gỉải mã trình tự gen sequencing

Giải mã trình tự ADN

Giải mã trình tự ADN

... trích từ trình tự cADN biết Các trình tự cADN ngẫu nhiên (có thể trình tự đầy đủ hay trình tự phần EST) xác định sử dụng phương pháp giải trình tự ngẫu nhiên đối chiếu với đoạn khung hệ gen Các ... thành trình tự phân đoạn ADN ngắn cuối có trình tự liên tục nhất, gọi contig Kỹ thuật giải trình tự kiểu shotgun cho phép ”ráp nối” phần hệ gen lớn Như trình bày việc giải đoạn trình tự ADN ... trình tự ADN giải trình tự ngẫu nhiên trực tiếp nhập vào phần mềm máy tính Nhiều phần mềm máy tính chuyên dụng xếp đoạn trình tự theo thứ tự dựa trình tự gối lên chúng Sự ”lắp ráp” thành trình...

Ngày tải lên: 24/10/2013, 12:15

25 435 3
Giải mã trình tự ADN potx

Giải mã trình tự ADN potx

... trích từ trình tự cADN biết Các trình tự cADN ngẫu nhiên (có thể trình tự đầy đủ hay trình tự phần EST) xác định sử dụng phương pháp giải trình tự ngẫu nhiên đối chiếu với đoạn khung hệ gen Các ... thành trình tự phân đoạn ADN ngắn cuối có trình tự liên tục nhất, gọi contig Kỹ thuật giải trình tự kiểu shotgun cho phép ”ráp nối” phần hệ gen lớn Như trình bày việc giải đoạn trình tự ADN ... trình tự ADN giải trình tự ngẫu nhiên trực tiếp nhập vào phần mềm máy tính Nhiều phần mềm máy tính chuyên dụng xếp đoạn trình tự theo thứ tự dựa trình tự gối lên chúng Sự ”lắp ráp” thành trình...

Ngày tải lên: 25/03/2014, 22:20

12 433 0
Di truyền phân tử ( phần 25 ) Giải mã trình tự ADN potx

Di truyền phân tử ( phần 25 ) Giải mã trình tự ADN potx

... trích từ trình tự cADN biết Các trình tự cADN ngẫu nhiên (có thể trình tự đầy đủ hay trình tự phần EST) xác định sử dụng phương pháp giải trình tự ngẫu nhiên đối chiếu với đoạn khung hệ gen Các ... thành trình tự phân đoạn ADN ngắn cuối có trình tự liên tục nhất, gọi contig Kỹ thuật giải trình tự kiểu shotgun cho phép ”ráp nối” phần hệ gen lớn Như trình bày việc giải đoạn trình tự ADN ... trình tự ADN giải trình tự ngẫu nhiên trực tiếp nhập vào phần mềm máy tính Nhiều phần mềm máy tính chuyên dụng xếp đoạn trình tự theo thứ tự dựa trình tự gối lên chúng Sự ”lắp ráp” thành trình...

Ngày tải lên: 12/07/2014, 04:21

7 310 1
Nghiên cứu giải mã trình tự hệ Genome của chủng Virus xoăn lá thuốc lá (TLCV) phân lập tại Việt Nam

Nghiên cứu giải mã trình tự hệ Genome của chủng Virus xoăn lá thuốc lá (TLCV) phân lập tại Việt Nam

... sánh trình tự gen Phân tích trình tự nucleotide gen thu được: So sánh trình tự thu đƣợc với trình tự gen BLAST NCBI để xác nhận gen tách dòng đƣợc đoạn gen quan tâm Sau so sánh trình tự gen tỉnh ... giải trình tự Số hóa trung tâm học liệu http://www.lrc.tnu.edu.vn/ Comment [SCD15]: plasmid 33 2.2.10 Xác định trình tự so sánh trình tự gen thu đƣợc với trình tự tƣơng ứng GenBank Xác định trình ... 2.2.10 Xác định trình tự so sánh trình tự gen thu đƣợc với trình tự tƣơng ứng GenBank 33 CHƢƠNG III: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 35 3.1 KẾT QUẢ TÁCH DÒNG GEN VÀ XÁC ĐỊNH TRÌNH TỰ NUCLEOTIDE...

