MỘT số đặc điểm DỊCH tễ học BỆNH NHIỄM TRÙNG ĐƯỜNG hô hấp cấp TÍNH NẶNG TRONG GIÁM sát TRỌNG điểm tại BỆNH VIỆN đa KHOA TỈNH KHÁNH hòa năm 2017 2018

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y HÀ NỘI BỘ Y TẾ ĐÀO THẾ ANH MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC BỆNH NHIỄM TRÙNG ĐƯỜNG HÔ HẤP CẤP TÍNH NẶNG TRONG GIÁM SÁT TRỌNG ĐIỂM TẠI BỆNH VIỆN ĐA KHOA TỈNH KHÁNH HÒA NĂM 2017 - 2018 LUẬN VĂN THẠC SĨ Y HỌC HÀ NỘI - 2019 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y HÀ NỘI BỘ Y TẾ LỜI CẢM ƠN Em xin chân thành cảm ơn Ban giám hiệu Trường Đại Học Y Hà Nội, Ban lãnh đạo viện Đào tạo Y học dự phòng Y tế cơng cộng, phòng quản lý đào tạo sau đại học Trường Đại Học Y Hà Nội, đặc biệt thầy cô Bộ môn Dịch tễ tạo điều kiện thuận lợi, động viên giúp đỡ để em hồn thành khóa luận Em vơ biết ơn sâu sắc Ban giám đốc Viện Pasteur Nha Trang tạo điều kiện cho em học tập nâng cao trình độ chuyên môn, rèn đức luyện tài chuẩn bị cho hành trang tương lai Với tất kính trọng biết ơn sâu sắc tới TS Lê Vĩnh Giang TS Viên Quang Mai, người thầy kính mến dạy dỗ trực tiếp hướng dẫn em hoàn thành luận văn tốt nghiệp thạc sĩ Em xin bày tỏ lòng biết ơn với thầy/cơ Viện Đào tạo Y học dự phòng Y tế cơng cộng Em xin cảm ơn quý đồng nghiệp khoa Dịch tễ khoa Vi rút Viện Pasteur Nha Trang, quý đồng nghiệp Văn phòng Trung tâm Dự phòng Kiểm soát bệnh tật Hoa Kỳ Việt Nam, Lãnh đạo cán bệnh viện đa khoa tỉnh Khánh Hòa tạo điều kiện thuận lợi cho em trình thu thập số liệu thực luận văn Hà Nội, ngày 28 tháng năm 2019 Học viên Đào Thế Anh LỜI CAM ĐOAN Tôi Đào Thế Anh, học viên cao học khóa 27 trường Đại học Y Hà Nội, chuyên ngành Y học dự phòng, xin cam đoan: Đây luận văn thân trực tiếp thực hướng dẫn Thầy Lê Vĩnh Giang Thầy Viên Quang Mai Cơng trình khơng trùng lặp với nghiên cứu khác công bố Việt Nam Các số liệu thông tin nghiên cứu hồn tồn xác, trung thực khách quan, xác nhận chấp thuận sở nơi nghiên cứu Tơi xin hồn tồn chịu trách nhiệm trước pháp luật cam kết Hà Nội, ngày 28 tháng năm 2019 Học viên Đào Thế Anh MỤC LỤC ĐẶT VẤN ĐỀ CHƯƠNG 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Tổng quan chung nhiễm trùng đường hơ hấp cấp tính .3 1.1.1 Định nghĩa ca bệnh 1.1.2 Tác nhân gây bệnh 1.1.3 Sự lưu hành tác nhân gây bệnh .4 1.1.4 Nguồn bệnh .6 1.1.5 Phương thức lây truyền 1.1.6 Tính cảm nhiễm miễn dịch 1.1.7 Sơ lược hệ thống giám sát SARI Việt Nam 1.2 Một số nghiên cứu giới Việt Nam đặc điểm dịch tễ lưu hành tác nhân vi rút gây nhiễm trùng đường hơ hấp cấp tính .11 1.2.1 Trên Thế giới 11 1.2.2 Tại