Xác định một số đoạn mã vạch ADN cho một số loài trà hoa vàng ở vườn quốc gia tam đảo

93 627 3
Xác định một số đoạn mã vạch ADN cho một số loài trà hoa vàng ở vườn quốc gia tam đảo

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

Thông tin tài liệu

ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN HOÀNG MINH TRANG XÁC ĐỊNH MỘT SỐ ĐOẠN MÃ VẠCH ADN CHO MỘT SỐ LOÀI TRÀ HOA VÀNG Ở VƯỜN QUỐC GIA TAM ĐẢO LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC Hà Nội - 2016 ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN HOÀNG MINH TRANG XÁC ĐỊNH MỘT SỐ ĐOẠN MÃ VẠCH ADN CHO MỘT SỐ LOÀI TRÀ HOA VÀNG Ở VƯỜN QUỐC GIA TAM ĐẢO Chuyên ngành: Sinh học thực nghiệm Mã số: 60420114 LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: PGS.TS Hà Văn Huân PGS.TS Nguyễn Trung Thành Hà Nội – 2016 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan công trình nghiên cứu tôi, hướng dẫn khoa học PGS.TS Hà Văn Huân PGS.TS Nguyễn Trung Thành Các nội dung nghiên cứu, kết đề tài trung thực chưa công bố hình thức Luận văn sử dụng thông tin, số liệu từ báo nguồn tài liệu tác giả khác có trích dẫn thích nguồn gốc đầy đủ Nếu có gian lận xin hoàn toàn chịu trách nhiệm nội dung luận văn Học viên Hoàng Minh Trang LỜI CẢM ƠN Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành đến thầy cô giáo khoa Sinh học, trường Đại học Khoa học Tự nhiên – Đại học Quốc gia Hà Nội trang bị kiến thức cho suốt trình học tập Đặc biệt, xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc đến PGS.TS Hà Văn Huân – Viện CNSH Lâm nghiệp – Đại học Lâm nghiệp PGS.TS Nguyễn Trung Thành – Khoa Sinh học – Đại học Khoa học Tự nhiên – ĐHQGHN tận tình bảo hướng dẫn suốt trình nghiên cứu đề tài hoàn chỉnh Luận văn Thạc sĩ Xin cảm ơn đề tài nghiên cứu khoa học cấp Nhà nước “Xây dựng sở liệu mã vạch ADN (DNA barcode) cho số loài lâm nghiệp gỗ lớn, lâm sản gỗ có giá trị kinh tế” PGS TS Hà Văn Huân chủ nhiệm hỗ trợ phương diện để thực nghiên cứu Tôi xin cảm ơn cán Viện Công nghệ Sinh học Lâm nghiệp – Đại học Lâm nghiệp tạo điều kiện cho hoàn thành đề tài nghiên cứu Xin cảm ơn Ban Quản lý VQG Tam Đảo cho phép thu thập mẫu vật làm nguồn vật liệu cho đề tài, cảm ơn chuyên gia thực vật học Lê Thành Cương giúp thu thập nhận dạng loài Trà hoa vàng nghiên cứu Cuối cùng, xin chân thành cảm ơn gia đình, bạn bè đồng nghiệp sát cánh hỗ trợ động viên vật chất tinh thần suốt trình học tập nghiên cứu Xin chân thành cảm ơn! Hà Nội, ngày tháng năm Học viên Hoàng Minh Trang MỤC LỤC MỞ ĐẦU .1 Chương TỔNG QUAN 1.1 Tổng quan Trà hoa vàng Vườn Quốc gia Tam Đảo 1.1.1 Điều kiện tự nhiên đa dạng thực vật Vườn Quốc gia Tam Đảo .3 1.1.2 Lược sử nghiên cứu Trà hoa vàng VQG Tam Đảo 1.1.3 Đảo Đặc điểm hình thái phân bố số loài Trà hoa vàng VQG Tam 1.1.4 Trà hoa vàng giá trị sử dụng 1.2 Tổng quan mã vạch ADN 1.2.1 Giới thiệu mã vạch ADN (DNA barcode) 1.2.2 Một số đoạn mã vạch ADN sử dụng 12 1.2.3 Các yếu tố ảnh hưởng đến khả phân biệt mã vạch ADN thực vật 20 1.2.4 Ứng dụng mã vạch ADN 21 1.2.5 Một số nghiên cứu mã vạch ADN loài Trà 22 Chương VẬT LIỆU - PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU .25 2.1 Vật liệu nghiên cứu 25 2.1.1 Đối tượng nghiên cứu 25 2.1.2 Nội dung nghiên cứu 25 2.2 Phương pháp nghiên cứu .26 2.2.1 Hóa chất, thiết bị dụng cụ 26 2.2.2 Phương pháp nghiên cứu 27 Chương KẾT QUẢ - THẢO LUẬN .29 3.1 Kết tách chiết ADN tổng số mẫu trà hoa vàng .29 3.2 Kết PCR đoạn mã vạch ADN 30 3.3 Giải trình tự phân tích trình tự đoạn mã vạch ADN 32 3.3.1 Kết giải trình tự 33 3.3.2 Khoảng cách di truyền loài 58 KẾT LUẬN – KIẾN NGHỊ 64 Kết luận .64 Kiến nghị 64 TÀI LIỆU THAM KHẢO 66 DANH MỤC BẢNG Bảng 2.1 Trình tự cặp mồi sử dụng 26 Bảng 3.1 Mẫu vật nghiên cứu 29 Bảng 3.2 Nồng độ độ tinh mẫu ADN tổng số (pha loãng 10 lần) 30 Bảng 3.3 Đánh giá trình tự đoạn mã vạch thu 33 Bảng 3.4 So sánh trình tự đoạn matK loài Trà hoa vàng 34 Bảng 3.5 So sánh trình tự matK loài Trà hoa vàng nghiên cứu 36 Bảng 3.6 Mức độ tương đồng đoạn matK loài Trà nghiên cứu với số loài khác 37 Bảng 3.7 So sánh trình tự đoạn rbcL loài Trà hoa vàng 39 Bảng 3.8 So sánh trình tự rbcL loài Trà hoa vàng nghiên cứu 41 Bảng 3.9 Mức độ tương đồng đoạn rbcL loài Trà nghiên cứu với số loài khác 41 Bảng 3.10 So sánh trình tự đoạn trnH-psbA loài Trà hoa vàng 44 Bảng 3.11 So sánh trình tự trnH-psbA loài Trà hoa vàng nghiên cứu 45 Bảng 3.12 Mức độ tương đồng đoạn trnH-psbA loài Trà nghiên cứu với số loài khác 46 Bảng 3.13 So sánh trình tự đoạn ycf1b loài Trà hoa vàng 49 Bảng 3.14 So sánh trình tự ycf1b loài Trà hoa