Khảo sát sự kháng sinh của các vi khuẩn gram âm đường ruột thường gặp trong các bệnh viện sinh SEBL

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC SƯ PHẠM TP HỒ CHÍ MINH Nguyễn Thị Yến Chi KHẢO SÁT SỰ KHÁNG KHÁNG SINH CỦA CÁC VI KHUẨN GRAM ÂM ĐƯỜNG RUỘT THƯỜNG GẶP TRONG BỆNH VIỆN SINH ESBL LUẬN VĂN THẠC SĨ SINH HỌC Thành phố Hồ Chí Minh – năm 2011 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC SƯ PHẠM TP HỒ CHÍ MINH Nguyễn Thị Yến Chi KHẢO SÁT SỰ KHÁNG KHÁNG SINH CỦA CÁC VI KHUẨN GRAM ÂM ĐƯỜNG RUỘT THƯỜNG GẶP TRONG BỆNH VIỆN SINH ESBL Chuyên ngành: Vi Sinh học Mã số: 60 42 40 LUẬN VĂN THẠC SĨ SINH HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC PGS – TS CAO MINH NGA ` Thành phố Hồ Chí Minh – năm 2011 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan công trình nghiên cứu riêng tơi Các số liệu kết nghiên cứu luận văn trung thực chưa cơng bố cơng trình khác Tác giả LỜI CẢM ƠN Tơi xin chân thành cám ơn hướng dẫn tận tình cô PGS - TS Cao Minh Nga suốt q trình làm luận văn Đồng thời, tơi xin chân thành cám ơn Ban chủ nhiệm Bộ môn, cán phịng thí nghiệm mơn Vi sinh trường Đại học Y Dược Thành phố Hồ Chí Minh hỗ trợ tích cực cho tơi việc thực nghiệm đề tài MỤC LỤC Chú thích chữ viết tắt Danh mục bảng Danh mục hình, biểu đồ MỞ ĐẦU T 3T Chương TỔNG QUAN TÀI LIỆU T T 1.1 Tổng quan vi khuẩn T 3T 1.1.1 Vi khuẩn T 3T 1.1.2 Trực khuẩn Gram âm T 3T 1.2 Các kháng sinh thuộc nhóm β-lactam T T 1.2.1 Phân loại kháng sinh thuộc nhóm β-lactam 10 T T 1.2.2 Cơ chế tác dụng 12 T 3T 1.3 Hiện tượng kháng kháng sinh 13 T T 1.3.1 Tổng quan 13 T 3T 1.3.2 Bản Chất di truyền phương thức truyền tải gen 14 T T 1.3.3 Cơ chế kháng kháng sinh vi khuẩn 15 T T Tổng quan ESBL 17 T 3T 1.4.1 Sơ lược β-lactamase 17 T T 1.4.2 ESBL 20 T 3T Chương ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 33 T T 2.1 Đối tượng nghiên cứu 33 T 3T 2.2 Phương pháp chọn mẫu 33 T 3T 2.3 Phương pháp tiến hành 33 T 3T 2.3.1 Vật liệu 33 T 3T 2.3.2 Thiết bị dụng cụ 34 T 3T 2.3.3 Quy trình thực 34 T 3T 2.4 Xử lý số liệu 37 T 3T Chương KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ THẢO LUẬN 38 T T 3.1 Tỉ lệ vi khuẩn đường ruột sinh ESBL 38 T T 3.2 Tỷ lệ chủng vi khuẩn Gram âm đường ruột thường gặp sinh ESBL 39 T T 3.3 Tỉ lệ kháng kháng sinh vi khuẩn Gram âm đường ruột thường gặp T sinh ESBL 42 3T 3.4 Tỷ lệ kháng kháng sinh vi khuẩn Gram âm đường ruột không sinh T ESBL 54 3T Chương KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 72 T T TÀI LIỆU THAM KHẢO 75 T PHỤ LỤC T 3T 3T DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT AN Amikacin AMC Amox - acid clavulanic AM Ampicillin ASTS Antibiotic Susceptibility Test Surveillance (Chương trình theo dõi nhạy cảm kháng sinh) ATM Aztreonam BHI Brain - Heart Infusion Agar (Thạch tim - óc hầm) CZ Cefazolin FEP Cefepime CFP Cefoperazone CCTX Cefotaxime-acid clavulanic FOX Cefoxitin CAZ Ceftazidime CCAZ Ceftazidime – acid clavulanic CTX Ceftotaxime CRO Ceftriaxone CXM Cefuroxime CIP Ciprofloxacin CTI Citrate CLSI Clinical and Laboratory Standards Institute (Viện chuẩn mực lâm sàng xét nghiệm) C Cloramphenicol EMB Eosin Methylene Blue Agar ESBL Extended – Spectrum Beta Lactamase GM Getamicin G Glucose IPM Imipenem IND Indol LVX Levofloxacin LYS Lysine MC Mac Conkey Agar (Thạch Mac Conkey) MEM Meropenem MR Methyl Red MIC Minimum Inhibitory Concentration (Nồng độ ức chế tối thiểu) MOT Motility (Di động) MHA Mueller Hinton Agar (Thạch Mueller