Việt Nam 15 CHƯƠNG 2: ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU .19 2.1 Đối tượng nghiên cứu 19 2.1.1 Tiêu chuẩn lựa chọn đối tượng vào nghiên cứu 19 2.1.2 Tiêu chuẩn loại trừ 19 2.2 Địa điểm thời gian nghiên cứu .19 2.3 Phương pháp nghiên cứu .20 2.3.1 Thiết kế nghiên cứu .20 2.3.2 Cỡ mẫu 20 2.3.3 Phương pháp công cụ thu thập số liệu .20 2.4 Các biến số, số nghiên cứu 21 2.5 Xử lý số liệu 22 2.6 Sai số biện pháp hạn chế sai số 22 2.6.1 Sai số .22 2.6.2 Biện pháp hạn chế sai số .22 2.7 Vấn đề đạo đức nghiên cứu .22 CHƯƠNG 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 23 3.1 Phân bố số tác nhân vi rút phổ biến gây nhiễm trùng đường hô hấp cấp tính nặng giám sát trọng điểm bệnh viện đa khoa tỉnh Khánh Hòa năm 2017 - 2018 23 3.1.1 Tỷ lệ dương tính với tác nhân vi rút bệnh nhân SARI 23 3.1.2 Tỷ lệ đồng nhiễm tác nhân vi rút bệnh nhân SARI 24 3.1.3 Phân bố týp vi rút theo nhóm tuổi 26 3.1.4 Tỷ lệ dương tính với tác nhân vi rút đường hơ hấp theo giới .28 3.1.5 Phân bố týp vi rút theo thời gian .29 3.2 Một số đặc điểm dịch tễ học bệnh nhiễm trùng đường hơ hấp cấp tính nặng giám sát trọng điểm bệnh viện đa khoa tỉnh Khánh Hòa năm 2017 – 2018 31 3.2.1 Tỷ lệ bệnh nhân SARI nhập viện 31 3.2.2 Tỷ lệ tử vong SARI tổng số SARI nhập viện 31 3.2.3 Phân bố bệnh nhân SARI theo thời gian, địa điểm .32 3.2.4 Phân bố bệnh nhân SARI theo giới 33 3.2.5 Phân bố bệnh nhân SARI theo nhóm tuổi .34 3.2.6 Phân bố bệnh nhân SARI theo nghề nghiệp 34 3.2.7 Một số bệnh kèm theo bệnh nhân SARI 35 3.2.8 Tỷ lệ bệnh nhân SARI tiêm phòng vắc xin cúm 12 tháng 36 3.2.9 Tiền sử tiếp xúc bệnh nhân SARI vòng ngày trước khởi phát bệnh .37 CHƯƠNG 4: BÀN LUẬN 38 4.1 Phân bố số tác nhân vi rút phổ biến gây nhiễm trùng đường hô hấp cấp tính nặng giám sát trọng điểm bệnh viện đa khoa tỉnh Khánh Hòa năm 2017 - 2018 38 4.2 Một số đặc điểm dịch tễ học bệnh nhiễm trùng đường hơ hấp cấp tính nặng giám sát trọng điểm bệnh viện đa khoa tỉnh Khánh Hòa năm 2017 - 2018 43 KẾT LUẬN 47 KIẾN NGHỊ 49 TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT AdV Adenovirus ARI Acute Respiratory Infection Nhiễm trùng đường hơ hấp cấp tính BVĐK Bệnh viện đa khoa CDC Centers for Disease Control and Prevention Trung tâm Dự phòng Kiểm sốt bệnh tật Hoa Kỳ hMPV Human metapneumovirus ILI Influenza-like illness Hội chứng cúm NISS National Influenza Surveillance System Hệ thống giám sát cúm quốc gia RSV Respiratory Syncytial Virus Vi rút hợp bào đường hô hấp RV Rhinovirus SARI Severe Acute Respiratory Infection Nhiễm trùng đường hơ hấp cấp tính