Phân lập, xác định trình tự và đánh giá biểu hiện của gen mã hóa acetoacetyl-CoA thiolase (AACT) ở sâm Ngọc Linh (Panax Vietnamensis ha et grushv.)

11 23 0

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

1 / 11 trang

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Thông tin cơ bản

Định dạng
Số trang	11
Dung lượng	749,04 KB

Nội dung

Trong nghiên cứu này, cDNA gen mã hóa AACT được phân lập từ sâm Ngọc Linh với vùng mang mã có kích thước 1224 bp, mã hóa cho 408 amino acid. Trình tự cDNA gen mã hóa AACT được công bố trên GenBank với mã số MZ272018, có sự tương đồng so với gen này ở loài Panax notoginseng KJ804173.1 là 99,08%. Tuy có một số điểm khác biệt trong trình tự cDNA gen mã hóa AACT ở sâm Ngọc Linh so với loài tham chiếu nhưng trình tự protein do gen mã hóa mang đầy đủ các đặc tính của AACT với các vị trí quan trọng liên quan tới hoạt tính protein đều được bảo toàn.

Ngày đăng: 27/11/2021, 10:59

HÌNH ẢNH LIÊN QUAN

Bảng 1. Trình tự các cặp mồi sử dụng trong nghiên cứu. - Phân lập, xác định trình tự và đánh giá biểu hiện của gen mã hóa acetoacetyl-CoA thiolase (AACT) ở sâm Ngọc Linh (Panax Vietnamensis ha et grushv.) — **Bảng 1.** Trình tự các cặp mồi sử dụng trong nghiên cứu (Trang 3)

Hình 1. Kết quả điện di sản phẩm PCR nhân cDNA gen mã hóa AACT trên gel agarose 1,2%. Marker 100 bp (Nippon Genetics, Nhật Bản) - Phân lập, xác định trình tự và đánh giá biểu hiện của gen mã hóa acetoacetyl-CoA thiolase (AACT) ở sâm Ngọc Linh (Panax Vietnamensis ha et grushv.) — **Hình 1.** Kết quả điện di sản phẩm PCR nhân cDNA gen mã hóa AACT trên gel agarose 1,2%. Marker 100 bp (Nippon Genetics, Nhật Bản) (Trang 4)

Hình 3. Kết quả so sánh trình tự amino acid của protein AACT ở sâm Ngọc Linh với một số loài thực vật khác đã được công bố trên GenBank - Phân lập, xác định trình tự và đánh giá biểu hiện của gen mã hóa acetoacetyl-CoA thiolase (AACT) ở sâm Ngọc Linh (Panax Vietnamensis ha et grushv.) — **Hình 3.** Kết quả so sánh trình tự amino acid của protein AACT ở sâm Ngọc Linh với một số loài thực vật khác đã được công bố trên GenBank (Trang 6)

phân tích bootstrap với 1000 vòng lặp (Hình 4) dựa trên vùng cDNA gen mã hóa AACT của sâm Ngọc Linh đã được xác định và các trình tự gen tương ứng ở một số loài đã được công bố trên GenBank - Phân lập, xác định trình tự và đánh giá biểu hiện của gen mã hóa acetoacetyl-CoA thiolase (AACT) ở sâm Ngọc Linh (Panax Vietnamensis ha et grushv.) — ph ân tích bootstrap với 1000 vòng lặp (Hình 4) dựa trên vùng cDNA gen mã hóa AACT của sâm Ngọc Linh đã được xác định và các trình tự gen tương ứng ở một số loài đã được công bố trên GenBank (Trang 7)

Hình 4. Cây phát sinh chủng loại được xây dựng dựa trên trình tự cDNA gen mã hóa AACT của sâm Ngọc Linh và các loài phân tích theo phương pháp Maximum-Likelihood - Phân lập, xác định trình tự và đánh giá biểu hiện của gen mã hóa acetoacetyl-CoA thiolase (AACT) ở sâm Ngọc Linh (Panax Vietnamensis ha et grushv.) — **Hình 4.** Cây phát sinh chủng loại được xây dựng dựa trên trình tự cDNA gen mã hóa AACT của sâm Ngọc Linh và các loài phân tích theo phương pháp Maximum-Likelihood (Trang 7)

Hình 5. Kết quả điện di sản phẩm real-time PCR gen mã hóa AACT và EF trên gel agarose 2% - Phân lập, xác định trình tự và đánh giá biểu hiện của gen mã hóa acetoacetyl-CoA thiolase (AACT) ở sâm Ngọc Linh (Panax Vietnamensis ha et grushv.) — **Hình 5.** Kết quả điện di sản phẩm real-time PCR gen mã hóa AACT và EF trên gel agarose 2% (Trang 8)

Hình 6. Sự biểu hiện gen mã hóa AACT ở lá và thân rễ sâm Ngọc Linh tại 4 độ tuổi. Dấu hoa thị chỉ ra sự khác biệt có ý nghĩa thống kê (p <0,05) theo kiểm định t-test - Phân lập, xác định trình tự và đánh giá biểu hiện của gen mã hóa acetoacetyl-CoA thiolase (AACT) ở sâm Ngọc Linh (Panax Vietnamensis ha et grushv.) — **Hình 6.** Sự biểu hiện gen mã hóa AACT ở lá và thân rễ sâm Ngọc Linh tại 4 độ tuổi. Dấu hoa thị chỉ ra sự khác biệt có ý nghĩa thống kê (p <0,05) theo kiểm định t-test (Trang 9)

TỪ KHÓA LIÊN QUAN