phản ứng xác định trình tự chuỗi nucleotide sequence
Xác định trình tự và phân tích gen mã hóa kháng nguyên HA của virus cúm chủng NIBRG-14 sử dụng trong sản xuất vacine cúm A/H5N1 tại Việt Nam
... trình phản ứng PCR cho giải trình tự trình bày phần phương pháp nghiên cứu Quá trình giải trình tự thực máy giải trình tự tự động ABI 3100 Sau giải trình tự gen mã hóa kháng ngun HA virus H5N1, trình ... đọc trình tự 38 3.5 Kết xác định trình tự Sử dụng DNA plasmit cho phản ứng PCR giải trình tự với việc sử dụng sinh phẩm BigDyeR Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit Applied Biosystems, quy trình ... tốc độ tối đa phút 27 2.2.10 Xác định trình tự gen máy tự động Nguyên tắc: Dựa nguyên tắc Sanger có sử dụng dideoxynucleotit Trong kỹ thuật xác định trình tự máy tự động, người ta khơng đánh...
Ngày tải lên: 27/10/2012, 11:12
Tách dòng và xác định trình tự gene kháng thể tái tổ hợp kháng tế bào lympho bệnh ung thư vú
... vị trí ( trình tự ) xác định Do đặc tính RE khả nhận biết cắt trình tự xác định phân tử DNA nên dựa vào khả này, người ta chia chúng làm ba loại: - Loại I: Khi enzyme nhận biết trình tự, di chuyển ... EcoRI ) Yêu cầu phản ứng cắt RE: - Mồi RE hoạt động tối ưu điều kiện phản ứng xác định, mặt dung dịch đệm Các dung dịch đệm dùng phản ứng RE thường khác nồng độ NaCl Do đó, phản ứng cần sử dùng ... ion vơ trùng 2.3.8 Xác định trình tự nucleic Trình tự DNA xác định phương pháp enzyme Sanger Cơ sở phương pháp: dựa vào tổng hợp mạch bổ sung với đoạn DNA mạch đơn cần xác định nhờ enzyme DNA-polmerase...
Ngày tải lên: 24/04/2013, 22:04
Tài liệu Báo cáo " Góp phần xác định mức độ quan hệ họ hàng giữa sa mộc trồng Cunninghamia lanceolata và sa mộc dầu Cunninghamia Konishii (họ hoàng đàn Cupressaceae) ở Việt Nam bằng phương pháp xác định trình tự 18s-rDNA " pdf
... using the 18S-rDNA sequence data DNA was exttacted from young leaves of inttoduced and cultivated Cunninghamia lanceolata and of native Cunninghamia konshiii The nucleotide sequence of 18S-rDNA ... muhiple sequence alignment aided by quality analysis tools Nucl Acids Res 25: 4876-4882 Thomas JD, Higgins DG, Gibson TJ (1994) CLASTALWimproving the sensitivity of progressive multiple sequence ... method for estimating evolutionary rate of base substitations through comparative stadies of nucleotide sequences J Mol Evol 16: 111-120 Lu SY, Chiang TY, Hong KH, Hu TW (1999) Reexamination of...
Ngày tải lên: 26/02/2014, 10:20
Báo cáo " Phân lập và xác định trình tự đoạn điều khiển của gen tổng hợp đường (Rsuc1 - promoter) từ các giống lúa Việt Nam " docx
Ngày tải lên: 11/03/2014, 08:20
BÁO CÁO KHOA HỌC: "TẠO DÒNG VÀ XÁC ĐỊNH TRÌNH TỰ ĐOẠN ADN ĐẶC HIỆU THUỘC GEN CRY1AB TỪ MỘT SỐ CHỦNG BACILLUS THURINGIENSIS KURSTAKI PHÂN LẬP Ở VIỆT NAM" doc
... Tuy nhiên để khẳng định cách chắn điều này, cần xác định trình tự đoạn ADN gắn vào vectơ II.4 Xác định trình tự nucleotid đoạn ADN đặc hiệu gen cry 1Ab Kết hình cho thấy: trình tự đoạn ADN đặc ... loại RNaza nồng độ 100g/ml I.4 Phân tích trình tự đoạn ADN đặc hiệu gen cry1Ab Sau tách chiết tinh vectơ tái tổ hợp từ tế bào chủ, gen xác định trình tự theo phương pháp enzim học Sanger nhờ ... Sanger nhờ kit Hãng Amersham-Pharmacia Biotech với máy xác định trình tự ADN tự động ALFExpress Hãng Pharmacia Phân tích kết tiến hành với chương trình PC/Gene II KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN: Chúng tiến...
