Nghiên cứu phân lập Gene SyrB 2 ừ chủng vi khuẩn Pseudomonas syringae pv. syringae sinh tổng hợp Syringomycin cao (Khóa luận tốt nghiệp)Nghiên cứu phân lập Gene SyrB 2 ừ chủng vi khuẩn Pseudomonas syringae pv. syringae sinh tổng hợp Syringomycin cao (Khóa luận tốt nghiệp)Nghiên cứu phân lập Gene SyrB 2 ừ chủng vi khuẩn Pseudomonas syringae pv. syringae sinh tổng hợp Syringomycin cao (Khóa luận tốt nghiệp)Nghiên cứu phân lập Gene SyrB 2 ừ chủng vi khuẩn Pseudomonas syringae pv. syringae sinh tổng hợp Syringomycin cao (Khóa luận tốt nghiệp)Nghiên cứu phân lập Gene SyrB 2 ừ chủng vi khuẩn Pseudomonas syringae pv. syringae sinh tổng hợp Syringomycin cao (Khóa luận tốt nghiệp)Nghiên cứu phân lập Gene SyrB 2 ừ chủng vi khuẩn Pseudomonas syringae pv. syringae sinh tổng hợp Syringomycin cao (Khóa luận tốt nghiệp)Nghiên cứu phân lập Gene SyrB 2 ừ chủng vi khuẩn Pseudomonas syringae pv. syringae sinh tổng hợp Syringomycin cao (Khóa luận tốt nghiệp)
- - PSEUDOMONAS SYRINGAE SYRINGOMYCIN CAO : Chính quy Chuyên ngành : Khoa : CNSH - CNTP : 2011 - 2015 Thái Nguyên - 2015 - - PSEUDOMONAS SYRINGAE SYRINGOMYCIN CAO : Chính quy Chuyên ngành : Khoa : CNSH - CNTP : 2011 - 2015 : Khoa CNSH- Thái Nguyên - 2015 i ! i, Sinh viên ii DANH M C CÁC B NG Pseudomonas spp 23 Pseudomonas syringae pv syringae 23 24 24 27 29 31 32 9: 33 -time PCR 34 -time PCR 35 P.syringae 38 260/A280 P.syringae 38 iii DANH M C CÁC HÌNH Hình 2.1: Pseudomonas Hình 2.2 Pseudomonas Hình 2.3 Hình 2.4: Hình 2.5 Ho t ng c a SyrB2 sinh t ng h p syringomycin 15 Hình 2.6 Vector tách dịng pGEM-T Easy 20 Hình 4.1: Pseudomonas syringae pv syringae 37 Hình 4.2: 39 Hình 4.3: 40 Hình 4.4: 41 iv Amp Ampicillin Bp Base pair PDA Potato Dextro Agar BLAST Basic Local Aligenment Search Tool DNA Deoxyribonucleic axit dNTP Deoxynucleotide Triphotphate E coli Escherichia coli Et al; cs IPTG Isopropyl Thiogalactoside Kb Kilo base kilo base nito LB Lauria Broth SDS Sodium Dodecyl Sulfate PCR Polymerase Chain Reaction - Ph n ng chu i trùng h p SR-E Syringomycin E TAE Tris- acetate- EDTA TE Tris- EDTA X gal 5-bromo-4-chloro-3indoly- -D-galactoside v M CL C Ph n 1: M 1.1 tv U 1.2 M c tiêu nghiên c u tài c c ti n Ph n 2: T NG QUAN NGHIÊN C U 10 11 2.3 Tình hình nghiên c c 12 2.3.1 Tình hình nghiên c u Syringomycin E th gi i 12 2.3.2 Tình hình nghiên c u Syringomycin E Vi t Nam 14 15 2.5 16 16 2.5.2 Real-time PCR 18 2.6 Vector tách dòng pGEM-T Easy 19 22 22 22 vi 22 22 23 25 25 25 25 26 el agarose 27 -T Easy 28 29 3.4.6 30 -T Easy - 31 31 32 -time PCR 33 35 36 37 37 38 38 -T Easy 39 40 41 43 vii 43 44 44 44 46 5.1 46 5.2 46 47 Ph n M 1.1 U tv Fusarium Rhizocronia a, ngày nh nhi m n m, lo i thu c kháng n m có s n, lồi n m ngày kháng v i thu c ch ng n m có s n, n vi c m r ng vi c tìm ki m ch ph m sinh h c ch ng n m m i Ch ng Pseudomonas syringae pv syringae s n xu t lipodepsinonapeptides v i ho t tính kháng n m Nghiên c u ng nghi m v ho ch kháng n m ng di t n m c a ba lipodepsinonapeptides (syringomycin E, syringotoxin B, syringostatin A) cho th y, c ba h p ch t có kh ch ng n m ph r ng có ho t tính di t h u h t loài n m th nghi m Syringomycin E (C53 H85CLN14O17) m t nh ng h p ch t quan tr ng nh c nghiên c u Pseudomonas syringae pv.Syringae 43 4.3 phân tích gen Syrb2 SyrB2 n: - - gen SyrB2 44 4.3.2 gen SyrB2 96% t gen SyrB2 ng P.syringae 4.3.3 gen SyrB2 ng P.syringae c 3) SyrB2 SR-E ng P.syringae SR- -E -E 45 - m a gen SyrB2 n gen Ct( SyrB2-W)=20,29 Ct ( SyrB2-M)=20,55 Ct( Ref-M)=19,72 Ct(Ref-W)= 19,25 -W gen gâ Ref-M gen -W)- Ct(Ref-W)=1,04 -M)-Ct(Ref-M)=0,83 n gen SyrB2 phiên mã, gen SyrB2 n gen SyrB2 46 P 5.1 Pseudomonas syringae pv syringae ng gen SyrB2 Pseudomonas syringae pv syringae 5.2 SyrB2 n 47 I t Pseudomonas Rhizoctonia Fusarium , II - 58 ng Anh A.J De Lucca, T.J Jacks, J.Y