Nghiên cứu đặc điểm lâm sàng, cận lâm sàng và căn nguyên của viêm phổi mắc phải tại cộng đồng

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y HÀ NỘI TẠ THỊ DIỆU NGÂN NGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM LÂM SÀNG, CẬN LÂM SÀNG VÀ CĂN NGUYÊN CỦA VIÊM PHỔI MẮC PHẢI TẠI CỘNG ĐỒNG LUẬN ÁN TIẾN SĨ Y HỌC HÀ NỘI – 2016 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y HÀ NỘI TẠ THỊ DIỆU NGÂN NGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM LÂM SÀNG, CẬN LÂM SÀNG VÀ CĂN NGUYÊN CỦA VIÊM PHỔI MẮC PHẢI TẠI CỘNG ĐỒNG Chuyên ngành: Truyền nhiễm Bệnh Nhiệt đới Mã số : 62720153 LUẬN ÁN TIẾN SĨ Y HỌC Người hướng dẫn khoa học: PGS.TS Nguyễn Văn Kính PGS.TS Nguyễn Vũ Trung HÀ NỘI - 2016 LỜI CAM ĐOAN Tôi Tạ Thị Diệu Ngân, nghiên cứu sinh khóa 29, Trường Đại học Y Hà Nội, chuyên ngành Truyền Nhiễm, xin cam đoan: Đây luận án thân trực tiếp thực hướng dẫn PGS.TS Nguyễn Văn Kính, PGS.TS Nguyễn Vũ Trung Công trình không trùng lặp với nghiên cứu khác công bố Việt Nam Các số liệu thông tin nghiên cứu hoàn toàn xác, trung thực khách quan, xác nhận chấp thuận sở nơi nghiên cứu Tôi xin hoàn toàn chịu trách nhiệm trước pháp luật cam kết Hà Nội, ngày 16 tháng 10 năm 2016 Người viết cam đoan Tạ Thị Diệu Ngân LỜI CẢM ƠN Để hoàn thành luận án này, nhận nhiều giúp đỡ thầy cô giáo, đồng nghiệp, bạn bè, quan gia đình Tôi xin bày tỏ lòng kính trọng biết ơn sâu sắc tới: PGS TS Nguyễn Văn Kính, Giám đốc Bệnh viện Bệnh Nhiệt đới Trung ương, Trưởng Bộ môn Truyền nhiễm Trường Đại học Y Hà Nội PGS TS Nguyễn Vũ Trung, Phó Giám đốc Bệnh viện Bệnh Nhiệt đới Trung ương, Trưởng Bộ môn Vi sinh Trường Đại học Y Hà Nội Các Thầy trực tiếp hướng dẫn, bảo tận tình cho suốt trình học tập cho nhiều ý kiến quý báu toàn trình thực để hoàn thành luận án Tôi xin bày tỏ lòng biết ơn trân trọng tới: Đảng ủy, Ban Giám hiệu, Phòng Đào tạo Sau Đại học Trường Đại học Y Hà Nội; Đảng ủy, Ban Giám đốc, Khoa Phòng Bệnh viện Bệnh Nhiệt đới Trung ương; PGS.TS Bùi Vũ Huy thầy cô Bộ môn Truyền nhiễm Trường Đại học Y Hà Nội, tạo điều kiện cho trình học tập thực nghiên cứu Tôi xin chân thành cảm ơn PGS TS Heiman Wertheim cán Đơn vị Nghiên cứu Lâm sàng Trường Đại học Oxford, Vương Quốc Anh.; Ban Giám đốc thành viên tham gia nghiên cứu 03HN Bệnh viện Đa khoa Đống Đa, Bệnh viện Đa khoa Đức Giang nhiệt tình hỗ trợ trình thu thập số liệu, thực xét nghiệm để hoàn thành luận án Với tất lòng kính trọng, xin cảm ơn Thầy Cô Hội đồng chấm luận án tốt nghiệp đóng góp ý kiến quí báu để hoàn thành tốt luận án Tôi xin gửi lời cảm ơn tới bạn bè, đồng nghiệp động viên, cổ vũ, giúp đỡ nhiều trình học tập Tôi xin dành tất tình cảm yêu quý biết ơn tới người thân gia đình tôi, người hết lòng sống học tập Hà Nội , ngày 10 tháng năm 