CÁC CHỦNG VI NẤM Candida spp. PHÂN LẬP TỪ ĐƯỜNG HÔ HẤP VÀ ĐƯỜNG TIẾT NIỆU CỦA CÁC BỆNH NHÂN NHẬP VIỆN TẠI BỆNH VIỆN BỆNH NHIỆT ĐỚI TP.HCM

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH KHOA CƠNG NGHỆ SINH HỌC ****************** KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP CÁC CHỦNG VI NẤM Candida spp PHÂN LẬP TỪ ĐƯỜNG HÔ HẤP VÀ ĐƯỜNG TIẾT NIỆU CỦA CÁC BỆNH NHÂN NHẬP VIỆN TẠI BỆNH VIỆN BỆNH NHIỆT ĐỚI TP.HCM Ngành học : CÔNG NGHỆ SINH HỌC Sinh viên thực : HỒ QUANG THẮNG Niên khóa : 2005 – 2009 Tháng 08/2009 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH KHOA CƠNG NGHỆ SINH HỌC ****************** KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP CÁC CHỦNG VI NẤM Candida spp PHÂN LẬP TỪ ĐƯỜNG HÔ HẤP VÀ ĐƯỜNG TIẾT NIỆU CỦA CÁC BỆNH NHÂN NHẬP VIỆN TẠI BỆNH VIỆN BỆNH NHIỆT ĐỚI TP.HCM Hướng dẫn khoa học Sinh viên thực TS.BS TRẦN PHỦ MẠNH SIÊU HỒ QUANG THẮNG Tháng 08/2009 LỜI CẢM ƠN Đây thời điểm đánh dấu kết thúc cho chặng đường học tập xuyên suốt năm qua bậc Đại học đồng thời mở chặng đường nhiều thách thức phía trước Để vượt qua khó khăn bên cạnh nỗ lực không ngừng thân em xin tri ân người hết lòng giúp đỡ thời khắc định quan trọng Xin cảm ơn Bố Mẹ sinh thành dưỡng dục Con suốt năm tháng qua với tình yêu thương ủng hộ Con theo đuổi ngành học công việc mà Con đam mê Cảm ơn thầy cô Bộ môn Công Nghệ Sinh Học Đại học Nông Lâm TP.HCM - người suốt năm liền dạy dỗ truyền đạt cho em kiến thức làm tảng cho việc học làm việc sau Em xin gửi lời cảm ơn thầy Nguyễn Văn Vĩnh Châu - BS.Trưởng khoa xét nghiệm Bệnh viện Bệnh Nhiệt Đới TP.HCM tạo điều kiện giúp đỡ em nhiều thời gian thực tập khoa Em xin gửi lời cảm ơn đến BS.Trần Phủ Mạnh Siêu tận tâm hướng dẫn truyền thụ cho em kiến thức lý thuyết lẫn kỹ thuật thực hành Em xin cảm ơn anh chị khoa xét nghiệm Bệnh viện Bệnh Nhiệt Đới TP.HCM tận tình giúp đỡ bảo cho em nhiều kinh nghiệm thời gian thực tập vừa qua iii TÓM TẮT Bệnh nhiễm vi nấm Candida spp phổ biến nước vùng nhiệt đới, có khí hậu nóng ẩm quanh năm, cộng đồng dân cư thiếu thốn điều kiện vệ sinh môi trường Chủng Candida spp vi nấm nội-hoại sinh người Khi gặp điều kiện thuận lợi địa phụ nữ có thai, tiểu đường, béo phì, suy dinh dưỡng, sử dụng loại kháng sinh, tình trạng suy giảm miễn dịch HIV/AIDS vi nấm chuyển từ trạng thái hoại sinh thành gây bệnh  Mục đích nghiên cứu đề tài tìm hiểu tình hình nhiễm nấm Candida spp gây bệnh nhân nhập viện Bệnh viện Bệnh Nhiệt đới TP Hồ Chí Minh chủng vi nấm Candida spp gây bệnh, tìm hiểu độ nhạy cảm với thuốc kháng nấm kháng nấm đồ phương pháp thực định danh chủng vi nấm Candida spp phân lập từ bệnh phẩm máu, dịch rửa phế quản, nước tiểu, phết họng, phết da; tính tỷ lệ dương tính với nấm Candida spp loại bệnh phẩm; thực kỹ thuật kháng nấm đồ chủng vi nấm phân lập để tìm hiểu độ nhạy cảm với thuốc kháng nấm sử dụng  Kết nghiên cứu cho thấy: (1) Bệnh nhiễm nấm vùng họng bệnh nhân HIV/AIDS chiếm tỷ lệ cao (66,67%), bệnh nhân không nhiễm HIV/AIDS chiếm tỷ lệ thấp (25,33%) Chủng vi nấm thường gặp Candida albicans (75%); (2) Bệnh nhiễm nấm đường tiểu bệnh nhân sử dụng kháng sinh, đặt ống sonde tiểu bệnh nhân tiểu đường chiếm tỷ cao Chủng thường gặp Candida albicans Candida tropicalis chiếm tỷ lệ tương đương (47, 83%) (3) Bệnh nhiễm nấm phổi bệnh nhân lớn tuổi đặt nội khí quản, đặt ống thở, người