Nghiên cứu đặc tính sinh học và sinh học phân tử của chủng virus cường độc KTY PRRS 06 gây hội chứng rối loạn hô hấp và sinh sản ở lợn luận văn thạc sĩ nông nghiệp

HỌC VIỆN NƠNG NGHIỆP VIỆT NAM HỒNG THỊ THẢO NGHIÊN CỨU ĐẶC TÍNH SINH HỌC VÀ SINH HỌC PHÂN TỬ CỦA CHỦNG VIRUS CƯỜNG ĐỘC KTY-PRRS-06 GÂY HỘI CHỨNG RỐI LOẠN HÔ HẤP VÀ SINH SẢN Ở LỢN Ngành : Thú y Mã số : 60 64 01 01 Người hướng dẫn khoa học : PGS.TS Nguyễn Hữu Nam NHÀ XUẤT BẢN ĐẠI HỌC NÔNG NGHIỆP - 2016 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan, số liệu kết nghiên cứu luận văn trung thực chưa sử dụng để bảo vệ học vị Tôi xin cam đoan, giúp đỡ cho việc thực luận văn cám ơn thơng tin trích dẫn luận văn rõ nguồn gốc Hà Nội, ngày 10 tháng 11 năm 2016 Tác giả luận văn Hoàng Thị Thảo i LỜI CẢM ƠN Nhân dịp hoàn thành luận văn, cho phép tơi bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc đến Thầy, Cô giáo - người tận tình dạy dỗ, hướng dẫn giúp đỡ tơi suốt q trình tơi học tập Học viện Nông nghiệp Việt Nam thời gian thực luận văn Tôi xin bày tỏ lòng biết ơn chân thành đến PGS.TS Nguyễn Hữu Nam, người hướng dẫn khoa học, giúp đỡ nhiệt tình có trách nhiệm tơi q trình thực đề tài hồn thành luận văn Lời cảm ơn xin gửi tới Bộ môn Bệnh lý - Khoa Thú y - Học viện Nông nghiệp Việt Nam, anh, chị, em phịng Thí nghiệm trọng điểm CNSH Thú y - Khoa Thú y nơi thực đề tài tạo điều kiện để tơi hồn thành đề tài tốt Cuối tơi xin cảm ơn tới gia đình, bạn bè đồng nghiệp động viên, giúp đỡ tơi q trình hồn thành luận văn Hà Nội, ngày 10 tháng 11 năm 2016 Tác giả luận văn Hoàng Thị Thảo ii MỤC LỤC Lời cam đoan i Lời cảm ơn ii Mục lục iii Danh mục chữ viết tắt vi Danh mục bảng viii Danh mục hình ix Trích yếu luận văn x Thesis Abstract xi Phần Mở đầu 1.1 Tính cấp thiết đề tài 1.2 Mục đích nghiên cứu Phần Tổng quan tài liệu 2.1 Tình hình nghiên cứu Hội chứng rối loạn hô hấp sinh sản lợn 2.1.1 Tình hình dịch PRRS giới 2.1.2 Tình hình dịch PRRS Việt Nam 2.1.3 Những nghiên cứu dịch PRRS nước 2.1.4 Những nghiên cứu dịch PRRS Việt Nam 2.2 Virus gây Hội chứng rối loạn hô hấp sinh sản lợn (PRRSV) 2.2.1 Hình thái, cấu tạo virus PRRS 2.2.2 Phân loại virus PRRS 10 2.2.3 Khả gây bệnh virus PRRS 11 2.2.4 Sức đề kháng virus PRRS 11 2.2.5 Đặc tính ni cấy virus PRRS 12 2.3 Hội chứng rối loạn hô hấp sinh sản 12 2.3.1 Đặc điểm chung 12 2.3.2 Động vật cảm nhiễm 13 2.3.3 Chất chứa mầm bệnh 13 2.3.4 Cơ chế sinh bệnh phương thức truyền lây 13 2.3.5 Triệu chứng lâm sàng lợn mắc PRRS 15 iii 2.3.6 Bệnh tích lợn mắc PRRS 17 2.3.7 Các phương pháp chẩn đoán PRRS 18 2.3.8 Biện pháp phòng trị bệnh 19 Phần Vật liệu phương pháp nghiên cứu 21 3.1 Đối tượng, địa điểm thời gian nghiên cứu 21 3.1.1 Đối tượng nghiên cứu 21 3.1.2 Vật liệu nghiên cứu 21 3.1.3 Địa điểm nghiên cứu 22 3.1.4 Thời gian nghiên cứu 22 3.2 Nội dung nghiên cứu 22 3.2.1 Nghiên cứu số đặc tính sinh học chủng virus KTY-PRRS-06 qua 40 đời cấy chuyển môi trường tế bào Marc-145 22 3.2.2 Nghiên cứu số đặc tính sinh học phân tử chủng virus KTYPRRS-06 qua 40 đời cấy chuyển môi trường tế bào Marc-145 22 3.3 Phương pháp nghiên cứu 22 3.3.1 Nuôi cấy virus KTY-PRRS-06 môi trường tế bào Marc-145 22 3.3.2 Phương pháp