Ngày tải lên: 19/11/2014, 19:46

64 300 0
GIẢI MÃ TRÌNH TỰ GENE MÃ HÓA PROTEIN VỎ VI RÚT VÀNG XOĂN LÁ CÀ CHUA (TYLCV) Ở MỘT SỐ TỈNH PHÍA NAM

GIẢI MÃ TRÌNH TỰ GENE MÃ HÓA PROTEIN VỎ VI RÚT VÀNG XOĂN LÁ CÀ CHUA (TYLCV) Ở MỘT SỐ TỈNH PHÍA NAM

... PCR tinh giải trình tự MACROGEN Phân tích trình tự gen chương trình Seqman DNASTAR Kiểm tra trình tự chương trình ClustalX (Thompson et al, 1997) Nhận dạng trình tự tính toán chương trình BioEdit ... rút vàng xoăn Trình tự đoạn gen CP giải từ sản phẩm PCR TYLCV mẫu cà chua thu huyện Đơn Dương tỉnh Lâm Đồng sau: Bảng So sánh tính đồng hai đoạn trình tự phiên xuôi /ngược gen CP vi vi rút ... trình tự đoạn gen CP từ sản phẩm PCR tinh mang gen vi rút gây bệnh TYLCV ly trích từ mẫu cà chua huyện Đức Trọng, tỉnh Lâm Đồng sau: Bảng So sánh tính đồng hai đoạn trình tự phiên xuôi /ngược gen...

Ngày tải lên: 18/05/2015, 10:01

9 395 0
Giải trình tự gen HP1125 mã hóa cho protein màng ngoài của helicobacter

Giải trình tự gen HP1125 mã hóa cho protein màng ngoài của helicobacter

... Phân tích gen mức độ ADN protein A) Ở mức độ ADN Trình tự toàn gen HP1125 vừa giải so sánh với gen tương ứng chủng nước chương trình Blast Nhìn chung, gen Việt nam có tương đồng cao với gen tương ... tiếp không qua giai đoạn tạo dòng phân tử Kết trình bầy hình A B Gen HP1125 Việt Nam đệ trình vào quĩ gen có số AY513613 Hình Trình tự nucleotide gen HP1125(A) thành phần protein tương ứng (B) ... Gene clean Kit ADN với nồng độ 10 ng/µl sử dụng để giải trình tự ADN Core, trường đại học tổng hợp Michigan (Mỹ) theo phương pháp giải trình Hultman (6a) Phân tích trình tự đoạn ADN: Chương trình...

Ngày tải lên: 30/01/2013, 14:43

7 617 4
Giaỉ trình tự Gen HP125 mã hóa cho Protein

Giaỉ trình tự Gen HP125 mã hóa cho Protein

... Phân tích gen mức độ ADN protein A) Ở mức độ ADN Trình tự toàn gen HP1125 vừa giải so sánh với gen tương ứng chủng nước chương trình Blast Nhìn chung, gen Việt nam có tương đồng cao với gen tương ... tiếp không qua giai đoạn tạo dòng phân tử Kết trình bầy hình A B Gen HP1125 Việt Nam đệ trình vào quĩ gen có số AY513613 Hình Trình tự nucleotide gen HP1125(A) thành phần protein tương ứng (B) ... Gene clean Kit ADN với nồng độ 10 ng/l sử dụng để giải trình tự ADN Core, trường đại học tổng hợp Michigan (Mỹ) theo phương pháp giải trình Hultman (6a) Phân tích trình tự đoạn ADN: Chương trình...

Ngày tải lên: 15/03/2013, 17:19

14 443 1
SÀNG lọc và GIẢI TRÌNH tự GEN mã hóa ENDO 1,4 β GLUCANASE từ nấm mốc CHỊU NHIỆT thielavia spp

SÀNG lọc và GIẢI TRÌNH tự GEN mã hóa ENDO 1,4 β GLUCANASE từ nấm mốc CHỊU NHIỆT thielavia spp

... 18) Hình 18 So sánh trình tự DNA với trình tự protein nhóm Nhóm gồm trình tự chủng LPH209 với trình tự protein dài gồm 413 axit amin Trình tự protein chủng sai khác với trình tự protein Thite_72629 ... gồm 16 axit amin trình tự protein (Hình 15) Mặc dù sai khác trình tự DNA, trình tự protein hay vị trí intron, exon chủng lớn trình tự peptide tín hiệu giống giống với trình tự Thielavia terrestris ... So sánh trình tự DNA với trình tự protein nhóm Nhóm có trình tự khác biệt lớn với trình tự ThCEL 72629 (khoảng 5%) đặc biệt 21 axit amin cuối từ axit amin 370 đến 391 Nguyên nhân trình tự Thite_72629...