nghiện thuốc chiếm tỷ lệ cao Và chủng vi nấm thường gặp Candida albicans (80%) iv SUMMARY  Candidiasis are commonly found in tropical countries where the climate is hot and humid throughout the year Especially, that kind of diseases is spread among the poor sanitation communities Candida spp are both endosymbiont and exosymbiont fungus in human host In the endosymbiont state, Candida spp normal flora in the balance with other bacteria, therefore they can keep the bio-balance However, the fungus are able to activate into a pathogen in some special hosts such as pregnant women or those who are suffering from malnutrition, diabetes, antibiotic use, corticoid therapy and immunocompromised condition  This study is aimed to identify the prevalence of Candidiasis in inpatients admitted to Hospital of Tropital Diseases in Ho Chi Minh City as well as the pathogen species causing the disease and to find the sensitivity with antifungal drugs The content and method of this study is to identify the the prevalence of Candida spp isolated from blood, BAL, bronchial washings, urine, skin scraps and throat swab specimens, to identify Candida species isolated on each kind of specimens, to identify the sensitivity with common antifungal drugs  Research results show: (1) The throat fungal infection patients with HIV / AIDS accounts for high percentage (66.67%), patients not infected with HIV / AIDS accounts for a low rate (25.33%) Common fungal strain is Candida albicans (75%) (2) Tract fungal infections patients using antibiotics, put tubes sonde profile and patients with diabetes account for higher rates Common strains of Candida albicans and Candida tropicalis accounted equivalent rate (47, 83%) (3) Fungal lung disease patients older set internal airway, breathing tube placed, smokers account for high rates And a common fungal strains Candida albicans (80%) v MỤC LỤC LỜI CẢM ƠN iii TÓM TẮT iv SUMMARY .v DANH SÁCH CÁC CHỮ VIẾT TẮT ix DANH SÁCH CÁC BẢNG .x DANH SÁCH CÁC HÌNH .xi Chương MỞ ĐẦU .1 1.1 Đặt vấn đề 1.2 Mục tiêu nghiên cứu 1.3 Nội dung nghiên cứu .2 Chương TỔNG QUAN TÀI LIỆU .3 2.1 Giới thiệu vi nấm .3 2.1.1 Định nghĩa vi nấm 2.1.2 Phân loại vi nấm 2.1.3 Sự sinh sản vi nấm 2.1.3.1 Sinh sản hữu tính .4 2.1.3.2 Sinh sản vơ tính 2.2 Tổng quan vi nấm gây bệnh 2.2.1 Vi nấm da .5 2.2.2 Vi nấm nội tạng 2.2.3 Định nghĩa nấm hội 2.2.4 Nhiễm trùng hội người nhiễm HIV/AIDS .6 2.3 Tổng quan vi nấm Candida spp 2.3.1 Đặc điểm sinh vật học vi nấm Candida spp .6 2.3.2 Phân bố địa lý .9 2.3.3 Tính chất gây bệnh vi nấm Candida spp 10 2.3.4 Các bệnh nhiễm nấm Candida spp thường gặp 10 2.3.5 Những đối tượng dễ nhiễm nấm Candida spp 11 2.3.6 Tình hình nhiễm nấm Candida spp nghiên cứu gần 12 vi 2.4 Đặc điểm loại thuốc điều trị bệnh nấm 12 2.4.1 Amphotericin B (Fungizone) .12 2.4.2 Ketoconazole (Nizoral) 12 2.4.3 Nystatin 13 2.4.4 Fluconazole 13 2.4.5 5-Fluorocytosine 13 2.4.6 Clotrimazole .13 Chương VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 14 3.1 Vật liệu 14 3.1.1 API 20C AUX 14 3.1.2 Môi trường Sabouraud 16 3.1.3 Môi trường Chrom agar .16 3.1.4 Môi trường thạch bột ngô ( corn meal agar) 17 3.1.5 Chai cấy máu 17 3.1.6 Tăm vô trùng .17 3.1.7 Thuốc nhuộm giemsa 18 3.1.8 KOH 10% 19 3.1.9 Mực tàu (india ink) .19 3.1.10 Thuốc nhuộm Lacto Phenol Cotton Blue (LPCB) 