xác định hiệu giá virus TCID50 24 3.3.3 Xác định đường cong sinh trưởng virus PRRS qua đời cấy chuyển 24 3.3.4 Phương pháp tách chiết RNA tổng số hệ gen virus PRRS 24 3.3.5 Phương pháp RT- PCR 25 3.3.6 Phương pháp giải trình tự Gen 27 3.3.7 Phương pháp đọc kết 28 Phần Kết thảo luận 29 4.1 Kết nghiên cứu chủng virus prrs nghiên cứu 29 4.1.1 Kết lựa chọn mẫu PRRS cho nghiên cứu 29 4.1.2 Kết kiểm tra khả tạp nhiễm với loại virus khác 32 4.2 Kết nghiên cứu số đặc tính sinh học chủng virus KTYPRRS-06 33 4.2.1 Kết xác định khả gây bệnh tích tế bào qua đời cấy chuyển 33 4.2.2 Kết xác định hiệu giá chủng virus KTY-PRRS-06 36 iv 4.3 Kết nghiên cứu số đặc tính sinh học phân tử chủng virus KTY-PRRS-06 39 4.3.1 Kết tách chiết RNA tổng số chủng virus KTY-PRRS-06 40 4.3.2 Kết giải trình tự đoạn ORF5 chủng virus KTY-PRRS-06 41 4.3.3 Kết nghiên cứu so sánh trình tự nucleotide qua đời cấy chuyển 43 4.3.4 Kết nghiên cứu so sánh trình tự axit amin virus KTY-PRRS-06 qua đời cấy chuyển 47 4.3.5 Kết xây dựng sinh học phân tử 50 Phần Kết luận kiến nghị 52 5.1 Kết luận 52 5.2 Kiến nghị 52 Tài liệu tham khảo 53 v DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT Từ viết tắt Chữ viết đầy đủ BED Blue Ear disease BLAST Basic Local Alignment Search Tool Bp Base pair CNSH Công nghệ sinh học CPE Cyto Pathogenic Effect DMEM Dulbecco,s Modified Eagle’s Medium DMSO Dimethylsulfoxide DNA Deoxynucleotide Acid dNTP Deoxynucleotide triphotphat EAV Equine Arteritis virus EDTA Ethylenediaminetetraacetic Acide ELISA Enzyme Linked Immunosortbent Assay FBS Fetal Bovine Serum FCS Fetal Calf Serum GP Glycoprotein IFA Indirect Immunofluoresence Assay kDa Kilodalton LDHV Lactate Dehydlogenase – elevating virus Log Logarit (cơ số 10) MEGA5 Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 5.10 MOI Multiplicity Of Infection mRNA Acid Ribonucleic thông tin vi MSD Mistery Swine Disease OIE Tổ chức thú y giới ORF Open Reading Frame (khung đọc mở) PAM Pulmnary Alveolar Macrophage PBS Phosphate Buffer Saline PCR Polymerase Chain Reaction PEARS Porcine Endemic Abortion and Respiratory Syndrome PRRS Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome PRRSV Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome virus RNA Ribonucleic Acid RT- PCR Reverse Transcriptase-Polymerase Chain Reaction SHFV Simian Hemorrhaghic Fever Virus TCID50 Tissue Culture Infectious Dose 50 VNT Virus Neutralization Test vii DANH MỤC BẢNG Bảng 2.1 Protein cấu trúc PRRSV 10 Bảng 2.2 Sức đề kháng virus với điều kiện ngoại cảnh 11 Bảng 3.1 Thành phần thể tích cho phản ứng RT- PCR 25 Bảng 3.2 Các cặp mồi cho phản ứng RT- PCR 26 Bảng 3.3 Chu kỳ nhiệt độ cho phản ứng RT- PCR 26 Bảng 4.1 Mẫu lợn nghi mắc PRRS thu thập 29 Bảng 4.2 Kết chẩn đoán RT- PCR lợn nghi mắc PRRS 31 Bảng 4.3 Hồ sơ giống virus PRRS lựa chọn nghiên cứu 32 Bảng 4.4 Kết xác định có mặt virus PRRS, CSF, FMD, FED, TGE 32 Bảng 4.5 Kết xác định khả gây bệnh tích tế bào chủng virus KTYPRRS-06 qua đời cấy chuyển 33 Bảng 4.6 Hiệu giá chủng virus KTY-PRRS-06 thời điểm thu hoạch 37 Bảng 4.7 Hiệu giá chủng virus KTY-PRRS-06 qua đời cấy chuyển 38 Bảng 4.8 Sai khác vị trí nucleotide đời chủng KTY-PRRS-06 