XÁC ĐỊNH TỶ LỆ NHIỄM VÀ DÒNG VI RÚT PRRS TRÊN ĐÀN HEO TẠI MỘT ĐỊA PHƯƠNG LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC NÔNG NGHIỆP

XÁC ĐỊNH TỶ LỆ NHIỄM VÀ DÒNG VI RÚT PRRS TRÊN ĐÀN HEO TẠI MỘT ĐỊA PHƯƠNG LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC NÔNG NGHIỆP BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO ĐẠI HỌC NÔNG LÂM THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH HUỲNH THỊ THU HƯƠNG XÁC ĐỊNH TỶ LỆ NHIỄM VÀ DÒNG VI RÚT PRRS TRÊN ĐÀN HEO TẠI MỘT ĐỊA PHƯƠNG LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC NÔNG NGHIỆP Thành phố Hồ Chí Minh Tháng 102009 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO ĐẠI HỌC NÔNG LÂM THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH HUỲNH THỊ THU HƯƠNG XÁC ĐỊNH TỶ LỆ NHIỄM VÀ DÒNG VI RÚT PRRS TRÊN ĐÀN HEO TẠI MỘT ĐỊA PHƯƠNG Chuyên ngành: Thú y Mã số: 60.62.50 LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC NÔNG NGHIỆP Hướng dẫn khoa học: PGS.TS TRẦN THỊ DÂN Th.S. TRẦN THỊ BÍCH LIÊN Thành phố Hồ Chí Minh Tháng 102009 i XÁC ĐỊNH TỶ LỆ NHIỄM VÀ DÒNG VI RÚT PRRS TRÊN ĐÀN HEO TẠI MỘT ĐỊA PHƯƠNG HUỲNH THỊ THU HƯƠNG Hội đồng chấm luận văn: 1. CHỦ TỊCH: TS. LÊ ANH PHỤNG Trường Đại Học Nông Lâm TP. Hồ Chí Minh 2. THƯ KÝ: TS. NGUYỄN ĐÌNH QUÁT Trường Đại Học Nông Lâm TP. Hồ Chí Minh 3. PHẢN BIỆN 1: PGS. TS. NGUYỄN NGỌC HẢI Trường Đại Học Nông Lâm TP. Hồ Chí Minh 4. PHẢN BIỆN 2: TS. HỒ THỊ KIM HOA Trường Đại Học Nông Lâm TP. Hồ Chí Minh 5. ỦY VIÊN: PGS. TS. TRẦN THỊ DÂN Hội chăn nuôi Việt Nam ĐẠI HỌC NÔNG LÂM TP. HỒ CHÍ MINH HIỆU TRƯỞNG ii CẢM TẠ Xin thành kính ghi ơn PGS.TS. Trần Thị Dân và Th.S. Trần Thị Bích Liên đã hết lòng tận tình dìu dắt, hướng dẫn và giúp tôi trong suốt quá trình học tập và thực hiện luận văn này. Chân thành cảm ơn: Ban Giám Hiệu Trường Đại học Nông Lâm, Ban chủ nhiệm và thầy cô Khoa Chăn nuôi – Thú y, Phòng Đào tạo sau đại học đã tận tâm dạy, truyền đạt kiến thức và tạo điều kiện thuận lợi cho chúng tôi trong quá trình học. Ban lãnh đạo Chi cục Thú y Thành phố và Trạm Chẩn đoán Xét nghiệm và điều trị đã tạo điều kiện để tôi theo học lớp đào tạo thạc sĩ thú y. TS. Trần Văn Chính và PGS.TS. Nguyễn Ngọc Tuân đã giúp đỡ trong thời gian thực hiện luận văn tốt nghiệp. Các bạn đồng nghiệp tại Trạm Chẩn đoán Xét nghiệm và điều trị, và đặc biệt là các chị và bạn trong Bộ môn Siêu vi – huyết thanh đã hỗ trợ trong suốt quá trình học tập. iii LÝ LỊCH CÁ NHÂN Tôi tên là Huỳnh Thị Thu Hương sinh ngày 28 tháng 1 năm 1973 tại Hà Nội. Con Ông Huỳnh Thuần và Bà Nguyễn Thị Tỵ. Tốt nghiệp tú tài tại trường phổ thông trung học Bùi Thị Xuân, TP. Hồ Chí Minh năm 1991. Tốt nghiệp Đại học ngành Công Nghệ Sinh Học hệ mở rộng tại Đại học Mở Bán Công, TP. Hồ Chí Minh