Ngày tải lên: 01/07/2016, 13:02

68 510 2
Tách dòng, xác định và so sánh trình tự gen mã hoá Nuclear Inclusion Body protein (NIb) của một số dòng virus gây bệnh đốm vòng trên cây đu đủ (Papaya Ringspot virus-PRSV) ở Việt Nam

Tách dòng, xác định và so sánh trình tự gen mã hoá Nuclear Inclusion Body protein (NIb) của một số dòng virus gây bệnh đốm vòng trên cây đu đủ (Papaya Ringspot virus-PRSV) ở Việt Nam

... sánh trình tự gen thu đợc Các bớc tiến hành nh sau: + So sánh trình tự gen đợc đọc từ hai đầu xuôi đầu ngợc để xác định trình tự đầy đủ gen + Xác định đợc vị trí, số lợng enzym hạn chế trình tự ... đoạn gen 16 trình tự gen Nib đợc khai thác NCBI Các trình tự đợc so sánh với nhờ chơng trình phần mềm DNAstar Với mục đích sử dụng cặp mồi nhân đợc nhiều dòng virus khác nhau, chọn vùng trình tự ... đình đầy đủ trình tự đoạn gen Muốn tiến hành subclone trớc hết phải xác định trình tự chiều trình tự gen, sau xác định vị trí cắt enzym giới hạn Chọn vị trí cắt enzym giới hạn gen PCS phải khác...

Ngày tải lên: 30/10/2012, 15:03

33 1,4K 5
nghiên cứu giải trình tự gen kháng nguyên GP5 của virus gây hội chứng rối loạn sinh sản và hô hấp lợn việt nam và so sánh với một số chủng của thế giới

nghiên cứu giải trình tự gen kháng nguyên GP5 của virus gây hội chứng rối loạn sinh sản và hô hấp lợn việt nam và so sánh với một số chủng của thế giới

... chương trình tin – sinh h c ng d ng nghiên c u x lý, phân tích so sánh chu i gen thu nh n - Chương trình so sánh phân tích chu i gen GeneDoc m t chương trình Nicholas Nicholas (1997) [48] l p trình ... c) Ghi chú: ñ dài gen h gen tính b ng bp; 5’UTR 3’UTR: ph n không hóa ñ u cu i h gen; Lelystad: ch ng ñ i di n dòng châu Âu (genotype I); VR-2332: ch ng ñ i di n dòng B c M (genotype II); GD*: ... ngu n gen 2.3.6 Gi i trình t x lý chu i gen 2.3.6.1 Gi i trình t DNA 2.3.6.2 Tinh s ch s n ph m c a ph n ng gi i trình t 2.3.6.3 Thu nh n, x lý phân tích d li u chu i gen...

Ngày tải lên: 14/12/2013, 16:10

100 724 3
Tài liệu GIẢI TRÌNH TỰ GEN doc

Tài liệu GIẢI TRÌNH TỰ GEN doc

... Các phương pháp giải trình tự gen Có phương pháp chính: Phương pháp hoá học Maxam Gilbert: phương pháp sử dụng để xác định trình tự gen không đựơc sử dụng phổ biến Phương ... ddTTP C T A G Đoạn ADN cần giải trình tự Mồi Sequencing .CCTATGGAATGC- ống phản ứng A * * ** * phản ứng C ống * ** ống phản ứng G * * ống phản ứng T ** Phóng xạ tự ghi sợi AND đơn tổng hợp ống ... phương pháp cải tiến Tạo điều kiện thuận lợi cho việc tự động hoá Giảm giá thành phản ứng Tăng tốc độ phản ứng => Nhiều trung tâm giải trình tự gen sử dụng phương pháp họ đọc hàng triệu bp ngày...