46 Bảng 4.9 So sánh tương đồng nucleotide virus KTY-PRRS-06 qua đời cấy chuyển 46 Bảng 4.10 Sai khác vị trí axit amin đời chủng KTY-PRRS-06 49 Bảng 4.11 So sánh tương đồng axit amin virus KTY-PRRS-06 đời cấy chuyển 49 viii DANH MỤC HÌNH Hình 2.1 Bản đồ lịch sử xuất PRRS giới Hình 2.2 Cấu trúc hạt PRRS virus Hình 2.3 Cấu trúc hệ gen virus PRRS Hình 2.4 Virus PRRS xâm nhập phá hủy tế bào đại thực bào 14 Hình 4.1 Tế bào Marc-145 chưa gây nhiễm virus 35 Hình 4.2 Bệnh tích tế bào sau 36 gây nhiễm 35 Hình 4.3 Bệnh tích tế bào sau 48 gây nhiễm 35 Hình 4.4 Bệnh tích tế bào sau 60 gây nhiễm 35 Hình 4.5 Bệnh tích tế bào sau 72 gây nhiễm 35 Hình 4.6 Đường cong sinh trưởng virus KTY-PRRS-06 37 Hình 4.7 Log10 hiệu giá chủng virus KTY-PRRS-06 39 Hình 4.8 Hình ảnh điện di kiểm tra sản phẩm tách chiết RNA tổng số 40 Hình 4.9 Kết phản ứng RT- PCR với mồi ORF5 41 Hình 4.10 Giản đồ giải trình tự tự động thành phần nucleotide đoạn gen ORF5 chủng KTY-PRRS-06 đời cấy chuyển thứ 10 43 Hình 4.11 So sánh trình tự nucleotide chủng KTY-PRRS-06 qua đời cấy chuyển 45 Hình 4.12 So sánh trình tự axit amin chủng KTY-PRRS-06 qua đời cấy chuyển 48 Hình 4.13 Cây sinh học phân tử chủng virus KTY-PRRS-06 51 ix Sản phẩm điện di cho vạch DNA tương ứng với 683bp theo thiết kế mồi Kết tạo DNA chủng KTY-PRRS-06 qua đời cấy chuyển thành công Như khẳng định xác có mặt virus PRRS mẫu nuôi cấy chuyển đời mơi trường tế bào Marc -145 Kết giải trình tự gen đời cấy chuyển Sau tiến hành kỹ thuật RT- PCR thu sản phẩm tiến hành tinh sản phẩm phản ứng RT- PCR Kit để loại bỏ hết thành phần dư thừa sau phản ứng Sản phẩm sau tinh DNA virus cloning với loại mồi đơn (mồi xuôi mồi ngược) để nhân nhanh số lượng theo chiều đoạn gene Tinh sản phẩm phản ứng PCR giải trình tự Kit cung cấp nhà sản xuất, sau tiến hành giải trình tự gene Quá trình giải trình tự thực nhờ vào máy giải trình tự Beckman coulter CEQ 8000 Mỹ phịng Thí nghiệm trọng điểm CNSH Thú Y - Khoa Thú Y Kết biểu thị chương trình Geneetyx trình bày minh họa hình 4.10 Qua hình 4.10 cho thấy chất lượng giải trình tự tương đối tốt, đỉnh màu giản đồ thể loại nucleotide, loại nucleotide khác tiếp nhận thuốc nhuộm huỳnh quang khác đọc tia laser cho hiển thị màu tương ứng Adenine cho màu đỏ, Thymine cho màu xanh, Guanine cho màu xanh cây, Cytosine cho màu đen Sau giải trình tự, chuỗi nucleotide thu xử lý phần mềm phân tích máy tính Sau phân tích chúng tơi thu tồn đoạn gen ORF5 chủng virus KTYPRRS-06 có độ dài 603bp Như việc tách chiết RNA tổng số, trình thực RT- PCR giải trình tự thực thành cơng Trình tự nucleotide đoạn gen ORF5 chủng qua đời nghiên cứu định 42 Hình 4.10 Giản đồ giải trình tự tự động thành phần nucleotide đoạn gen ORF5 chủng KTY-PRRS-06 đời cấy chuyển thứ 10 4.3.3 Kết nghiên cứu so sánh trình tự nucleotide qua đời cấy chuyển Để nghiên cứu đặc tính sinh học phân tử chủng virus KTY-PRRS06 Chúng tiến hành giải trình tự đoạn gen ORF5 chủng virus nghiên cứu đời cấy chuyển thứ 10, 20, 30, 40 để xác định tương đồng 43 nucleotide đời cấy chuyển, qua thấy cụ thể mức độ biến đổi thành phần, trật tự nucleotide biến đổi cấu trúc gen chủng virus KTY-PRRS-06 qua đời cấy chuyển Chuỗi gen mà