Phân tích số liệu trong y tế. ThS. Đỗ Thanh Toàn

THNG Kấ C BN V PHN TCH S LIU Y T ThS Thanh Ton (dothithanhtoan@hmu.edu.vn) BM Thng kờ, Tin hc Y hc Mc tiờu hc Sau bi học, hc viên có khả năng: 1. Trỡnh by c mt s khỏi nim c bn v thng kờ v phõn tớch s liu 2. Trỡnh by v ỏp dng c nguyờn tc la chn trc nghim thng kờ cho cỏc mc tiờu phõn tớch v bin s 3. Trỡnh by v ỏp dng c nguyờn tc phiờn gii c kt qu phõn tớch s liu 4. Lp c cỏc bng, biu cho d kin phõn tớch s liu cho cng NC nhúm thống kê gì? Là môn khoa học liên quan đến: J thu thập J tổ chức J tóm tắt J phân tích số liệu nhằm đưa suy luận toàn hay phần quần thể nghiên cứu Thng kờ y sinh hc " Thng kờ y sinh hc l cm t bao gm y sinh v thng kờ Y sinh cú ngha l cuc sng, cũn thng kờ liờn quan n thu thp, t chc, phõn tớch v phiờn gii cỏc SL " Thng kờ y sinh hc liờn quan n ng dng cỏc phng phỏp TK vo KH cuc sng nh sinh hc, y hc v y t cụng cng " Thng kờ cú ý ngha khỏc cỏc ng cnh khỏc VD: TK YTCC, TK bnh vin, TK dõn s, TK cỏc dch v, vvv S LIU " L kt qu quan sỏt c trờn tng cỏ th (hay tng i tng nghiờn cu) Vớ d: Quan sỏt h gia ỡnh: S ngi h: (4 nam, n) S tr di tui: Ngun nc: nc ging khoan Loi nh : kiờn c Thu nhp bỡnh quõn: triu/thỏng S LIU " Loi s liu - Ngun s liu S liu ban u: Do t thu thp " Qua iu tra " Nghiờn cu th nghim S liu cú sn: Do ngi khỏc thu thp " T kt qu ca cỏc nghiờn cu khỏc " T bỏo cỏo, s sỏch, h s, bnh ỏn, BIN S " L cỏc c im cú th quan sỏt c " Bin nh tớnh: Vớ d: dõn tc, gii tớnh, ngh nghip, " Bin nh lng (bin dng s): Bin liờn tc: chiu cao theo cm, cõn nng theo kg Bin ri rc: s bnh nhõn n khỏm mt ngy, s ging bnh, s trng giun tiờu bn, Tôi cân nặng bao nhiêu?! Nhiệt độ bình nước nào? ! Tôi ăn bữa ngày Tôi có đẹp trai không?! Lượng thức ăn nhận TB ngày bao nhiêu?! QUN TH V MU NGHIấN CU " Qun th: Tp hp ton b cỏc cỏ th mà quan tâm khía cạnh khoảng thời gian định " Mu: Phn c chn o lng, quan sỏt c gi l mu Quần thể với cỡ N! P! à! ! Chọn mẫu! p s X Mẫu với cỡ n Cú hai lnh vc chớnh ca thng kờ " Thng kờ mụ t Cỏc s, c mụ t da trờn cỏc giỏ tr thng kờ nh: trung bỡnh, trung v, mode, tng s, khong, lch chun, t l, Trỡnh by cỏc kt qu da trờn cỏc bng biu v th " Thng kờ suy lun Da trờn cỏc s t mt mu cung cp cỏc giỏ tr khỏi quỏt, suy lun v qun th Quần thể đích! Lựa chọn! Mẫu xác suất! - Ngẫu nhiên đơn ! - Ngẫu nhiên hệ thống! - Mẫu phân tầng ! - Mẫu chùm ! - Mẫu nhiều bậc! Mẫu không xác suất! - Mẫu kinh nghiệm ! - Mẫu thuận tiện ! - Mẫu tiêu! - Mẫu có mục đích.! - Khung chọn mẫu! - Đơn vị quan sát! - Đơn vị mẫu! - Các số! Kết luận ngoại suy! Quần thể nghiên cứu! Tham số quần thể! (à, , P )! Ước lượng! điểm! khoảng! Suy luận thông kê (Chỉ áp dụng cho mẫu xác suất với cỡ mẫu đủ lớn)! Chọn mẫu! Mẫu! Kiểm định giả thuyết! Giá trị p Tham số mẫu! ( X , s, p )! Biến số! Các test thống kê Mô tả tham số mẫu! (trình bày kết nghiên cưú)! Thng kờ Mụ t bin nh lng Mụ t bin nh tớnh Suy lun bin nh lng Suy lun bin nh tớnh Thng kờ mụ t bin nh lng " o lng trung Trung bỡnh (mean) Trung v (median) Mode " o lng phõn tỏn Khong s liu (range) Khong t phõn v (25%-75%) (Interquartile ) lch chun (Standard deviation) Phng sai (Variance) Tng hp v mụ t s liu nh lng DTT - Tong hop so