Ngày tải lên: 26/07/2014, 14:21
xác định trình tự gen e6 và l1 của hpv và gen ebna-1 của ebv để ứng dụng trong chuẩn đoán ung thư cổ tử cung và vòm mũi họng
... giải trình trình tự xác định gen EBNA – EBV 60 3.2.1 Kết kiểm tra DNA tổng số từ mẫu bệnh phẩm 60 3.2.2 Kết thực phản ứng PCR 61 3.2.3 Kết giải trình tự thu nhận chuỗi ... DNA tái tổ hợp 47 2.4.5 Giải trình trình tự xử lý số liệu 48 CHƢƠNG 3: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 51 3.1 Kết thu nhận, giải trình trình tự xác định gen E6 HPV-16 L1 HPV-18 ... phần trình tự gen E6 mẫu PK12 (HPV-16) 54 Hình 3.5 Hình ảnh giản đồ (chromatogram) phần trình tự gen L1 mẫu PS16 (HPV18) 54 Hình 3.6 Trình bày chuỗi gen E6 typ HPV-16 55 Hình 3.7 Trình bày chuỗi...
Ngày tải lên: 05/10/2014, 06:35
Tuyển chọn, tách dòng và xác định trình tự gen cry1c mã hóa Protein tinh thể diệt côn trùng bộ cánh vảy từ vi khuẩn Bacillus thuringiensis subsp. aizawai phân lập từ một số mẫu đất tỉnh Thái Nguyên
... 2.3.8 Phương pháp xác định trình tự nucleotid đoạn gen tách dòng Trình tự nucleotid đoạn gen tách dòng xác định theo phương pháp tổng hợp Sanger cs [1], [12], [33] Thực phản ứng PCR ngồi thành ... dòng in vitro, không cần diện tế bào, nhằm mục đích thu nhận số lượng lớn trình tự DNA xác định [33] Thành phần phản ứng PCR: Thành phần Thể tích (µl) 10x PCR buffer included Mg++ µl 10mm dNTP ... thành phần phản ứng colony - PCR tương tự phản ứng khuếch đại gen cry1C với mồi đặc hiệu, khác chỗ DNA template thay lượng nhỏ sinh khối từ khuẩn lạc trắng sử dụng cặp mồi M13 - Chu trình nhiệt:...
Ngày tải lên: 15/11/2014, 22:24
Xác định trình tự gen tổng hợp isoflavone phân lập từ đậu tương
... tím 2.2.6 Phƣơng pháp xác định trình tự nucleotide Các mẫu plasmid mang gen quan tâm có kích thước phù hợp với lý thuyết sử dụng để giải trình tự máy xác định trình tự tự động ABI PRISM® 3100-Avant ... chất lượng số lượng để tiến hành đọc trình tự nucleotide gen IFS1 3.4 KẾT QUẢ GIẢI TRÌNH TỰ GEN Trình tự nucleotide gen IFS1 tách dòng đọc thiết bị giải trình tự tự động ABI PRISM® 3100-Avant Genetic ... ligase Trình tự gen quan tâm nối vào trình tự MCS (multiple cloning site) trình tự gen mã hóa enzyme β-galactosidase (lacZ) vector pBT Hỗn hợp phản ứng ghép nối ủ 370C 30 phút để phản ứng xảy...
Ngày tải lên: 02/11/2016, 08:53
Xác định trình tự gen E6 và L1 của HPV và gen EBNA-1 của EBV để ứng dụng trong chuẩn đoán ung thư cổ tử cung và vòm mũi họn
... giải trình trình tự xác định gen EBNA – EBV 60 3.2.1 Kết kiểm tra DNA tổng số từ mẫu bệnh phẩm 60 3.2.2 Kết thực phản ứng PCR 61 3.2.3 Kết giải trình tự thu nhận chuỗi ... DNA tái tổ hợp 47 2.4.5 Giải trình trình tự xử lý số liệu 48 CHƢƠNG 3: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 51 3.1 Kết thu nhận, giải trình trình tự xác định gen E6 HPV-16 L1 HPV-18 ... phần trình tự gen E6 mẫu PK12 (HPV-16) 54 Hình 3.5 Hình ảnh giản đồ (chromatogram) phần trình tự gen L1 mẫu PS16 (HPV18) 54 Hình 3.6 Trình bày chuỗi gen E6 typ HPV-16 55 Hình 3.7 Trình bày chuỗi...