vàng nghiên cứu .51 Bảng 3.15 Mức độ tương đồng đoạn ycf1b loài Trà nghiên cứu với số loài khác 51 Bảng 3.16 So sánh trình tự đoạn ITS2 loài Trà hoa vàng 54 Bảng 3.17 So sánh trình tự ITS2 loài Trà hoa vàng nghiên cứu .55 Bảng 3.18 Mức độ tương đồng đoạn ITS2 loài Trà nghiên cứu với số loài khác 55 Bảng 3.19 Khoảng cách di truyền đoạn mã vạch riêng rẽ kết hợp đoạn mã vạch 59 DANH MỤC HÌNH Hình 1.1 Hệ gen lục lạp số loài thuộc chi Camellia [94] 24 Hình 2.1 Chu trình nhiệt nhân đoạn mã vạch ADN 28 Hình 3.1 Kết điện di sản phẩm tách chiết ADN tổng số mẫu Trà hoa vàng 29 Hình 3.2 Kết điện di sản phẩm PCR đoạn mã vạch ADN 32 Hình 3.3 Cây phân loại sinh học xây dựng dựa trình tự đoạn gen matK 38 Hình 3.4 Cây phân loại sinh học xây dựng dựa trình tự đoạn gen rbcL 43 Hình 3.5 Cây phân loại sinh học xây dựng dựa trình tự đoạn trnH-psbA 48 Hình 3.6 Cây phân loại sinh học xây dựng dựa trình tự đoạn ycf1b .53 Hình 3.7 Cây phân loại sinh học xây dựng dựa trình tự đoạn ITS2 57 Hình 3.8 Khoảng cách di truyền đoạn mã vạch 58 Hình 3.9 Cây phân loại sinh học dựa kết hợp vài trình tự mã vạch 63 DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT STT Tên viết tắt DNA Tên đầy đủ Nghĩa tiếng Việt Deoxyribonucleic acid ADN bp Base pair Cặp base ITS Internal transcribed spacer Vùng đệm vùng phiên mã matK Maturase K Protein maturase K NCBI National Center for Biotechnology Information Trung tâm Thông tin Công nghệ sinh học Quốc gia PCR Polymerase Chain Reaction Phản ứng chuỗi polimer hóa rbcL Ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit Tiểu đơn vị lớn enzyme ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase RNA Ribonucleic acid ARN VQG Vườn Quốc gia Hoàng Minh Trang – K23 QH2014 MỞ ĐẦU Trà hoa vàng thuộc chi Trà Camellia (họ Theaceae, Ericales) có hoa màu vàng, phát lần Việt Nam vào năm đầu kỉ XX Cho đến nhà khoa học phát khoảng 30 loài Trà hoa vàng, có 28 loài tìm thấy Trung Quốc 24 loài tìm thấy Việt Nam [2] Các loài trà hoa vàng có giá trị lớn mặt dược liệu, biết đến với tác dụng kiềm chế sinh trưởng khối u, ngăn ngừa ung thư, giảm lượng cholesterol lipoprotein máu có nguyên tố vi lượng Germanium (Ge), Selenium (Se), Mangan (Mn)… Ngoài trà hoa vàng có giá trị thẩm mỹ cao, trồng làm cảnh có hoa lớn màu vàng đặc trưng [5] Ở Việt Nam, Trà hoa vàng phát chủ yếu số địa phương VQG Tam Đảo (Vĩnh Phúc), VQG Cúc Phương (Ninh Bình), Phước Lộc (Lâm Đồng)… [21, 65, 67], VQG Tam Đảo phát loài với số loài đặc hữu Việt Nam Camellia tamdaoensis, Camellia crassiphylla, Camellia petelotii … [63, 65] Đây nguồn gen vô quý cho hệ thực vật Tam Đảo nói riêng Việt Nam nói chung, cần bảo vệ phân loại để đưa biện pháp thích hợp cho việc bảo tồn nguồn gen, đa dạng sinh học Tuy nhiên, Trà hoa vàng Tam Đảo bị đe dọa nghiêm trọng việc khai thác mức từ phía người dân, đồng thời việc bảo tồn nghiên cứu chưa ý nhiều [65] Cho đến nay, việc phân loại thực vật nói chung loài thuộc chi Trà nói riêng chủ yếu dựa vào đặc điểm hình thái, cấu tạo giải phẫu bên [94] Việc phân loại số trường hợp gặp nhiều khó khăn số loài Trà hoa vàng có đặc điểm hình thái tương đối giống Với phát triển sinh học phân tử công nghệ gen, phương pháp phân loại dựa kỹ thuật phân tích ADN nghiên cứu phát triển sử dụng đoạn mã vạch ADN đặc trưng cho loài (DNA barcode) [17] Phương pháp trở thành công cụ đắc lực cho nhà khoa học việc phát loài mới, phân loại, đánh giá đa dạng di truyền quan hệ di truyền loài Mỗi đoạn mã vạch ADN có đặc trưng riêng có khả phân Hoàng Minh Trang – K23 QH2014 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 Anastrophyllum joergensenii Schiffn and A alpinum Steph.(Jungermanniopsida: Lophoziaceae)”, Journal of Bryology Lunt, D., Zhang D.X., Szymura J., and Hewltt O (1996), “The insect cytochrome oxidase I gene: evolutionary patterns and conserved primers for phylogenetic studies”, Insect molecular biology, (3), pp 153-165 Mcneal, J.R., Kuehl J.V., Boore J.L., and Leebens-Mack J (2009), “Parallel loss of plastid introns and their maturase in the genus Cuscuta”, PLoS One, (6), pp e5982 Miwa, H., Odrzykoski I.J., et al (2009), “Adaptive evolution of rbcL in Conocephalum (Hepaticae, bryophytes)”, Gene, 441 (1), pp 169-175 Möller, M (2000), “How universal are universal rDNA primers? A cautionary note for plant systematists and phylogeneticists”, Edinburgh Journal of Botany, 57 (02), pp 151-156 Neigel, J., Domingo A., and Stake J (2007), “DNA barcoding as a tool for coral reef conservation”, Coral Reefs, 26 (3), pp 487-499 Nicolalde-Morejón, F., Vergara-Silva F., González-Astorga J., and Stevenson D.W (2010), “Character-based, population-level DNA barcoding in Mexican species of Zamia L.