nặng PIV Parainfluenza Vi rút cúm WHO World Health Organization DANG MỤC BẢNG Bảng 1.1 Các vi rút thường gây nhiễm trùng hơ hấp cấp tính Bảng 3.2 Tỷ lệ dương tính với tác nhân vi rút bệnh nhân SARI .23 Bảng 3.3 Số lượng đồng nhiễm tác nhân vi rút bệnh nhân SARI 24 Bảng 3.4 Số lượng đồng nhiễm 3,4 tác nhân vi rút bệnh nhân SARI 24 Bảng 3.5 Phân bố týp vi rút theo nhóm tuổi 26 Bảng 3.6 So sánh tỷ lệ nhiễm tác nhân vi rút đường hô hấp hai nhóm tuổi = 15 tuổi 27 Bảng 3.7 Phân bố bệnh nhân SARI theo nghề nghiệp .34 Bảng 3.8 Phân bố bệnh nhân SARI theo tiền sử bệnh kèm theo 35 Bảng 3.9 So sánh tỷ lệ nhiễm tác nhân vi rút đường hơ hấp nhóm có bệnh mạn tính nhóm khơng có bệnh mạn tính 36 Bảng 3.10 Tiền sử tiếp xúc bệnh nhân SARI vòng ngày 37 DANH MỤC BIỂU ĐỒ Biểu đồ 3.1 Tỷ lệ dương tính với tác nhân vi rút đường hơ hấp theo giới 28 Biểu đồ 3.2 Phân bố tác nhân cúm theo thời gian 29 Biểu đồ 3.3 Phân bố số tác nhân cúm theo thời gian .29 Biểu đồ 3.4 Phân bố số tác nhân PIV1 - theo thời gian 30 Biểu đồ 3.5 Tỷ lệ bệnh nhân SARI nhập viện 31 Biểu đồ 3.6 Tỷ lệ SARI tử vong SARI nhập viện .31 Biểu đồ 3.7 Phân bố bệnh nhân SARI theo tuần 32 Biểu đồ 3.8 Phân bố bệnh nhân SARI theo địa điểm .33 Biểu đồ 3.9 Phân bố bệnh nhân SARI theo giới .33 Biểu đồ 3.10 Phân bố bệnh nhân SARI theo nhóm tuổi .34 Biểu đồ 3.11 Tỷ lệ bệnh nhân SARI tiêm phòng vắc xin cúm 36 ĐẶT VẤN ĐỀ Nhiễm trùng đường hô hấp cấp tính (ARIs) bệnh có tỷ lệ mắc tỷ lệ tử vong cao hàng đầu bệnh truyền nhiễm gây dịch toàn cầu, đặc biệt trẻ em tuổi; theo ước tính, giới có khoảng 20 - 30% trẻ em - 10% người lớn mắc viêm đường hơ hấp cấp tính hàng năm; trung bình khoảng 500 - 800 triệu người/năm, có khoảng triệu trường hợp nặng, 290.000 - 650.000 trường hợp tử vong ,, Bệnh thường vi rút gây như: influenza virus, Rhinoviruses, Enterovirus, Coronaviruses, Respiratory Syncytial Virus, Human Metapneumovirus, Parainfluenza Bệnh có khả lây lan nhanh chóng, trường hợp bệnh tản phát, dịch nhỏ địa phương, dẫn tới bùng phát đại dịch gây mối đe dọa nghiêm trọng sức khỏe cộng đồng kinh tế xã hội…, Lịch sử giới trải qua nhiều đại dịch cúm như: đại dịch cúm năm 1918 với 500 triệu người mắc (chiếm 1/3 dân số giới thời điểm đó) 50 triệu người tử vong, đại dịch cúm A/H1N1pdm09 năm 2009 214 quốc gia giới với 105.000 người tử vong ,…Đầu kỷ XXI, Việt Nam xảy nhiều vụ dịch vi rút đường hơ hấp như: hội chứng hơ hấp cấp tính nặng (SARS) năm 2003 với 63 trường hợp mắc, trường hợp tử vong 5/61 tỉnh/thành phố, cúm gia cầm A/H5N1 từ cuối năm 2005 đến tháng 9/2008 với 106 trường