Takemoto, B Vinyard, J Peter, E Akira Isogai, Jiro Nakayamaingomycin- Agents Chemother., (1999) p: 371 373 compoundsagainst emerg Antimicrob Agents Chemother (1999) p: 11 and et al Structure and stereochemistry of three phytotoxins, syringomycin, syringotoxin and syringostatin, produced by Pseudomonas J Chem Soc., Perkin Trans 1, 1149-1157 Anzai, Y; Kim, H; Park, JY; Wakabayashi, H; Oyaizu, H (2000) International journal of systematic and evolutionary microbiology 50 Pt 4: 1563 89 Blazevic DJ, Köpcke M identification of Pseudomonas fluorescens and Pseudomonas putida in the Microbiol, p 25: 107 Breidenstein EB, Fuente-Núñez C, Hancock RE (2011) Pseudomonas aeruginosa: all roads lead to resistance Trends Microbiol 19: 419 26 48 Carol L Bender1, Francisco Alarcón-Chaidez, and Dennis C Pseudomonas syringae Phytotoxins: Mode of Action, Gross(1999) Microbiology and molecular biology, June 1999, p 266 292 control of Gaeumannomyces graminis by suppress Soil Biol Biochem 8: 269- 273 10 Dirk Konz , Marahiel MA How peptide synthetases Chem Biol, R39-R48 11 Gitanjali M Singh , Fre ´ de ´ ric H Vaillancourt, Jun Yin, and Aminoacyltransferase Shuttling Threonyl and Chlorothreonyl Residues in Chemistry & Biology, Pt: 1- 10 12 GJ, Jousset A, Bonkowski M, Thorpe MR, Scheu S, Lanoue A, Schurr U, intains carbon delivery to Fusarium graminearum-infected roots and prevents reduction in Exp Bot 62: 4337 4344 13 H.T.H MUEDI, D FOURIE and N.W MCLAREN, (2011), rown spot pathogen from dry bean African Crop Science Journal, Vol 19, No 4, pp 357 367 14 Plant Cell 8: 1855-1869 49 15 Howell CR, Stipanovic RD - induced damping-off of cotton seedlings by Pseudomonas fluorescens and Phytopathology 70: 712-715 16 Jan-Hua Zhang and et al, (1995), Analysis of the syrB and syrC genes of Pseudomonas syringae pv syringae indicates that syringomycin is 4009-4020 17 Kommedahl T, Changinfection in the field by seed treatment with antagonists Phytopathology 65: 296-300 18 -principles study of non-heme J Am Chem Soc, p 1-22 19 -Triggered Formation and Remarkable Stability of the C-H Bond-Cleaving Intermediate in the Aliphatic Halogenase, SyrB2 Chloroferryl 2009, 48, 4331 4343 20 N B., Y.syringomycin production by Pseudomonas syringae pathovar syringae and Mol Microbiol is related to a family of ATP9:787 801 21 Naoyuka Fukuchi and et al , (1992), three phytotoxins, syringomycin, Structure and stereochemistry of syringotoxin and syringostatin, J Chem Soc., Perkin Trans 1, 1992, 1149-1157 22 FEBS Lett 255: 27-31 50 23 S antibiotic and phytoxic produced by Pseudomonas syringae, and its role in Physiol, Plant Pathol, 1, 199-213 24 Stockwell VO, Stack JP Using Pseudomonas spp for Integrated Phytopathology., p 244-249 25 Walker TS, Bais HP, Déziel E, Schweizer HP, Rahme LG, Fall R, -plant root interactions Plant Physiol 134: 320-331 26 Annual Review of Phytopathology 26: 379-407 27 Yang ZJ, Wan identification, and degradation characteristics of phenazine-1-carboxylic Curr Microbiol 55: 284-7 acidIII Tài li u tham kh o t Internet 28 HTTP://EN.WIKIPEDIA.ORG/WIKI/PSEUDOMONAS_SYRINGAE 29 http://en.wikipedia.org/wiki/Syringomycin_E 30 Ngô Thanh Phong (2012), http://gs.ctu.edu.vn/tomtat_LATS/VSVH_NTPhong.pdf [Ngày - gen SyrB2 NCBI - - c3 ... STT A260/A280 (ng/µL) P .syringae PS 120 1,96 199 P .syringae PS 120 -15 1,86 29 4 - 4 .2: 26 0/A280 P .syringae 4 .2 STT A260/A280 Ps- 120 2. 05 965.9 Ps- 120 -15 1.98 684.0 dòng gen SyrB2 4 .2. 1 S d ng... Syringomycin E Vi t Nam 14 15 2. 5 16 16 2. 5 .2 Real-time PCR 18 2. 6 Vector tách dòng pGEM-T Easy 19 22 22 22 vi 22 ... tr ng nh c nghiên c u Pseudomonas syringae pv .Syringae 2 syringae pv syringae 1 .2 M c tiêu nghiên c u gen SyrB2 - RT- realtime PCR 1.3 ac 1.3 tài c p tách dòng thành cơng gen syrB2 1.3 c ti