19 3.1.11 Đĩa kháng nấm môi trường đặt đĩa kháng nấm .20 3.2 Phương pháp 20 3.2.1 Phương pháp nghiên cứu 20 3.2.1.1 Thiết kế nghiên cứu 20 3.2.1.2 Cỡ mẫu nghiên cứu 20 3.2.1.3 Tiêu chuẩn chọn mẫu 20 3.2.2 Y đức nghiên cứu 20 3.2.3 Kỹ thuật nghiên cứu .21 3.2.3.1 Soi tươi bệnh phẩm 21 3.2.3.2 Cấy bệnh phẩm 22 3.2.3.3 Định danh vi nấm 23 vii Chương KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 26 4.1 Kết nghiên cứu 26 4.1.1 Tỷ lệ bệnh nhân nhiễm nấm Candida spp theo loại bệnh phẩm .26 4.1.1.1 Vi nấm phân lập qua phết họng, phết lưỡi 26 4.1.1.2 Vi nấm phân lập qua nước tiểu 27 4.1.1.3 Vi nấm phân lập qua đàm, dịch rửa phế quản 28 4.1.2 Tỷ lệ nhiễm loại vi nấm Candida spp theo loại bệnh phẩm .29 4.1.2.1 Vi nấm phân lập qua phết họng, phết lưỡi 29 4.1.2.2 Vi nấm phân lập qua nước tiểu 30 4.1.2.3 Vi nấm phân lập qua đàm, dịch rửa phế quản 30 4.1.3 Kết kháng nấm đồ theo loại bệnh phẩm 31 4.1.3.1 Vi nấm phân lập qua phết họng, phết lưỡi 31 4.1.3.2 Vi nấm phân lập qua nước tiểu .32 4.1.3.3 Vi nấm phân lập qua đàm, dịch rửa phế quản 33 4.2 Thảo luận .33 4.2.1 Tình hình nhiễm vi nấm vùng họng .33 4.2.2 Tình hình nhiễm vi nấm nước tiểu .35 4.2.3 Tình hình nhiễm vi nấm đàm, dịch rửa phế quản .36 4.2.4 Kết kháng nấm đồ theo loại bệnh phẩm 37 4.2.4.1 Vi nấm phân lập qua phết họng, phết lưỡi 37 4.2.4.2 Vi nấm phân lập qua nước tiểu 37 4.2.4.3 Vi nấm phân lập qua đàm, dịch rửa phế quản 37 KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 39 5.1 Kết luận 39 5.2 Đề nghị 39 TÀI LIỆU THAM KHẢO 40 viii DANH SÁCH CÁC CHỮ VIẾT TẮT AIDS Acquired Immune Deficiency BS Bác Sĩ CDC Centers of Disease Control and Prevention ĐH Đại Học GS Giáo Sư HIV Human Immunodeficiency Virus LPCB Lacto Phenol Cotton Blue OIs Opportunistic Infections TP.HCM Thành Phố Hồ Chí Minh WHO World Health Organization ix DANH SÁCH CÁC BẢNG TRANG Bảng 4.1 Tỷ lệ dương tính với vi nấm qua cấy phết họng, lưỡi 26 Bảng 4.2 Phân loại bệnh nhân qua cấy phết họng, lưỡi 26 Bảng 4.3 Tỷ lệ dương tính với vi nấm qua cấy nước tiểu .27 Bảng 4.4 Phân loại bệnh nhân qua cấy nước tiểu 27 Bảng 4.5 Tỷ lệ dương tính với vi nấm qua cấy đàm .28 Bảng 4.6 Phân loại bệnh nhân qua cấy đàm 28 Bảng 4.7 Tỷ lệ tác nhân vi nấm qua cấy phết họng, lưỡi 29 Bảng 4.8 Tỷ lệ tác nhân vi nấm qua cấy nước tiểu 30 Bảng 4.9 Tỷ lệ tác nhân vi nấm qua cấy đàm 30 Bảng 4.10 Tỷ lệ nhạy, kháng nấm C.albicans qua phết họng, lưỡi .31 Bảng 4.11 Tỷ lệ nhạy, kháng nấm C.tropicalis qua phết họng, lưỡi 32 Bảng 4.12 Tỷ lệ nhạy, kháng nấm C.albicans qua cấy nước tiểu 32 Bảng 4.13 Tỷ lệ nhạy, kháng nấm C.tropicalis qua cấy nước tiểu .32 Bảng 4.14 Tỷ lệ nhạy, kháng nấm C.albicans qua cấy đàm 33 Bảng 4.15 Tỷ lệ nhạy, kháng nấm C.tropicalis qua cấy đàm .33 x ... lệ mắc bệnh vi nấm Candida spp gây bệnh nhân nhập vi? ??n Bệnh vi? ??n Bệnh Nhiệt đới Tp Hồ Chí Minh Xác định chủng vi nấm Candida spp gây bệnh Tìm hiểu độ nhạy cảm với thuốc kháng nấm kháng nấm đồ... gây thể bệnh lan toả thứ phát Nghiên cứu đề tài này, chúng tơi muốn tìm hiểu tình trạng nhiễm vi nấm Candida spp đường hơ hấp đường tiết niệu bệnh nhân nhập vi? ??n bệnh vi? ??n Bệnh Nhiệt Đới TP Hồ... vi nấm ngồi da, khơng phải bệnh vi nấm ngoại biên Mầm bệnh khu trú, xâm nhập sâu, phát tán toàn thân Bệnh vi nấm hạt men: Bệnh vi nấm Cryptococcus neoformans Bệnh vi nấm Candida spp Bệnh vi nấm