hợp mắc, 52 trường hợp tử vong, cúm lợn A/H1N1pdm09 năm 2009 với số ca mắc cúm lên tới 7.156 trường hợp (đến tháng 9/2009) , Theo báo cáo Cục Y tế dự phòng 10 năm trở lại đây, hàng năm ghi nhận hàng triệu trường hợp mắc cúm nước bệnh có tỷ lệ mắc đứng đầu bệnh truyền nhiễm, năm 2017 ghi nhận 659.608 trường hợp mắc, trường hợp tử vong Việc giám sát vi rút cúm tác nhân vi rút cúm gây nhiễm trùng đường hơ hấp cấp tính quan trọng việc theo dõi, đánh giá chiều hướng dịch bệnh, Phụ lục Bệnh viện:………………………………………………… BÁO CÁO TUẦN CỦA BỆNH VIỆN (Chuyển Viện VSDT/ Pasteur trước 16h00 ngày thứ Ba tuần kế tiếp) (Tuần………., từ thứ hai, ngày……/……./20… đến chủ nhật, ngày……./……./20……) TỔNG HỢP SỐ BỆNH NHÂN NHẬP VIỆN VÀ TỬ VONG Khoa Tổng số nhập viện theo khoa Nam STT Nữ Tổng số SARI nhập viện theo khoa Nam Nữ Tổng số SARI tử vong theo khoa Nam Nữ Tổng số tử vong nguyên nhân khác theo khoa Nam Nữ Tổng số lấy mẫu theo khoa Nam Nữ DANH SÁCH BỆNH NHÂN SARI ĐƯỢC LẤY MẪU Mã số SARI Họ tên bệnh nhân Tuổi Nam Nữ Ngày khởi phát Ngày nhập viện Ngày lấy mẫu 10 Ngày báo cáo: ……/……/20… Người làm báo cáo Phụ lục HƯỚNG DẪN LƯU TRỮ, XÉT NGHIỆM BỆNH PHẨM SARI Lưu trữ mẫu bệnh phẩm - Các dụng cụ môi trường dùng để vận chuyển, bảo quản mẫu cần tuân thủ nguyên tắc vô trùng thực hành vi sinh tốt - Các bệnh phẩm phải bảo quản nhiệt độ 2-8 oC vòng 72 sau lấy mẫu bệnh phẩm - Trường hợp phòng xét nghiệm Viện khu vực không tiến hành xét nghiệm mẫu bệnh phẩm vòng 72 sau lấy mẫu bảo quản mẫu tủ âm 70°C (-70oC) thấp - Các mẫu bệnh phẩm sau tách chiết vật liệu di truyền phải bảo quản tủ âm 70°C (-70°C) thấp Viện - Tất bệnh phẩm cần bảo quản tủ âm 70°C (-70 oC) thấp vòng năm sau làm xét nghiệm.Sau hủy mẫu phải tuân theo quy trình hủy mẫu lưu hồ sơ Quy trình xét nghiệm Mẫu bệnh phẩm Thực XN sàng lọc cúm A B phương pháp real-time RT-PCR Dương tính Âm tính Xét nghiệm phân tuýp cúm A phương pháp real-time RT-PCR (H1pdm 09, H3 H5*, H7N9*) Xét nghiệm tác nhân vi rút khác phương pháp real-time RT-PCR (RSV, hMPV; Parainfluenza 1,2,3; Adv, RV) Phụ lục HƯỚNG DẪN LẤY MẪU, BẢO QUẢN, VẬN CHUYỂN BỆNH PHẨM SARI Lấy mẫu Một mẫu bệnh phẩm hợp lệ bao gồm mẫu dịch ngoáy mũi dịch ngoáy họng bệnh nhân lấy thời điểm.Hai mẫu bảo quản ống đựng môi trường vận chuyển.Tuy nhiên, bệnh nhân thở máy phải đặt nội khí quản, lấy mẫu dịch nội khí quản thay hai bệnh phẩm Bệnh phẩm nên lấy sớm bệnh nhân vừa vào khoa tốt trước sử dụng loại thuốc (đặc biệt thuốc kháng vi rút) theo định bác sỹ khoa điều trị Lưu ý: Mã số bệnh nhân cung cấp phiếu điều tra trường hợp bệnh phải