năm 1996. Tốt nghiệp Đại học ngành Thú Y hệ tại chức tại Đại học Nông Lâm, Thủ Đức, TP. Hồ Chí Minh năm 2002. Tháng 9 năm 2005 đến nay theo học Cao học ngành Thú y tại Đại học Nông Lâm, Thủ Đức, TP. Hồ Chí Minh. Làm việc tại Chi Cục Thú Y TP. Hồ Chí Minh từ năm 1996 đến nay. Tình trạng gia đình: họ tên chồng là Nguyễn Vũ Duy Năng, nghề nghiệp Kỹ sư cơ khí, kết hôn năm 1993, có 2 con tên Nguyễn Vũ Minh Nguyệt và Nguyễn Huỳnh Minh Quân. Địa chỉ liên lạc: Chi Cục Thú Y TP. Hồ Chí Minh Điện thoại: 0838551258 Email: huynhnguyenhuongyahoo.com iv LỜI CAM ĐOAN Tôi cam đoan đây là công trình nghiên cứu của tôi. Các số liệu, kết quả nêu trong luận văn là trung thực và chưa từng được ai công bố trong bất kỳ công trình nào khác. Huỳnh Thị Thu Hương v TÓM TẮT Đề tài nghiên cứu “Xác định tỷ lệ nhiễm và dòng vi rút PRRS trên đàn heo tại một địa phương” tiến hành khảo sát trên 1803 heo từ 236 trại và hộ chăn nuôi chưa tiêm phòng vaccin PRRS tại một địa phương từ tháng 012008 đến 012009. Nội dung nghiên cứu gồm 3 phần: (1) ghi nhận tỷ lệ heo có kháng thể kháng vi rút PRRS và dòng vi rút lưu hành bằng phương pháp ELISA; (2) khảo sát tỷ lệ nhiễm vi rút PRRS huyết và chủng độc lực cao bằng phương pháp RTPCR, và so sánh sự tương đồng giữa kết quả RTPCR với tỷ số SP trong phát hiện kháng thể; (3) đánh giá sự thống nhất giữa các kết quả RTPCR phát hiện vi rút trong huyết thanh và trong máu. Tỷ lệ heo và tỷ lệ trại có kháng thể kháng vi rút PRRS chiếm khá cao tại địa phương khảo sát (56,52% và 63,56%). Dòng vi rút PRRS tại địa phương là dòng Bắc Mỹ. Ở loại hình chăn nuôi công nghiệp, tỷ lệ heo có kháng thể biến động từ 58,55% đến 66,85%, nhiều hơn có ý nghĩa thống kê so với hộ chăn nuôi (48,25%). Heo hậu bị có tỷ lệ huyết thanh dương tính cao nhất (72,22%), tỷ lệ này ít nhất ở nái và heo 1 3 tháng (49,08% 52,10%). Trong các heo có kháng thể kháng vi rút PRRS tỷ số SP có giá trị tập trung trong khoảng 0,4 1,99. Khi xét nghiệm bằng phương pháp RTPCR, tỷ lệ heo nhiễm vi rút PRRS huyết là 19,89%, và vùng tập trung nhiều trại công nghiệp có tỷ lệ nhiễm vi rút huyết cao nhất. Đồng thời, có sự hiện diện của vi rút PRRS chủng độc lực cao tại vùng này của địa phương khảo sát. Trại công nghiệp nhỏ và hộ chăn nuôi có tỷ lệ nhiễm vi rút PRRS huyết cao nhất. Heo 1 3 tháng tuổi nhiễm vi rút PRRS huyết (82,86%) nhiều hơn so với các hạng heo thịt, nái, hậu bị (tỷ lệ nhiễm biến động từ 5,75% đến 23,53%). Khả năng phát hiện vi rút PRRS trong máu bằng phương pháp RTPCR cao khi huyết thanh heo có tỷ số SP ≥ 1 và thấp ở mức SP < 1. Riêng heo 1 3 tháng tuổi khả năng phát hiện vi rút PRRS trong máu vẫn cao khi SP ≥ 0,4. Phát hiện vi rút huyết khi kết quả ELISA âm tính (SP= Expected counts are printed below