Khảo sát và xây dựng cơ sở dữ liệu tần suất các alen ở 15 locus gen hệ indentifiler từ quần thể người dân tộc khmer ứng dụng trong giám định ADN

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM VIỆN SINH THÁI VÀ TÀI NGUYÊN SINH VẬT LÊ THANH CỪ KHẢO SÁT VÀ XÂY DỰNG CƠ SỞ DỮ LIỆU TẦN SUẤT CÁC ALEN Ở 15 LOCUS GEN HỆ IDENTIFILER TỪ QUẦN THỂ NGƢỜI DÂN TỘC KHMER ỨNG DỤNG TRONG GIÁM ĐỊNH ADN LUẬN VĂN THẠC SỸ SINH HỌC HÀ NỘI - NĂM 2014 Số hóa Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn/ BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM VIỆN SINH THÁI VÀ TÀI NGUYÊN SINH VẬT LUẬN VĂN THẠC SỸ SINH HỌC Đề tài : KHẢO SÁT VÀ XÂY DỰNG CƠ SỞ DỮ LIỆU TẦN SUẤT CÁC ALEN Ở 15 LOCUS GEN HỆ IDENTIFILER TỪ QUẦN THỂ NGƢỜI DÂN TỘC KHMER ỨNG DỤNG TRONG GIÁM ĐỊNH ADN Học viên: Lê Thanh Cừ Chuyên ngành: Sinh học thực nghiệm Mã số: 60 42 01 14 Ngƣời hƣớng dẫn: PGS TS Nguyễn Văn Hà NĂM 2014 Số hóa Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn/ LỜI CẢM ƠN Để hoàn thành đƣợc luận văn cao học xin đƣợc bày tỏ lời cảm ơn đến: - PGS.TS Nguyễn Văn Hà - Phó giám đốc trung tâm giám định Sinh học pháp lý, Viện Khoa học hình sự, bảo cho nhiều kinh nghiệm thời gian thực luận văn nhƣ trình công tác - Tập thể Lãnh đạo Viện Khoa học hình sự, Lãnh đạo cán Trung tâm giám định Sinh học Pháp lý - Viện Khoa học hình tạo điều kiện thuận lợi cho trình học làm nghiên cứu đề tài - Tôi xin đƣợc gửi lời cảm ơn đến tất thầy, cô giảng dạy Viện Sinh thái Tài nguyên Sinh vật Việt Nam - Viện Hàn lâm Khoa học Công nghệ Việt Nam ngƣời truyền đạt cho kiến thức quí giá lĩnh vực Công nghệ Sinh học làm sở cho thực tốt luận văn Sau xin gửi lời biết ơn sâu sắc đến gia đình tạo điều kiện tốt cho suốt trình học nhƣ thực luận văn Hà Nội, tháng 12 năm 2014 Lê Thanh Cừ Số hóa Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn/ MỤC LỤC DANH MỤC CÁC KÝ HIỆU VÀ CÁC CHỮ VIẾT TẮT DANH MỤC HÌNH VẼ VÀ BẢNG BIỂU………………….…………… …4 MỞ ĐẦU Chƣơng 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Giám định gen (ADN): 1.1.1 Sự đời sinh học phân tử: 1.1.2 Cơ sở khoa học đời giám định gen: 13 1.1.3 Khái niệm locus alen 19 1.1.4 Các tiêu chuẩn cho locus STR dùng giám định ADN 19 1.1.5 Ý nghĩa sở liệu tần suất alen locus STR 20 1.2 Tình hình nghiên cứu nƣớc khảo sát tần suất alen locus gen sử dụng giám định ADN 21 1.2.1 Tình hình nghiên cứu giới 21 1.2.2 Tình hình nghiên cứu nƣớc: 23 CHƢƠNG NỘI DUNG VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 26 2.1 Nội dung nghiên cứu: 26 2.2 Phƣơng pháp nghiên cứu: 26 2.2.1 Thu mẫu: 26 2.2.2 Phân tích mẫu: 27 2.2.2.1 Quy trình phân tích ADN……………………………………….27 2.2.2.2 Hóa chất, thiết bị dụng cụ: 28 a Hóa chất thiết bị cho tách chiết ADN 28 b Hóa chất thiết bị cho định lƣợng ADN 28 c Hóa chất thiết bị cho nhân bội điện di 28 2.2.3 Xử lý thống kê số liệu tính tần suất locus gen 29 29 29 2.2.3.3 Các bƣớc tính toán thống kê kiểm định: 30 CHƢƠNG 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ BÀN LUẬN 31 3.1 Kết thu, bảo quản mẫu tách chiết AND 31 3.2 Kết thực phản ứng PCR, điện di phân tích kiểu gen 31 3.3 Kết xử lý số liệu thống kê 32 3.3.1 Kết tính toán tần suất alen 32 3.3.2 Kết quan sát kiểu gen locus tính toán số kiểm định Khi bình phƣơng………………………………………………….……….35 3.4 Một số ví dụ ứng dụng kết đề tài công tác giám định ADN Viện Khoa học hình - Bộ Công an 54 KẾT LUẬN…………… .………………………………………………….56 KIẾN NGHỊ 57 TÀI LIỆU THAM KHẢO DANH MỤC CÁC KÝ HIỆU, CÁC CHỮ VIẾT TẮT ADN - Axit Deoxyribo Nucleic ARN - Axít ribonucleic A - Adenine T - Thymine G - Guanine C - Cytosine NST - Nhiễm sắc thể VNTR - Variable Number of Tandem Repeat - Các trình tự lặp ngắn STR - Short Tandem Repeat - Các trình tự lặp ngắn ID - Identifiler/Identify definition PCR - Polymerase Chain Reaction - Phản ứng chuỗi trùng hợp FTA - Tên riêng vật mang thu mẫu máu (dạng thẻ) khoa học hình bp - Base pair DANH MỤC HÌNH VẼ VÀ BẢNG BIỂU Hình ảnh kiểu gen dạng peak từ mẫu ký hiệu KM100 Bảng 1.1 Các locus gen hệ Identifiler Bảng 3.1 Kết định lƣợng ADN phƣơng pháp Realtime PCR Bảng 3.2 Tần suất xuất alen 15 locus gen hệ Identifiler Bảng 3.3 đến 3.17 Xử lý số liệu thống kê 15 locus gen hệ Identifiler Bảng 3.18 So sánh tt lt Bảng 3.19 So sánh tần xuất alen với số quần thể MỞ ĐẦU Viện Khoa học hình đơn vị đầu ngành lực lƣợng kỹ thuật hình sự, trung tâm khoa học ngành Công an Việt Nam Một nhiệm vụ quan trọng Viện Khoa học hình công tác giám định phục vụ tố tụng hình sự, tố tụng dân yêu cầu cá nhân, bật lĩnh vực giám định ADN Từ tháng năm 1999, Viện Khoa học hình triển khai lĩnh vực giám định ADN với toàn quy trình đƣợc chuyển giao từ Viện Khoa học hình bang Victoria - Úc, sử dụng hệ NinePlex II (gồm 09 locus) Năm 2006 Viện Khoa học hình đƣa vào ứng dụng hệ Identifiler (gồm 15 locus) giám định ADN Với kit này, công tác giám định đạt hiệu cao so với kit locus NinePlex II Trong giám định ADN hình đòi hỏi bắt buộc phải tính xác suất ngƣời ngẫu nhiên quần thể