhtự gene aprE tách dòng - Giảitrìnhtự gene aprE tách dòng máy giảitrìnhtựtự động Applied Biosystems - So sánh thành phần thiết yếu trìnhtự gene aprE giảitrìnhtự với thiết ... hành dịch mã đoạn gene giảitrìnhtự xem có bị stop codon hay không 38 4.6.2 Kết dịch mã gene aprE Kết dịch mã đoạn gene giảitrìnhtự không xuất stop codon vô nghĩa tận cuối gene, dịch mã đầy...
... sánh trìnhtựgen thu đợc Các bớc tiến hành nh sau: + So sánh trìnhtựgen đợc đọc từ hai đầu xuôi đầu ngợc để xác định trìnhtự đầy đủ gen + Xác định đợc vị trí, số lợng enzym hạn chế trìnhtự ... + Giảimãtrìnhtự nucleotit sang trìnhtự axit amin theo khung đọc mở, xác định vị trí mở đầu kết thúc dịch mã + Lập phân loại bảng hệ số đồng dạng so sánh mức độ tơng đồng di truyền trìnhtự ... xác định trìnhtự máy đọc tự động ABI PRIMSđ 3100 Avant Genetic Analyzer Kết đọc hai chiều foward 3.5 kết so sánh trìnhtự 3.4.1 So sánh giống gen NIb mức độ nucleotit 3.4.2 So sánh giống gen NIb...
... chương trình tin – sinh h c ng d ng nghiên c u x lý, phân tích so sánh chu i gen thu nh n - Chương trình so sánh phân tích chu i gen GeneDoc m t chương trình Nicholas Nicholas (1997) [48] l p trình ... c) Ghi chú: ñ dài gen h gen tính b ng bp; 5’UTR 3’UTR: ph n không mã hóa ñ u cu i h gen; Lelystad: ch ng ñ i di n dòng châu Âu (genotype I); VR-2332: ch ng ñ i di n dòng B c M (genotype II); GD*: ... ngu n gen 2.3.6 Gi i trình t x lý chu i gen 2.3.6.1 Gi i trình t DNA 2.3.6.2 Tinh s ch s n ph m c a ph n ng gi i trình t 2.3.6.3 Thu nh n, x lý phân tích d li u chu i gen...
... Các phương pháp giảitrìnhtựgen Có phương pháp chính: Phương pháp hoá học Maxam Gilbert: phương pháp sử dụng để xác định trìnhtựgen không đựơc sử dụng phổ biến Phương ... phương pháp cải tiến Tạo điều kiện thuận lợi cho việc tự động hoá Giảm giá thành phản ứng Tăng tốc độ phản ứng => Nhiều trung tâm giảitrìnhtựgen sử dụng phương pháp họ đọc hàng triệu bp ngày ... dTTP ddTTP C T A G Đoạn ADN cần giảitrìnhtự Mồi Sequencing .CCTATGGAATGC- ống phản ứng A * * ** * phản ứng C ống * ** ống phản ứng G * * ống phản ứng T ** Phóng xạ tự ghi sợi AND đơn tổng hợp ống...
... Thịnh NỘI DUNG Khái niệm giảitrìnhtựgen ý nghĩa GTTG Phương pháp giảitrìnhtự gen: 2.1 Phương pháp Maxam – Gilbert 2.2 Phương pháp Sanger 2.3 Phương pháp giảitrìnhtựgentự động So sánh phương ... Nạp sản phẩm PCR vào máy giảitrìnhtựgen chạy máy giảitrìnhtựgen Bước 4: Phân tích kếttừ liệu máy tính cung cấp 2.3 Phương pháp giảitrìnhtựgentự động Đầu đọc laser máy kích hoạt chất ... phát màu, màu ứng với nucleotide hiển thị đỉnh 2.3 Phương pháp giảitrìnhtựgentự động Đọc kết 2.3 Phương pháp giảitrìnhtựgentự động ABI Automated Sequencers (contd.) ABI 310 Capillary ABI...
... ADN đợc xử lý vào máy giảitrìnhtựgen để đọc tự động trìnhtự nucleotide FliC Có thể đọc sợi đọc đồng thời hai sợi để tăng độ xác trìnhtự đợc đọc Kếttrìnhgiảitrìnhtựgen FliC đợc lu máy ... paratyphi B (Hình 1) Hình Gen FliC - b Salmonella paratyphi B GenBank (http: //www ncbi nlm nih gov) 27 TCNCYH phụ 32 (6) - 2004 Các gen FliC Salmonella khác đợc giảitrìnhtự so sánh với để tìm ... dạng (hình ảnh chữ) Kết đợc so sánh với liệu loại có ngân hàng gen (GenBank, www ncbi nlm nih gov) đợc đăng ký công bố thức với số truy cập AY657000 AY657001 Sau xin giới thiệu gen FliC Salmonella...
... liệu chuỗi gene thu nhận với chuỗi có Ngân hàng gene quốc tế (GenBank) chương trình GENEDOC2.5 KẾTQUẢ THẢO LUẬN 3.1 Kết khảo sát lưu hành virus cúm gia cầm tỉnh Cà Mau Sóc Trăng Bảng 1: Kết xét ... dịch bảo quản) Sau đem huyễn dịch 20% ly tâm 3.500 g/10 phút, thu phần dịch bên tiến hành chiết xuất RNA Qiagen Kit thu nhận toàn gene H5 N1 phương pháp RT-PCR, tách dòng giảitrìnhtrình tự, phân ... bước đầu giảitrìnhtự gene virus cúm gia cầm subtype H5N1 tỉnh Cà Mau Sóc Trăng” nhằm đạt mục tiêu khảo sát lưu hành virus cúm gia cầm tỉnh Cà Mau Sóc Trăng, bước đầu nghiên cứu trìnhtự gene HA...
... Brenner tờ Nature 449 ông cổ vũ cho dự án giảimãtrìnhtự genome James Watson Viện J Craig Venter Nhóm tác giả cho việc thu thập nhiều tốt trìnhtự gene tỏ quan trọng cảnh báo khác mà người ... sức vào giảimãtrìnhtự gene theo đề xuất Brenner phí phạm vô nghĩa không tính đến nhân tố ngoại cảnh Điều không vấn đề hàn lâm lý thuyết Ngày nhiều nhà khoa học tập trung vào dự án genome Quỹ ... phần thưởng X công bố trao 10 triệu USD cho nhóm giảimã xác 100 genome người 10 ngày Liệu người trúng giải hiểu khám phá khoa học đằng sau trìnhtự lại vấn đề hoàn toàn độc lập? ...