observed counts 0,4 - 385 262,00 >= 139 262,00 Total 524 634 757,00 880 757,00 1514 Total 1019 1019 2038 Chi-Sq = 57,744 + 57,744 + 19,985 + 19,985 = 155,459 DF = 1, P-Value = 0,000 4.2 Xác định tỷ lệ nhiễm vi rút PRRS huyết chủng độc lực cao heo * Tỷ lệ nhiễm vi rút PRRS huyết theo vùng chăn nuôi Chi-Square Test: I II III Expected counts are printed below observed counts I 90 69,80 II 10,94 III 10 24,26 Total 105 261 281,20 50 44,06 112 97,74 423 Total 351 55 122 528 Chi-Sq = 5,845 + 3,223 + 1,451 + 0,800 + DF = 2, P-Value = 0,000 8,383 + 2,081 = 21,783 Chi-Square Test: I II Expected counts are printed below observed counts I 90 82,13 II 12,87 Total 95 261 268,87 50 42,13 311 Total 351 55 406 Chi-Sq = 0,754 + 4,812 + 0,230 + 1,470 = 7,266 DF = 1, P-Value = 0,007 Chi-Square Test: I III Expected counts are printed below observed counts I 90 74,21 III 10 25,79 Total 100 261 276,79 112 96,21 373 Total 351 122 473 Chi-Sq = 3,361 + 9,670 + 0,901 + 2,592 = 16,524 DF = 1, P-Value = 0,000 * Tỷ lệ nhiễm vi rút PRRS huyết theo loại hình chăn ni Chi-Square Test: Cong nghiep lon Cong nghiep vua Cong nghiep nho Ho CN Expected counts are printed below observed counts Cong ngh Cong ngh Cong ngh 38 22 11 47,33 24,26 6,36 Ho CN 34 27,05 Total 105 200 190,67 100 97,74 21 25,64 102 108,95 423 Total 238 122 32 136 528 Chi-Sq = 1,839 + 0,211 + 0,456 + 0,052 + DF = 3, P-Value = 0,029 3,378 + 0,838 + 1,788 + 0,444 = 9,007 Chi-Square Test: Cong nghiep lon Cong nghiep nho Expected counts are printed below observed counts Cong ngh Cong ngh 38 11 43,19 5,81 Total 49 200 194,81 21 26,19 221 Total 238 32 270 Chi-Sq = 0,624 + 4,643 + 0,138 + 1,029 = 6,435 DF = 1, P-Value = 0,011 Chi-Square Test: Cong nghiep lon Ho CN Expected counts are printed below observed counts Cong ngh 38 45,82 Ho CN 34 26,18 Total 72 200 192,18 102 109,82 302 Total 238 136 374 Chi-Sq = 1,334 + 0,318 + 2,335 + 0,557 = 4,543 DF = 1, P-Value = 0,033 Chi-Square Test: Cong nghiep vua Cong nghiep nho Expected counts are printed below observed counts Cong ngh Cong ngh 22 11 26,14 6,86 Total 33 100 95,86 21 25,14 121 Total 122 32 154 Chi-Sq = 0,657 + 2,503 + 0,179 + 0,683 = 4,021 DF = 1, P-Value = 0,045 * Tỷ lệ nhiễm vi rút PRRS huyết theo hạng heo Chi-Square Test: - thang tuoi Thit Hau bi Nai Duc giong Expected counts are printed below observed counts - th 58 13,92 Thit 12,53 Hau bi 6,76 Nai 15 19,89 12 56,08 54 50,47 26 27,24 85 80,11 246 209,10 423 Total 70 63 34 100 261 528 Chi-Sq =139,579 + 0,994 + 34,647 + 0,247 + DF = 4, P-Value = 0,000 0,227 + 0,056 + Duc giong 15 51,90 1,201 + 26,238 + 0,298 + 6,513 = 210,000 Chi-Square Test: - thang tuoi Thit Expected counts are printed below observed counts - th 58 35,26 Thit 