chúng tơi tiến hành giải trình tự thành cơng có kích thước 603bp dùng làm chuỗi truy cập chương trình BLAST ngân hàng gen quốc tế nhằm tìm kiếm chuỗi đích đăng ký ngân hàng gen dựa vào mức độ tương ứng nucleotide Kết so sánh trình tự nucleotide chủng qua đời nghiên cứu xử lý phần mềm Genetyx thể hình 4.11 44 Hình 4.11 So sánh trình tự nucleotide chủng KTY-PRRS-06 đời cấy chuyển Qua hình 4.11 thấy thành phần nucleotide đời cấy chuyển chủng virus khơng có thay đổi có thay đổi khơng đáng kể khác từ đến nucleotide, cụ thể sau: - Đời P0 đời P10 có trình tự nucleotide giống - Đời P20, P30 đời P40 có trình tự nucleotide giống Sự sai khác đời P0, P10 so với đời P20, đời P30 đời P40 tổng hợp bảng 4.8 45 Bảng 4.8 Sai khác vị trí nucleotide đời chủng KTY-PRRS-06 STT Vị trí sai khác P0 P10 P20 P30 P40 97 A A G G G 135 A A G G G 168 A A G G G 177 A A T T T 280 C C G G G 287 G G T T T 351 A A G G G 405 T T C C C 490 G G A A A 10 519 C C G G G 11 587 A A T T T Qua bảng 4.8 cho thấy, sai khác vị trí nucleotide 603 nucleotide theo thứ tự trình tự thu nhận chủng virus KTY-PRRS-06 đời P0 P10 so với đời P20, P30 P40 11 vị trí sau: 97 (A ↔ G); 135 (A ↔ G); 168 (A ↔ G); 177 (A ↔ T); 280 (C ↔ G); 287 (G ↔ T); 351 (A ↔ G); 405 (T ↔ C); 490 (G ↔ A); 519 (C ↔ G); 587 (A ↔ T) Từ kết giải trình tự đoạn gen ORF5 chủng PRRS nghiên cứu đời cấy chuyển tiến hành thu thập xử lý chương trình MEGA5 để so sánh mức độ tương đồng nucleotide đời cấy chuyển Kết thể bảng 4.9 Bảng 4.9 So sánh tương đồng nucleotide virus KTY-PRRS-06 đời cấy chuyển P0 - ORF5 P10 - ORF5 P20 - ORF5 P30 - ORF5 P0 - ORF5 100,00 P10 - ORF5 100,00 100,00 P20 - ORF5 98,15 98,15 100,00 P30 - ORF5 98,15 98,15 100,00 100,00 P40 - ORF5 98,15 98,15 100,00 100,00 46 P40 - ORF5 100,00 Qua bảng 4.9 cho thấy: - Mức độ tương đồng nucleotide đoạn gen ORF5 đời P0 P10 100%; đời P20, P30 P40 100% - Độ tương đồng nucleotide đoạn gen ORF5 đời P0 P10 so với đời P20, P30 P40 98,15% Như vậy, sau cấy chuyển qua 40 đời chủng virus KTY-PRRS06 tương đồng nucleotide đạt tỷ lệ cao 4.3.4 Kết nghiên cứu so sánh trình tự axit amin virus KTY-PRRS06 qua đời cấy chuyển Những sai khác trình tự nucleotide ba mã hóa dẫn đến sai khác thành phần axit amin (cứ nucleotide mã hóa cho axit amin - nucleotide gọi mã hóa) nhiên có thay đổi nucleotide mà không dẫn đến thay đổi axit amin số axit amin nhiều ba nucleotide mã hóa Chính vậy, đơi sai khác nucleotide lại không dẫn đến sai khác axit amin nên không làm thay đổi cấu trúc protein mã hóa gen Tuy nhiên, có sai khác nucleotide dẫn đến sai khác mã hóa hệ sai khác axit amin thay đổi tính chất protein tạo axit amin nguyên nhân phát sinh biến dị di truyền thay đổi tính gây bệnh virus Để nghiên cứu toàn diện đặc tính sinh học phân tử chủng virus KTY-PRRS-06 sau xác định trình tự nucleotide cần xác định tiếp thành phần axit amin đoạn gen để có kết xác biến đổi mức độ phân tử chủng virus KTY-PRRS-06 qua đời cấy chuyển Từ trình tự nucleotide đoạn gen thu được, tiến hành xác định trình tự axit amin đoạn gen ORF5 dựa mã vi khuẩn bậc thấp (Bacterial code) có ngân hàng gen so sánh trình tự axit amin chủng virus KTYPRRS-06 qua đời cấy chuyển Kết so sánh