lieu 14 o lng phõn tỏn DTT - Tong hop so lieu 15 Thng kờ mụ t bin nh tớnh " Tn s: S ln xut hin ca mt quan sỏt " T s: L phõn s m mu s khụng bao hm t s " T l phn trm: L phõn s m mu s bao hm t s " T sut: dng c bit ca t l c o lng mt khong thi gian nht nh N Range Minimum Maximum Mean HAT 373 125.0 TB 86.0 211.0 Statistics huyet ap toi da tb N Valid 373 Missing Percentiles 10 20 25 30 40 50 60 70 75 80 90 122.4 Std Deviation Variance 19.3 371.9 101.0000 110.4000 111.0000 111.0000 114.0000 121.0000 121.0000 128.4000 131.0000 133.1000 147.3000 Thc hnh " M file s liu trờn SPSS Mn hỡnh data view: mn hỡnh s liu Mn hỡnh variable view: xem tờn bin s v gii thớch ca bin s " Thc hin thng kờ mụ t: bin nh lng Analyze -> Descriptive Statistic -> Descriptive Kim tra phõn b s liu " Thc hin thng kờ mụ t: bin nh tớnh Analyze -> Descriptive Statistic -> Crosstab Thng kờ suy lun " L quỏ trỡnh ngoi suy kt qu nghiờn cu t mu qun th nghiờn cu: c lng khong Kim nh gi thuyt Cỏc tham s mu v tham s qun th Cỏc tiờu thc Tham s qun th Tham s mu X Trung binh số học (mean) Phương sai (variance) s2 ộ lệch chuẩn (standard deviation s Tỷ lệ (proportion) P Sự khác gia giá trị trung bỡnh à1 à2 - Sự khác gia tỷ lệ P1 P2 p X1 X p1 p 10 c lng khong-khong tin cy (confidence interval) " Thng chn khong tin cy 95% (95%CI) " Khi thc hin o c 100 ln thỡ it nht 95 ln kt qu nm khong tin cy " 95% tin tng rng giỏ tr thc ca qun th nm khong tin cy 95%CI= Trung bỡnh 1,96*sai s chun c lng khong-khong tin cy (confidence interval) Confidence interval 90 95 99 99.9 Multiplying factor 1.64 1.96 2.58 3.29 11 Sai s chun (standard errors) 95%CI= Trung bỡnh 1,96*sai s chun Thc hnh (SPSS) " Thc hin c lng khong cho giỏ tr trung bỡnh Analyze -> Descriptive Statistic -> Explore 12 Kim nh gi thuyt S dng trc nghim (test) thng kờ a kt lun v gi thuyt ca nh nghiờn cu l chp nhn c hay khụng Qun th Chn mu Ngoi suy Trc nghim thng kờ Mu NC Gi thuyt nghiờn cu " Gi thuyt Ho: Khụng cú s khỏc bit (iu tr khụng hiu qu) " Gi thuyt Ha: Cú s khỏc bit (iu tr cú hiu qu) 13 Cỏc loi sai lm kim nh Loi quyt nh Thc t Ho ỳng Ho sai Chp nhn Ho x Sai lm loi II () Bỏc b Ho Sai lm loi I () x Mc ý ngha thng kờ " Loi b sai lm loi I = 0.05 p = probability= Xỏc sut gi thuyt Ho ỳng p 95% = Ha xy l chc chn = Chp nhn Ha p>0.05 = ??? 14 Mc ý ngha thng kờ 01 (99) 02(98) 05 (95) 10 (90) Z(1-/2) 2.576 2.326 1.960 1.645 mnh " Loi b sai lm loi II 1- = 80% Thng dựng tớnh toỏn c mu 1- Z(1-) 80 85 90 95 0.842 1.036 1.282 1.645 15 La chn trc nghim thng kờ " Mc tiờu ca nghiờn cu? So sỏnh: Cỏc giỏ tr trung bỡnh Cỏc t l Tỡm mi liờn quan gia cỏc bin NC: Gia hai bin: " Gia nhiu bin " Xỏc nh s khỏc bit hai bin nh lng " nhúm Phõn b chun t test Phõn b K chun Sign test/ Wilcoxon test " nhúm Phõn b chun t test (Ph sai .nh t) Phõn b K chun MannWhitney test " >2 nhúm Phõn b chun Phõn b K chun ANOVA (ph.s .nh t) KruskalWallis test 16 T test (Student t test) " S dng cho s liu nh lng, cú phõn b chun " So sỏnh s khỏc bit v giỏ tr trung bỡnh ca mt hoc hai nhúm c lp " Lnh trờn SPSS: So sỏnh mt nhúm c lp: Analyze -> Compare Means -> One-Sample T test So sỏnh hai nhúm c lp Analyze -> Compare Means -> Independent-Samples