Chẩn đoán lao phổi trẻ em gặp rất nhiều khó khăn do xét nghiệm đờm tìm vi khuẩn có tỉ lệ dương tính rất thấp, các dấu hiệu lâm sàng không đặc hiệu. Các phương pháp chẩn đoán hình ảnh như: XQ, CLVT, siêu âm ngực giữ một vai trò quan trọng trong chẩn đoán bệnh.