Thiết kế primer và xây dựng phương án thực hành tách dòng gen

BÁO CÁO THỰC HÀNH TIN SINH HỌC Nội dung : Bài : Khai thác sở liệu mạng Internet (NCBI) Bài : Khai thác ứng dụng chương trình phân tích liệu cấu trúc chuỗi Clustal Omega xây dựng phương án thiết kế mồi phục vụ tách dòng gen gen Bài : Thiết kế primer xây dựng phương án thực hành tách dòng Bài : khai thác sở liệu mạng Internet (NCBI) Yêu cầu : Nắm cơng cụ sở liệu NCBI tìm kiếm phần mềm tin sinh , tìm kiếm sách báo , tìm kiếm trình tự , tìm kiếm cấu trúc protein …Từ liên hệ đến cơng cụ tương tự sở liệu khác EMBL , … Nội dung thực hành : a, Tìm kiếm báo , cơng trình nghiên cứu sở liệu NCBI liên quan đến “ alpha globin ” b,Tìm kiếm trình tự nucleotide “alpha globin” Bài : Khai thác ứng dụng chương trình phân tích liệu cấu trúc chuỗi Clustal Omega Yêu cầu : Xác định quy luật vận động tương đối chuỗi kiểm tra ( vùng bảo thủ , vùng phân ly cấu trúc chúng ) , để từ dự đốn khai thác đặc tính vùng chuỗi phân tích Nội dung thực hành : Bài :Thiết kế primer cho PCR Yêu cầu : Sử dụng phần mềm thông dụng thiết kế mồi cho phản ứng PCR : primer3, primer blast,… Nội dung thực hành : a, Thiết kế mồi primer blast b, Xây dựng phương án thực hành tách dịng gen - Phân tích thơng tin cấu trúc gen : Truy cập sở liệu để thu thông tin cấu trúc chuỗi gen cần tách ( tạm gọi chuỗi khuôn ) Thông tin sử dụng làm sở để nghiên cứu thiết kế (hay lựa chọn ) đoạn mồi tương ứng - Nhân khuếc đại thu nhận gen : ni hoạt hóa chủng mang gen để thu sinh khối -> xử lý để tách thu DNA tế bào -> sử dụng đoạn mồi thiết kế tiến hành phản ứng PCR -> điện di tác tinh chế thu sản phẩm gen sau khuếch đại - Xác định cấu trúc gen tách dòng : gắn đoạn gen tách dòng vào vector mang thích hợp -> chèn vào tế bào chủ lựa chọn -> tiến hành lên men tách thu vector mang gen biểu -> áp dụng kĩ thuật thích hợp để xác định phân tích cấu trúc sản phẩm gen tách dịng ... thực hành : Bài :Thiết kế primer cho PCR Yêu cầu : Sử dụng phần mềm thông dụng thiết kế mồi cho phản ứng PCR : primer3 , primer blast,… Nội dung thực hành : a, Thiết kế mồi primer blast b, Xây. .. sản phẩm gen sau khuếch đại - Xác định cấu trúc gen tách dòng : gắn đoạn gen tách dòng vào vector mang thích hợp -> chèn vào tế bào chủ lựa chọn -> tiến hành lên men tách thu vector mang gen biểu... Thiết kế mồi primer blast b, Xây dựng phương án thực hành tách dịng gen - Phân tích thơng tin cấu trúc gen : Truy cập sở liệu để thu thông tin cấu trúc chuỗi gen cần tách ( tạm gọi chuỗi khuôn )