có cấu trúc di truyền trùng lặp với ADN mẫu vật giám định Để tính toán đƣợc xác suất phải có liệu tần suất alen [7] Theo lý thuyết di truyền học, quần thể ngƣời (dân tộc) khác có đặc điểm di truyền đặc trƣng, thể phân bố tần suất alen quần thể khác áp dụng sở liệu quần thể cho quần thể khác Do đó, bắt buộc phải tiến hành khảo sát tần suất alen locus dùng giám định ADN hình dân tộc để đảm bảo tính khoa học, xác khách quan kết luận giám định Việc khảo sát tần suất alen locus sử dụng giám định ADN dân tộc toàn lãnh thổ Việt Nam việc làm mang tính cấp bách Việt Nam có 54 dân tộc, dân tộc Kinh chiếm tỉ lệ lớn (gần 90%) [1] có đề tài khoa học cấp Bộ khảo sát tần suất alen gen ngƣời Việt (Kinh) theo hệ Identifiler [12] Còn lại dân tộc thiểu số, điều kiện sở vật chất nhƣ ngƣời chƣa đáp ứng đƣợc nên chƣa thể tiến hành khảo sát tần suất alen cho tất dân tộc Trong nhóm dân tộc thiểu số đông dân (Tày, Thái, Mƣờng, Khmer, Hoa, Nùng, Hmông, ngƣời Dao, Giarai, Êđê, Chăm, Sán Dìu, ngƣời Raglay) có số dân tộc cƣ trú chủ yếu tỉnh biên giới, điểm nóng An ninh Trật tự an toàn xã hội Theo Tổng điều tra dân số nhà năm 2009, ngƣời Khmer Việt Nam có dân số 1.260.640 ngƣời, có mặt tất tỉnh, thành phố Ngƣời Khmer cƣ trú tập trung tỉnh: Sóc Trăng (397.014 ngƣời, chiếm 30,7 % dân số toàn tỉnh 31,5 % tổng số ngƣời Khmer Việt Nam), Trà Vinh (317.203 ngƣời, chiếm 31,6 % dân số toàn tỉnh 25,2 % tổng số ngƣời Khmer Việt Nam), Kiên Giang (210.899 ngƣời, chiếm 12,5 % dân số toàn tỉnh 16,7 % tổng số ngƣời Khmer Việt Nam), An Giang (90.271 ngƣời), Bạc Liêu (70.667 ngƣời), Cà Mau (29.845 ngƣời), thành phố Hồ Chí Minh (24.268 ngƣời), Vĩnh Long (21.820 ngƣời), Cần Thơ (21.414 ngƣời), Hậu Giang (21.169 ngƣời), Bình Phƣớc (15.578 ngƣời), Bình Dƣơng (15.435 ngƣời) Tết: Ngƣời Khơ Me có lễ lớn năm, Tết Chuôn chnam Thmây tổ chức từ ngày đến ngày đầu tháng Chét (theo Phật lịch) vào khoảng tháng dƣơng lịch Lễ chào mặt trăng (ok ang bok) tổ chức vào rằm tháng 10 âm lịch, lễ có đua thuyền Ngo phum - sóc Lịch sử: Ngƣời Khơ Me từ Tây Khƣơng xuống Trung Lào vào khoảng thiên kỷ trƣớc Tây lịch, lúc với ngƣời Việt tộc từ Giang Nam di cƣ xuống Bắc (2), từ Tây Khƣơng (hay Tây Khang) Trung Lào không xa lắm, vƣợt qua Vân Nam đến, lại có sẵn “đƣờng” tiện sông Cửu Long Đến trƣớc kỉ XII ngƣời Khơ Me văn hoá họ giữ vai trò chủ thể vùng đồng sông Cửu Long Văn hóa: Ngƣời Khơ Me có cống hiến to lớn vào kho tàng văn hóa chung dân tộc Việt Nam Về văn học dân gian, ngƣời Khơ Me chủ nhân di sản văn hóa phong phú gồm nhiều thể loại: dân ca, truyển cổ, câu châm ngôn, tục ngữ thƣờng nhƣ lời khuyên răn, kinh nghiệm sống Gắn liền với sinh hoạt khác nhau, dân ca Khơ Me có nhiều loại: hát ru con, hát lao động… hát không phản ánh không kinh nghiệm nông nghiệp mà phản ánh đời sống xã hội nhiều tình cảm ngƣời Khơ Me Hoạt động sản xuất: Bên cạnh việc trồng lúa nƣớc ngành sản xuất chủ yếu, nông dân Khơ Me trồng hoa mầu đất rẫy Có hai loại đất rẫy: rẫy chuyên dùng rẫy vốn ruộng ven làng Giữa hai vụ mùa lớn, ngƣời dân Khơ Me canh tác thêm vụ hoa màu phụ ngắn ngày Trên đất rẫy, phổ biến loại đậu, khoai, ngô, rau, mía, hành, ngò… Có nhiều địa phƣơng chuyên trồng đặc sản nhƣ dƣa hấu, hành đỏ, nhãn, trầu vàng, xoài… Ngoài công việc chăn nuôi, ngƣời Khơ Me vùng ven sông rạch hay biển sử dụng kỹ thuật đánh bắt cá nƣớc ngọc nƣớc mặn Rất ngƣời Khơ Me sống chuyên chài lƣới biển, có số gia đình chung vốn vào việc mua thuyền, mua lƣới đánh cá ven biển Nhƣ vậy, ngƣời Khmer dân tộc thiểu số nhƣng phân bố rộng rãi khắp tỉnh thành tập trung chủ yếu theo tuyến biên giới phía Tây Nam Bộ [1] Đây khu vực có thời tiết khí hậu khắc nghiệt, giao thông lại khó khăn lại địa bàn nhạy cảm, thƣờng xuyên phải đấu tranh với âm mƣu thủ đoạn, hoạt động chống phá lực thù địch, loại tội phạm (tội phạm xâm phạm an ninh quốc gia, tội phạm ma túy, buôn lậu, buôn bán phụ nữ trẻ em, giết ngƣời, hiếp dâm, vận chuyển, buôn bán tiền giả, chất nổ, chất cháy ) Giám định ADN công cụ đắc lực phục vụ cho công tác điều tra, xét xử nói chung góp phần bảo vệ chủ quyền an ninh biên giới, giữ vững an Trong 15 locus gen hệ Identifiler khảo sát từ 120 ngƣời dân tộc Khmer locus FGA có giá trị truy nguyên cá thể cao (tính đa hình cao nhất, với số loại alen 16) locus TPOX locus có tính đa hình thấp với loại alen, alen alen phổ biến quần thể (chiếm 57,1%) Nhƣ vậy, với alen 15 locus gen hệ Identifiler khảo sát đƣợc từ quần thể ngƣời dân tộc Khmer cho thấy khác số loại alen tần suất alen, áp dụng tần suất quần thể cho quần thể khác tính toán xác suất công tác giám định ADN 3.4 Một số ví dụ ứng dụng kết đề tài công tác giám định ADN Viện Khoa học hình - Bộ Công an Ví dụ - Nội dung vụ việc: Vào khoảng cuối tháng 12 năm 2013, Thạch T (Sinh năm: 1989; ngụ ấp X, xã H, huyện Càng Long, tỉnh Trà Vinh; ngƣời dân tộc Khmer) Sơn Thị Ngọc Đ (Sinh năm 1998; ngụ ấp B, xã P, huyện Càng Long; ngƣời dân tộc Khmer) quan hệ tình dục với nhà trọ thuộc ấp Bến