T test Mann-Whitney test " S dng cho so sỏnh giỏ tr trung bỡnh ca cỏc nhúm c lp, s liu l phõn b khụng chun hoc chun " Analyze -> Nonparametric Tests -> Independent Samples 17 ANOVA test " So sỏnh giỏ tr trung bỡnh ca cỏc nhúm c lp " iu kin: - Bin s kim nh cú phõn b chun - Phng sai ng nht gia cỏc nhúm Analyze -> Compare Means -> One-Way ANOVA (ỏnh du hp Option: Homogeneity of variance test kim nh tớnh ng nht ca phng sai) Kruskal Wallis Test " So sỏnh giỏ tr trung bỡnh ca cỏc nhúm c lp bin s kim nh cú phõn b khụng chun hoc chun Analyze -> Nonparametric Tests -> K Independent Samples 18 Xỏc nh s khỏc bit bin nh tớnh Z test nhúm > nhúm Giỏ tr mong i Giỏ tr mong i < Khi bỡnh phng Fishers exact test Z test " So sỏnh mt t l mu vi mt t l lý thuyt Analyze -> Nonparametric Tests -> Binomial Test 19 Test Khi bỡnh phng " So sỏnh hai hay nhiu t l " iu kin: Di 20% s ụ bng cú tn s mong i (E) < v khụng cú ụ no cú tn s mong i Descriptive Statistic -> Crosstab Hoc Analyze -> Nonparametric Tests -> Chi-square Test Xỏc nh mi liờn quan " Bin nh lng: vH s tng quan (r) ỹpearson ỹspearman vHi quy tuyn tớnh " Bin nh tớnh vT sut chờnh (OR), nguy c tng i (RR) vHi quy logistic 20 Tng quan ca hai bin nh lng " H s tng quan r Cú giỏ tr t -1 n +1 " " " Khi HSTQ > => tng quan ng bin Khi HSTQ < => tng quan nghch bin Cng gn => tng quan cng cht Quy c: " " " " =0,3-0,5: tng quan TB >=0,5-0,7: tng quan cht ch >=0,7: tng quan rt cht ch Tng quan ca hai bin nh lng Analyze -> Correlate -> Bivariate Chn Pearson cỏc bin tng quan l phõn b chun Chn Spearman cỏc bin tng quan khụng tuõn theo phõn b chun 21 Tng quan ca bin nh tớnh " Khi mun tỡm cng mi liờn quan gia hai bin nh tớnh=> cú th s dng: Nguy c tng i: RR, hoc T sut chờnh: OR Bnh Khụng bnh Tng Phi nhim a b a+b Khụng phi nhim c d c+d Tng a+c b+d a+b+c+d Cụng thc tớnh OR - RR " RR = Risk ratio = risk1/risk2 " OR = Odds ratio = odds1/ odds2 " RR/OR cú th: >1 =1 Descriptive Statistic -> Crosstab => Chn Risk hp Statistics 22 Z test cho t l Bin nh tớnh Z test cho t l Test cho t l Quan sỏt c lp Bin nh lng Tỡm s khỏc bit T test cho giỏ tr trung bỡnh Quan sỏt ghộp cp Gi thuyt nghiờn cu Bin nh tớnh - Test Mc Nemar Bin nh lng - Test t ghộp cp Bin nh tớnh Tỡm mi tng quan T test cho giỏ tr trung bỡnh Test tỡm mi liờn quan Bin nh lng H s tng quan Hi qui tuyn tớnh Mt s vớ d (matching) Tỡm mi liờn quan gia hai bin nh lng So sỏnh huyt ỏp (mmHg) trc v sau iu tr ca mt nhúm bnh nhõn T l bnh sau iu tr thuc A cú tng khụng? Nng Hb mỏu trung bỡnh ca nhng ngi mc bnh x gan so vi ngi bỡnh thng Liờn quan gia gii v tỡnh trng bnh tiu ng (cú bnh/khụng bnh) nghiờn cu bnh chng A Phõn tớch tng B Test t student C Test t ghộp cp D H s tng quan E Nguy c tng i F T sut chờnh G Test Chi bỡnh phng 23 [...]