Ngày tải lên: 16/04/2017, 19:57
Tuyển chọn, tách dòng và xác định trình tự gen cry1c mã hóa Protein tinh thể diệt côn trùng bộ cánh vảy từ vi khuẩn Bacillus thuringiensis subsp. aizawai phân lập từ một số mẫu đất tỉnh Thái Nguyên
... aizawai phương pháp PCR 43 3.2 Tách dòng đọc trình tự gen cry1C .44 3.2.1 Tách dòng gen cry1C 44 3.2.2 Xác định trình tự đoạn gen cry1C 49 KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ ... đại gen cry1C 31 2.3.7 Phương pháp tách dòng gen cry1C 31 2.3.8 Phương pháp xác định trình tự nucleotid đoạn gen tách dòng 34 2.4 Địa điểm nghiên cứu 35 Chƣơng KẾT QUẢ ... aizawai DNA Deoxyribonucleotide acid E coli Escherichia coli EDTA Ethylene diamine tetra- acetic acid OD Optical density- mật độ quang học PCR Polymerase chain reaction- phản ứng chuỗi 10 SDS Sodium...
Ngày tải lên: 21/04/2017, 14:04
Xác định trình tự nuclêôtit trên phân tử ADN hoặc ARN
... có trình tự nuclêơtit là: A - G - X - T - T - A - G - X - A Xác định trình tự ribơnuclêơtit tổng hợp từ đoạn gen Hướng dẫn giải tập Xác định trình tự nucleotit mạch gốc Xác định trình tự ... Lưu ý: Trình tự nuclêơtit mARN giống trình tự nuclêơtit mạch bổ sung (thay T U) Ví dụ 3: Phân tử mARN chứa đoạn mạch có trình tự nuclêơtit A- G - X - U - A - G - X - A Xác định trình tự nuclêơtit ... nucleotit mạch gốc Xác định trình tự nucleotit mạch ARN (theo nguyên tắc bổ sung) Theo NTBS: Các nuclêôtit gen liên kết với theo nguyên tắc A liên kết với T, G liên kết với X Trong q trình phiên mã...
Ngày tải lên: 10/09/2017, 23:24
Phương pháp xác định trình tự ADN
... Phương pháp xác định trình tự ADN •Là phương pháp dùng để xác định trình tự xếp nucleotides chuỗi đoạn DNA •Sử dụng phương pháp : Maxam-Gilbert (1977) Sanger (1977) Xác định trình tự tự động I.Phương ... hay 35S Chạy điện di để tách đoạn ADN tổng hợp phản ứng Điện di riêng rẽ kết phản ứng gel Làm phim phóng xạ tự ghi cho gel điện di đọc trình tự nucleotit điện di đồ mẫu từ cực âm gel lên cực ... tích Manual sequencing method III .Xác định trình t bng phng phỏp t ng Nguyên tắc chung giải trình tự gen tự động dựa theo sở phương pháp Sanger Nhưng : Quá trình tỉng hỵp AND thùc hiƯn nhê kú...
Ngày tải lên: 29/10/2012, 14:02
Phương pháp xác định trình tự axit nucleic bằng phương pháp của sanger
... dấu P32, S35 ddNTP - Chạy điện di để tách đoạn ADN tổng hợp lô phản ứng Điện di riêng rẽ kết phản ứng gel Tức điện di nhóm phản ứng phương pháp điện di gel polyacrylamid điều kiện biến tính để ... riêng biệt (ddATP, ddCTP, ddTTP) điện di khác Các băng ADN xác định nhờ việc gắn đồng vị phóng xạ vào mồi, ddNTP Dựa vào để đọc trình tự ADN Các bước tiến hành: - Cắt ADN enzyme cắt giới hạn, ... Ví dụ: Nếu ta thêm ddCTP vào hỗn hợp phản ứng tổng hợp ADN trình tổng hợp chỗi polipeptid dừng lại vị trí C Nếu thêm ddGTP vào hỗn hợp gặp ddGTP chuỗi polynucleotit dừng lại vị trí G + Điện...
Ngày tải lên: 29/10/2012, 14:41
Trình bày phương pháp xác định trinh tự axitnucleic bằng phương pháp hoá học của Maxam- Gilbert
... ATTGACTTAGCC C * ATTGA * ATTGACTTAG * ATTGACTTAGC * ATTGACTTAGCC ↓ điện di gel + chụp phóng xạ Trình tự AND: 5’ ATTGACTTAGCC 3’ ...