Ngày tải lên: 18/02/2014, 10:20

19 1,6K 47
Phương pháp giải trình tự gen doc

Phương pháp giải trình tự gen doc

... NỘI DUNG Khái niệm giải trình tự gen ý nghĩa GTTG Phương pháp giải trình tự gen: 2.1 Phương pháp Maxam – Gilbert 2.2 Phương pháp Sanger 2.3 Phương pháp giải trình tự gen tự động So sánh phương ... giải trình tự gen tự động Bước 1: Chuẩn bị (DNA khuôn, dNTP ddNTP có gắn màu quỳnh quang, enzyme, mồi…) Bước 2: Nhân DNA PCR Bước 3: Nạp sản phẩm PCR vào máy giải trình tự gen chạy máy giải trình ... màu, màu ứng với nucleotide hiển thị đỉnh 2.3 Phương pháp giải trình tự gen tự động Đọc kết 2.3 Phương pháp giải trình tự gen tự động ABI Automated Sequencers (contd.) ABI 310 Capillary ABI...

Ngày tải lên: 06/03/2014, 05:22

28 3,8K 54
Giới thiệu kỹ thuật giải trình tự gen và Real - Time PCR pot

Giới thiệu kỹ thuật giải trình tự gen và Real - Time PCR pot

... đợc xử lý vào máy giải trình tự gen để đọc tự động trình tự nucleotide FliC Có thể đọc sợi đọc đồng thời hai sợi để tăng độ xác trình tự đợc đọc Kết trình giải trình tự gen FliC đợc lu máy dới ... paratyphi B GenBank (http: //www ncbi nlm nih gov) 27 TCNCYH phụ 32 (6) - 2004 Các gen FliC Salmonella khác đợc giải trình tự so sánh với để tìm vùng đặc trng cho loài, FliC - a gen FliC Salmonella ... loại có ngân hàng gen (GenBank, www ncbi nlm nih gov) đợc đăng ký công bố thức với số truy cập AY657000 AY657001 Sau xin giới thiệu gen FliC Salmonella paratyphi B (Hình 1) Hình Gen FliC - b Salmonella...

Ngày tải lên: 10/03/2014, 22:20

9 731 6
Phát hiện đột biến gen COL1A1 trên bệnh nhân tạo xương bất toàn bằng kỹ thuật PCR và giải trình tự gen

Phát hiện đột biến gen COL1A1 trên bệnh nhân tạo xương bất toàn bằng kỹ thuật PCR và giải trình tự gen

... ảnh minh họa kỹ thuật giải trình tự theo phương pháp Sanger [13] Giải trình tự DNA chia làm bước lớn: PCR giải trình tự đọc trình tự máy tự động Bước 1: PCR giải trình tự Thành phần hỗn hợp phản ... nucleotid Sản phẩm PCR giải trình tự điện di đọc kết máy Bước 2: Đọc trình tự máy tự động Để thực đọc trình tự máy tự động mạch DNA đơn sản sinh ống phản ứng giải trình phải đánh dấu huỳnh quang ... nhân đoạn gen đặc hiệu với OI - Chạy điện di kiểm tra sản phẩm Bước 4: Giải trình tự sản phẩm PCR gồm bước: - Thực phản ứng PCR giải trình tự - Tinh sản phẩm PCR giải trình tự - Giải trình tự trực...

Ngày tải lên: 07/10/2014, 01:31

68 572 0
nghiên cứu tách dòng và đọc trình tự gen cry1ab, cry1ac mã hóa protein tinh thể diệt côn trùng bộ cánh vảy từ các chủng bacillus thuringiensis phân lập từ một số mẫu đất thuộc tỉnh thái nguyên

nghiên cứu tách dòng và đọc trình tự gen cry1ab, cry1ac mã hóa protein tinh thể diệt côn trùng bộ cánh vảy từ các chủng bacillus thuringiensis phân lập từ một số mẫu đất thuộc tỉnh thái nguyên

... cú ti hn 300 gen ó c tỏch dũng v ng kớ trờn ngõn hng d liu gen (Gene Database) [7] 1.2.6.4 c im riờng ca mt s nhúm gen v c t ca chỳng Nhúm gen cry1: gm trờn 130 gen thuc cỏc nhúm gen cry1A-cry1L ... cỏc bn ca gen hoc trỡnh t DNA cn thit Tỏch dũng gen cũn c gi l phõn lp gen, cú nhiu phng phỏp tỏch dũng gen khỏc Tỏch dũng invitro (in vitro gene cloning), tỏch dũng silico (in silico gene cloning) ... tng hp Gen ny khụng xp vo h gen cry vỡ khụng sinh tinh th S húa bi Trung tõm Hc liu i hc Thỏi Nguyờn http://www.lrc-tnu.edu.vn 16 1.2.6.5 c im v gen cry1Ab, cry1Ac Gen cry1Ab kớch thc gen 3468...