trình bày hình 4.12 47 Hình 4.12 So sánh trình tự axit amin chủng KTY-PRRS-06 đời cấy chuyển Qua hình 3.12 chúng tơi thấy trình tự axit amin đoạn gen ORF5 chủng virus KTY-PRRS-06 đời nghiên cứu có kích thước 200 axit amin Cũng giống với trình tự nucleotide, trình tự axit amin đoạn gen ORF5 chủng virus KTY-PRRS-06 đời P0 đời P10 giống nhau; đời P20, P30 P40 giống Sự sai khác diễn đời P0, P10 so với đời P20, P30, P40 thể bảng 4.10 48 Bảng 4.10 Sai khác vị trí axit amin đời chủng KTY-PRRS-06 STT Vị trí sai khác P0 P10 P20 P30 P40 33 N N D D D 59 K K N N N 94 P P A A A 96 G G V V V 164 G G R R R 196 Q Q L L L Qua bảng 4.10 chúng tơi thấy, sai khác trình tự axit amin chủng KTYPRRS-06 đời P0 P10 so với đời P20, P30 P40 vị trí gồm axit amin thứ 33 (N ↔ D); axit amin thứ 59 (K ↔ N); axit amin thứ 94 (P ↔ A); axit amin thứ 96 (G ↔ V); axit amin thứ 164 (G ↔ R); axit amin thứ 196 (Q ↔ L) Từ kết so sánh cho thấy thành phần axit amin đời cấy chuyển chủng virus khơng có thay đổi có thay đổi khơng đáng kể Kết giải trình tự đoạn gen ORF5 chủng virus KTY-PRRS-06 trình tự axit amin tương ứng xác định, thu thập sử dụng chương trình Genetyx để so sánh tỷ lệ đồng thành phần axit amin chủng v iru s KTY-PRRS-06 qua đời cấy chuyển Kết trình bày bảng 4.11 Bảng 4.11 So sánh tương đồng axit amin virus KTY-PRRS-06 đời cấy chuyển P0 - ORF5 P10 - ORF5 P20 - ORF5 P30 - ORF5 P40 - ORF5 P0 - ORF5 100,00 P10 - ORF5 100,00 100,00 P20 - ORF5 96,88 96,88 100,00 P30 - ORF5 96,88 96,88 100,00 100,00 P40 - ORF5 96,88 96,88 100,00 100,00 49 100,00 Qua bảng 4.11 cho thấy sau cấy chuyển qua 40 đời chủng virus KTY-PRRS-06 tương đồng axit amin đạt tỷ lệ cao Cụ thể, mức tương đồng trình tự axit amin đoạn gen ORF5 đời P0 P10 100%; đời P20, P30 P40 100%; đời P0 P10 so với đời P20, đời P30, đời P40 96,88% Tóm lại, từ kết phân tích thành phần nucleotide, axit amin so sánh đời cấy chuyển chủng virus nghiên cứu nhận thấy trình tự nucleotide axit amin đời cấy chuyển khơng có sai khác có sai khác khơng đáng kể Điều chứng tỏ chủng virus KTY-PRRS-06 có ổn định đặc tính di truyền đời cấy chuyển 4.3.5 Kết xây dựng sinh học phân tử Qua việc so sánh mức độ tương đồng nucleotide axit amin chủng virus PRRS phân lập chủng tham chiếu, tiến hành xây dựng sinh học phân tử để xác định nguồn gốc phát sinh chủng virus KTY-PRRS-06 Kết phân tích nguồn gốc phát sinh chủng PRRS nghiên cứu trình bày hình 4.13 Từ kết so sánh thành phần nucleotide axit amin chủng virus KTY-PRRS-06 Dựa chương trình ClustalW chúng tơi tiến hành xác định nguồn gốc phát sinh chủng PRRSV nghiên cứu để phân tích nguồn gốc phát sinh chủng PRRS nghiên cứu Kết phân tích nguồn gốc phát sinh cho thấy: Chủng virus KTY-PRRS-06 nằm nhánh phát sinh với chủng virus 374KTY, 352KTY, HTP0, nằm nhánh phát sinh khác với chủng 171KTY thuộc nhánh chủng virus PRRS Trung Quốc (GU980186) Chủng virus nghiên cứu không nằm nhánh phát sinh chủng virus Bắc Mỹ VR-2332 nhánh Châu Âu - Lelystad Điều phù hợp với kết nghiên cứu trước sai khác nucleotide axit amin chủng virus với Các chủng virus PRRS Singapore, Thái Lan đưa vào phả hệ Tuy nhiên, chúng không nằm nguồn gốc phát sinh với chủng virus KTY-PRRS-06 50 Như