Có, xã Nguyệt Hóa, huyện Châu Thành, tỉnh Trà Vinh Ngày 10/6/2014, gia đình đƣa Đ khám, phát Đ mang thai 25 tuần nên đến Cơ quan điều tra trình báo việc Ngày 13/9/2014 Đ sinh con, đặt tên Sơn Thành Đạt Để có sở xử lý vụ việc, Cơ quan CSĐT Công an huyện Càng Long, tỉnh Trà Vinh tiến hành thu mẫu đối tƣợng có liên quan Quyết định trƣng cầu giám định Viện Khoa học hình giám định ADN để xác định cha đẻ Sơn Thành Đạt? - Kết giám định: Viện Khoa học hình tiến hành giám định ADN (sử dụng kit Identifiler Plus bảng tần suất alen locus gen ngƣời dân tộc Khmer để tính xác suất) cho kết luận nhƣ sau: 54 Thạch Sa R cha đẻ Sơn Thành Đạt (con đẻ Sơn Thị Ngọc Đ) với xác suất 99,99998% Ví dụ - Nội dung vụ việc: Khoảng 20 ngày 31/8/2014, sau dự tiệc sinh nhật bạn nhóm Lâm Thành N (sinh năm: 1990, xã T, thị trấn Châu Thành, tỉnh Sóc Trăng) ngang qua cầu thuộc ấp T, thị trấn Châu Thành, huyện Châu Thành, tỉnh Sóc Trăng gặp nhóm Thạch Đ (sinh năm: 1996, ĐKTT thị trấn Châu Thành, huyện Châu Thành, tỉnh Sóc Trăng; ngƣời dân tộc Khmer), nghĩ nhóm Thạch Đ chặn đƣờng nhóm mình, nên sau chạy qua cầu nơi nhóm Thạch Đ đứng nhóm Lâm Thành N quay lại tìm nhóm Đ, Đ N xảy cãi cự, nên N dung dao đâm vào ngực trái Đ Hậu Thạch Đ tử vong đƣờng cấp cứu Viện Khoa học hình nhận đƣợc Quyết định trƣng cầu Cơ quan CSĐT Công an tỉnh Sóc Trăng yêu cầu giám định ADN kèm theo mẫu vật vụ án để xác định dao, áo mẫu máu ghi thu trƣờng có dính máu ngƣời không? Nếu máu ngƣời máu ai? - Kết giám định: Viện Khoa học hình tiến hành giám định ADN (sử dụng kit Identifiler Plus bảng tần suất alen locus gen ngƣời dân tộc Khmer để tính xác suất) cho kết luận nhƣ sau: Trên dao, áo mẫu máu ghi thu trƣờng có dính máu Thạch Đ với xác suất 99,999999% 55 KẾT LUẬN Với kết khảo sát xây dựng bảng liệu tần suất alen 15 locus hệ Identifiler từ quần thể ngƣời dân tộc Khmer có số kết luận nhƣ sau: Đã thu đƣợc mẫu máu từ 120 ngƣời dân tộc Khmer tỉnh phía Tây Nam Bộ phân tích theo quy trình giám định ADN Viện Khoa học hình thu đƣợc bảng kiểu gen đầy đủ theo hệ Identifiler thể Đƣa bảng liệu tần suất đầy đủ alen 15 locus gen hệ Identifiler ngƣời dân tộc Khmer Bảng liệu tần suất đƣợc kiểm định cho thấy 120 mẫu khảo sát (mẫu thực nghiệm) phù hợp với quần thể lý thuyết Các phƣơng pháp kỹ thuật sử dụng nghiên cứu đảm bảo tính xác, khoa học khách quan, đủ độ tin cậy Qua nghiên cứu cho thấy 15 locus gen hệ Identifiler có tính đa hình cao, áp dụng công tác giám định ADN để truy nguyên cá thể xác định quan hệ huyết thống phục vụ công tác điều tra tội phạm yêu cầu giám định tổ chức cá nhân Ở locus D7S820 có alen 9+ alen không nằm hệ thống thang alen chuẩn nhà sản xuất nên alen đặc trƣng cho quần thể ngƣời Việt (dân tộc Khmer Kinh) Kết nghiên cứu đề tài khoa học để xây dựng sở pháp lý cho Kết luận giám định ADN có đối tƣợng giám định ngƣời dân tộc Khmer 56 KIẾN NGHỊ Trong phạm vi nghiên cứu đề tài nhiều hạn chế, đƣa số kiến nghị sau: Cần phải có nghiên cứu quần thể ngƣời dân tộc Khmer với số lƣợng mẫu lớn để phát alen chƣa xuất để tần suất mẫu khảo sát tiệm cận với tần suất thực tế quần thể Nghiên cứu sâu để xác định xác alen 9+ locus D7S820 thông tin với nhà sản xuất để đƣa thêm vào thang alen chuẩn Đƣa vào ứng dụng bảng tần suất alen để tính xác suất Kết luận giám định lực lƣợng Kỹ thuật hình tổ chức giám định khác Thông tin cho cảnh sát Quốc tế (Interpol) để phối hợp vụ án xuyên quốc gia Cần phải có nghiên cứu khảo sát dân tộc khác để áp dụng công tác giám định ADN, phục vụ tố tụng hình sự, dân yêu cầu cá nhân đối tƣợng giám định ngƣời dân tộc khác 57 TÀI LIỆU THAM KHẢO Tiếng Việt Ban đạo Tổng điều tra dân số nhà Trung ƣơng, Kết toàn Tổng điều tra Dân số Nhà Việt Nam năm 2009, Nhà xuất Thống kê (2009), Chu Văn Mẫn, Đào Hữu Hồ (1999), Giáo trình thống kê sinh học, Nhà xuất Khoa học kỹ thuật Đào Hữu Hồ (1999), Xác suất thống kê, nhà xuất đại học quốc gia Hà Nội Đào Hữu Hồ (2010), Xác suất thông kê, Nhà xuất đại học Quốc gia Hà Nội Giáo trình lý thuyết Thống kê, NXB Giáo dục, HN 1996 Hà Quốc Khanh (2000), "Điều tra xây dựng sở liệu tần suất gen hệ Nineplex ngƣời Việt (Kinh) ứng dụng giám định gen", Đề tài khoa học cấp Bộ năm 2000 Lê Đức Vĩnh (2006), Giáo trình Xác suất thống kê, Đại học Nông nghiệp Hà Nội Phạm Xuân Kiều (2005), Giáo trình Xác suất thống kê, NXB GD 10.Tăng Văn Khiên (2003), Điều tra chọn mẫu ứng dụng công tác thống kê, NXB Thống kê, Hà Nội 11.TS Lê Thị Thu Thủy (2012), "Khảo sát xây dựng sở liệu tần suất alen 15 gen hệ Identifiler quần thể ngƣời Việt (Kinh) ứng dụng giám định gen (ADN) lực lƣợng Kỹ thuật hình sự", Đề tài khoa học cấp Bộ 12.TS Lê Thị Thu Thủy (2012), Vai trò sở liệu tần suất giám định tư pháp gen (ADN), tạp chí Cảnh sát Phòng chống tội phạm, Số 31 (178) 58 13.TS Nguyễn Văn Đức (2002), Phƣơng pháp kiểm tra thống kê Sinh học Nhà xuất khoa học kỹ thuật 14 Hà Nội 15 (2005), K (2007), , ADN, Hà Nội Tiếng Anh 16.ADN Technology in Forensic Science (1992) Committee