Hinton) NCCLS National Committee for Clinical Laboratory Standards NET Neltimicin FT Nitrofurantoin NOR Norffloxacin NA Nutrien Agar (Môi trường dinh dưỡng) PAD Phenylalanine Deaminase TZP Piperacillin-tazobactam Tg Tác giả TE Tetracyline Tp Thành phố TCC Ticarcilin acid clavuanic TM Tobramycin SXT Trimethoprim –sulfamethoxazole TSI Triple Suger Iron VKDR Vi khuẩn đường ruột VP Voges Proskauer DANH MỤC CÁC BẢNG Bảng 1.1 Tính chất sinh hóa số loại vi khuẩn đường ruột thường gặp U T T U Bảng 1.2 Các nhân kháng sinh thuộc nhóm β-lactam 10 U T T U Bảng 1.3 Cơ chế kháng thuốc vi khuẩn 17 U T T U Bảng 1.4 Xếp loại β-lactamase theo chức 18 U T T U Bảng 1.5 Các lớp ESBL 22 U T T U Bảng 1.6 Các type ESBLs CTX-M 24 U T T U Bảng 1.7 Các type ESBL- OXA 25 U T T U Bảng 1.8 Các loại ESBL khác 25 U T T U Bảng 1.9 Một số phương pháp phân tử xác định ESBL 29 U T T U Bảng 3.1 Tỉ lệ loại vi khuẩn đường ruột phân lập 38 U T T U Bảng 3.2 Tỉ lệ vi khuẩn Gram âm đường ruột thường gặp sinh ESBL 39 U T T U Bảng 3.3 Tỉ lệ kháng kháng sinh vi khuẩn Gram âm đường ruột thường gặp U T T U 42 Bảng 3.4 Tỉ lệ kháng kháng sinh loài vi khuẩn đường ruột thường gặp U T sinh ESBL 46 3T U Bảng So sánh tỉ lệ kháng kháng sinh E coli sinh ESBL với số tác giả U T nghiên cứu trước 48 3T U Bảng So sánh tỉ lệ kháng kháng sinh Klebsiella spp sinh ESBL với số U T tác giả nghiên cứu trước 53 3T U Bảng 3.7 So sánh tỉ lệ kháng kháng sinh vi khuẩn Gram âm đường ruột thường U T gặp không sinh ESBL với tác giả nghiên cứu trước 55 T U Bảng Tỉ lệ kháng kháng sinh loài vi khuẩn Gram âm đường ruột U T thường gặp không sinh ESBL 59 3T U Bảng 3.9 So sánh tỉ lệ kháng kháng sinh E coli không sinh ESBL với tác U T giả nghiên cứu trước 62 3T U Bảng 3.10 Tỉ lệ kháng kháng sinh vi khuẩn E coli sinh ESBL không sinh U T ESBL 63 3T U Bảng 11 So sánh tỉ lệ kháng kháng sinh vi khuẩn Klebsiella spp với tác U T giả nghiên cứu trước 68 3T U Bảng 3.12 So sánh tỉ lệ kháng kháng sinh vi khuẩn Klebsiella spp sinh ESBL U T không sinh ESBL 69 3T U 28 Bonnet R, Champs CD, Sirot D, Chanal C, Labia R, Sirot J,(1999), “Diversity of TEM mutants in Proteus mirabilis”, Antimicrob Agents Chemother, 43 :2671–2677 29 Bonnet R, Sampaio J L M, Chanal C, Sirot D, Champs C D, Viallard J L, Labia R, Sirot J (2000), “A novel class A extended-spectrum β-lactamase (BES-1) in Serratia marcescens isolated in Brazil”, Antimicrob Agents Chemother, 44:3061–3068 30 Bradford PA, Urban C, Jaiswal A, Mariano N, Rasmussen BA, Projan SJ, Rahal JJ, Bush K.(1995), “SHV-7, a novel cefotaxime-hydrolyzing β-lactamase, identified in Escherichia coli isolates from hospitalized nursing home patients”, Antimicrob Agents Chemother, 39 :899–905 31 Branger C, Lesimple A L, Bruneu B, Berry P, Lambert-Zechovsky N (1998), " Long-term investigation of the clonal dissemination of Klebsiella pneumoniae isolates producing extended-spectrum β-lactamases in a university hospital", J Med Microbiol, 47:210–209 32 Danel F, Hall L M C, Gur D, Livermore D M (1997), “OXA-15, an extendedspectrum variant of OXA-2 β-lactamase, isolated from a Pseudomonas aeruginosa strain”, Antimicrob Agents Chemother, 41:785–790 33 Danel F, Hall L M C, Gur D, Livermore D M (1998), “OXA-16, a further extended-spectrum variant of OXA-10 β-lactamase, from two Pseudomonas aeruginosa isolates”, Antimicrob Agente Chemother, 42:3117–3122 34 Danel F, Hall LMC, Gur D, Livermore D M (1995), “OXA-14, another extended-spectrum