vậy, lập sơ đồ phả hệ phân tích nguồn gốc phát sinh nghiên cứu so sánh với số chủng khu vực giới dựa trình tự chuỗi gen ORF5 cho thấy Chủng virus KTY-PRRS-06 có nguồn gốc phát sinh với chủng PRRSV Trung Quốc, không nguồn gốc phát sinh với chủng VR-2332 EF488048China 171KTY 20 Vaccine GU980185 TRICHOTOMY 52 GU980186 33 HTP1TY 87 347KTY 86 24 352-KTY 26 KTY - PRRS - 06 GU980179China GU980182China 27 AF184212Sing 100 100 70 DQ489311Eur 96 100 Lelystad 50 AF176463USA 39 AF046869USA 100 100 AF176461USA 78 73 AF176348 VR-2332 46 AF066183 94 DQ056373Thailand Hình 4.13 Cây sinh học phân tử chủng virus KTY-PRRS-06 51 PHẦN KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 5.1 KẾT LUẬN Sau thời gian nghiên cứu Phòng thí nghiệm trọng điểm CNSH Thú y, chúng tơi thu số kết luận đặc tính sinh học sinh học phân tử chủng virus KTY-PRRS-06 sau: Đặc tính sinh học chủng virus KTY-PRRS-06 sau 40 đời cấy chuyển: 1.1 Khả gây bệnh tích tế bào chủng virus nghiên cứu có tính ổn định cao qua đời cấy chuyển môi trường Marc-145 1.2 Chủng virus PRRS có hiệu giá cao ổn định, có khả phát triển nhân lên tốt môi trường tế bào Marc-145 Hiệu giá virus thu cao thời điểm 72 sau gây nhiễm Đặc tính sinh học phân tử chủng virus KTY-PRRS-06 sau 40 đời cấy chuyển: 2.1 Xác định trình tự nucleotide đoạn gen ORF5 chủng virus sau đời cấy chuyển liên tục Đoạn gen ORF5 quy định kháng nguyên GP5 chủng virus KTY-PRRS-06 có kích thước 603 bp mã hóa cho 200 axit amin protein kháng nguyên GP5 2.2 Trình tự nucleotide axit amin đoạn gen ORF5 chủng nghiên cứu qua đời cấy chuyển môi trường tế bào Marc-145 ổn định, mức độ tương đồng nucleotide từ 98,15 % đến 100%; axit amin từ 96,88% đến 100% 5.2 KIẾN NGHỊ Để góp phần hồn thiện đề tài nghiên cứu chúng tơi có số kiến nghị sau: Triển khai thực đề tài phạm vi rộng nghiên cứu với nhiều chủng PRRS nhằm thu kết toàn diện hơn, đánh giá chủng gây bệnh chủ yếu nước ta Tiếp tục nghiên cứu để giải trình tự gen đoạn gen cịn lại virus PRRS tiến tới giải trình tự tồn hệ gen virus phát biến chủng để chế tạo vacin có hiệu phịng bệnh cao 52 TÀI LIỆU THAM KHẢO Tiếng Việt: Cục Thú Y (2007) Báo cáo Hội thảo khoa học phịng chống hội chứng Rối loạn hơ hấp sinh sản lợn ngày 21 tháng năm 2008, Hà Nội Cục Thú Y (2008) Báo cáo Hội thảo khoa học phịng chống hội chứng Rối loạn hơ hấp sinh sản lợn ngày 21 tháng năm 2008, Hà Nội Lê Văn Năm (2007) Kết khảo sát bước đầu biểu lâm sàng bệnh tích đại thể bệnh PRRS số địa phương thuộc đồng Bắc Bộ Việt Nam Hội thảo Hội chứng rối loạn hô hấp - sinh sản bệnh liên cầu khuẩn lợn ngày 11/10/2007 ĐH Nông Nghiệp Hà Nội Nguyễn Bá Hiên Huỳnh Thị Mỹ Lệ (2007) Một số hiểu biết virus gây hội chứng rối loạn hô hấp sinh sản lợn Hội thảo Hội chứng rối loạn hô hấp- sinh sản bệnh liên cầu khuẩn lợn ngày 11/10/2007 ĐH Nông Nghiệp Hà Nội Nguyễn Bá Hiên, Trần Xuân Hạnh, Phạm Quang Thái Hoàng Văn Năm (2011) Công nghệ chế tạo sử dụng văc xin Thú y Việt Nam Nhà xuất Nông nghiệp, Hà Nội Nguyễn Hữu Nam Nguyễn Thị Lan (2007) Hội chứng rối loạn sinh sản hô hấp, Hội thảo Hội chứng rối loạn hô hấp sinh sản bệnh liên cầu gây lợn tháng 10/2007 Trường Đại học Nông nghiệp Hà Nội Nguyễn Thị Hoa (2011) Nghiên