on DNA Technology in Forensic Science, National Research Council Commission on Life Sciences (CLS) 17.AmpFlSTR® Identifiler® PCR Amplification Kit - User’s Manual 18.Angel Carracedo (2005), Forensic DNA Typing Protocols, Humana Press Inc 19.Bio-Rad Cat No 143-2832 Insert Chelex 100 and Chelex 20 Chelating Ion Exchange Resin, Instruction Manual 20.Butler JM, Schoske R, Vallone PM, Redman JW, Kline MC (2003), "Allele frequencies for 15 autosomal STR loci on US Caucasian, African American, and Hispanic Populations", J Forensic Sci, July 2003, Vol 48, No 21.Chakraborty, R (1992), "Sample size requirements for addressing the population genetic issues of forensic use of DNA typing", Human Biology 64: 141-159 22.Forensic Science International 158 (2006) 234 -237 23.Fung WK, Ye J, Hu L, Zhao X, Liu B, Wong DM, Law MY(2001), Allele frequencies for nine STR loci in Beijing Chinese Forensic Sci Int ;121(3):207-9 24.John M Butler (2003), Forensic DNA Typing Elsevier 25.John M Butler (2005), Forensic DNA typing 26.John M Butler (2005), Forensic DNA Typing Elsevier 59 27.John M Butler (2006), "Genetic and genomics of core short tandem repeat loci used in human identify testing", J Forensic Sci, March 2006, Vol 51, No 28.John M Butler (2010), Fundamentals of Forensic DNA Typing, Elsevier Inc 29.John M Butler (2012), Advanced Topics in Forensic DNA Typing 30.John S Buckleton, Christopher M Triggs, Simon J Walsh, (2005), Forensic DNA Evidence Interpretation , CRC PRESS 31.Lawrence Kobilinsky, Louis Levine, Henrietta Margolis-Nunno (2007), Forensic DNA Analysis, Infobase Publishing 32.Lawrence Koblinsky, Thomas F Liotti, Jamel Oeser-Sweat, (2005), DNA forensic and legal applications,A John Wiley & Sons, Inc Publication 33.Maruyama S, Minaguchi K, Takezaki N, Nambiar P (2008), Population data on 15 STR loci using AmpF/STR Identifiler kit in a Malay population living in and around Kuala Lumpur, Malaysia Leg Med (Tokyo) 10:160-2 34.Matthew B Hamilton (2009) Population Genetics 35.Rerkammuaychoke B et al Thai population data on 15 tetrameric STR loci-D8S1179, D21S11, D7S820, CSF1PO, D3S1358, TH01, D13S317, D16S539, D2S1338, D19S433, vWA, TPOX, D18S51, D5S818 and FGA 36.The Evaluation of Forensic DNA Evidence (1996) Commission on Life Sciences (CLS) 37.Wing Kam Fung, Yue – Qing Hu (2008), Statistical DNA Forensic 38 Zhivotovsky et al (2009), "An STR database on the Volga-Ural population", Forensic Science International: Genetics 3, e133-e136 39 Zhivotovsky et al (2009), "Developing STR databases on structured populations: The native South Siberian population versus the Russian population", Forensic Science International: Genetics 3, e111-e116 40.Wing Kam Fung, Yue – Qing Hu (2008), Statistical DNA Forensic 60 Experiment Name: Experiment Type: Run Start: lethanhcu Last Date Saved: Quantification/Hydrolysis Probe/DNA/Standard Curve Tuesday, October 28, 2014 11:29:31 AM Run Finish: Instrument: Software: Tuesday, October 28, 2014 12:50:11 PM Eco™ Real-Time PCR system Eco™ Software v4.1.2.0 Tuesday, October 28, 2014 12:50:10 PM Plate Layout Well Exclude Sample Name Assay Name Assay Role Reporter Quencher KM1 Humman Unknown A2 KM1 ICP Unknown VIC NonFluorescent NonFluorescent B2 KM13 Humman Unknown FAM NonFluorescent B2 KM13 ICP Unknown VIC NonFluorescent C2 KM27 Humman Unknown FAM NonFluorescent C2 KM27 ICP Unknown VIC NonFluorescent D2 KM34 Humman Unknown FAM NonFluorescent D2 KM34 ICP Unknown VIC NonFluorescent E2 KM46 Humman Unknown FAM NonFluorescent E2 KM46 ICP Unknown VIC NonFluorescent F2 KM61 Humman Unknown FAM NonFluorescent F2 KM61 ICP Unknown VIC NonFluorescent A3 KM73 Humman Unknown FAM NonFluorescent A3 KM73 ICP Unknown VIC NonFluorescent B3 KM92 Humman Unknown FAM NonFluorescent B3 KM92 ICP Unknown VIC NonFluorescent C3 KM115 Humman Unknown FAM NonFluorescent C3 KM115 ICP Unknown VIC NonFluorescent D3 KM120 Humman Unknown FAM NonFluorescent D3 KM120 ICP Unknown VIC NonFluorescent Quantity 10,2 8.7 8.9 11 9.8 8.6 9.4 8.1 9.8 8.6 DANH SÁCH THU MẪU MÁU NGƢỜI DÂN TỘC KHMER STT 01 02 03 04 05 06 07 08 09 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 Họ tên Nguyễn Huy D Hàn Ng Lƣơng Bỉnh H Thạch Kim T Đào Văn Ch Thạch Lan H Thạch Sóc Kh Sơn Lâm M Sơn T Thạch Trƣờng Th Sơn Quốc Ph Thái H Kim Châu Thế L Kim H Danh D Thạch Phi T Thạch H Lâm Hoanl N Thạch Lo Thạch L Thạch Huy H Thạch Kh Thạch H Thạch D Triệu Ch Trần H Sơn Xà Q Cổ Hoàng Kh Ngô Nh Lâm Đ Lâm Si P Lâm Quốc Đ Lý Câ Thạch Ta Thạch Ma Thạch Sa Say Th Thạch Trọng Ch Thạch Th Thạch Tha Kiên Dom Trần Hoàng T Thạch Nă Sơn Ngọc H Năm sinh 1993 1990 1982 1994 1974 1984 1991 1987 1993 1990 1987 1992 1981 1966 1967 1992 1984 1980 1986 1991 1990 1983 1985 1987 1988 1980 1989 1991 1955 1990 1980 1992 1964 1966 1984 1984 1973 1988 1983 1954 1989 1993 1965 Địa Ký hiệu Thành phố Trà Vinh, tỉnh Trà Vinh P Lái Khế, Ninh Kiều, Cần Thơ Phƣờng 9, Q4, TP Hồ Chí Minh Phƣờng 