Ngày tải lên: 29/10/2012, 14:41
Xác định trình tự vùng ITS - rDNA của nấm Beauveria bassiana Vuille. ký sinh trên côn trùng gây hại
... đọc trình tự 2.4.1 Nguyên tắc phƣơng pháp đọc chuỗi mã Sanger Phương pháp đọc chuỗi mã Sanger dựa tổng hợp sợi DNA bổ sung sợi cần xác định trình tự Trong phản ứng tổng hợp sợi bổ sung, dideoxynucleotide ... với hai đầu trình tự DNA, phản ứng PCR nhân trình tự nằm hai primer (PCR thường dùng để nhân trình tự DNA có chiều dài khoảng 200-2000 bp) (Bùi Trang Việt, 2002) 2.3.3 Thành phần phản ứng PCR yếu ... hiệu đọc trình tự với primer ITS4 hồn tồn bị nhiễu Tín hiệu đọc trình tự với primer ITS5 thể tốt từ nucleotide thứ 67 đến nucleotide 475 Vì trình tự với primer ITS4 bị nhiễu nên trình tự cuối...
Ngày tải lên: 31/10/2012, 09:26
luận văn thạc sĩ sinh học :Tách phòng và xác định trình tự Nucleotit
... khử ion (3,5µl ) Tổng thể tích 10µl 2.3.10 Xác định trình tự so sánh trình tự gen thu đƣợc với trình tự tƣơng ứng GenBank Tách dòng xác định trình tự gen: Sản phẩm PCR đƣợc gắn vào vector tách ... PRISM 3100 Avant Genetic Analyzer 3.3 XÁC ĐỊNH TRÌNH TỰ NUCLEOTIT CỦA MỘT SỐ ĐOẠN TRONG GENOME CỦA RGSV Các trình tự RGSV thu đƣợc máy xác định trình tự tự động ABI PRISM® 3100 Avant Genetic ... Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn 41 trình tự đem so sánh với trình tự phân đoạn RGSV GenBank cao (96- 99%) Kết chứng tỏ hai trình tự trình tự phân đoạn RGSV Các trình tự thu đƣợc đƣợc đăng ký vào GenBank...
Ngày tải lên: 09/11/2012, 16:11
XÁC ĐỊNH TRÌNH TỰ NUCLEOTID VÙNG SIÊU BIẾN I Ở NGƯỜI VIỆT NAM
... ADN Xác định trình tự đoạn gen vùng siêu biến I ADN plasmit sau kiểm tra khẳng định gắn sản phẩm PCR gửi cho “BIOSERVICE UNIT”, Bangkok, Thailand để xác định trình tự Kết xác định trình tự nucleotid ... mẫu tóc chưa gửi xác định trình tự) sau: So sánh trình tự nucleotid sản phẩm PCR mà chúng tơi thu với trình tự vùng siêu biến mtADN Anderson, 1981 công bố thu kết sau: REF: Trình tự nucleotid vùng ... biến xác định trình tự Nhân đoạn gen vùng siêu biến tiến hành với cặp mồi LOOP460F/ LOOP460R chu trình nhiệt sau: 940C-3 phút 35 chu kỳ ( 940C-30 giây, 560C-1 phút, 680C-1 phút 30 giây), ổn định...
Ngày tải lên: 07/09/2013, 16:10
Phương pháp xác định trình tự của acid nucleic
... hai trình tự chuyên biệt, trình tự nằm mặt cần xác định trình tự mạch nào, trước hết người ta tách rời hai mạch (biến tính NaOH) sử dụng mồi bắt cặp với trình tự chun biệt nằm mạch Phản ứng tổng ... dideoxynucleotide sử dụng vào phản ứng tổng hợp oligonucleotide; tổng hợp oligonucleotide ngùng lại Tính xác suất phân đoạn có mặt tất cỡ oligonucleotide ứng với tất nucleotide loại diện ADN VD : trình ... pháp sử dụng dideoxynucleotide.Phương pháp sử dụng vùng cần xác định trình tư biết trước ; ứng dụng chủ yếu dùng phát nhah đột biến điểm Trước hết đoạn DNA cần xác định trình tự khuyếch đại phương...
Ngày tải lên: 06/11/2013, 05:15