variant of OXA-10 (PSE-2) β-lactamase from Pseudomonas aeruginosa “, Antimicrob Agents Chemother, 1995; 39 :1881– 1884 35 Danel, F., L.M.C Hall, B.Duke, D Gur, and D.M Livermore (1999), “ OXA – 17, a futher extended – spectrum variant of OXA – 10 β-lactamase, isolated from Pseudomonas aeruginosa”, Antimicrob Agents Chemother, pp 1362 – 1366 36 Datta N, and P Kontomuchalou (1965), “Penicillinase synthesis controlled by infectious factors in Enterobacteriaceae” , Nature, 208: 239 – 244 37 Dennesen PJ et al (2001), “Resolution of infectious parameters after antimicrobial therapy in patients with ventilator – associated P pneumonia”, Am J Respire Crit Care Med, 161:1371 – 38 El Harrif-Heraud Z, Arpin C, Benliman S, Quentin C (1997), “Molecular epidemiology of a nosocomial outbreak due to SHV-4 producing strains of Citrobacter diversus”, J Clin Microbiol, 35 :2561–2567 39 George A Jacoby and Paulahan (1996), “Detection of Extended-Spectrum bLactamases in Clinical Isolates of Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli”, Journal of Clinical Microbiology, p 908–911 40 George A Jacoby (2009), “AmpC β-Lactamases” , American Society for Microbiology, 22 (1): 161-182 41 Hall L M C, Livermore D M, Gur D, Akova M, Akalin H E (1993), “OXA-11, an extended-spectrum variant of OXA-10 (PSE-2) β-lactamase from Pseudomonas aeruginosa”, Antimicrob Agents Chemother, 37:1637–1644 42 Ho P L, Tsang D N C, Que T L, Ho M, Yuen K Y (2000), “Comparison of screening methods for detection of extended-spectrum β-lactamases and their prevalence among Escherichia coli and Klebsiella species in Hong Kong”, APMIS, 108:237–240 43 Hsueh PR, TA Snyder, MJ DiNubile, et al (2006), “In vitro susceptibilities of aerobic and facultative Gram-negative bacilli isolated from patients with intra-abdominal infections in the Asia-Pacific region: 2004 results from SMART” , Int J Antimicrob Agents, 28:238-243 44 Huletsky A, Knox JR, Levesque R C.(1993), “Role of Ser-238 and Lys-240 in the hydrolysis of 3rd-generation cephalosporins by SHV-type betalactamases probed by site-directed mutagenesis and 3-dimensional modeling”, J Biol Chem, 268 :3690–3697 45 Jawetz, Melnick & Adelberg’s (2007), Medical Microbiology, 24th Edition, Mc Graw Hill Lange 46 Jones RN (2001), “Resistance patterns among nosocomial pathogens: trends over the past few years”, Chest, 119(suppl 2):397-404 47 K Bush (2007), “Extended-spectrum β-lactamases in North America, 1987– 2006”, Clinical Microbiology and Infection, 14:134 – 143 48 Kader AA K A (2004), “Prevalence of extended – spectrum beta – lactamase among multidrug resistance gram – negative isolates from a general hospital in Saudi Arabia” , Saudi Med, j25(5);570 - 49 Karen Bush, Grogre A Jacoby and Antone A Medeiros (1995), “A Functional Classification Scheme for β-lactamases and Its Correclation with Molecular Structure” , Antimicrobial agents and chemotherapy, pp 1211 – 1233 50 Kathleen Park Talaro, Arthur Talaro (2001), Foundations in Microbiology, 4th Edition, Mc Graw Hill 51 Katz O T, Peled N., Yagupsky P (2004), “Evaluation of current National Committee for Clinical Laboratory Standards guidelines for screeing and confirming extended – spectrum beta – lactamase production in isolates of Escherichia coli and Klebsiella spcies from bacteremia patients”, Eur J Ckin Microbiol Infect Dis, 23: 813 – 817 52 Kliebe, C., B A Nies, J F Meyer, R M Tolxdorff – Neutzling, and B