9, TP.Trà Vinh, Trà Vinh Xuân Khánh, Ninh Kiều, Cần Thơ Kim Hòa, Cầu Ngang, Trà Vinh Kim Hòa, Cầu Ngang, Trà Vinh Phƣờng 9, TP Trà Vinh, Trà Vinh Khóm 3, P8, thành phố Sóc Trăng Khóm 1, P7, thành phố Sóc Trăng Lâm Khiết, Thạch Trị, Sóc Trăng Mỹ Xuyên, Mỹ Xuyên, Sóc Trăng Khóm 4, P4 thành phố Sóc Trăng Phƣờng 7, Q8, TP Hồ Chí Minh Lƣơng Tâm, Long Mỹ, Hậu Giang Tân Hiệp, Trà Cú, Trà Vinh Long Sơn, Cầu Ngang, Trà Vinh Thạch Phú, Mỹ Xuyên, Sóc Trăng TT Châu Thành, Trà Vinh Hiếu Trung, Tiểu Cần, Trà Vinh Đa Lộc, Châu Thành, Trà Vinh Phƣờng 7, TP Trà Vinh, Trà Vinh Xuân Khánh, Ninh Kiều, Cần Thơ Đa Lộc, Châu Thành, Trà Vinh Trung Bình, Trần Đề, Sóc Trăng Thanh Sơn, Trà Cú, Trà Vinh Thạch Quới, Mỹ Xuyên, Sóc Trăng Châu Phú, Châu Đốc, An Giang Phan Đ Phùng, Ninh Kiều, Cần Thơ Liên Tú, Trần Đề, Sóc Trăng Khóm 5, P4, TP Sóc Trăng Phƣờng 5, thành phố Sóc Trăng Ngọc Trúc, Giồng Riềng, K Giang Cây Dƣơng, Phụng Hiệp, H Giang Nhị Trƣờng, Cầu Ngang, Trà Vinh Phƣờng 5, TX Trà Vinh, Trà Vinh Phƣờng 1, Q3, TP Hồ Chí Minh Phú Cần, Tiểu Cần, Trà Vinh Phƣờng 8, TX Trà Vinh, Trà Vinh Đại An, Trà Cú, Trà Vinh Hƣng Hội, Vĩnh Lợi, bạc Liêu Phƣớc Hƣng, Trà Cú, Trà Vinh Thanh Sơn, Trà Cú, Trà Vinh KM1 KM2 KM3 KM4 KM6 KM7 KM8 KM9 KM10 KM11 KM12 KM13 KM14 KM15 KM16 KM17 KM18 KM19 KM20 KM21 KM22 KM23 KM24 KM25 KM26 KM27 KM28 KM29 KM30 KM31 KM32 KM33 KM34 KM35 KM36 KM37 KM38 KM39 KM40 KM41 KM42 KM43 KM44 Ghi 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 Thạch Nhi Kiên Lâm S Thạch Cho Lâm Hi Kim Ngọc L Sơn Ngọc Th Kim Trung Tăng Anh Kim Nhƣ Minh Th Danh Đa Lâm Sƣ Danh Hƣ Kim Tua Châu Sa Kim Ngọc Li Ha Ruol Kim Mƣ Thạch Ca Thạch Dƣ Lâm Văn Ch Thạch Nha Thạch Li 1990 1981 1986 1992 1993 1994 1992 1989 1993 1970 1984 1977 1967 1985 1979 1986 1986 1993 1988 1993 1987 1993 1963 1990 1984 1987 1961 1966 1986 1974 1988 1989 1972 1985 1992 1993 1981 1981 1982 1986 1990 1982 1968 1984 1985 1962 Hiệp Hòa, Cầu Ngang, Trà Vinh Thanh Sơn, Trà Cú, Trà Vinh Tân Hƣng, Tiểu Cần, Trà Vinh Tân Ngãi, Châu Thành, Trà Vinh Thập Sơn, Trà Cú, Trà Vinh Mỹ Hòa, Cầu Ngang, Trà Vinh , Kiên Giang Đông H , TPHCM Chi Tôn, Tri Tôn, An Giang , Tri Tôn, An Giang Tân Sơn, Trà Cú, Trà Vinh Xuân Hƣng, Xuân Lộc, Đồng Nai Kim Sơn, Trà Cú, Trà Vinh Kim Sơn, Trà Cú, Trà Vinh Ngũ Lạc, Duyên Hải, Trà Vinh Khoan Tây, Long Phú, Sóc Trăng Mỹ Khánh, Châu Thành, Trà Vinh Bào Mốt, Long Sơn, Trà Vinh KM45 KM46 KM47 KM48 KM49 KM50 KM51 KM52 KM53 KM54 KM55 KM56 KM57 KM59 KM60 KM61 KM62 KM63 KM64 KM65 KM66 KM67 KM68 KM69 KM70 KM71 KM72 KM73 KM74 KM75 KM76 KM77 KM78 KM79 KM80 KM81 KM82 KM83 KM84 KM85 KM86 KM87 KM88 KM89 KM90 KM91 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 Tăng Văn Nhi Liên Lƣ Thạch Vi Thạch Tha Sơn Hoài Ba Huỳnh Văn Hoa Huỳnh Văn Q Danh Hi Châu Khƣơ Thạch Đe Châu Thanh Q Đặng Văn Tơ Tống Kim Ra Danh Sê Thạch Tấn H Sơn Thị H Danh Diên Thạch Ngọc Thu Sơn Ngọc Th Thạch Tho Lâm Qua Thạch Thị Nh Thạch Thị Thảo Kim Cảnh Thạch Phƣ Danh Trọng Danh Hùng Mai Thành Dien Lâm Tài Ma Thạch Thi Danh Điện 1983 1992 1973 1987 1987 1980 1993 1977 1977 1996 1985 1981 1977 1980 1990 1997 1990 1998 1981 1977 1994 1991 1992 1977 1973 1990 1985 1988 1974 1986 1982 Thanh Sơn, Trà Cú, Trà Vinh Châu Thành, Vĩnh Lợi, Bạc Liêu Vĩnh Châu, Sóc Trăng Châu Điền, Cầu Kè, Trà Vinh Phƣớc Hảo, Châu Thành, Trà Vinh Hàm Chính, Hàm Th Bắc, B.Thuận Đại Hải, Kế Sách, Sóc Trăng Tân Thành, Tân Hiệp, Kiên Giang Trần Đề, Sóc Trăng Châu Thành, Sóc Trăng Thuận Bình, Thạnh Hóa, Long An Long Mỹ, Hậu Giang Phú Hữu, Long Phú, Sóc Trăng TT Thứ 3, An Biên, Kiên Giang Thuận Hƣng, Mỹ Trí, Sóc Trăng Nhơn Mỹ, Kế Sách, Sóc Trăng Lộc Ninh, Hồng Ngự, Đồng Tháp Tân Hiêp, Thạch Hóa, Long An Lâm Tân, Thạch Trị, Sóc Trăng Bình Phú, TP Bến Tre, Bến Tre Hòa Chánh, U M Thƣợng, K.Giang Ngãi Xuyên, Trà Cú, Trà Vinh Nhơn Mỹ, Kế Sách, Sóc Trăng Thạch Quới, Mỹ Xuyên, Sóc Trăng Thạnh Lộc, Q12, TPHCM Phú Hữu, Long Phú, Sóc Trăng Thổ Sơn, Hòn Đất, Kiên Giang Hội Thƣợng, Trần Đề, Sóc Trăng Vĩnh Phƣớc, Vĩnh Châu, Sóc Trăng Trần Đề, Sóc Trăng Thạch Bình, Giồng Riềng, K.Giang KM92 KM93 KM94 KM95 KM96 KM97 KM98 KM99 KM100 KM101 KM102 KM103 KM104 KM105 KM106 KM107 KM108 KM109 KM110 KM111 KM112 KM113 KM114 KM115 KM116 KM117 KM118 KM119 KM120 KM121 KM122 BẢNG KẾT QUẢ XỬ LÝ DỮ LIỆU ĐIỆN DI, KIỂU GEN 120 CÁ THỂ KHMER ST T 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 Ký hiệu KM1 KM2 KM3 KM4 KM5 KM6 KM7 KM8 KM9 KM10 KM11 KM12 KM13 KM14 KM15 KM16 KM17 KM18 KM19 KM20 KM21 KM22 KM23 KM24 KM25 KM26 KM27 KM28 KM29 KM30 D8S 1179 13 16 11 13 15 16 10 14 15 11 12 10 10 14 13 13 14 12 12 11 12 14 10 11 14 10 10 10 13 14 11 10 10 15 12 13 10 10 15 15 14 15 15 16 15 15 14 12 12 15 14 13 11 14 16 15 15 13 D21 D7S CSF S11 820 1PO 30 33.2 8 11 12 29 30 11 12 11 13 30 31.2 11 11 11 30 33.2 12 10 12 30 30.2 30 30 30 31.2 30.2 30 29 30 28 29 32.2 31.2 32.2 30 29 29 30 29 28 30 30.2 28 30 32.2 31 33.2 30 32 33.2 33.2 30 30.2 30 32.2 32.2 32.2 32.2 