Giám sát tình hình đề kháng kháng sinh của các vi khuẩn phân lập từ bệnh phẩm máu tại bệnh viện nhi đồng từ 10 năm 2013 đến 03 năm 2014

B GIÁO DC VẨ ẨO TO TRNG I HC M TP.HCM KHịA LUN TT NGHIP Tên đ tài: GIÁM SÁT TỊNH HỊNH  KHÁNG KHÁNG SINH CA CÁC VI KHUN PHÂN LP T BNH PH M MÁU TI BNH VIN NHI NG 1 T 10/2013 N 03/2014 KHOA CÔNG NGH SINH HC CHUYÊN NGHÀNH VI SINH-SINH HC PHÂN T GVHD: THS.BS. LÊ QUC THNH SVTH: NGUYN QUANG TÍN MSSV: 1053010802 NIÊN KHÓA: 2010-2014 Tp. H Chí Minh, tháng 05 nm 2014 Nhn xét ca giáo viên hng dn: SVTH: Nguyn Quang Tín MSSV: 1053010802  tài: “GIÁM SÁT TỊNH HỊNH  KHÁNG KHÁNG SINH CA CÁC VI KHUN PHÂN LP T BNH PHM MÁU TI BNH VIN NHI NG 1 T 10/2013 N 03/2014” ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ LI CM N u tiên, em xin gi li cm n sơu sc nht đn ThS. Bs. Lê Quc Thnh. Thy đƣ nhit tình hng dn và cho em nhng kin thc chuyên môn đ em hoàn thành tt báo cáo khóa lun tt nghip này. Em xin chơn thƠnh cám n Ban giám hiu và Quý thy cô Khoa Công ngh sinh hc trng i hc M Thành ph H Chí Minh trong sut 4 nm hc qua đƣ nhit tình ging dy, ht lòng truyn đt cho em nhng kin thc c bn và kin thc chuyên môn, to điu kin tt nht cho em trong sut quá trình hc tp ti trng. Em xin gi li cm n đn các cô, chú, anh, ch trong khoa Vi sinh - Bnh vin Nhi ng 1 đƣ nhit tình hng dn các kin thc, k thut chuyên môn, góp ý và giúp đ em hoàn thành khóa thc tp tt nghip. Cui cùng, con xin cm n b m đƣ sinh thƠnh, dy d con khôn ln và dành cho con nhng điu tt đp nht đ con có th chuyên tâm hc hành và có đc thành qu nh ngƠy hôm nay. Thành ph H Chí Minh, ngày 22 tháng 05 nm β014 Sinh viên Thc Hin Nguyn Quang Tín KHOA CÔNG NGH SINH HC GVHD: ThS.BS. Lê Quc Thnh Báo cáo khóa lun tt nghip SVTH: Nguyn Quang Tín Trang 1 MSSV: 1053010802 DANH MC VIT TT CFU: Colony Forming Unit (đn v to khúm đi vi các vi khun sng) ESBLs: Extended spectrum beta-lactamase F1: Fraction 1(kháng nguyên nang) I: Intermediate (trung gian) Ks: kháng sinh KS: kháng sinh đ LPS: lipopolysaccharide (ni đc t) n: c mu NKT: nhim khun huyt NTH: nhim trùng huyt R: Resistant (đ kháng) S: Susceptible (nhy cm) Môi trng: BA: Blood agar BHI: Brain Heart Infusin CA: Chocolate Agar KIA: Kligler’s Iron Agar MC: MacConkey agar MHA: Mueller Hinton Agar SIM: Sulfide Indole Motility KHOA CÔNG NGH SINH HC GVHD: ThS.BS. Lê Quc Thnh Báo cáo khóa lun tt nghip SVTH: Nguyn Quang Tín Trang 2 MSSV: 1053010802 Vi khun: aan: Acinetobacter sp E. coli: Escherichia coli EAEC: Enteroadherent E.coli ecl: Enterobacter cloacae eco: Escherichia coli EHEC: Enterohemorrhagic E.coli EIEC: Entero invasive Escherichia coli ent: Enterococcus sp EPEC: Enteropathogenic Escherichia coli ETEC: Enteroxigenic Escherichia coli kpn: Klebsiella pneumonia pae: Pseudomonas aeruginosa pce: Pseudomonas cepacia ps-: Pseudomonas spp sau: Staphylococcus aureus scn: Staphylococcus coagulase nagative sta: Staphylococci str: Streptococcus sp KHOA CÔNG NGH SINH HC GVHD: ThS.BS. Lê Quc Thnh Báo cáo khóa lun tt nghip SVTH: Nguyn Quang Tín Trang 3 MSSV: 1053010802 Kháng sinh AP: ampicillin ATM: aztreonam Ba: Bacitracin C: chloramphenicol CAZ: ceftazidime CCAZ: ceftazidime /clav. CCTX: cefotaxime/clav. CIP: ciprofloxacin CPD: cefpodoxime CPM: cefepime CPZ: cefoperazone CTX: cefotaxime CXM: cefuroxime GM: gentamycin IMP: imipenem Op: Optochin OX: oxacillin PB: polimyxin B PEF: pefloxacin PG: penicillin RP: rifampicin TIM: ticarcillin/Clavulanic acid TS: cotrimoxazole VA: vacomycin Khoa: 1AB: Khoa ngoi tng hp 1CD: Khoa ni tng quát 1 1I: Khoa dch v 2AB: Khoa phng, chnh hình 2CD: Khoa ni tng quát 2 2I: Khoa Thn 3B: Khoa tim mch 3CD: Khoa hô hp 3I: Khoa st xut huyt + huyt hc CC: Khoa cp cu HSN: Khoa hi sc ngoi ICU: Khoa hi sc tng cng NC: Khoa ngoi chn Nhim NICU: Khoa hi sc s sinh RHM: Khoa rng hƠm mt. SS: Khoa s sinh TH: Khoa tiêu hóa KHOA CÔNG NGH SINH HC GVHD: ThS.BS. Lê Quc Thnh Báo cáo khóa lun tt nghip SVTH: Nguyn Quang Tín Trang 4 MSSV: 1053010802 DANH MC CÁC BNG Bng 3. Bng trc nghim sinh hóa đnh danh trc khun Gram âm thuc nhóm Enterobacteriaceae. [3] 71 Bng 3.1: T l cy máu dng tính  Bnh vin Nhi ng 1 t 10/β01γ đn 03/2014. 76 Bng 3.2: T l phân b ca cy máu dng tính theo tng khoa  Bnh vin Nhi ng 1 t 10/β01γ đn 03/2014 (n = 543) 78 Bng 3.3: T l phân b s ca cy máu dng tính theo đ tui  Bnh vin Nhi ng 1 t tháng 10/β01γ đn 03/2014 (n = 543). 79 Bng 3.4: T l phân b s ca cy máu dng tính theo gii tính  Bnh vin Nhi ng 1 t tháng 10/β01γ đn 03/2014 (n = 543). 81 Bng 3.5: T l các loi vi khun phân lp đc t chai cy máu dng ti Bnh vin Nhi ng 1 t 10/2013- 03/2014 (n = 543). 82 Bng 3.6: T l đ kháng kháng sinh ca Escherichia coli đc phân lp t bnh phm máu ti Bnh vin Nhi ng 1 t 10/β01γ đn 03/2014 (n = 22). 84 Bng 3.7: T lên đ kháng kháng sinh ca Acinetobacter spp đc phân lp t bnh phm máu ti Bnh vin Nhi ng 1 t 10/β01γ đn 03/2014 (n=59). 86 Bng 3.8: T l đ kháng kháng sinh ca Klebsiella pneumoniae đc phân lp t bnh phm máu ti Bnh vin Nhi ng 1 t 10/β01γ đn 03/2014 (n = 26). 88 Bng 3.9: T l đ kháng kháng sinh ca P. aerigunosa đc phân lp t bnh phm máu ti Bnh vin Nhi ng 1 t 10/β01γ đn 03/2014 (n = 23). 90 Bng 3.10: T l đ kháng kháng sinh ca Staphylococcus aureus đc phân lp t bnh phm máu ti Bnh vin Nhi ng 1 t 10/β01γ đn 03/2014 (n = 25). 92 Bng 3.11: Kh nng sinh men ESBLs ca : Escherichia coli (n = 22) và Klebsiella pneumonia (n = 26), Acinetobacter sp (n = 59) đc phân lp t bnh phm máu ti Bnh vin Nhi ng 1t 10/β01γ đn 03/2014. 