cứu số đặc tính sinh học phân tử chủng virus gây hội chứng rối loạn hô hấp sinh sản (PRRS) phân lập vùng phụ cận Hà Nội Luận văn thạc sĩ nông nghiệp Trường Đại học Nông nghiệp Hà Nội Nguyễn Thị Lan (2011) Nghiên cứu số đặc tính sinh học phân tử chủng virus gây hội chứng rối loạn hô hấp sinh sản (PRRS) phân lập vùng phụ cận Hà Nội Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp Trường Đại học Nông nghiệp Hà Nội tr.79 Nguyễn Thị Lan Lương Quốc Hưng (2012) Nghiên cứu số đặc tính sinh học virus gây hội chứng rối loạn hô hấp sinh sản (PRRS) phân lập đàn lợn nuôi số tỉnh phía Bắc Việt Nam Tạp chí Khoa học Phát triển Nông thôn (2) tr 82 – 88 53 10 Lê Thị Toan, Nguyễn Thị Lan, Nguyễn Hữu Nam, Phạm Hồng Ngân Lê Văn Hùng (2016) Đặc tính sinh học chủng virus PRRS (KTY - PRRS - 05) phân lập Việt Nam qua đời cấy chuyển Tạp chí Nơng nghiệp Việt Nam 2016 tập 14 số tr 605 – 612 11 Nguyễn Thu Trang (2015) Khảo sát số đặc tính sinh học chủng vi rút nhược độc PRRS Hanvet1.VN Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp Học viện Nông nghiệp Việt Nam Tr 32 – 34 12 Nguyễn Văn Thanh (2007) Hội chứng rối loạn hô hấp sinh sản (PRRS) Hội thảo Hội chứng rối loạn hô hấp - sinh sản bệnh liên cầu khuẩn lợn ngày 11/10/2007 ĐH Nông Nghiệp Hà Nội 13 Phạm Ngọc Thạch Đàm Văn Phải (2007) Một số tiêu lâm sàng, tiêu máu lợn mắc hội chứng rối loạn hô hấp sinh sản (bệnh tai xanh) số đàn lợn tỉnh Hải Dương Hưng Yên Hội thảo Hội chứng rối loạn hô hấp - sinh sản bệnh liên cầu khuẩn lợn ngày 11/10/2007 ĐH Nông Nghiệp Hà Nội 14 Tô Long Thành Nguyễn Văn Long (2008) Kết chẩn đoán nghiên cứu gây hội chứng rối loạn sinh sản hô hấp lợn Việt Nam từ tháng 3/2007 đến 5/2008 Tạp chí KHKT Thú y 15 (5) Tr - 13 15 William T.Christianson and Han Soo Joo (2001) Hội chứng rối loạn hô hấp sinh sản lợn (Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome – PRRS) Tạp chí KHKT Thú y tập VIII - số – 2001 Tr 74 - 86 Tiếng Anh: 16 A A.Bưtner, B.Strandbygaard, K.J sứrencen, M.B Oleksiewicz and T Storgaard, (2000) Distinction between ìnfections with European and American/vaccin type PRRS virus after vaccination with a modified - live PRRS virus vaccin Vet.Ré (31) pp.72 - 72 17 Anette botner (1997) Diagnosis of PRRS, Veterinary Microbiology 55 pp.295 - 301 18 Benfield, D.A., Nelson, E., Collins, J.E., Harris, L., Goyal, S.M., Robison, D., Christianson, W.T., Morrison, R.B., Gorcyca, D., and Chladek, D (1992) Characterization of swine infertility and respiratory syndrome (SIRS) virus (isolate ATCC VR-2332) Journal of Veterinary Diagnostic Investigation 4.pp 127-133 54 19 Bush J.A., N.I berlin, W.N.Jensen, A.B bill, G.E Cart Wright and M.M Wintrobe (1995) Erythocyte life Span in Graving Swin as Determined by glycine J Exp.Med 20 Calvert Jay G, Slade David E, Shields Shelly L, Jolie Rika, Mannan Ramasamy M, Ankenbauer Robert G, Welch Siao-Kun W (2007) CD163 expression confers susceptibility to porcine reproductive and respiratory syndrome viruses Journal of virology 81 (14): 7371-9 doi:10.1128/JVI.00513-07 21 Collin JE, Benfield DA, Christianson ƯT, Harris L, Hennings JC, Shaw DP, Goyal SM, McCullough S, Morrison RB, Joo HS, Gorcyca D, Chladek