32.2 30 32.2 30 31.2 31.2 32.2 30 32.2 29 32.2 8 10 12 11 10 10 10 8 10 10 11 12 11 12 11 10 10 11 12 13 12 11 11 12 11 11 10 11 11 11 10 11 10 12 10 10 12 11 12 10 11 12 12 10 11 10 11 11 12 10 10 10 11 10 12 10 12 10 11 11 10 11 12 12 11 13 12 10 13 11 13 12 11 12 11 12 12 11 12 13 12 12 13 12 12 11 12 12 D3S 1358 15 16 15 16 16 16 15 15 TH D13S D16 01 317 S539 10 11 11 12 10 11 11 10 12 12 9.3 11 12 11 11 D2S D19S vWA 1338 433 17 24 15.2 16.2 14 18 19 23 14 16 16 17 24 24 12 14 14 18 17 23 14 14 14 20 16 17 16 13 15 15 16 16 15 16 16 14 15 15 15 15 15 16 16 15 16 15 16 15 16 9 7 9 7 7 7 7 6 6 9 19 19 23 23 23 17 17 20 23 21 23 19 17 17 17 17 17 23 19 19 18 17 18 19 19 16 18 17 15 16 16 18 18 16 16 17 17 16 17 15 15 16 18 16 17 17 15 16 17 16 9.3 10 9 9.3 9 10 9 7 9.3 9.3 8 8 9 12 8 11 8 10 8 10 12 8 11110 12 11 13 9 11 13 9 11 12 11 9 11 11 12 12 12 11 11 12 10 11 12 9 12 11 11 12 9 10 12 12 10 10 12 11 11 12 12 12 12 11 10 11 12 12 12 13 13 12 12 12 11 12 12 12 12 14 14 11 19 19 23 24 23 19 23 24 24 24 24 21 23 19 17 17 24 23 21 24 19 21 18 20 24 13 14 13 14.2 12 13 14 15.2 13.2 14 14 14 14 13 12 13 12.2 15 14 12 13.2 13 13 14 15 15.2 14 14 16.2 13 14 14.2 15.2 14 14.2 16.2 15.2 15.2 15.2 14.2 14 13.2 15.2 15 14 14 14.2 14 18 17 19 17 17 14 14 14 14 17 16 14 14 17 14 17 14 14 16 16 16 17 13 17 15 14 TPO X 8 8 8 8 17 19 19 20 19 17 15 17 16 17 18 16 17 17 19 19 17 17 16 18 18 18 20 19 10 18 10 10 11 11 11 11 8 11 12 11 11 11 11 11 D18 S51 12 16 13 15 16 17 12 15 D5S 818 10 13 11 12 11 11 12 13 12 14 14 12 14 15 14 13 12 14 13 12 11 14 13 11 12 15 13 13 15 16 13 15 14 11 10 11 11 10 10 13 11 11 10 11 10 12 10 12 10 12 10 11 10 12 11 11 10 10 15 15 17 14 18 16 17 13 16 14 16 13 13 18 20 15 14 19 13 13 16 17 16 20 16 FGA 19 21 22 22 26 26 22 24 13 21 27 12 19 22 12 21 21 12 22 23.2 12 23 23 11 24 25 13 24 25 11 21 22 12 20 22 13 21 23 11 24 25 11 24 25 13 24 24 12 19 21 12 24 24 12 21 22 13 19 20.2 11 22 26 11 22 24 10 20 24 12 24 27 12 20 23 12 22 23 10 22 23 21 11 23 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 KM31 KM32 KM33 KM34 KM35 KM36 KM37 KM38 KM39 KM40 KM41 KM42 KM43 KM44 KM45 KM46 KM47 KM48 KM49 KM50 KM51 KM52 KM53 KM54 KM55 KM56 KM57 KM58 KM59 KM60 KM61 KM62 KM63 KM64 12 14 10 11 15 12 13 12 10 12 11 10 15 10 15 13 13 15 13 10 11 12 12 10 13 11 12 13 15 15 13 16 14 14 13 11 13 15 12 15 10 15 14 15 16 15 14 11 12 12 18 15 13 15 29 30 30 29 29 32.2 29 30 28 29 30 30 31.2 30 29 30 28 30 29 30 29 29 29 30 29 28 32.2 12 10 14 12 10 18 13 14 15 13 30 30 31 29 29 12 13 11 13 13 11 11 11 12 12 10 11 12 10 12 11 12 14 12 12 12 12 11 11 11 18 22 20 18 24 17 20 16 17 22 19 17 19 20 19 19 18 24 24 18 17 19 19 17 19 19 18 20 24 22 19 24 22 23 22 23 23 20 23 23 23 21 21 23 25 24 23 21 20 19 19 19 19 22 12 11 10 11 13 11 12 12 11 16 19 23 20 20 14 23 24 22 23 15 15.2 18 18 12 14.2 14 18 11 11 13 14 14 14 8 14 15 17 19 8 14 15 17 17 11 11 12 11 13 18 23 13 15.2 14 18 10 15 18 11 13 65 66 KM65 KM66 10 14 29 30 11 11 11 11 15 16 11 12 13 14 32.2 32.2 10 12 16 18 10 11 11 10 12 12 23 20 24 12 14.2 14 15 21 15.2 15.2 15 16 8 15 21 10 11 21 23.2 11 16 17 11 11 21.2 24 12 13 29 31.2 32.2 30 30 32.2 34.2 31.2 31.2 29 32.2 30 30 32.2 30 30 30 31.2 32 32.2 32.2 32.2 30 32.2 30 30 30.2 33.2 10 11 10 10 10 10 11 10 10 10 11 11 11 10 10 11 11 11 11 12 11 10 11 11 11 11 11 12 11 10 10 12 10 11 11 10 13 10 11 11 11 13 12 12 10 10 11 10 10 12 11 11 10 10 11 11 11 12 11 11 10 11 10 12 11 10 10 10 10 12 12 13 12 12 12 12 13 12 12 12 11 12 12 13 12 12 11 12 12 12 13 12 12 11 11 12 15 15 16 15 16 15 15 17 16 16 15 16 13 16 17 14 15 16 15 16 16 15 16 17 17 15 15 16 16 17 16 17 15 16 17 17 16 15 17 17 18 17 16 15 16 16 17 16 16 19 17 17 16 16 7 7 6 7 6 7 7 7 7 9 10 9.3 9 9.3 9.3 9 10 9 10 9 9.3 10 10 8 12 12 11 11 10 8 8 10 10 8 11 13 11 13 11 12 10 12 11 9 11 12 12 1199 12 11 12 10 13 12 11 10 9 12 12 12 12 12 12 11 11 12 12 12 10 11 11 12 33.2 11 32.2 10 31.2 10 32.2 32.2 14 11 12 12 11 11 10 11 12 12 12 12 12 12 12 15 15 16 15 15 17 16 17 17 16 7 7 8 8 8 9 10 12 11 10 29.2 11 12 12 12 15 17 9 14.2 14 15 13 13 14 13 13 13 13 15 13.2 15.2 14 15 15.2 13 14.2 14 14 13 13 13 13.2 12 15.2 13 14.2 14.2 15.2 13 15.2 15 14.2 14.2 14.2 13.2 16.2 15.2 17.2 15.2 18.2 15.2 16.2 15.2 14 15.2 15.2 14 13 15.2 13 15.2 15.2 17 15 15 14 14 14 14 17 14 14 14 17 17 16 14 14 17 14 18 14 15 16 17 18 16 17 18 18 8 13 18 11 12 24 26 21 11 15 16 12 21 23 19 11 14 20 12 12 21 22 19 8 13 17 10 10 21 23 17 11 15 20 11 13 19 22 17 11 15 27 11 23 20 22 14 10 11 11 20 10 10 23 24 21 8 13 13 10 11 21 24 16 15 15 11 12 22 23 19 11 14 18 10 11 20 21 16 11 13 14 11 12 22 24 19 10 11 13 15 10 12 21 22 18 12 13 20 11 12 21 21 17 11 14 16 10 10 21 24 18 8 13 15 12 13 20 20.2 14 10 15 15 11 12 23 27 18 10 16 18 13 13 20 22 14 12 13 11 12 23 24 19 11 13 15 10 13 20 22 14 8 15 16 10 11 22 24 17 8 15 16 10 11 23 23.2 17 8 16 23 11 11 21.2 22 20 8 15 20 