(Zamiaceae: Cycadales)”, Mitochondrial DNA, 21 (sup1), pp 51-59 Nicolalde‐Morejón, F., Vergara‐Silva F., González‐Astorga J., Stevenson D.W., Vovides A.P., and Sosa V (2011), “A character‐based approach in the Mexican cycads supports diverse multigene combinations for DNA barcoding”, Cladistics, 27 (2), pp 150-164 Ninh, T and Hakoda N (1998), “Camellia petelotii: a new species of yellow Camellia from Viet nam”, International Camellia Journal, (30), pp 81 –83 Ninh, T and Hakoda N (1998), “Three new species of the genus Camellia from Vietnam”, International Camellia Journal, (30), pp 76-79 Ninh T., N.L.N.H (2013), “The Yellow Camellias of the Tam Dao National Park”, International Camellia Journal, 1, pp 122-128 Nock, C.J., Waters D.L., et al (2011), “Chloroplast genome sequences from total DNA for plant identification”, Plant biotechnology journal, (3), pp 328-333 Orel, G and Curry A.S (2013), “Preliminary morphological assessment of six new, yellow flowering Camellia (Theaceae) species from Viet Nam”, International Camellia Journal, pp 83-86 Ostermeier, C., Iwata S., and Michel H (1996), “Cytochrome c oxidase”, Current opinion in structural biology, (4), pp 460-466 Pang, X., Liu C., et al (2012), “Utility of the trnH–psbA intergenic spacer region and its combinations as plant DNA barcodes: a meta-analysis”, PLoS One, (11), pp e48833 Parks, M., Cronn R., and Liston A (2009), “Increasing phylogenetic resolution at low taxonomic levels using massively parallel sequencing of chloroplast genomes”, BMC biology, (1), pp 70 Hoàng Minh Trang – K23 QH2014 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 Pawluczyk, M., Weiss J., Vicente-Colomer M.J., and Egea-Cortines M (2012), “Two alleles of rpoB and rpoC1 distinguish an endemic European population from Cistus heterophyllus and its putative hybrid (C.× clausonis) with C albidus”, Plant systematics and evolution, 298 (2), pp 409-419 Poczai, P and Hyvönen J (2011), “Identification and characterization of plastid trnF (GAA) pseudogenes in four species of Solanum (Solanaceae)”, Biotechnology letters, 33 (11), pp 2317-2323 Poczai, P and Hyvönen J (2013), “Discovery of novel plastid phenylalanine (trn F) pseudogenes defines a distinctive clade in Solanaceae”, SpringerPlus, (1), pp Poczai, P and Hyvönen J (2013), “Plastid trnF pseudogenes are present in Jaltomata, the sister genus of Solanum (Solanaceae): molecular evolution of tandemly repeated structural mutations”, Gene, 530 (1), pp 143-150 Rubinoff, D., Cameron S., and Will K (2006), “A genomic perspective on the shortcomings of mitochondrial DNA for “barcoding” identification”, Journal of Heredity, 97 (6), pp 581-594 Sang, T., Crawford D., and Stuessy T (1997), “Chloroplast DNA phylogeny, reticulate evolution, and biogeography of Paeonia (Paeoniaceae)”, American Journal of Botany, 84 (8), pp 1120-1120 Schmickl, R., Kiefer C., Dobeš C., and Koch M.A (2009), “Evolution of trnF (GAA) pseudogenes in cruciferous plants”, Plant Systematics and Evolution, 282 (3-4), pp 229-240 Schoch, C.L., Seifert K.A., et al (2012), “Nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region as a universal DNA barcode marker for Fungi”, Proceedings of the National Academy of Sciences, 109 (16), pp 62416246 Seifert, K.A (2009), “Progress towards DNA barcoding of fungi”, Molecular ecology resources, (s1), pp 83-89 Shaw, J., Lickey E.B., Schilling E.E., and Small R.L (2007), “Comparison of whole chloroplast genome sequences to choose noncoding regions for phylogenetic studies in angiosperms: the tortoise and the hare III”, American journal of botany, 94 (3), pp 275-288 Shen, Y.-Y., Chen X., and Murphy R.W (2013), “Assessing DNA barcoding as a tool for species identification and data quality control”, PLoS One, (2), pp e57125 Stoeckle, M.Y., Gamble C.C., Kirpekar R., Young G., Ahmed S., and Little D.P (2011), “Commercial teas highlight plant DNA barcode identification successes and obstacles”, Scientific reports, Suárez-Díaz, E and Anaya-Munoz V.H (2008), “History, objectivity, and the construction of molecular phylogenies”, Studies in History and Philosophy of Science Part C: Studies in History and Philosophy of Biological and Biomedical Sciences, 39 (4), pp 451-468 71 Hoàng Minh Trang – K23 QH2014 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 Taanman, J.