D (1992) Isolation of swine infertility and respiratory syndrome virus (isolate ATCC VR - 2332) in North America and experimental reproduction of the disease in gnotobiotic pigs J Vet Diagn Invest Pp 17- 126 22 Eichhorn G and J.W Frost (1997) Study on the Suitability of Sow Colostrum for the Serological Diagnosis of Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome (PRRS) Journal of Veterinary Medicine Series B – Infectious Diseases and Veterinary Public Health 23 Joo Han Soo (1997) Low pathogenicity PRRS live virus vacxinnes and methods of preparation therepj 24 Kamakawaa A, HTV and Yamada S (2006) Vet Microbiol 118: 47 – 56 25 Kegong Tian, Xiuling Yu and Tiezhu Zhao (2007) Emergence of Fatal PRRSV Variants: Unparalleled Outbreaks of Atypical PRRS in China and Molecular Disection of the Unique Hall Mark 26 Kim, H.S., Kwang, J., Joo, H.S and Frey, M.L (1993) Enhanced replication of porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS) virus in a homogeneous subpopulation of MA-104 cell line Arch Virol 133 pp 477-483 27 Meulenberg, J.J.M., Hulst, M M., De Meijer, E J., Moonem, P L J M., Den besreten, A., De Kluyver, E P., Wensvoort, G., and Moormann and R J M (1993) Lelystad virus, the causative agent of porcine epidemic abortion and respiratory syndrome (PEARS) is related to LDV and EAV Virology 192.pp 62-74 28 Lan N.T., Yamaguchi, R., Kai, K., Uchida, K., Kato, A and Tateyam, S (2005) The growth profiles of three types of canine distemper virus on Vero cells 55 expressing canine signaling lymphocyte activation molecule Journal of veterinary medical science 67(5) pp 491-495 29 Lunney Joan K (2007) Advances in swine biomedical model genomics International journal of biological sciences (3).pp 179-84 30 Nelsen, C.J., Murtaugh, M.P., Faaberg and K.S (1999) Porcine reproductive and respiratory syndrome virus comparison: divergent evolution on two continents J Virol 73 (1).pp 270-80 31 Paton DJ and Brown IH (1991) Blue ear disease of pigs Vet Ree 128 pp.617 32 Rossow KD (1998) Porcine reproductive and respiratory syndrome, J Vet Pathol 35 pp.1-20 33 Segales.J, Piella J and Macro E (1998) Vet Rec 142 pp 483-486 34 Tian K, Yu, Zhao (2007) Emergence of fatal PRRS variants: unparalleled outbreaks of atypical PRRS in China and molecular dissection of the unique hallmark PLoS ONE (6), e526 doi: 10.137l/jouARNl Pone.0000526 35 Zimmerman JJ., Yoon, KJ., Willis RW And Swenson SL (1997) General overview of PRRSV: A perspective from the United States Veterinary Microbiology 55.pp 187- 196 56 ... Cây sinh học phân tử chủng virus KTY- PRRS- 06 51 ix TRÍCH YẾU LUẬN VĂN Tên tác giả: Hoàng Thị Thảo Tên luận văn: “ Nghiên cứu đặc tính sinh học sinh học phân tử chủng virus cường độc KTY- PRRS- 06. .. loạn hô hấp sinh sản lợn? ?? 1.2 MỤC ĐÍCH NGHIÊN CỨU Đánh giá ổn định số đặc tính sinh học sinh học phân tử chủng virus cường độc KTY- PRRS- 06 gây Hội chứng rối loạn hô hấp sinh sản lợn qua đời cấy... đàn lợn việc làm cần thiết Xuất phát từ yêu cầu thực tiễn, tiến hành thực đề tài: ? ?Nghiên cứu đặc tính sinh học sinh học phân tử chủng virus cường độc KTY- PRRS- 06 gây hội chứng rối loạn hô hấp sinh