31,74 Total 67 12 34,74 54 31,26 66 Total 70 63 133 Chi-Sq = 14,660 + 16,289 + 14,882 + 16,536 = 62,367 DF = 1, P-Value = 0,000 Chi-Square Test: - thang tuoi Hau bi Expected counts are printed below observed counts - th 58 44,42 Hau bi 21,58 Total 66 12 25,58 26 12,42 38 Total 70 34 104 Chi-Sq = 4,149 + 8,543 + Total 105 7,207 + 14,838 = 34,737 DF = 1, P-Value = 0,000 Chi-Square Test: - thang tuoi Nai Expected counts are printed below observed counts - th 58 30,06 Nai 15 42,94 Total 73 12 39,94 85 57,06 97 Total 70 100 170 Chi-Sq = 25,973 + 18,181 + 19,546 + 13,683 = 77,383 DF = 1, P-Value = 0,000 Chi-Square Test: - thang tuoi Duc giong Expected counts are printed below observed counts 1 - th 58 15,44 duc giong 15 57,56 Total 73 12 54,56 246 203,44 258 Total 70 261 331 Chi-Sq =117,341 + 31,471 + 33,201 + 8,905 = 190,917 DF = 1, P-Value = 0,000 Chi-Square Test: Thit Nai Expected counts are printed below observed counts Thit 9,28 Nai 15 14,72 Total 24 54 53,72 85 85,28 139 Total 63 100 163 Chi-Sq = 0,008 + 0,005 + 0,001 + 0,001 = 0,016 DF = 1, P-Value = 0,900 Chi-Square Test: Thit Duc giong Expected counts are printed below observed counts Thit Duc gion 15 4,67 19,33 Total 24 54 58,33 246 241,67 300 Total 63 261 324 Chi-Sq = 4,024 + 0,971 + 0,322 + 0,078 = 5,395 DF = 1, P-Value = 0,020 cells with expected counts less than 5,0 Chi-Square Test: Nai Hau bi Expected counts are printed below observed counts Nai 15 17,16 Hau bi 5,84 Total 23 85 82,84 26 28,16 111 Total 100 34 134 Chi-Sq = 0,273 + 0,803 + 0,057 + 0,166 = 1,298 DF = 1, P-Value = 0,255 Chi-Square Test: Hau bi Duc giong Expected counts are printed below observed counts Hau bi 2,65 duc giong 15 20,35 Total 23 26 31,35 246 240,65 272 Total 34 261 295 Chi-Sq = 10,794 + 1,406 + 0,913 + 0,119 = 13,232 DF = 1, P-Value = 0,000 cells with expected counts less than 5,0 Chi-Square Test: Nai Duc giong Expected counts are printed below observed counts Nai 15 8,31 duc giong 15 21,69 Total 30 85 91,69 246 239,31 331 Total 100 261 361 Chi-Sq = 5,385 + 2,063 + 0,488 + 0,187 = 8,124 DF = 1, P-Value = 0,004 ... 60.62.50 LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC NÔNG NGHIỆP Hướng dẫn khoa học: PGS.TS TRẦN THỊ DÂN Th.S TRẦN THỊ BÍCH LIÊN Thành phố Hồ Chí Minh Tháng 10/2009 XÁC ĐỊNH TỶ LỆ NHIỄM VÀ DÒNG VI RÚT PRRS TRÊN ĐÀN HEO. .. kháng vi rút PRRS xác định dòng vi rút phương pháp ELISA .36 4.1.1 Tỷ lệ heo có kháng thể kháng vi rút PRRS theo vùng chăn nuôi .38 4.1.2 Tỷ lệ heo có kháng thể kháng vi rút PRRS theo... Đánh giá mức độ nhiễm vi rút PRRS phân bố dòng vi rút heo địa phương sản xuất nhiều heo giống 1.3 Yêu cầu (1) Khảo sát tỷ lệ heo có kháng thể kháng vi rút PRRS dòng vi rút lưu hành phương pháp ELISA,