-W (1999), “The mitochondrial genome: structure, transcription, translation and replication”, Biochimica et Biophysica Acta (BBA)Bioenergetics, 1410 (2), pp 103-123 Taberlet, P., Coissac E., et al (2007), “Power and limitations of the chloroplast trnL (UAA) intron for plant DNA barcoding”, Nucleic acids research, 35 (3), pp e14-e14 Tate, J.A and Simpson B.B (2003), “Paraphyly of Tarasa (Malvaceae) and diverse origins of the polyploid species”, Systematic Botany, 28 (4), pp 723737 Vrijenhoek, R (1994), “DNA primers for amplification of mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I from diverse metazoan invertebrates”, Molecular marine biology and biotechnology, (5), pp 294-299 Wang, W., Wu Y., Yan Y., Ermakova M., Kerstetter R., and Messing J (2010), “DNA barcoding of the Lemnaceae, a family of aquatic monocots”, BMC Plant Biology, 10 (1), pp Waugh, J (2007), “DNA barcoding in animal species: progress, potential and pitfalls”, BioEssays, 29 (2), pp 188-197 Wheeler, Q.D (2004), “Taxonomic triage and the poverty of phylogeny”, Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, 359 (1444), pp 571-583 White, T.J., Bruns T., Lee S., and Taylor J (1990), “Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics”, PCR protocols: a guide to methods and applications, 18 (1), pp 315-322 Wu, W., Schmidt T.R., Goodman M., and Grossman L.I (2000), “Molecular evolution of cytochrome c oxidase subunit I in primates: is there coevolution between mitochondrial and nuclear genomes?”, Molecular phylogenetics and evolution, 17 (2), pp 294-304 Xu, J., Xu Y., et al (2015), “Polymorphism and evolution of ribosomal DNA in tea (Camellia sinensis, Theaceae)”, Molecular phylogenetics and evolution, 89, pp 63-72 Yang, J.-B., Yang S.-X., Li H.-T., Yang J., and Li D.-Z (2013), “Comparative chloroplast genomes of Camellia species”, PLoS One, (8), pp e73053 Yang, L., Tan Z., et al (2014), “Species identification through mitochondrial rRNA genetic analysis”, Scientific reports, 4, pp 4089 Yao, H., Song J., et al (2010), “Use of ITS2 region as the universal DNA barcode for plants and animals”, PloS one, (10), pp e13102 Yu, J., Xue J.H., and Zhou S.L (2011), “New universal matK primers for DNA barcoding angiosperms”, Journal of Systematics and Evolution, 49 (3), pp 176-181 72 Hoàng Minh Trang – K23 QH2014 WEBSITE 98 http://www.barcodinglife.org/ 99 http://dnabank.vn/ 100 http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/ 101 http://www.internationalcamellia.org/ 102 https://www.iucn.org/ 103 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 73 Hoàng Minh Trang – K23 QH2014 PHỤ LỤC TRÌNH TỰ CÁC ĐOẠN MÃ VẠCH ADN Trình tự đoạn matK  Hải đường vàng Camellia tienii Ninh, Tr GTTTATATGGATCCTTCCTGGTTGAGACCACATGTAAAAATAACATTGCCAGAAAT TGACAAGGTAAGATTTCCATTTATTCATCAAAAGAGACGTACCTTTTGAAGCCAAA ATGTATTTTCCTTGATACCTAACATAATGAATAAAAGGATCCTTGAACAACCACAG AATGACCTGAAAATCCTTAGTAAAGACTTCTAAAAAATGTTCTATTTTTCCATAGA AATATCTTCGTTCGAGAAAGGTTCCAGAAGATATTGATCGTAAATGAGAAGATTGC TTGCGGAGAAAAACGAAGATGGATTCGTATTCACATATATGAAAATTATATAGAAA CAAGAATAATCTTTGATTTCTTTTTGAAAAATAAAAACTAGATTTCTTTGGAGTAA TAAGACTATTCCAATTCCAATACATATGGAGAAAGAATCGTAATAAATACAAAGAA GAGGCATCTTTTACCCAGTAACGAAGAGTTTGAACCGAGATTTCCAGATGGATGGA GTGGGGTATTAGTATATCTAACACATAATTTAGATGTGAAAATTTGTCCTCTAAAA AAGGAAATATTGAATGAATTGATCGTAAATTTTGAGATTTCACTATTTCTTTACCT TCTAGGGAAAATAGAGAAAATGGAATTTCCACAACGGCTACAAATCCTTCTAATAT CATTTGAGAATACAAATTCGTGTTGTGCCCAAAAAATGGATTTTGGTTAGAATCAT TAGCAGAAAAAAGAAAATGATTCTGTTGATACATTTGAGTAATTAAATGTTTCACA ATTAGTAAGCTGAATTTATTGTCATAACCTATATTTTCCAAAAAAATCGATCTAGT TAAACCATGATCATGAGCAAGTGCATAAATATACTCCTGAAAGATAAGTGGATATA CGAAGTCGTGTTGCTGAGATCTATCTAGTTCTAAATATCTTTTGAATTCTTCCAT  Trà vàng Hakoda Camellia hakodae Ninh GTTTATATGGATCCTTCCTGGTTGAGACCACATGTAAAAATAACATTGCCAGAAAT TGACAAGGTAAGATTTCCATTTATTCATCAAAAGAGACGTACCTTTTGAAGCCAAA ATGTATTTTCCTTGATACCTAACATAATGAATAAAAGGATCCTTGAACAACCACAG AATGACCTGAAAATCCTTAGTAAAGACTTCTAAAAAATGTTCTATTTTTCCATAGA AATATCTTCGTTCGAGAAAGGTTCCAGAAGATATTGATCGTAAATGAGAAGATTGC TTGCGGAGAAAAACGAAGATGGATTCGTATTCACATATATGAAAATTATATAGAAA CAAGAATAATCTTTGATTTCTTTTTGAAAAATAAAAACTAGATTTCTTTGGAGTAA TAAGACTATTCCAATTCCAATACATATGGAGAAAGAATCGTAATAAATACAAAGAA GAGGCATCTTTTACCCAGTAACGAAGAGTTTGAACCGAGATTTCCAGATGGATGGA GTGGGGTATTAGTATATCTAACACATAATTTAGATGTGAAAATTTGTCCTCTAAAA AAGGAAATATTGAATGAATTGATCGTAAATTTTGAGATTTCACTATTTCTTTACCT TCTAGGGAAAATAGAGAAAATGGAATTTCCACAACGGCTACAAATCCTTCTAATAT CATTTGAGAATACAAATTCGTGTTGTGCCCAAAAAATGGATTTTGGTTAGAATCAT Hoàng Minh Trang – K23 QH2014 TAGCAGAAAAAAGAAAATGATTCTGTTGATACATTTGAGTAATTAAATGTTTCACA