... tin c y (confidence interval) " Thường chọn khoảng tin c y 95% (95%CI) " Khi thực hiện đo đạc 100 lần thì it nhất 95 lần kết quả nằm trong khoảng tin c y " 95% tin tưởng rằng giá trị thực của quần thể nằm trong khoảng tin c y 95%CI= Trung bình ± 1,96*sai số chuẩn Ước lượng khoảng-khoảng tin c y (confidence interval) Confidence interval 90 95 99 99.9 Multiplying factor 1.64 1.96 2.58 3.29 11 Sai số chuẩn... biến " Xác định sự khác biệt hai biến định lượng " 1 nhóm Phân bố chuẩn t test Phân bố K chuẩn Sign test/ Wilcoxon test " 2 nhóm Phân bố chuẩn t test (Ph sai đ.nh ất) Phân bố K chuẩn MannWhitney test " >2 nhóm Phân bố chuẩn Phân bố K chuẩn ANOVA (ph.s ai đ.nhấ t) KruskalWallis test 16 T test (Student t test) " Sử dụng cho số liệu định lượng, có phân bố chuẩn " So sánh sự khác biệt về giá trị trung bình... mẫu với một tỷ lệ lý thuyết Analyze -> Nonparametric Tests -> Binomial Test 19 Test Khi bình phương " So sánh hai hay nhiều tỷ lệ " Điều kiện: Dưới 20% số ô trong bảng có tần số mong đợi (E) < 5 và không có ô nào có tần số mong đợi Descriptive Statistic -> Crosstab Hoặc Analyze -> Nonparametric Tests -> Chi-square Test Xác định mối liên quan " Biến định lượng: v Hệ số tương quan (r) ü pearson... 95%CI= Trung bình ± 1,96*sai số chuẩn Thực hành (SPSS) " Thực hiện ước lượng khoảng cho giá trị trung bình ⇒ Analyze -> Descriptive Statistic -> Explore 12 Kiểm định giả thuyết ⇒ Sử dụng trắc nghiệm (test) thống kê để đưa ra kết luận về giả thuyết của nhà nghiên cứu là chấp nhận được hay không Quần thể Chọn mẫu Ngoại suy Trắc nghiệm thống kê Mẫu NC Giả thuyết nghiên cứu " Giả thuyết Ho: Không có sự khác... Analyze -> Compare Means -> One-Sample T test •  So sánh hai nhóm độc lập Analyze -> Compare Means -> Independent-Samples T test Mann-Whitney test " Sử dụng cho so sánh 2 giá trị trung bình của các nhóm độc lập, số liệu là phân bố không chuẩn hoặc chuẩn " Analyze -> Nonparametric Tests -> 2 Independent Samples 17 ANOVA test " So sánh ≥ 3 giá trị trung bình của các nhóm độc lập " Điều kiện: -  Biến số. .. hiệu quả) " Giả thuyết Ha: Có sự khác biệt (Điều trị có hiệu quả) 13 Các loại sai lầm trong kiểm định Loại quyết định Thực tế Ho đúng Ho sai Chấp nhận Ho x Sai lầm loại II (β) Bác bỏ Ho Sai lầm loại I (α) x Mức ý nghĩa thống kê " Loại bỏ sai lầm loại I –  α= 0.05 –  p = probability= Xác suất để giả thuyết Ho đúng p Nonparametric Tests -> K Independent... ü pearson ü spearman v Hồi quy tuyến tính " 4 Biến định tính v Tỷ suất chênh (OR), nguy cơ tương đối (RR) v Hồi quy logistic 20 Tương quan của hai biến định lượng " Hệ số tương quan r •  Có giá trị từ -1 đến +1 " " " Khi HSTQ > 0 => tương quan đồng biến Khi HSTQ < 0 => tương quan nghịch biến Càng gần 1 => tương quan càng chặt •  Quy ước: " " " " =0,3-0,5: tương quan TB >=0,5-0,7:... odds2 " RR/OR có thể: –  >1 –  =1 –  Descriptive Statistic -> Crosstab => Chọn Risk trong hộp Statistics 22 Z test cho 1 tỷ lệ Biến định tính Z test cho 2 tỷ lệ Test χ2 cho ≥ 2 tỷ lệ Quan sát độc lập Biến định lượng Tìm sự khác biệt T test cho 2 giá trị trung bình Quan sát ghép cặp Giả thuyết nghiên cứu Biến định tính - Test χ2 Mc... lượng Hệ số tương quan Hồi qui tuyến tính Một số ví dụ (matching) 1 Tìm mối liên quan giữa hai biến định lượng 2 So sánh huyết áp (mmHg) trước và sau điều trị của một nhóm bệnh nhân 3 Tỷ lệ khỏi bệnh sau điều trị thuốc A có tăng không? 4 Nồng độ Hb trong máu trung bình của những người mắc bệnh xơ gan so với người bình thường 5 Liên quan giữa giới và tình trạng bệnh tiểu đường (có bệnh/không bệnh) trong