Wiedemann (1985), “Evolution of plasmid – coded resistance to broad – spectrum cephalosporins”, Antimicrob Agents Chemother, pp 302 – 307 53 Knothe H, Shah P Kremery V et al (1983), "Transferable resistance to cefotaxime, cefoxitin, cefamandole and cefuroxime in clinical isolates of Klebsiella pneumoniae and Serratia marcescens", Infection, 11 (6): 315–7 54 Kumarasamy KK, Toleman MA, Walsh TR, et al (August 2010), "Emergence of a new antibiotic resistance mechanism in India, Pakistan, and the UK: a molecular, biological, and epidemiological study", Lancet Infect Dis , 10 (9): 597–602 55 Livermore D.M , (1995), “β-lactamases in laboratory and clinicial resistance”, Clin Microbiol, Rev., pp 557 – 584 56 Livermore D.M , Paterson D.L (1995), “ Pocket Guide to Extended – spectrum β-lactamases in resistance”, Current Medicine Group, pp 29 – 33 57 Luke F Chen, MBBS, FRACP (2009), “Klebsiella pneumoniae Carbapenemase: Extended-Spectrum beta-Lactamase Continues to Go Global” Medscape Infectious Diseases 58 Marchandin H, Carriere C, Sirot D, Jean-Pierre H, Darbas H, (1999) , “TEM-24 produced by four different species of Enterobacteriaceae , including Providencia rettgeri , in a single patient”, Antimicrob Agents Chemother, 43 :2069–2073 59 Matsumoto Y, Ikeda F, Kamimura T, Yokota Y, Mine Y (1998), “Novel plasmid-mediated β-lactamase from Escherichia coli that inactivates oxyimino-cephalosporins”, Antmicrob Agents Chemother, 32:1243–1246 60 Matsumoto Y, Inoue M (1999), “Characterization of SFO-1, a plasmidmediated inducible class A β-lactamase from Enterobacter cloacae”, Antimicrob Agents Chemother, 43:307–313 61 Medeiros, A A (1984), “β-lactamases “, Br Med Bull., pp 18 – 27 62 Medicalopaedia, “NDM-1 Gene: Bacteria says humans; “Its a WAR!” 63 Meyer K.S., C Urban, J A Eagan, B.J.Berger, J.J.Rahal (1993), "Nosocomial outbreak of Klebsiella infection resistant to late generation cephalosphorin", Ann Intern Med, (199), p.353 - 358 64 Michael Madigan, John Martinko (2000), Brock Biology of microorganisms, 9th Edition , Prentice Hall 65 Moland ES, Hanson ND, Black JA, Hossain A, Song W, Thomson KS (2001), “Prevalence of newer beta-lactamases in gram-negative clinical isolates collected in the United States from 2001 to 2002”, J Clin Microbiol, 44: 3318–3324 66 Morosini MI, Canton R, Martinez-Beltran J, Negri MC, Perez-Diaz JC, Baquero F, Blazquez J (1995), “New extended spectrum TEM-type β-lactamase from Salmonella enterica subsp enterica isolated in a nosocomial outbreak”, Antimicrob Agents Chemother, 39 :458–461 67 Mugnier P, Casin I, Bouthors A T, Collatz E (1998), “Novel OXA-10-derived extended-spectrum β-lactamases selected in vivo or in vitro”, Antimicrob Agents Chemother, 42:3113–3116 68 Mugnier P, Dubrous P, Casin I, Arlet G, Collatz E (1996), “ A TEM-derived extended-spectrum β-lactamase in Pseudomonas aeruginosa”, Antimicrob Agents Chemother, 40 :2488–2493 69 Mugnier P, Podglajen I, Goldstein F W, Collatz E (1998), “Carbapenems as inhibitors of OXA-13, a novel integron-encoded β-lactamase in Pseudomonas aeruginosa ”, Microbiology, 144:1021–1031 70 Murthy R (2001), “Implementation of strategies to control antimicrobial resistance” , Chest , 119(suppl 2):405-11 71 Naas T, Philippon L, Poirel L, Ronco E, Nordman P.