ATTAGTAAGCTGAATTTATTGTCATAACCTATATTTTCCAAAAAAATCGATCTAGT TAAACCATGATCATGAGCAAGTGCATAAATATACTCCTGAAAGATAAGTGGATATA CGAAGTCGTGTTGCTGAGATCTATCTAGTTCTAAATATCTTTTGAATTCTTCCAT  Trà vàng dày Camellia crassiphylla Ninh et Hakoda GTTTATATGGATCCTTCCTGGTTGAGACCACATGTAAAAATAACATTGCCAGAAAT TGACAAGGTAAGATTTCCATTTATTCATCAAAAGAGACGTACCTTTTGAAGCCAAA ATGTATTTTCCTTGATACCTAACATAATGAATAAAAGGATCCTTGAACAACCACAG AATGACCTGAAAATCCTTAGTAAAGACTTCTAAAAAATGTTCTATTTTTCCATAGA AATATCTTCGTTCGAGAAAGGTTCCAGAAGATATTGATCGTAAATGAGAAGATTGC TTGCGGAGAAAAACGAAGATGGATTCGTATTCACATATATGAAAATTATATAGAAA CAAGAATAATCTTTGATTTCTTTTTGAAAAATAAAAACTAGATTTCTTTGGAGTAA TAAGACTATTCCAATTCCAATACATATGGAGAAAGAATCGTAATAAATACAAAGAA GAGGCATCTTTTACCCAGTAACGAAGAGTTTGAACCGAGATTTCCAGATGGATGGA GTGAGGTATTAGTATATCTAACACATAATTTAGATGTGAAAATTTGTCCTCTAAAA AAGGAAATATTGAATGAATTGATCGTAAATTTTGAGATTTCACTATTTCTTTACCT TCTAGGGAAAATAGAGAAAATGGAATTTCCACAACGGCTACAAATCCTTCTAATAT CATTTGAGAATACAAATTCGTGTTGTGCCCAAAAAATGGATTTTGGTTAGAATCAT TAGCAGAAAAAAGAAAATGATTCTGTTGATACATTTGAGTAATTAAATGTTTCACA ATTAGTAAGCTGAATTTATTGTCATAACCTATATTTTCCAAAAAAATCGATCTAGT TAAACCATGATCATGAGCAAGTGCATAAATATACTCCTGAAAGATAAGTGGATATA CGAAGTCGTGTTGCTGAGATCTATCTAGTTCTAAATATCTTTTGAATTCTTCCAT  Trà vàng Tam Đảo Camellia tamdaoensis Hakoda et Ninh GTTTATATGGATCCTTCCTGGTTGAGACCACATGTAAAAATAACATTGCCAGAAAT TGACAAGGTAAGATTTCCATTTATTCATCAAAAGAGACGTACCTTTTGAAGCCAAA ATGTATTTTCCTTGATACCTAACATAATGAATAAAAGGATCCTTGAACAACCACAG AATGACCTGAAAATCCTTAGTAAAGACTTCTAAAAAATGTTCTATTTTTCCATAGA AATATCTTCGTTCGAGAAAGGTTCCAGAAGATATTGATCGTAAATGAGAAGATTGC TTGCGGAGAAAAACGAAGATGGATTCGTATTCACATATATGAAAATTATATAGAAA CAAGAATAATCTTTGATTTCTTTTTGAAAAATAAAAACTAGATTTCTTTGGAGTAA TAAGACTATTCCAATTCCAATACATATGGAGAAAGAATCGTAATAAATACAAAGAA GAGGCATCTTTTACCCAGTAACGAAGAGTTTGAACCGAGATTTCCAGATGGATGGA GTGGGGTATTAGTATATCTAACACATAATTTAGATGTGAAAATTTGTCCTCTAAAA AAGGAAATATTGAATGAATTGATCGTAAATTTTGAGATTTCACTATTTCTTTACCT TCTAGGGAAAATAGAGAAAATGGAATTTCCACAACGGCTACAAATCCTTCTAATAT CATTTGAGAATACAAATTCGTGTTGTGCCCAAAAAATGGATTTTGGTTAGAATCAT TAGCAGAAAAAAGAAAATGATTCTGTTGATACATTTGAGTAATTAAATGTTTCACA Hoàng Minh Trang – K23 QH2014 ATTAGTAAGCTGAATTTATTGTCATAACCTATATTTTCCAAAAAAATCGATCTAGT TAAACCATGATCATGAGCAAGTGCATAAATATACTCCTGAAAGATAAGTGGATATA CGAAGTCGTGTTGCTGAGATCTATCTAGTTCTAAATATCTTTTGAATTCTTCCAT  Trà vàng Petelo Camellia petelotii (Merr.) Sealy GTTTATATGGATCCTTCCTGGTTGAGACCACATGTAAAAATAACATTGCCAGAAAT TGACAAGGTAAGATTTCCATTTATTCATCAAAAGAGACGTACCTTTTGAAGCCAAA ATGTATTTTCCTTGATACCTAACATAATGAATAAAAGGATCCTTGAACAACCACAG AATGACCTGAAAATCCTTAGTAAAGACTTCTAAAAAATGTTCTATTTTTCCATAGA AATATCTTCGTTCGAGAAAGGTTCCAGAAGATATTGATCGTAAATGAGAAGATTGC TTGCGGAGAAAAACGAAGATGGATTCGTATTCACATATATGAAAATTATATAGAAA CAAGAATAATCTTTGATTTCTTTTTGAAAAATAAAAACTAGATTTCTTTGGAGTAA TAAGACTATTCCAATTCCAATACATATGGAGAAAGAATCGTAATAAATACAAAGAA GAGGCATCTTTTACCCAGTAACGAAGAGTTTGAACCGAGATTTCCAGATGGATGGA GTGGGGTATTAGTATATCTAACACATAATTTAGATGTGAAAATTTGTCCTCTAAAA AAGGAAATATTGAATGAATTGATCGTAAATTTTGAGATTTCACTATTTCTTTACCT TCTAGGGAAAATAGAGAAAATGGAATTTCCACAACGGCTACAAATCCTTCTAATAT CATTTGAGAATACAAATTGTGCCCAAAAAATGGATTTTGGTTAGAATCATTAGCAG AAAAAAGAAAATGATTCTGTTGATACATTTGAGTAATTAAATGTTTCACAATTAGT AAGCTGAATTTATTGTCATAACCTATATTTTCCAAAAAAATCGATCTAGTTAAACC ATGATCATGAGCAAGTGCATAAATATACTCCTGAAAGATAAGTGGATATACGAAGT CGTGTTGCTGAGATCTATCTAGTTCTAAATATCTTTTGAATTCTTCCAT Trình tự đoạn rbcL  Hải đường vàng Camellia tienii Ninh, Tr ATGTCACCACAAACAGAGACTAAAGCAAGTGTTGGATTCAAAGCTGGTGTTAAAGA TTACAAATTGACTTATTATACTCCTGACTATGAAACCAAAGATACTGATATCTTGG CAGCATTCCGAGTAACTCCGCAACCTGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCCGCG GTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGACTTAC TAGCCTTGATCGTTACAAAGGGCGATGCTACCACATCGAGCCCGTTGCTGGAGAAG AAAGTCAATTTATTGCTTATGTAGCGTATCCTTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCT GTTACTAACATGTTTACTTCCATTGTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGCG CGCTCTACGTCTGGAAGATCTGCGAATCCCTACTGCGTATGTTAAAACTTTCCAAG GACCGCCTCATGGCATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGTCGTCCC CTGTTGGGATGTACTATTAAACCTAAATTGGGGTTATCTGCCAAAAACTACGGAAG AGCAGTTTATGAATGTCTCCGCGGTGGACTTGATTTTAC Hoàng Minh Trang – K23 QH2014  Trà vàng Hakoda Camellia hakodae Ninh ATGTCACCACAAACAGAGACTAAAGCAAGTGTTGGATTCAAAGCTGGTGTTAAAGA TTACAAATTGACTTATTATACTCCTGACTATGAAACCAAAGATACTGATATCTTGG CAGCATTCCGAGTAACTCCGCAACCTGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCCGCG GTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGACTTAC TAGCCTTGATCGTTACAAAGGGCGATGCTACCACATCGAGCCCGTTGCTGGAGAAG AAAGTCAATTTATTGCTTATGTAGCGTATCCTTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCT GTTACTAACATGTTTACTTCCATTGTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGCG CGCTCTACGTCTGGAAGATCTGCGAATCCCTACTGCGTATGTTAAAACTTTCCAAG GACCGCCTCATGGCATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGTCGTCCC CTGTTGGGATGTACTATTAAACCTAAATTGGGGTTATCTGCTAAAAACTACGGAAG AGCAGTTTATGAATGTCTCCGCGGTGGACTTGATTTTAC  Trà vàng dày Camellia crassiphylla Ninh et Hakoda ATGTCACCACAAACAGAGACTAAAGCAAGTGTTGGATTCAAAGCTGGTGTTAAAGA TTACAAATTGACTTATTATACTCCTGACTATGAAACCAAAGATACTGATATCTTGG CAGCATTCCGAGTAACTCCGCAACCTGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCCGCG GTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGACTTAC TAGCCTTGATCGTTACAAAGGGCGATGCTACCACATCGAGCCCGTTGCTGGAGAAG AAAGTCAATTTATTGCTTATGTAGCGTATCCTTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCT GTTACTAACATGTTTACTTCCATTGTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGCG CGCTCTACGTCTGGAAGATCTGCGAATCCCTACTGCGTATGTTAAAACTTTCCAAG GACCGCCTCATGGCATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGTCGTCCC CTGTTGGGATGTACTATTAAACCTAAATTGGGGTTATCTGCTAAAAACTACGGAAG AGCAGTTTATGAATGTCTCCGCGGTGGACTTGATTTTAC  Trà vàng Tam Đảo Camellia tamdaoensis Hakoda et Ninh ATGTCACCACAAACAGAGACTAAAGCAAGTGTTGGATTCAAAGCTGGTGTTAAAGA TTACAAATTGACTTATTATACTCCTGACTATGAAACCAAAGATACTGATATCTTGG CAGCATTCCGAGTAACTCCGCAACCTGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCCGCG GTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGACTTAC TAGCCTTGATCGTTACAAAGGGCGATGCTACCACATCGAGCCCGTTGCTGGAGAAG AAAGTCAATTTATTGCTTATGTAGCGTATCCTTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCT GTTACTAACATGTTTACTTCCATTGTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGCG CGCTCTACGTCTGGAAGATCTGCGAATCCCTACTGCGTATGTTAAAACTTTCCAAG GACCGCCTCATGGCATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGTCGTCCC CTGTTGGGATGTACTATTAAACCTAAATTGGGGTTATCTGCTAAAAACTACGGAAG AGCAGTTTATGAATGTCTCCGCGGTGGACTTGATTTTAC Hoàng Minh Trang – K23 QH2014  Trà vàng Petelo Camellia petelotii (Merr.) Sealy ATGTCACCACAAACAGAGACTAAAGCAAGTGTTGGATTCAAAGCTGGTGTTAAAGA TTACAAATTGACTTATTATACTCCTGACTATGAAACCAAAGATACTGATATCTTGG CAGCATTCCGAGTAACTCCGCAACCTGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCCGCG GTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGACTTAC TAGCCTTGATCGTTACAAAGGGCGATGCTACCACATCGAGCCCGTTGCTGGAGAAG AAAGTCAATTTATTGCTTATGTAGCGTATCCTTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCT GTTACTAACATGTTTACTTCCATTGTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGCG CGCTCTACGTCTGGAAGATCTGCGAATCCCTACTGCGTATGTTAAAACTTTCCAAG GACCGCCTCATGGCATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGTCGTCCC CTGTTGGGATGTACTATTAAACCTAAATTGGGGTTATCTGCTAAAAACTACGGAAG AGCAGTTTATGAATGTCTCCGCGGTGGACTTGATTTTAC Trình tự đoạn trnH-psbA  Hải đường vàng Camellia tienii Ninh, Tr CGCGCATGGTGGATTCACAATCCACTGCCTTAATCCACTTGGCTACATCCGCCCCC TTACTCCACTATTTAAATTATAAAATAAAGAATTAAAATTCAACCATTCATGATTA TTTCTTTCTTCTCTTATTTTTGAGATACAAATAGTAAGCAAAAATTCAAAATTTTA TCTTTTATTTTAAATGGAAAATAACAATTTCACAAAGGTATATAAATTCTAAATTA ATACATAACAAAAAGACGATACTCAATGATGAACCAACCCATAAAAATCCTTTTCT TTTTACCCATACGAATCTTTTTCTTGTAACGAAAAAAGGATATGTAAAAAAAAAAA AGTAAAGGAACAATAATGCCTTCCTGATAGAACAAGAAATTGGTTATTGTTCCTTT ACTTTTAAAAACGAGTATACACTAAGACCAAAGTCTTATCCATTTGTAGATGGAGC TTCAATAGCAGCTAGGTCTAGAGGAAAGTTATGAGCATTACGTTCATGCATAAC  Trà vàng Hakoda Camellia hakodae Ninh CGCGCATGGTGGATTCACAATCCACTGCCTTAATCCACTTGGCTACATCCGCCCCC TTACTCCACTATTTAAATTATAAAATAAAGAATTAAAATTCAACCATTCATGATTA TTTCTTTCTTCTCTTATTTTTGAGATACAAATAGTAAGCAAAAATTCAAAATTTTA TCTTTTATTTTAAATGGAAAATAACAATTTCACAAAGGTATATAAATTCTAAATTA ATACATAACAAAAAGACGATACTCAATGATGAACCAACCCATAACCCATAAAAATC CTTTTCTTTTTACCCATACGAATCTTTTTCTTGTAACGAAAAAAGGATATGTAAAA AAAAAAAAGTAAAGGAACAATAATGCCTTCCTGATAGAACAAGAAATTGGTTATTG TTCCTTTACTTTTAAAAACGAGTATACACTAAGACCAAAGTCTTATCCATTTGTAG Hoàng Minh Trang – K23 QH2014 ATGGAGCTTCAATAGCAGCTAGGTCTAGAGGAAAGTTATGAGCATTACGTTCATGC ATAAC  Trà vàng dày Camellia crassiphylla Ninh et Hakoda CGCGCATGGTGGATTCACAATCCACTGCCTTAATCCACTTGGCTACATCCGCCCCC TTACTCCACTATTTAAATTATAAAATAAAGAATTAAAATTCAACCATTCATGATTA TTTCTTTCTTCTCTTATTTTTGAGATACAAATAGTAAGCAAAAATTAAAAATTTTA TCTTTTATTTTAAATGGAAAATAACAATTTCACAAAGGTATATAAATTCTAAATTA ATACATAACAAAAAGACGATACTCAATGATGAACCAACCCATAACCCATAAAAATC CTTTTTACCCATACGAATCTTTTTCTTGTAACGAAAAAAGGATATGTAAAAAAAAA AAAGTAAAGGAACAATAATGCCTTCCTGATAGAACAAGAAATTGGTTATTGTTCCT TTACTTTTAAAAACGAGTATACACTAAGACCAAAGTCTTATCCATTTGTAGATGGA GCTTCAATAGCAGCTAGGTCTAGAGGAAAGTTATGAGCATTACGTTCATGCATAAC  Trà vàng Tam Đảo Camellia tamdaoensis Hakoda et Ninh