ghi vào phiếu yêu cầu xét nghiệm ống đựng bệnh phẩm Ngoài mã số bệnh nhân, ống đựng bệnh phẩm phải ghi thêm họ tên tuổi bệnh nhân, loại bệnh phẩm ngày lấy mẫu quy định theo tiêu chuẩn Bộ Y tế Thông tư 43/2011/TT-BYT ngày 05/12/2011 quy định chế độ quản lý mẫu bệnh phẩm bệnh truyền nhiễm 1.1.Dụng cụ lấy mẫu - Găng tay Dụng cụ đè lưỡi Khẩu trang Áo choàng y tế Tăm y tế làm sợi polyester sợi tơ (Khơng nên sử dụng tăm bơng có đầu làm cotton có cán cầm gỗ chúng ức chế phản ứng PCR) - Ống đựng bệnh phẩm có chứa mơi trường vận chuyển (VTM) - Túi chống thấm - Cồn sát trùng, bút ghi - Túi giữ lạnh/ đá khơ - Phích lạnh bảo quản mẫu - Dây nhựa mềm (đường kính 10 FG) để lấy dịch nội khí quản 1.2 Loại bệnh phẩm kỹ thuật lấy mẫu bệnh phẩm Trước tiến hành lấy mẫu cần điền đầy đủ thông tin họ tên, tuổi ngày lấy mẫu nhãn ống đựng mẫu Lấy đồng thời dịch ngoáy họng ngoáy mũi bệnh nhân a) Dịch ngoáy họng - Yêu cầu bệnh nhân há miệng to - Dùng dụng cụ đè nhẹ nhàng lưỡi bệnh nhân - Đưa tăm vào vùng hầu họng, miết xoay tròn nhẹ đến lần khu vực bên vùng Amiđan thành sau họng để lấy dịch tế bào vùng họng - Sau lấy bệnh phẩm, que tăm chuyển vào ống chứa 3ml môi trường vận chuyển (VTM UTM) để bảo quản Lưu ý, đầu tăm bơng phải nằm ngập hồn tồn mơi trường vận chuyển, que tăm dài ống đựng môi trường vận chuyển cần bẻ/cắt cán tăm cho phù hợp với độ dài ống nghiệm chứa môi trường vận chuyển Que lấy mẫu Amidan Miết vào bên amidan thành bên họng Hình 1: Lấy dịch ngoáy họng b) Dịch ngoáy mũi - Yêu cầu bệnh nhân ngồi yên, mặt ngửa, trẻ nhỏ phải có người lớn giữ - Người lấy bệnh phẩm nghiêng đầu bệnh nhân sau khoảng 70o, tay đỡ phía sau cổ bệnh nhân - Tay đưa nhẹ nhàng tăm vào mũi, vừa đẩy vừa xoay giúp tăm dễ dàng vào sâu khoảng ½ độ dài từ cánh mũi đến dái tai phía Lưu ý: chưa đạt độ sâu mà cảm thấy có lực cản rõ rút tăm thử lấy mũi bên Khi cảm thấy tăm chạm vào thành sau họng mũi dừng lại, xoay tròn từ từ rút tăm - Giữ tăm chỗ lấy mẫu vòng giây để đảm bảo dịch thấm tối đa - Từ từ xoay rút tăm - Đặt đầu tăm vào ống đựng bệnh phẩm có chứa mơi trường vận chuyển bẻ cán tăm bơng điểm đánh dấu để có độ dài phù hợp với độ dài ống nghiệm chứa môi trường vận chuyển Que tăm bơng sau lấy dịch ngốy mũi để chung vào ống môi trường chứa que tăm bơng lấy dịch ngốy họng - Đóng nắp, xiết chặt, bọc ngồi giấy parafin (nếu có) - Bảo quản mẫu điều kiện nhiệt độ 2-8oC trước chuyển phòng xét nghiệmcủa Viện Pasteur Nha Trang Nếu bệnh phẩm khơng vận chuyển đến phòng xét nghiệm Viện vòng 72 kể từ lấy mẫu, mẫu bệnh phẩm phải bảo quản âm 70°C (-70°C) sau