Ngày tải lên: 07/10/2014, 09:14

74 827 2
Tuyển chọn, tách dòng và xác định trình tự gen cry1c mã hóa Protein tinh thể diệt côn trùng bộ cánh vảy từ vi khuẩn Bacillus thuringiensis subsp. aizawai phân lập từ một số mẫu đất tỉnh Thái Nguyên

Tuyển chọn, tách dòng và xác định trình tự gen cry1c mã hóa Protein tinh thể diệt côn trùng bộ cánh vảy từ vi khuẩn Bacillus thuringiensis subsp. aizawai phân lập từ một số mẫu đất tỉnh Thái Nguyên

... 1981, gen hóa protein tinh thể diệt sâu tách dòng đọc trình tự Từ đó, số lượng gen hóa protein tinh thể Bt tách dòng nghiên cứu đặc tính không ngừng tăng lên Những gen chủ yếu thuộc họ gen ... yếu – tinh thể độc) hóa gen cry, độc tố Cyt (độc tố phân huỷ tế bào) gen cyt hoá độc tố Vip (vegetative insecticidal protein) gen vip hoá tổng hợp Gen không xếp vào họ gen cry không sinh ... gen tách dòng đăng kí ngân hàng liệu gen (Gene Database) [29], [42] 1.4.2 Phân nhóm gen hóa độc tố Hệ thống phân loại gen cry HÖfte Whiteley xây dựng dựa vào côn trùng đích độc tố gen mã...

Ngày tải lên: 15/11/2014, 22:24

65 549 2
Nghiên cứu trình tự gen mã hóa enzyme polyphenol odidase ở một số giống chè đặc sản trồng ở Thái Nguyên

Nghiên cứu trình tự gen mã hóa enzyme polyphenol odidase ở một số giống chè đặc sản trồng ở Thái Nguyên

... theo 3.2 NHN GEN PPO CC MU CHẩ NGHIấN CU Gen mó húa PPO c cho l ch cú trỡnh t mó húa cú kớch thc l 1,8 kb Trỡnh t gen mó húa PPO c phõn lp t mRNA v genome chố ó c cụng b trờn Genbank vi mó ... 33 3.2 NHN GEN PPO CC MU CHẩ NGHIấN CU 34 3.3 TCH DềNG GEN PPO T CC GING CHẩ NGHIấN CU 35 3.4 PHN TCH TRèNH T GEN PPO T GING NGHIấN CU 3.5 PHN TCH, SO SNH TRèNH T GEN PPO GING ... cú th on gen mó húa PPO 3.4 PHN TCH TRèNH T GEN PPO CA GING CHẩ NGHIấN CU T cỏc dũng plasmid tỏi t hp thu c, chỳng tụi tin hnh tinh sch nhm mc ớch xỏc nh trỡnh t gen PPO Trỡnh t ca gen mó húa...

Ngày tải lên: 06/08/2015, 15:54

60 340 0
Đa dạng di truyền một số chủng virus gây bệnh tai xanh (prrsv) ở việt nam dựa vào trình tự gen mã hóa protein màng (m)

Đa dạng di truyền một số chủng virus gây bệnh tai xanh (prrsv) ở việt nam dựa vào trình tự gen mã hóa protein màng (m)

... vào trình tự gen hóa cho protein màng (M)” Trong khn khổ luận văn, đặc điểm di truyền phân tử số chủng PRRSV phân lập Việt Nam năm 2010 so sánh với chủng khác Việt Nam giới dựa trình tự gen ... nhận gen hóa cho protein màng (M) Giải trình tự gen tiến hành phân tích số liệu, so sánh tương đồng nucleotide amino acid để đánh giá đa dạng di truyền chủng PRRS Việt Nam giới dựa trình tự gen ... truyền gen M 3.2 Phân tích quan hệ di truyền dòng virus PRRS Khi có trình tự nucleotid chuỗi gen M, chúng tơi tiến hành so sánh chuỗi trình tự nucleotid vừa giải duợc với chuỗi trình tự nucleotid...

Ngày tải lên: 06/12/2015, 20:44

20 404 2
w