(1999), “An SHV-derived extended-spectrum β-lactamase in Pseudomonas aeruginosa”, Antimicrob Agents Chemother, 43 :1281–1284 72 National Committee for Clinical Laboratory Standards (2000), “Methods for dilution antimicrobial susceptibility tests for bacteria that grow aerobically Approved standard M7–A5 and informational supplement M100–S10” Wayne, Pa: National Committee for Clinical Laboratory Standards 73 Nordman P, Ronco E, Naas T, Duport C, Michel-Briand Y, Labia R (1993), “Characterization of a novel extended-spectrum β-lactamase from Pseudomonas aeruginosa”, Antimicrob Agents Chemother, 37:962–969 74 Nordmann P, Cuzon G, Naas T (April 2009), "The real threat of Klebsiella pneumoniae carbapenemase-producing bacteria", Lancet Infect Dis, (4): 228–36 75 Pai H, Lyu S, Lee J H, Kim J, Kwon Y, Kim J-W, Choe K W (1999), “Survey of extended-spectrum β-lactamases in clinical isolates of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae: prevalence of TEM-52 in Korea”, J Clin Microbiol, 37:1758–1763 76 Palasubramaniam S., Parasakthi N (2001), “Comparision of three different methods for the presumptive detection of ESBL producing in ceftazidime resistant strains of K pneumoniae”, Malaysia J Pathol, 23(2): 73: 78 77 Paltzkill T, Thomson KS, Sanders CC, Moland ES, Huang W, Milligan T W (1995), “New variant of TEM-10 β-lactamase gene produced by a clinical isolate of Proteus mirabilis”, Antimicrob Agents Chemother, 39 :1199–1200 78 Panjarat Suntarasamit (2007), “Characterization of extended spectrum - βlactamase (ESBL) in E coli and K pneumoniae and their responsers to combinations of piperacillin/tazobactam plus amikacin or ciprofloxacin versus meropenem A thesis submitted in partial fulfillment of the requirements for the degree of master of scinece in pharmacy”, Mahidol University 79 Patricia A Bradford (2001), “Extended – spectrum β-lactamases in the 21th centrury characterization, epidemiology, and detection of this importan resistance threat”, Clinical Microbiology reveiw, Oct.2001, vol.14, p 933 – 951 American Society for Microbiology 80 Perilli M, Segatore B, Massis MRD, Riccio ML, Bianchi C, Zollo A, Rossolini GM, Amicosante G (2000), “TEM-72, a new extended-spectrum βlactamase detected in Proteus mirabilis and Morganella morganii in Italy”, Antimicrob Agents Chemother, 44 :2537–2539 81 Philippon L N, Naas T, Bouthors A-T, Barakett V, Nordmann P (1997) “OXA18, a class D clavulanic acid-inhibited extended-spectrum β-lactamase from Pseudomonas aeruginosa”, Antimicrob Agents Chemother, 41:2188–2195 82 Phuong, D.M (2009), Quality issues in resistance testing and data in Vietnam (Presentation in the 1st GARP's workshop) 83 Poirel L, Girlich D, Naas T, Nordmann P (2001) “OXA-28, an extendedspectrum variant of OXA-10, β-lactamase from Pseudomonas aeruginosa and its plasmid- and integron-located gene”, Antimicrob Agents Chemother, 45:447–453 84 Poirel L, Naas T, Guibert M, Chaibi E B, Labia R, Nordmann P (1999), “Molecular and biochemical characterization of VEB-1, a novel class A extended-spectrum β-lactamase encoded by an Escherichia coli integron gene”, Antimicrob Agents Chemother, 43:573–581 85 Prinarakis EE, Miriagou V, Tzelepi E, Gazouli M, Tzouvelekis L S (1997), “Emergence of an inhibitor-resistant β-lactamase (SHV-10) derived from an SHV-5 variant”, Antimicrob Agents Chemother, 41 :838–840 86 Rahal J J, Urban C, Horn D.