phải giữ đơng q trình vận chuyển đến phòng xét nghiệm Lưu ý: Đối với trẻ nhỏ đặt ngồi đùi cha/mẹ, lưng trẻ đối diện với phía ngực cha mẹ Cha/mẹ cần ôm trẻ giữ chặt thể tay trẻ Yêu cầu cha/mẹ ngã đầu trẻ phía sau Que lấy mẫu Đưa tăm bơng vơ trùng vào thẳng phía sau bên mũi (khơng hướng lên trên), dọc theo sàn mũi tới khoang mũi hầu Hình 2: Lấy dịch ngốy mũi c) Dịch nội khí quản: - Chỉ áp dụng cho bệnh nhân thở máy đặt nội khí quản - Dùng ống hút dịch đặt theo đường nội khí quản, dùng bơm tiêm hút dịch nội khí quản theo đường ống đặt - Chuyển dịch nội khí quản vào ống nhựa chứa mơi trường vận chuyển vi rút - Đóng nắp ống, xiết chặt, bọc giấy paraffin (nếu có) bảo quản điều kiện nhiệt độ 2-8 oC trước chuyển phòng xét nghiệm Nếu bệnh phẩm khơng vận chuyển đến phòng xét nghiệm Viện vòng 72 kể từ lấy mẫu, mẫu bệnh phẩm phải bảo quản âm 70°C (-70°C) sau phải giữ đơng q trình vận chuyển đến phòng xét nghiệm Viện Pasteur Nha Trang Bảo quản, đóng gói, vận chuyển nhận mẫu 2.1 Bảo quản mẫu: - Các mẫu bệnh phẩm cần bảo quản nhiệt độ 2-8oC vòng 72 kể từ lấy mẫu đến tới phòng xét nghiệm Viện Pasteur Nha Trang Lưu ý: Nếu bệnh phẩm không vận chuyển đến phòng xét nghiệm Viện Pasteur Nha Trang vòng 72 kể từ lấy mẫu, mẫu bệnh phẩm phải bảo quản tủ âm 70°C (-70°C) sau phải bảo quản đơng q trình vận chuyển đến phòng xét nghiệm Viện 2.2 Đóng gói - Bệnh phẩm thu thập cho chẩn đốn tác nhân gây bệnh đóng gói theo nguyên tắc lớp quy định theo tiêu chuẩn Bộ Y tế Thông tư 43/2011/TT-BYT ngày 05/12/2011 quy định chế độ quản lý mẫu bệnh phẩm bệnh truyền nhiễm - Kiểm tra xem ống đựng mẫu bệnh phẩm nắp chặt hay chưa, bọc ống giấy paraffin (nếu có) giấy thấm, trường hợp để nhiều ống mẫu kiện hàng cần bọc giấy thấm quanh ống để tránh tiếp xúc - Đặt ống đựng mẫu bệnh phẩm túi chống thấm/ túi nylon hộp đựng có nắp đóng kín theo quy định - Đặt túi/hộp chứa ống đựng mẫu bệnh phẩm vào phích lạnh bảo quản mẫu thùng cứng - Bổ sung đủ túi /bình tích lạnh vào phích/thùng đựng mẫu để mẫu bảo quản nhiệt độ từ 2-8oC, suốt trình vận chuyển mẫu - Đối với mẫu lưu nhiệt độ -70oC, bổ sung đủ đá khơ túi /bình tích lạnh để mẫu đông bảo quản nhiệt độ -70 oC suốt trình vận chuyển mẫu (trong trường hợp dùng đá khơ lớp đóng gói ngồi cần có thơng khí; sử dụng bình tích lạnh phải đặt bình tích lạnh tủ lạnh âm sâu -70oC thấp trước sử dụng) - Phiếu yêu cầu xét nghiệm đặt túi chống thấm / túi nylon khác (không để chung phiếu với mẫu bệnh phẩm) đặt phích/thùng đựng mẫu có biểu tượng nguy hiểm sinh học (hazard) quy định WHO cho việc vận chuyển mẫu