CGCGCATGGTGGATTCACAATCCACTGCCTTAATCCACTTGGCTACATCCGCCCCC TTACTCCACTATTTAAATTATAAAATAAAGAATTAAAATTCAACCATTCATGATTA TTTCTTTCTTCTCTTATTTTTGAGATACAAATAGTAAGCAAAAATTAAAAATTTTA TCTTTTATTTTAAATGGAAAATAACAATTTCACAAAGGTATATAAATTCTAAATTA ATACATAACAAAAAGACGATACTCAATGATGAACCAACCCATAACCCATAAAAATC CTTTTTACCCATACGAATCTTTTTCTTGTAACGAAAAAAGGATATGTAAAAAAAAA AAAGTAAAGGAACAATAATGCCTTCCTGATAGAACAAGAAATTGGTTATTGTTCCT TTACTTTTAAAAACGAGTATACACTAAGACCAAAGTCTTATCCATTTGTAGATGGA GCTTCAATAGCAGCTAGGTCTAGAGGAAAGTTATGAGCATTACGTTCATGCATAAC  Trà vàng Petelo Camellia petelotii (Merr.) Sealy CGCGCATGGTGGATTCACAATCCACTGCCTTAATCCACTTGGCTACATCCGCCCCC TTACTCCACTATTTAAATTATAAAATAAAGAATTAAAATTCAACCATTCATGATTA TTTCTTTCTTCTCTTATTTTTGAGATACAAATAGTAAGCAAAAATTAAAAATTTTA TCTTTTATTTTAAATGGAAAATAACAATTTCACAAAGGTATATAAATTCTAAATTA ATACATAACAAAAAGACGATACTCAATGATGAACCAACCCATAACCCATAAAAATC CTTTTCTTTTTACCCATACGAATCTTTTTCTTGTAACGAAAAAAGGATATGTAAAA AAAAAAAAAGTAAAGGAACAATAATGCCTTCCTGATAGAACAAGAAATTGGTTATT GTTCCTTTACTTTTAAAAACGAGTATACACTAAGACCAAAGTCTTATCCATTTGTA GATGGAGCTTCAATAGCAGCTAGGTCTAGAGGAAAGTTATGAGCATTACGTTCATG CATAAC Hoàng Minh Trang – K23 QH2014 Trình tự đoạn ycf1b  Hải đường vàng Camellia tienii Ninh, Tr TTAGTATCCTTATTATTAGGATCGGTATTTCCCCGGTTATCAGTAAAAATCACTAC ACGTTTGGCTTTTCTTGAACGAATCTGATAATCTATTGGTACTTCTTCTTCACTTT CTCCTTCCTGTTGTTCTAATTCGTTGATTAATTTGTATGACCATCGAGGGACTTTT TTACTGATTTCTTTTATTCCAATAGATTTTTTTTTTTTTTTTTGATCATTAAGATC ACTTCTAATTGCATTGAATAAAAATTTTGTTTTATTTTCGGAATCCATTCTTCCTT GTTCTGAAAATAAAGAAGATCCTTTCAAATTCAAATTTGATTTAAGTTCACTGATT AAAGTTAAGAAATAACTCATTTTTGTTGATAATGGGTTGTTATCAAATATATCTGT TTTATCTTTAAATTCTCGAGAATCAGTATCAGTAAGAAAGATAGTATGAATCTTAT TTTTTTCTATGAAATTTTCTATTGAAGTTTCATTTATGATTAAAGGTGAAAACAAA TTTTGTATTGTTCCACGATGTGGTCCATTCAAGAAAGGATCATATATTTTGGGCAA GTATTCTTTTTTAGGCTCATCATTACACAATCTAATCCTTTTTTCAAGTAAATCCA GAGAAAGAAATTCTTTGGATAGAACCTCAATTCTATTTATCAACTTTTTGTTTAGA TTGTTACTTTTTTGTTTGTTGGTCGAAACCCAATGGTTGTACAGTTCATCAGAGGA GAGTTTTTCTATTATGGACAAGGACATCTTTCTT  Trà vàng Hakoda Camellia hakodae Ninh TTAGTATCCTTATTATTAGGATCGGTATTTCCCCGGTTATCAGTAAAAATCACTAC ACGTTTGGCTTTTCTTGAACGAATCTGATAATCTATTGGTACTTCTTCTTCACTTT CTCCTTCCTGTTGTTCTAATTCGTTGATTAATTTGTATGACCATCGAGGGACTTTT TTACTGATTTCTTTTATTCCAATAGATTTTTTTTTTTTTTTTTGATCATTAAGATC ACTTCTAATTGCATTGAATAAAAATTTTGTTTTATTTTCGGAATCCATTCTTCCTT GTTCTGAAAATAAAGAAGATCCTTTCAAATTCAAATTTGATTTAAGTTCACTGATT AAAGTCAAGAAATAACTCATTTTTGTTGATAATGGGTTGTTATCAAATATATCTGT TTTATCTTTAAATTCTCGAGAATCAGTATCAGTAAGAAAGATAGTATGAATCTTAT TTTTTTCTATGAAATTTTCTATTGAAGTTTCATTTATGATTAAAGGTGAAAACAAA TTTTGTATTGTTCCACGATGTGGTCCATTCAAGAAAGGATCATATATTTTGGGCAA GTATTCTTTTTTAGGCTCATCATTACACAATCTAATCCTTTTTTCAAGTAAATCCA GAGAAGGAAATTCTTTGGATAGAACCTCAATTCTATTTATCAACTTTTTGTTTAGA TTGTTACTTTTTTGTTTGTTGGTCGAAACCCAATGGTTGTACAGTTCATCAGAGGA GAGTTTTTCTATTATGGACAAGGACATCTTTCTT  Trà vàng dày Camellia crassiphylla Ninh et Hakoda TTAGTATCCTTATTATTAGGATCGGTATTTCCCCGGTTATCAGTAAAAATCACTAC ACGTTTGGCTTTTCTTGAACGAATCTGATAATCTATTGGTACTTCTTCTTCACTTT CTCCTTCCTGTTGTTCTAATTCGTTGATTAATTTGTATGACCATCGAGGGACTTTT TTACTGATTTCTTTTATTCCAATAGATTTTTTTTTTTTTTTTTGATCATTAAGATC Hoàng Minh Trang – K23 QH2014 ACTTCTAATTGCATTGAATAAAAATTTTGTTTTATTTTCGGAATCCATTCTTCCTT GTTCTGAAAATAAAGAAGATCCTTTCAAATTCAAATTTGATTTAAGTTCACTGATT AAAGTCAAGAAATAACTCATTTTTGTTGATAATGGGTTGTTATCAAATATATCTGT TTTATCTTTAAATTCTCGAGAATCAGTAAGAAAGATAGTATGAATCTTATTTTTTT CTATGAAATTTTCTATTGAAGTTTCATTTATGATTAAAGGTGAAAACAAATTTTGT ATTGTTCCACGATGTGGTCCATTCAAGAAAGGATCATATATTTTGGGCAAGTATTC TTTTTTAGGCTCATCATTACACAATCTAATCCTTTTTTCAAGTAAATCCAGAGAAA GAAATTCTTTGGATAGAACCTCAATTCTATTTATCAACTTTTTGTTTAGATTGTTA CTTTTTTGTTTGTTGGTCGAAACCCAATGGTTGTACAGTTCATCAGAGGAGAGTTT TTCTATTATGGACAAGGACATCTTTCTT  Trà vàng Tam Đảo Camellia tamdaoensis Hakoda et Ninh TTAGTATCCTTATTATTAGGATCGGTATTTCCCCGGTTATCAGTAAAAATCACTAC ACGTTTGGCTTTTCTTGAACGAATCTGATAATCTATTGGTACTTCTTCTTCACTTT CTCCTTCCTGTTGTTCTAATTCGTTGATTAATTTGTATGACCATCGAGGGACTTTT TTACTGATTTCTTTTATTCCAATAGATTTTTTTTTTTTTTTTTGATCATTAAGATC ACTTCTAATTGCATTGAATAAAAATTTTGTTTTATTTTCGGAATCCATTCTTCCTT GTTCTGAAAATAAAGAAGATCCTTTCAAATTCAAATTTGATTTAAGTTCACTGATT AAAGTCAAGAAATAACTCATTTTTGTTGATAATGGGTTGTTATCAAATATATCTGT TTTATCTTTAAATTCTCGAGAATCAGTAAGAAAGATAGTATGAATCTTATTTTTTT CTATGAAATTTTCTATTGAAGTTTCATTTATGATTAAAGGTGAAAACAAATTTTGT ATTGTTCCACGATGTGGTCCATTCAAGAAAGGATCATATATTTTGGGCAAGTATTC TTTTTTAGGCTCATCATTACACAATCTAATCCTTTTTTCAAGTAAATCCAGAGAAA GAAATTCTTTGGATAGAACCTCAATTCTATTTATCAACTTTTTGTTTAGATTGTTA CTTTTTTGTTTGTTGGTCGAAACCCAATGGTTGTACAGTTCATCAGAGGAGAGTTT TTCTATTATGGACAAGGACATCTTTCTT  Trà vàng Petelo Camellia petelotii (Merr.) Sealy TTAGTATCCTTATTATTAGGATCGGTATTTCCCCGGTTATCAGTAAAAATCACTAC