Escherichia coli (E. coli) được xem là một trong những vi khuẩn thường trú trong đường ruột của người và động vật, tuy nhiên một số nhómE. colilại có khả năng gây tiêu chảy nặng và gây bệnh ngoài bệnh đường ruột như viêm đường tiết niệu, nhiễm trùng máu, viêm màng não và viêm phổi ở trẻ sơ sinh. Trong chủngE. coli gây bệnh, có5 nhóm gây bệnh phổ biến và được nghiên cứu nhiều nhất chính là enterotoxigenic E. coli (ETEC), enteropathogenic E. coli (EPEC), enteroinvasive E. coli (EIEC), enteroaggregative E. coli (EAEC) và enterohemorhagic E. coli (EHEC). Trong số đó, EPEC, EAEC và ETEC gây bệnh chủ yếu ở các nước đang phát triển, EHEC gây bệnh chủ yếu ở các nước phát triển.