phẩm sinh học Mẫu bệnh phẩm Cho vào túi nylon Cho vào thùng vận chuyển Hình 3: Đóng gói bảo quản bệnh phẩm 2.3.Vận chuyển mẫu - Hàng tuần, mẫu bệnh phẩm cần gửi kèm Phiếu điều tra trường hợp bệnh (Phụ lục 4) Phiếu yêu cầu xét nghiệm (Phụ lục 2) phòng xét nghiệm Viện Pasteur Nha Trang - Mẫu bệnh phẩm phải bảo quản nhiệt độ từ 2-8°C (hoặc -70°C mẫu đơng) suốt q trình vận chuyển - Phiếu u cầu xét nghiệm (Phụ lục 2) phiếu điều tra trường hợp bệnh (Phụ lục 4) đính kèm với mẫu bệnh phẩm - Các sở gửi mẫu cần thơng báo cho phòng xét nghiệm khoảng thời gian dự kiến phòng xét nghiệm nhận bệnh phẩm để cán phòng xét nghiệm chuẩn bị cho việc nhận mẫu - Lựa chọn phương tiện, hình thức vận chuyển để đảm bảo thời gian vận chuyển ngắn nhất, phải đảm bảo điều kiện bảo quản mẫu suốt trình vận chuyển 2.4.Nhận mẫu Khi bệnh phẩm phiếu yêu cầu xét nghiệm (Phụ lục 2) chuyển đến phòng xét nghiệm Viện Pasteur Nha Trang, bên giao bên nhận phải ký xác nhận vào Sổ giao nhận bệnh phẩm Các mẫu bệnh phẩm không chấp nhận có vấn đề sau: - Có tượng rò rỉ bệnh phẩm; - Khơng đủ lượng bệnh phẩm yêu cầu; - Loại bệnh phẩm không phù hợp; - Ống đựng bệnh phẩm khơng có mơi trường vận chuyển; - Ống đựng bệnh phẩm chứa môi trường vận chuyển hết hạn sử dụng; - Nhiệt độ phích lạnh khơng đảm bảo u cầu; - Bệnh phẩm bảo quản nhiệt độ 2-8oC chuyển đến phòng xét nghiệm Viện Pasteur Nha Trang 72 sau lấy mẫu; - Thông tin bệnh nhân (tên, mã số bệnh nhân, tuổi…) hoặc/và thời gian thu thập mẫu ống đựng mẫu bị không trùng với phiếu yêu cầu xét nghiệm Phụ lục CÁC BIẾN SỐ, CHỈ SỐ TRONG NGHIÊN CỨU Định Biến số nghĩa /phân loại Phương Chỉ số pháp thu Cơng cụ Cách tính số thập Mô tả phân bố số tác nhân vi rút phổ biến gây nhiễm trùng đường hô hấp cấp tính nặng giám sát trọng điểm bệnh viện đa khoa tỉnh Khánh Hòa năm 2017 -2018 Định Biến số nghĩa /phân loại Phương Chỉ số pháp thu Cơng cụ Cách tính số thập Tỷ lệ dương Thu thập Cơng cụ = số dương tính tính, tỷ lệ mẫu, xét thu thập với chủng vi đồng nhiễm nghiệm mẫu: rút/Số ca SARI tác nhân vi theo Bơm kim xét nghiệm x 100 rút phương tiêm, lọ bệnh nhân pháp đựng SARI real-time RT-PCR mẫu, vật tư tiêu hao Tác nhân gây bệnh Tỷ lệ dương = số dương tính tính với với chủng vi tác rút theo nhóm nhân vi rút tuổi/ Số dương bệnh nhân tính SARI theo chủng vi rút x nhóm tuổi Tỷ lệ dương 100 = số dương tính tính với với chủng vi tác nhân vi rút theo tháng theo rút theo thời gian Mô tả số đặc điểm dịch tễ học bệnh nhiễm trùng đường hơ hấp cấp tính nặng giám sát trọng điểm bệnh viện đa khoa tỉnh Khánh Hòa năm 2017 - 2018 