2016 Tạ Thị Diệu Ngân DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT ADN Axit deoxyribonucleic AFB Acid fast bacilli (Trực khuẩn kháng acid) ANSORP Asian Network for Surveillance of Resistant Pathogens (Mạng lưới Giám sát Tác nhân Kháng thuốc Khu vực châu Á) ARDS Acute respiratory distress syndrome (Hội chứng suy hô hấp cấp) ARN Axit ribonucleic ATS American Thoracic Society (Hội lồng ngực Mỹ) BTS British Thoracic Society (Hội lồng ngực Anh) CAP Community-acquired pneumoniae (Viêm phổi mắc phải cộng đồng) CF Complement fixation (Cố định bổ thể) CMV Cytomegalovirus COPD Chronic obstructive pulmonary disease (Bệnh phổi mạn tính tắc nghẽn) CRP C-reactive protein (Protein C phản ứng) CS Cộng CT Computerized tomography (Chụp cắt lớp vi tính) Ct Cycle threshold (Ngưỡng chu kỳ) CURB65 Confusion-Uremia-Respiratory-Blood pressure-65 (Rối loạn ý thức-Ure máu-Nhịp thở-Huyết áp động mạch-65 tuổi) ĐTTC Điều trị tích cực ELISA Enzyme-linked immunosorbent assay (Phản ứng hấp phụ miễn dịch có gắn men) FEV1 Forced expiratory volume in second (Thể tích thở gắng sức giây) FVC Forced vital capacity (Dung tích sống thở mạnh) HA Huyết áp HAP Hospital acquired pneumoniae (Viêm phổi mắc phải Bệnh viện) HCAP Health care-associated pneumoniae (Viêm phổi liên quan đến chăm sóc y tế) HIV Human immunodeficiency virus (Vi rút gây suy giảm Miễn dịch người) HMPV Human metapneumovirus HPIV Human parainfluenza virus (Virus cúm người) IDSA Infectious Diseases Society of America (Hội Bệnh Nhiễm trùng Mỹ) IFA Immunofluorescence assay (Thử nghiệm miễn dịch huỳnh quang) IgG Immunoglobulin G IgM Immunoglobulin M IL Interleukin IQR Interquartile range (Tứ phân vị) KT Kháng thể MIC Minimum inhibitory concentration (Nồng độ ức chế tối thiểu) MIF Migration inhibition assay (Thử nghiệm ức chế di chuyển) PCR Polymerase chain reaction (Phản ứng khuếch đại chuỗi) PCT Procalcitonin PMN Polymorphonuclear (Bạch cầu đa nhân trung tính) PORT Pneumonia Patient Outcomes Research Team (Nhóm nghiên cứu kết cục bệnh nhân viêm phổi) PSI Pneumoniae severity index (Chỉ số đánh giá mức độ nặng viêm phổi) RSV Respiratory syncytial virus (Vi rút hợp bào hô hấp) RT-PCR Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction Phản ứng khuếch đại chuỗi dùng men chép ngược SARS Severe acute respiratory syndrome (Hội chứng hô hấp cấp tính nặng) SEC Squamous epithelium cell (Tế bào biểu mô vẩy) SGMD Suy giảm miễn dịch TCLS Triệu chứng lâm sàng VAP Ventilation acquired pneumoniae (Viêm phổi thở máy) VC Vital capacity (Dung tích sống) VK Vi khuẩn VP Viêm phổi VPMPTCĐ Viêm phổi mắc phải cộng đồng WHO World health organisation (Tổ chức Y tế Thế giới) MỤC LỤC DANH MỤC BẢNG DANH MỤC BIỂU ĐỒ DANH MỤC SƠ ĐỒ, HÌNH VẼ DANH MỤC BẢNG DANH MỤC BIỂU ĐỒ