10 13 20 23 19 11 11 22 11 12 22 23.2 17 8 17 19 11 12 21 25 19 11 15 16 10 10 20 20 18 11 11 13 17 10 12 23 24 12 11 15 13 16 19 15 19 16 16 10 10 12 11 12 11 12 13 13 12 23 22 21 21 26 24 25 27 24 22 26.2 24 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 KM67 KM68 KM69 KM70 KM71 KM72 KM73 KM74 KM75 KM76 KM77 KM78 KM79 KM80 KM81 KM82 KM83 KM84 KM85 KM86 KM87 KM88 KM89 KM90 KM91 KM92 KM93 KM94 KM95 KM96 KM97 KM98 KM99 KM100 KM101 14 14 13 15 13 10 14 11 15 11 10 14 14 13 11 10 10 14 13 10 11 11 11 10 10 10 10 10 10 11 13 13 14 13 12 15 15 15 16 15 13 14 11 16 14 14 14 15 15 13 14 15 15 14 13 14 15 15 13 11 12 15 14 10 15 15 15 14 15 15 30 31 30 29 29 29 29 29 30 28 29 30 30 28 30 31.2 30 33 29 29 30 28 29 29 30 30 30 29 29 29 29 29 30 29 29 33.2 32.2 31 31.2 32.2 30 32.2 30 30 28 31.2 32 32.2 33.2 30 32.2 31 35.2 32.2 29 31.2 29 32.2 30 32.2 30.2 30 30 32.2 33.2 31.2 30 33.2 32.2 29 10 11 11 11 8 10 10 10 9.1 11 11 11 10 11 10 11 10 11 8 10 9.1 11 11 10 11 10 12 11 11 11 11 12 11 10 11 11 12 12 11 10 13 11 13 12 10 12 12 12 10 11 11 11 11 11 10 11 12 12 10 11 11 12 11 10 12 12 10 11 11 10 10 10 10 12 11 10 10 12 10 10 10 10 11 11 10 11 12 12 12 13 12 12 12 13 11 12 12 12 11 11 12 11 10 13 13 12 12 12 12 12 12 12 13 12 10 12 11 12 12 11 15 16 15 15 15 16 14 15 15 16 17 16 16 15 16 16 15 15 14 16 15 15 16 17 16 16 15 16 18 15 15 15 16 15 15 17 17 15 18 18 17 15 16 16 17 17 19 17 17 16 16 16 16 15 17 18 16 16 17 16 17 17 17 18 16 17 17 16 17 17 7 6 8 6 7 7 9 9 9 9 9 9.3 9.3 9 9 9 9.3 9.3 9 10 9 9 10 11 10 9 11 10 11 8 8 10 11 9 11 11 8 8 8 8 10 12 10 11 11 10 11 12 10 12 11 11 12 11 12 11 10 11 11 11 11 12 11 11 11 11 12 11 11 12 12 10 11 10 12 10 12 10 11 9 10 12 12 11 9 10 12 12 9 9 12 10 9 12 13 11 10 11 9 10 11 11 10 11 18 11 20 12 19 19 12 20 11 17 13 17 13 16 12 25 13 17 12 23 12 19 13 19 13 19 11 18 14 20 11 19 11 20 11 17 12 18 11 20 11 18 13 19 13 22 22 14 19 13 19 11 18 12 19 13 22 19 13 23 13 19 11 23 12 24 20 23 23 24 23 23 17 19 26 21 23 19 24 20 24 23 19 24 23 23 22 19 19 23 23 23 21 19 20 24 23 24 19 23 25 15 13 13 13 13 14 12 13 14 14 14 14 13 14 13 15.2 13 14 13 13 13 13.2 14.2 13 13 13.2 13 13 12 13 12 14 13 13.2 15.2 16 15.2 14 17 14.2 17.2 15.2 13 16.2 14.2 14.2 15.2 16 15.2 14 15.2 15 14.2 15 13 13.2 15 15.2 14.2 15 14.2 14 14 14 14.2 16.2 14 13.2 14 13 14 16 14 15 14 17 14 18 18 16 14 14 14 15 14 16 17 17 14 15 14 18 18 17 16 17 14 14 18 16 14 14 16 14 14 14 16 16 18 17 17 14 20 18 18 17 18 18 18 20 16 17 18 17 16 14 18 19 17 18 17 18 18 19 19 14 19 16 16 8 11 11 8 8 8 8 8 11 8 8 11 8 8 8 11 8 8 11 11 11 11 8 11 10 11 11 11 8 9 11 8 11 11 9 11 10 15 13 15 14 15 12 13 15 16 15 15 13 15 16 13 15 12 14 13 14 13 14 14 14 13 13 13 15 15 12 13 12 14 15 15 16 18 16 15 18 21 14 18 16 17 15 16 16 17 18 17 16 14 14 15 16 15 16 15 14 17 15 16 16 14 17 15 16 24 15 12 11 10 11 10 10 11 10 11 10 10 11 11 10 10 11 11 10 10 11 10 10 10 10 11 11 12 10 10 10 13 11 12 21 24 13 17 22 11 22 23 12 24.2 25 12 23 24 12 20 22 13 23 26 12 21 25 13 21 22 12 19 22 13 23 24 12 21 26 12 21 21 11 21 25 12 21 22 10 25 25 12 18 23 12 23 23 12 22 24 13 23 23 13 25 27 12 21 22 12 24 24 13 20 24 12 22 25 12 22 23 12 21 24 13 21 24.2 10 21 22 11 18 19 13 21 21 10 24 24 14 21 24 13 21 22 13 22 24.2 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 KM102 KM103 KM104 KM105 KM106 KM107 KM108 KM109 KM110 KM111 KM112 KM113 KM114 KM115 KM116 KM117 KM118 KM119 KM120 KM121 KM122 11 12 13 15 14 10 13 10 11 10 14 13 13 12 11 10 13 10 12 11 10 14 29 32 16 29 30 13 28 29 16 29 30 14 30 33.2 14 30 31.2 14 29 29 10 30 32.2 15 29 31 15 30 32.2 14 28 33.2 14 29 33.2 13 32.2 33.2 13 29 30 16 30 33.2 14 29 32.2 14 29 30 12 28 30 13 29 32.2 15 29 30 12 28 29 10 10 11 11 10 11 9 11 11 8 10 11 12 11 11 11 11 11 11 11 12 12 12 10 12 11 12 10 10 11 11 11 11 11 12 10 12 10 11 11 11 11 10 10 11 12 10 12 10 11 11 11 12 12 12 12 12 11 11 11 11 12 13 11 13 12 12 12 10 10 12 11 15 15 16 14 16 15 17 16 17 16 15 14 15 15 15 16 14 12 15 16 15 16 15 17 17 16 16 17 16 17 18 16 15 15 16 18 17 16 18 17 16 15 7 6 9 9 6.3 7 9 10 10 10 10 9.3 10 9.3 10 9 9.3 9 11 8 11 11 11 8 8 8 8 8 12 11 11 9 12 12 11 12 14 13 13 12 12 11 12 12 11 10 12 12 12 11 11 11 11 10 11 11 10 9 11 11 10 11 12 12 12 12 11 13 11 14 12 11 11 12 11 10 12 12 11 13 23 21 17 19 18 19 17 24 19 17 19 19 20 21 17 19 24 17 16 24 23 24 13 14 14 14 10 11 13 16 11 11 21 23 24 13 14 14 17 9 13 18 12 13 21 23 19 13 13 14 18 8 17 19 10 12 23 24.2 23 14 15 17 18 14 16 10 12 21 25 19 12 15 14 18 10 14 15 10 12 19 23 22 14 15 17 18 10 13 15 12 12 19 26 19 12 14.2 17 17 11 14 15 12 13 22 23 24 14 14 18 18 11 12 13 16 10 10 19 25 25 15.2 15.2 17 18 11 11 12 16 11 12 21.2 22 24 13 14 18 18 11 12 13 16 10 11 23 25 23 13 14 14 19 11 15 16 10 10 19 22 23 13 15.2 14 18 11 13 15 12 13 21.2 23 23 13 14 16 18 11 11 15 25 11 12 23 23 24 14.2 15.2 12 14 11 13 15 10 10 19 22 19 13 14 16 18 11 15 16 10 12 17 22 24 14 15.2 17 19 13 15 11 14 21 22 24 13.2 14 14 17 8 13 15 12 12 23 25 24 13 14.2 16 20 8 13 15 10 11 21 25 18 12 14 17 19 11 11 12 10 11 21 21 24 12 15.2 19 19 16 16 10 11 22 22 23 13 14.2 14 17 8 12 16 10 21 24 [...]