SARI Tỷ lệ bệnh Sàng lọc Báo cáo = Số bệnh nhân nhập viện nhân SARI ca bệnh tuần SARI nhập viện SARI khoa giám sát/ tổng số bệnh Định Biến số nghĩa Phương Chỉ số /phân loại pháp thu Công cụ Cách tính số thập nhân nhập viện khoa SARI Sàng lọc Báo cáo = Số bệnh nhân nhân SARI ca bệnh tuần SARI tử vong tử vong SARI, tử vong Thời gian Giới Tỷ lệ bệnh Nam Nữ khoa giám số SARI SARI tử sát/tổng số bệnh nhập viện vong Số ca mắc Sàng lọc Báo cáo khoa giám sát = Số bệnh nhân SARI theo ca bệnh tuần SARI nhập viện tháng SARI tháng Tỷ lệ nam, Sàng lọc Báo cáo năm = Số ca SARI nữ ca bệnh tuần theo giới tính/số tổng số ca SARI nhân SARI ca SARI SARI nhập thời gian x viện, SARI 100 lấy mẫu Tuổi Tuổi Phân bố dương lịch tuổi của bệnh bệnh nhân nhân SARI SARI Phỏng Phiếu vấn điều tra ca bệnh Định Biến số nghĩa Phương Chỉ số /phân loại tính pháp thu Cơng cụ Cách tính số thập = Số SARI theo tháng Tỷ lệ SARI nhóm (< tuổi), theo nhóm số ca SARI năm tuổi (%) thời gian x (≥ tuổi) Tỷ lệ SARI Phỏng Nghề theo nghề nghiệp vấn tuổi/tổng Phiếu 100 = Số SARI theo điều tra nghề nghiệp/tổng số ca SARI x 100 = Số SARI có nghiệp Tỷ lệ SARI Phỏng ca bệnh Phiếu theo bệnh vấn điều tra bệnh ca bệnh theo/tổng số ca lý kèm Bệnh lý lý kèm theo kèm theo (trước SARI khởi phát) thời gian x 100 Tiền sử tiêm vắc xin cúm Có Khơng Khơng rõ Tỷ lệ SARI Phỏng Phiếu = Số SARI có vấn điều tra tiêm phòng ca bệnh cúm/tổng số ca tiêm phòng vx cúm SARI trong 12 thời gian x 100 tháng Định Biến số nghĩa Phương Chỉ số pháp thu Công cụ Cách tính số Phiếu = Số SARI có điều tra tiền sử tiếp xúc ca bệnh với yếu tố nguy /phân loại Tiếp xúc Tỷ lệ thập Phỏng gần với tiền sử tiếp vấn người mắc xúc với tử số yếu tố cơ/tổng số ca vong nguy SARI bệnh bệnh nhân thời gian x 100 đường hô SARI hấp Tiền sử tiếp xúc vòng ngày Giết mổ, Tỷ lệ Phỏng Phiếu chăm sóc, tiền sử giết vấn điều tra tiếp xúc mổ, chăm với: sóc, tiếp - Lợn Gia cầm, chim - Động vật ăn cỏ: trâu, bò… xúc với số gia súc, gia cầm ca bệnh ... bố số tác nhân vi rút phổ biến gây nhiễm trùng đường hơ hấp cấp tính nặng giám sát trọng điểm bệnh viện đa khoa tỉnh Khánh Hòa năm 2017 - 2018 Mơ tả số đặc điểm dịch tễ học bệnh nhiễm trùng đường. .. chống dịch bệnh khu vực đề xuất đề tài nghiên cứu Một số đặc điểm dịch tễ học bệnh nhiễm trùng đường hơ hấp cấp tính nặng giám sát trọng điểm bệnh viện đa khoa tỉnh Khánh Hòa năm 2017 - 2018 ... Khánh Hòa năm 2017 - 2018 38 4.2 Một số đặc điểm dịch tễ học bệnh nhiễm trùng đường hơ hấp cấp tính nặng giám sát trọng điểm bệnh viện đa khoa tỉnh Khánh Hòa năm 2017 - 2018 43