(1998), “Class restriction of cephalosporin use to control total cephalosporin resistance in nosocomial Klebsiella”, JAMA, 280:1233–1237 87 Rasheed JK, Jay C, Metchock B, Berkowitz F, Weigel L, Crellin J, Steward C, Hill B, Medeiros AA, Tenover F C (1997), “Evolution of extended-spectrum β-lactam resistance (SHV-8) in a strain of Escherichia coli during multiple episodes of bacteremia”, Antimicrob Agents Chemother, 41 :647–653 88 Rosenau A, Cattier B, Gousset N, Harriau P, Philippon A, Quentin R (2000), “Capnocytophaga ochracea : characterization of a plasmid-encoded extended-spectrum TEM-17 β-lactamase in the phylum FlavobacterBacteroides” , Antimicrob Agents Chemother, 44 :760–762 89 Rossolini G M, Franceschini N, Lauretti L, Caravelli B, Riccio M L, Galleni M, Frère J-M, Amicosante G (1999), “Cloning of a Chryseobacterium (Flavobacterium) menigiosepticum chromosomal gene (blaACME) encoding an extended-spectrum class A β-lactamase related to the Bacteroides cephalosporinases and the VEB-1 and PER β-lactamases”, Antimicrob Agents Chemother, 43:2193–2199 90 Rybak MJ (2004), “Resistance to antimicrobial agents: an update” , Pharmacotherapy , 24(suppl 12):203-15 91 Silva J, Aguilar C, Ayala G, Estrada M A, Garza-Ramos U, Lara-Lemus R, Ledezma L (2000), “TLA-1: a new plasmid-mediated extended-spectrum βlactamase from Escherichia coli”, Antimicrob Agents Chemother, 44:997– 1003 92 Simonsen GS, Tapsall JW, Allegranzi B, Talbot EA, Lazzari S (2004), “The antimicrobial resistance containment and surveillance approach – a public health tool”, Bulletin of World Health Organization, 82:928-34 93 Sougakoff W, Goussard S, Courvalin P (1998), “The TEM-3 β-lactamase, which hydrolyzes broad-spectrum cephalosporins, is derived from the TEM2 penicillinase by two amino acid substitutions”, FEMS Microbiol Lett , 56 :343–348 94 Stephen Smith (September 13, 2010), "New drug-resistant 'superbug' arrives in Mass." , The Boston Globe 95 Tessier F, Arpin C, Allery A, Quentin C, (1998), “Molecular characterization of a TEM-21 β-lactamase in a clinical isolate of Morganella morganii” , Antimicrob Agents Chemother, 42 :2125–2127 96 Tzouvelekis LS, Bonomo R A (1999), “SHV-type β-lactamases”, Curr Pharm Des, :847–864 97 Van Cao Bao, T Lambert Duong Quynh Nhu, Huynh Kim Loan, Nguyen Kim Hoang, Quillanme Alrlet án Patrice Courvalin (2002), extended – spectrum betalactamases on “Distribution of clinical isolates of Enterobacteriaceae in Viet Nam”, Antimicrobial agents and chemotherapy, 46(12); 3739 – 3743 98 Vikas P Chaubey, Johann DD Pitout, Bruce Dalton, Terry Ross, Deirdre L Church, Daniel B Gregson andKevin B Laupland (2010), “Clinical outcome of empiric antimicrobial therapy of bacteremia due to extended-spectrum beta-lactamase producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae” , Chaubey et al BMC Research Notes, 3:116 99 Winokur PL, Canton R, Casellas JM, Legakis N (2001), “Variations in the prevalence of strains expressing an extended-spectrum beta-lactamase phenotype and characterization of isolates from Europe, the Americas, and the Western Pacific region”, Clin Infect Dis , 32 (suppl 2): S94–S103 100 Woodford N, et al (2006), “Wide geographic spread of diverse acquired AmpC beta-lactamases among Escherichia coli and Klebsiella spp in the UK and Ireland”, J Antimicrob Chemother 2006 Nov 101 Woodford N, Ward E, Kaufmann ME, et al.