ACGTTTGGCTTTTCTTGAACGAATCTGATAATCTATTGGTACTTCTTCTTCACTTT CTCCTTCCTGTTGTTCTAATTCGTTGATTAATTTGTATGACCATCGAGGGACTTTT TTACTGATTTCTTTTATTCCAATAGATTTTTTTTTTTGATCATTAAGATCACTTCT AATTGCATTGAATAAAAATTTTGTTTTATTTTCGGAATCCATTCTTCCTTGTTCTG AAAATAAAGAAGATCCTTTCAAATTCAAATTTGATTTAAGTTCACTGATTAAAGTC AAGAAATAACTCATTTTTGTTGATAATGGGTTGTTATCAAATATATCTGTTTTATC TTTAAATTCTCGAGAATCAGTAAGAAAGATAGTATGAATCTTATTTTTTTCTATGA AATTTTCTATTGAAGTTTCATTTATGATTAAAGGTGAAAACAAATTTTGTATTGTT Hoàng Minh Trang – K23 QH2014 CCACGATGTGGTCCATTCAAGAAAGGATCATATATTTTGGGCAAGTATTCTTTTTT AGGCTCATCATTACACAATCTAATCCTTTTTTCAAGTAAATCCAGAGAAAGAAATT CTTTGGATAGAACCTCAATTCTATTTATCAACTTTTTGTTTAGATTGTTACTTTTT TGTTTGTTGGTCGAAACCCAATGGTTGTACAGTTCATCAGAGGAGAGTTTTTCTAT TATGGACAAGGACATCTTTCTT Trình tự đoạn ITS2  Hải đường vàng Camellia tienii Ninh, Tr ATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAGTCTTTGAACGCA AGTTGCGCCCGAAGCCATTAGGCTGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCTCACGTTGC GTCGCCCGCGCCCCCTCCCCCGCGAAGGGAAGAAGGGCTGCGGGCGGATGCTGGCC CCCCGCGCGCGGTCGGCCCAAAAACGAGTCCCCCGCGACGGACGACGCGTCGCGAC GAGTGGTGGTTGACAAACCGTTGCGTCGCCTCGCGCGCGTCCGCGCCGTCTCGGGA GGCCTGTCGTGACCCCATCGCGCCGCCAAGGCCAAGGCCAAGGCCAAGGCGCTCCG ATCGCGACCCCAGGTCAGGCGGGATTACCCGCTGAGTTTAAGCATATCAATAAGCG GAGGA  Trà vàng Hakoda Camellia hakodae Ninh ATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAGTCTTTGAACGCA AGTTGCGCCCGAAGCCATTAGGCTGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCTCACGTTGC GTCGCCCGCGCCCCCTCCCCCGCGAAGGGAAGAAGGGCTGCGGGCGGATGCTGGCC CCCCGCGCGCGGTCGGCCCAAAAACGAGTCCCCCGCGACGGACGACGCGTCGCGAC GAGTGGTGGTTGACAAACCGTTGCGTCGCCTCGCGCGCGTCCGCGCCGTCTCGGGA GGCCTGTCGTGACCCCATCGCGCCGCCAAGGCCAAGGCCAAGGCCAAGGCGCTCCG ATCGCGACCCCAGGTCAGGCGGGATTACCCGCTGAGTTTAAGCATATCAATAAGCG GAGGA  Trà vàng dày Camellia crassiphylla Ninh et Hakoda ATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAGTCTTTGAACGCA AGTTGCGCCCGAAGCCATTAGGTTGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCTCACGTTGC GTCGCCCGCGCCCCCCTCCCCCGCGAAGGGAAGAAGGGCTGCGGGCGGATGCTGGC CCCCCGCGCGCGCCCGCGCACGGTCGGCCCAAAAGCGAGTCCCCCGCGACGGACGA CGCGTCGCGACGAGTGGTGGTTGACAAACCGTTGCGTCGCCTCGCGCGCGTCCGCG CCGTCTCGGGAGGCCTGTCGTGACCCCATCGCGCCAAGGCCAAGGCCAAGGCGCTC CGATCGCGACCCCAGGTCAGGCGGGATTACCCGCTGAGTTTAAGCATATCAATAAG CGGAGGA Hoàng Minh Trang – K23 QH2014  Trà vàng Tam Đảo Camellia tamdaoensis Hakoda et Ninh ATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAGTCTTTGAACGCA AGTTGCGCCCGAAGCCATTAGGTTGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCTCGCGTTGC GTCGCCCGCGCCCCCCTCCCCCGCGAAGGGAAGAAGGGCTGCGGGCGGATGCTGGC CCCCCGCGCGCGCCCGCGCGCGGTCGGCCCAAAAGCGAGTCCCCCGCGACGGACGA CGCGTCGCGACGAGTGGTGGTTGACAAACCGTTGCGTCGCCTCGCGCGCGTCCGCG CCGTCTCGGGAGGCCTGTCGTGACCCCATCGCGCCAAGGCCAAGGCCAAGGCGCTC CGATCGCGACCCCAGGTCAGGCGGGATTACCCGCTGAGTTTAAGCATATCAATAAG CGGAGGA  Trà vàng Petelo Camellia petelotii (Merr.) Sealy ATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAGTCTTTGAACGCA AGTTGCGCCCGAAGCCATTAGGCTGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCTCACGTTGC GTCGCCCGCGCCCCCTCCCCCGCGAAGGGAAGAAGGGCTGCGGGCGGATGCTGGCC CCCCGCGCGCGGTCGGCCCAAAAACGAGTCCCCCGCGACGGACGACGCGTCGCGAC GAGTGGTGGTTGACAAACCGTTGCGTCGCCTCGCGCGCGTCCGCGCCGTCTCGGGA GGCCTGTCGTGACCCCATCGCGCCGCCAAGGCCAAGGCCAAGGCCAAGGCGCTCCG ATCGCGACCCCAGGTCAGGCGGGATTACCCGCTGAGTTTAAGCATATCAATAAGCG GAGGA Hoàng Minh Trang – K23 QH2014 CÁC CÔNG TRÌNH CÔNG BỐ LIÊN QUAN ĐẾN NGHIÊN CỨU Hoàng Minh Trang, Hà Văn Huân, Phạm Thành Trang, Dương Thị Hoa, Vũ Thị Bích Thuận, “Xác định đoạn mã vạch ADN (DNA barcode) cho loài Hải đường vàng (Camellia Tienii Ninh): Phục vụ giám định loài”, Tạp chí Nông nghiệp & PTNT, tr240-246 Hoàng Minh Trang, Hà Văn Huân, Hoàng Vũ Thơ, Nguyễn Trung Thành, “Nghiên cứu xác định đoạn DNA barcode cho loài Trà hoa vàng dày (Camellia crassiphylla): Phục vụ giám định loài”, Tạp chí Khoa học Công nghệ Lâm nghiệp, tr3-10 ...ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN HOÀNG MINH TRANG XÁC ĐỊNH MỘT SỐ ĐOẠN MÃ VẠCH ADN CHO MỘT SỐ LOÀI TRÀ HOA VÀNG Ở VƯỜN QUỐC GIA TAM ĐẢO Chuyên ngành:... Xác định số đoạn mã vạch ADN cho số loài Trà hoa vàng Vườn Quốc gia Tam Đảo với đối tượng phân tích năm vùng trình tự rbcL, matK, ycf1b, trnH – psbA ITS2 Kết thu đóng góp vào Ngân hàng gen Quốc. .. nghiên cứu Trà hoa vàng VQG Tam Đảo 1.1.3 Đảo Đặc điểm hình thái phân bố số loài Trà hoa vàng VQG Tam 1.1.4 Trà hoa vàng giá trị sử dụng 1.2 Tổng quan mã vạch ADN

Ngày đăng: 17/05/2017, 18:21

Từ khóa liên quan

Tài liệu cùng người dùng

  • Đang cập nhật ...

Tài liệu liên quan