... locus gen hệ Identifiler đối với quần thể ngi dân tộc Khmer Vỡ vy, vic tin hnh trin khai ti nghiờn cu: Kho sỏt v xõy dng c s d liu tn sut cỏc alen ca 15 locus gen h Identifiler t qun th ngi dõn tc Khmer ng dng trong giỏm nh ADN l mt yờu cu cp thit Đề tài này c hoàn thành sẽ đáp ứng yêu cầu cấp thiết của giám định gen và đóng góp ti liệu vào hệ thống gen hình sự quốc tế Kết quả của đề tài là cơ sở pháp... lý vững chắc để phân tích, đánh giá và kết luận giám định đối với những vụ án liên quan đến ngi thuộc dân tộc Khmer Mc tiờu ca ti Kho sỏt v xõy dng c s d liu tn sut cỏc alen ca 15 locus gen (ADN) h Identifiler t dõn tc Khmer phc v cho cụng tỏc giỏm nh ADN cỏc v ỏn liờn quan n ngi dõn tc Khmer Trờn c s ú, tớnh tn sut xut hin ca mi alen trong tng locus ca dõn tc Khmer, lm c s khoa hc phõn tớch, ỏnh... an v cụng tỏc xột x ca ngnh T phỏp 1.1.3 Khỏi nim v locus v alen Locus l mt on ADN trờn nhim sc th, dnh cho mt gen nht nh Trong giỏm nh ADN thỡ locus cũn cú th l nhng on ADN khụng mó húa [26] Alen l cỏc trng thỏi khỏc nhau ca cựng mt locus Mi cỏ th u cú hai alen cho mi mt locus, trong ú mt alen di truyn t b, mt alen di truyn t m Nu hai alen ca mt locus hon ton ging nhau thỡ c gi l ng hp t, cũn khỏc... lng các vụ án hình sự nghiêm trọng liên quan đến ngi dân tộc Khmer và đc trng cầu giám định ADN tại Viện Khoa học hình sự có xu hng gia tăng Cụ thể năm 2004 có 10 vụ, năm 2005 có 11 vụ, năm 2006 có 7 vụ, năm 2007 có 9 vụ, năm 2008 có 16 vụ, năm 2009 có 21 vụ và năm 2010 có 18 vụ Tuy nhiên, ở Việt Nam cho đến nay cha có một nghiên cứu hoàn chỉnh nào đc công bố về khảo sát sự phân bố các alen của 15 locus. .. tớch kiu gen bng phn mm GenemaperID v3.2 Kt qu chỳng tụi ó thu c 120 bng kiu gen khỏc nhau ca 120 mu 31 Hỡnh nh kiu gen dng peak t mu ký hiu KM100 3.3 Kt qu x lý s liu thng kờ 3.3.1 Kt qu tớnh toỏn tn sut cỏc alen T 120 kiu gen h Identifiler, chỳng tụi ó m c tng s 3600 alen, gm 52 loi alen (t 6 n 35.2) vi tn sut v s loi alen tng locus gen l khỏc nhau 32 Bng 3.2 Tn sut xut hin ca cỏc alen trờn 15 locus. .. khỏc nhau c gi l d hp t [16, 26] 1.1.4 Cỏc tiờu chun cho locus STR dựng trong giỏm nh ADN Giỏm nh ADN hin nay s dng cỏc locus STR l ch yu Phng phỏp giỏm nh gen cú tin cy rt cao bi cỏc locus STR cú tớnh a alen (tớnh a hỡnh) rt cao, mi alen ch xut hin trong qun th vi tn s rt thp [16, 32] Locus STR ngn nờn cú th ng thi phõn tớch c ba hoc nhiu STR hn trong cựng mt thi im Vic phõn tớch a h rt cú giỏ tr vỡ... h gen ngi - mt s kin trng i trong s phỏt trin ca sinh hc phõn t núi chung v trong vic nghiờn cu gen ngi núi riờng Theo cụng b ny, s lng gen trong b gen ngi cú khong 35 000 gen, trong ú cú hng chc gen c nghiờn cu ng dng xỏc nh huyt thng v truy nguyờn cỏ th [26] Cng nh ADN sinh vt nhõn chun khỏc, ADN nhõn ngi gm nhng trỡnh t mó hoỏ (cỏc exon) xen k vi nhng trỡnh t khụng mó hoỏ (cỏc intron) [14, 15] ... sỏt c trong mt locus gen * Eij l s kiu gen AiAj tớnh toỏn theo lý thuyt Eij = npi2 nu i=j, Eij = 2npipj nu i j (2.2) Tra giỏ tr 2 lý thuyt trờn bng theo h s t do: k(k-1)/2 Quy tc kim nh 2 (2.3) l trong mt locus gen s lng kiu gen quan sỏt di 5, thỡ phi kt hp cỏc alen bờn cnh tng s lng quan sỏt cao hn 5 tớnh toỏn 29 2.2.3.3 Cỏc bc tớnh toỏn thng kờ v kim nh - 120 kiểu gen của 120 cá thể ng-ời Khmer. .. chn, nghiờn cu nhng locus (v trớ trờn nhim sc th) cú tớnh a alen (a hỡnh) cao thỡ cn kho sỏt tn sut phõn b cỏc alen trong qun th ca tng locus s dng Qun th c nghiờn cu kho sỏt phi t c cỏc yờu cu trong thng kờ, di truyn nh: cỏc mu dựng trong nghiờn cu phi m bo tớnh ngu nhiờn, khụng cú quan h huyt thng trong 3 i [19, 36] cú c tn sut ca mi alen, trc ht phi tỡm c s ln xut hin ca mi alen trong qun th nghiờn... nghiờn cu, kho sỏt v cụng b kt qu ca mỡnh v tn sut cỏc alen trong h locus gen ca tng qun th ngi ng dng trong giỏm nh truy nguyờn cỏ th hay xỏc nh quan h huyt thng m bo tớnh chớnh xỏc, cỏc phũng thớ nghim giỏm nh gen thng dựng h thng phõn tớch 15 locus gen nh h Identifiler hoc h Power Plex 16 Ti M, cnh sỏt liờn bang M ó kho sỏt v s dng tn sut d liu ADN theo h Identifiler ca nhiu chng tc ngi khỏc nhau: ... công bố khảo sát phân bố alen 15 locus gen hệ Identifiler quần thể ngi dân tộc Khmer Vỡ vy, vic tin hnh trin khai ti nghiờn cu: Kho sỏt v xõy dng c s d liu tn sut cỏc alen ca 15 locus gen h Identifiler... th ngi dõn tc Khmer ng dng giỏm nh ADN l mt yờu cu cp thit Đề tài c hoàn thành đáp ứng yêu cầu cấp thiết giám định gen đóng góp ti liệu vào hệ thống gen hình quốc tế Kết đề tài sở pháp lý vững... đánh giá kết luận giám định vụ án liên quan đến ngi thuộc dân tộc Khmer Mc tiờu ca ti Kho sỏt v xõy dng c s d liu tn sut cỏc alen ca 15 locus gen (ADN) h Identifiler t dõn tc Khmer phc v cho cụng