(2006) , "Molecular characterisation of Escherichia coli isolates producing CTX-M-15 extended-spectrum βlactamase (ESBL) in the United Kingdom", Health Protection Agency 102 Yagi T, Kruokawa H, Shibata N, Shibayama K, Arakawa Y (2000), “A preliminary survey of extended-spectrum β-lactamases (ESBLs) in clinical isolates of Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli in Japan”, FEMS Microbiol Lett, 184:53–56 103 Yan J-J, Wu S-M, Tsai S-H, Wu J-J, Su I-J, (2000), “Prevalence of SHV-12 among clinical isolates of Klebsiella pneumoniae producing extendedspectrum β-lactamases and identification of a novel AmpC enzyme (CMY-8) in southern Taiwan”, Antimicrob Agents Chemother, 44:1438–1442 104 Yoichi Hirakata, Junichi Matsuda (2005), “Regional variation in the prevalence of extended – spectrum β-lactamases- producing clinical isolates in Asia – Pacific region” , Diagnostic Microbiology and Infectious Diease, pp 323 – 329 Internet 105 http://vi.wikipedia.org/wiki/Vi_khu%E1%BA%A9n U T T U 106 http://www.tudienykhoa.net/e/583-escherichia-coli.html U T T U 107 http://vietsciences.free.fr/khaocuu/nguyenlandung/cacnhomvikhuanchuyeu4.htm U T T U 108 http://www.buzzle.com/articles/klebsiella-pneumoniae.html U T T U 109 http://en.wikipedia.org/wiki/Klebsiella_pneumoniae U T T U 110 http://en.wikipedia.org/wiki/Enterobacteriaceae U T T U 111 http://emedicine.medscape.com/article/219907-overview U T 112 http://www.klebsiellapneumoniae.net/ U T T U T U 113 http://www.merckmanuals.com/professional/sec14/ch170/ch170c.html U T T U 114 http://www.hpa.org.uk/Topics/InfectiousDiseases/InfectionsAZ/ESBLs/ U T T U PHỤ LỤC Các tiêu chuẩn giải thích đường kính vịng vơ khuẩn nồng độ ức chế tối thiểu B (MIC) tương quan vi khuẩn đường ruột Điều kiện thử nghiệm: Môi trường: Thạch Mueller - Hinton Nồng độ vi khuẩn: Tương đương 0,5 McFarland Ủ: 35 ± 2oC, 16 - 18 Chủng kiểm tra: E coli 25922 E coli 35218 (Dành cho hợp chất β-lactam/ chất ức chế β lactamase) Kháng sinh Đường kính vịng vơ MIC tương Nồng độ khuẩn đương đĩa kháng Trung sinh Kháng gian Nhạy Kháng Nhạy PENICILLIN Ampicillin 10 µg ≤ 13 14 - 16 ≥ 17 ≥ 32 ≤8 Mezlocillin 75 µg ≤ 17 18 - 20 ≥ 21 ≥ 128 ≤ 16 Piperacillin 100 µg ≤ 17 18 - 20 ≥ 21 ≥ 128 ≤ 16 Ticarcillin 75 µg ≤ 14 15 - 19 ≥ 20 ≥ 128 ≤ 16 Carbenicillin 100 µg ≤ 19 20 - 22 ≥ 23 ≥ 64 ≤ 16 Mecillinam 10 µg ≤ 11 12 - 14 ≥ 15 ≥ 32 ≤ 18 Hợp chất β-lactam/ chất ức chế β - lactamase Amoxicillin/clavulanic acid 20/10 µg ≤ 13 14 - 17 ≥ 18 ≥ 32/16 ≤ 8/4 Ampicillin- sulbactam 10/10 µg ≤ 11 12 - 14 ≥ 15 ≥ 32/16 ≤ 8/4 Piperacillin-tazobactam 100/10 µg ≤ 17 18 - 20 ≥ 21 ≥ 128/4 ≤ 16/4 75/10 µg ≤ 14 15 - 19 ≥ 20 ≥ 128/2 ≤ 16/2 Ticarcillin-clavulanic acid CEPHEMS (đường chích) bao gồm cephalosporin I, II, III, IV Cefazolin 30 µg ≤ 14 15 - 17 ≥ 18 ≥ 32 ≤8 Cephalothin 30 µg ≤ 14 15 - 17 ≥ 18 ≥ 32 ≤8 Cefamandole 30 µg ≤ 14 15 - 17 ≥ 18 ≥ 32 ≤8 Cefonicid 30 µg ≤ 14 15 - 17 ≥ 18 ≥ 32 ≤8 30 µg ≤ 14 15 - 17 ≥ 18 ≥ 32 ≤8 Cefepime 30 µg ≤ 14 15 - 17 ≥ 18 ≥ 32 ≤8 Cefmetazole 30 µg ≤ 12 13 - 15 ≥ 16 ≥ 64 ≤ 16 Cefoperazone 75 µg ≤ 15 16 - 20 ≥ 21 ≥ 64 ≤ 16 Cefotetan 30 µg ≤ 12 13 - 15 ≥ 16 ≥ 64 ≤ 16 Cefoxitin 30 µg ≤ 14 15 - 17 ≥ 18 ≥ 32 ≤8 Cefotaxime or 30 µg ≤ 14 15 - 22 ≥ 23 ≥ 64 ≤8 Ceftriaxone 30 µg ≤ 13 14 - 20 ≥ 21 ≥ 64 ≤8 Ceftizoxime 30 µg ≤ 14 15 - 19 ≥ 20 ≥ 32 ≤8 Ceftazidime 30 µg ≤ 14 15 - 17 ≥ 18 ≥ 32 ≤8 Moxalactam 30 µg ≤ 14 15 - 22 ≥ 23 ≥ 64 ≤8 Cefuroxime acetil (oral) 30 µg ≤ 14 15 - 22 ≥ 23 ≥ 32 ≤4 Loracarbef 31 µg ≤ 14 15 - 17 ≥ 18 ≥ 32 ≤8 Cefaclor 32 µg ≤ 14 15 - 17 ≥ 18 ≥ 32 ≤8 Cefdinir µg ≤ 16 17 - 19 ≥ 20 ≥4 ≤1 Cefixime µg ≤ 15 16 - 18 ≥ 19 ≥4 ≤1 Cefpodoxime 10 µg ≤ 17 18 - 20 ≥ 21 ≥8 ≤2 Cefprozil 30 µg ≤ 14 15 - 17 ≥ 18 ≥32 ≤8 Cefetamet 10 µg ≤ 14 15 - 17 ≥ 18 ≥16 ≤4 Ceftibuten 30 µg ≤ 17 18 - 20 ≥ 21 ≥32 ≤8 10 µg ≤ 15 16 - 18 ≥ 19 ≥8 ≤2 Cefuroxime sodium (parenteral) CEPHEMS (đường uống) CARBAPENEMS Ertapenem Imipenem 10 µg ≤ 13 14 - 15 ≥ 16 ≥16 ≤4 Meropenem 10 µg ≤ 13 14 - 15 ≥ 16 ≥16 ≤4 30 µg ≤ 15 16 - 21 ≥ 22 ≥32 ≤8 Gentamicin 10 µg ≤ 12 13 - 14 ≥ 15 ≥8 ≤4 Amikacin 30 µg ≤ 14 15 - 16 ≥ 17 ≥32 ≤ 16 Kanamycin 30 µg ≤ 13 14 - 17 ≥ 18 ≥25 ≤6 Netilmicin 30 µg ≤ 12 13 - 14 ≥ 15 ≥32 ≤ 12 Tobramycin 10 µg ≤ 12 13 - 14 ≥ 15 ≥8 ≤4 Streptomycin 11 µg ≤ 11 12 -14 ≥ 15 - - Tetracycline 30 µg ≤ 11 12 - 14 ≥ 15 ≥16 ≤4 Doxycycline 31 µg ≤ 10 11 - 13 ≥ 14 ≥16 ≤4 Minocycline 32 µg ≤ 12 13 - 15 ≥ 16 ≥16 ≤4 Ciprofloxacin µg ≤ 15 16 - 20 ≥ 21 ≥4 ≤1 Levofloxacin µg ≤ 13 14 - 16 ≥ 17 ≥8 ≤2 Gatifloxacin µg ≤ 14 15 - 17 ≥ 18 ≥8 ≤2 Gemifloxacin µg ≤ 15 16 - 19 ≥ 20 ≥1 ≤ 0.25 Lomefloxacin or 10 µg ≤ 18 19 - 21 ≥ 22 ≥8 ≤2 ofloxacin µg ≤ 12 13 - 15 ≥ 16 ≥8 ≤2 Norfloxacin 10 µg ≤ 12 13 - 16 ≥ 17 ≥ 16 ≤4 Enoxacin 10 µg ≤ 14 15 - 17 ≥ 18 ≥8 ≤2 Grepafloxacin µg ≤ 14 16 - 18 ≥ 19 ≥4 ≤1 Fleroxacin µg ≤ 15 14 - 18 ≥ 19 ≥8 ≤2 Cinoxacin 100 µg ≤ 14 15 - 18 ≥ 19 ≥ 64 ≤ 16 Nalidixic acid 30 µg ≤ 13 14 - 18 ≥ 19 ≥ 32 ≤8 MONOBACTAMS Aztreonam AMINOGLYCOSIDES TETRACYCLINES FLUOROQUINOLONES QUINOLONES CÁC CHẤT ỨC CHẾ CON ĐƯỜNG BIẾN DƯỠNG FOLATE Trimethoprim/ 1.25/23.75 Sulfamethoxazole µg 250 or Sulfonamides 300 µg Trimethoprim ≤ 10 11 - 15 ≥ 16 ≥ 8/152 ≤ 2/38 ≤ 12 13 - 16 ≥ 17 ≥ 350 ≤ 100 µg ≤ 10 11 - 15 ≥ 16 ≥ 16 ≤4 30 µg ≤ 12 13 - 17 ≥ 18 ≥ 32 ≤8 300 µg ≤ 14 15 - 16 ≥ 17 ≥ 128 ≤ 32 200 µg ≤ 12 13 - 15 ≥ 16 ≥ 256 ≤ 64 PHENICOLS Chloramphenicol NITROFURANTOINS Nitrofurantoin FOSFOMYCINS Fosfomycin Thử nghiệm xác định ESBL PHƯƠNG PHÁP THỬ NGHIỆM SÀNG LỌC THỬ NGHIỆM XÁC ĐỊNH Môi trường Mueller – Hinton Agar Mueller – Hinton Agar Với K pneumoniae, K oxytoca Ceftazidime 30 µg Nồng độ đĩa kháng sinh E coli Ceftazidime/ Clavulanic acid Cefpodoxime 10µg 30/10 µg Ceftazidime 30 µg Cefotaxime 30 µg Aztreonam 30 µg Cefotaxime /Clavulanic acid Cefotaxime 30 µg 30/10µg Ceftriaxone 30 µg (Thử nghiệm xác định đòi hỏi Với P mirabilis dùng loại kháng sinh Cefpodoxime 10µg Cefotaxime Ceftazidime 30 µg đơn kết hợp với Cefotaxime 30 µg Clavulanic acid) Ceftazidime (Sử dụng nhiều loại kháng sinh để sàng lọc làm tăng độ nhạy phát hiện) Nồng độ vi khuẩn Điều kiện ủ Tiêu chuẩn vòng ức chế Tiêu chuẩn vòng ức chế Thời gian ủ Với K pneumoniae, K oxytoca E coli Cefpodoxime ≤ 17mm Kết Ceftazidime ≤ 22mm Có gia tăng đường kính Aztreonam ≤ 27mm vòng ức chế ≥ 5mm thử Cefotaxime ≤ 27mm nghiệm kết hợp với Clavulanic Ceftriaxone ≤ 25mm acid, so với thử nghiệm Với P mirabilis đơn tức có ESBL Cefpodoxime ≤ 22mm ( Ví dụ: Ceftazidime =16 Ceftazidime ≤ 22mm Ceftazidime/ Clavulanic acid Cefotaxime ≤ 27mm =21) Với trị số đường kính vịng vơ khuẩn nói chứng tỏ vi khuẩn có sinh ESBL ... Khảo sát tỉ lệ chủng vi khuẩn Gram âm đường ruột thường gặp bệnh vi? ??n 175 - Khảo sát tỉ lệ vi khuẩn Gram âm đường ruột sinh ESBL - Khảo sát tình hình kháng kháng sinh vi khuẩn Chương TỔNG QUAN... lệ vi khuẩn đường ruột sinh ESBL 38 T T 3.2 Tỷ lệ chủng vi khuẩn Gram âm đường ruột thường gặp sinh ESBL 39 T T 3.3 Tỉ lệ kháng kháng sinh vi khuẩn Gram âm đường ruột thường gặp T sinh. .. tỉ lệ kháng thuốc vi khuẩn Đặc biệc vi khuẩn sinh ESBL Vì , đề tài ? ?Khảo sát kháng kháng sinh vi khuẩn Gram âm đường ruột thường gặp bệnh vi? ??n sinh ESBL “ nghiên cứu với mục tiêu: - Khảo sát tỉ