94 Bng PL.1: Hng dn đt đa kháng sinh (CLSI β01β) [11] 103 KHOA CÔNG NGH SINH HC GVHD: ThS.BS. Lê Quc Thnh Báo cáo khóa lun tt nghip SVTH: Nguyn Quang Tín Trang 5 MSSV: 1053010802 Bng PL.2: Tiêu chun đng kính vòng vô khun vi khun đng rut (Enterobacteriaceae) [11] 104 Acinetobacter sp. [11] 105 Staphylococci. [11] 106 Pseudomonas aerigunosa. [11] 107 KHOA CÔNG NGH SINH HC GVHD: ThS.BS. Lê Quc Thnh Báo cáo khóa lun tt nghip SVTH: Nguyn Quang Tín Trang 6 MSSV: 1053010802 DANH MC BIU  Biu đ 3.1: T l cy máu dng tính  Bnh vin Nhi ng 1 t 10/β01γ đn 03/2014. 77 Biu đ 3.2: T l phân b ca cy máu dng tính theo tng khoa  Bnh vin Nhi ng 1 t 10/β01γ đn 03/2014. 79 Biu đ 3.3: T l phân b ca cy máu dng theo đ tui  Bnh vin Nhi ng 1 t tháng 10/β01γ đn 03/2014 80 Biu đ 3.4: T l phân b ca cy máu dng theo gii tính  Bnh vin Nhi ng 1 t tháng 10/β01γ đn 03/2014. 81 Biu đ 3.5: T l các loi vi khun phân lp đc t chai cy máu dng ti Bnh vin Nhi ng 1 t 10/2013- 03/2014. 83 Biu đ 3.6: T l đ kháng kháng sinh ca Escherichia coli đc phân lp t bnh phm máu ti Bnh vin Nhi ng 1 t 10/β01γ đn 03/2014. 85 Biu đ 3.7: T lên đ kháng kháng sinh ca Acinetobacter sp đc phân lp t bnh phm máu ti Bnh vin Nhi ng 1 t 10/β01γ đn 03/2014. 87 Biu đ 3.8: T đ kháng kháng sinh ca Klebsiella pneumoniae đc phân lp t bnh phm máu ti Bnh vin Nhi ng 1 t 10/β01γ đn 03/2014. 89 Biu đ 3.9: T l đ kháng kháng sinh ca Pseudomonas aerigunosa đc phân lp t bnh phm máu ti Bnh vin Nhi ng 1t 10/β01γ đn 03/2014. 91 Biu đ 3.10: T l đ kháng kháng sinh ca Staphylococcus aureus đc phân lp t bnh phm máu ti Bnh vin Nhi ng 1t 10/β01γ đn 03/2014. 93 Biu đ 3.11: T l sinh men ESBLs ca : Escherichia coli và Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter sp đc phân lp t bnh phm máu ti Bnh vin Nhi ng 1t 10/β01γ đn 03/2014. 94 KHOA CÔNG NGH SINH HC GVHD: ThS.BS. Lê Quc Thnh Báo cáo khóa lun tt nghip SVTH: Nguyn Quang Tín Trang 7 MSSV: 1053010802 DANH MC HÌNH NH Hình 1.1: Staphylococci di kính hin vi và khun lc trên thch MHA 33 Hình 1.2: Streptococci di kính hin vi và khun lc trên môi trng BA 38 Hình 1.3: Klebsiella di kính hin vi và khun lc trên thch MC 42 Hình 1.4: Pseudomonas aeruginosa di kính hin vi và khun lc trên MHA 44 Hình 1.5: Acinetobacter di kính hin vi và khun lc trên MC 47 Hình 1.6: Escherichia coli di kính hin vi và khun lc trên MC 48 [...]... Kh o sát t n su t các vi khu n gây b nh phân l m c t b nh ph m máu và kháng kháng sinh c a các ch ng vi khu n này t i b nh vi n Nhi ng 1 t tháng 10 n tháng 03/ 2014 2 M C TIÊU C TH : Kh o sát t l phân b ca c tu i, gi i tính, khoa u tr Kh o sát t l vi khu n phân l nhân có ch nh c y máu Kh b nh vi c t b nh ph m máu c a các b nh ng 1 kháng kháng sinh c a các vi khu n phân l ct b nh ph m máu Kh o sát t... này, chúng tôi xin th c hi GIÁM SÁT TÌNH HÌNH KHU N PHÂN L P T tài: KHÁNG KHÁNG SINH C A CÁC VI B NH PH M MÁU T I B NH VI N NHI NG 1 T 10 N 03/ 2014 K t qu nghiên c u nh m cung c p thêm thông tin tham kh o cho các nhà lâm sàng trong vi ng s d u tr i v i các ng h p có nhi m trùng huy t do vi khu n gây nên SVTH: Nguy n Quang Tín MSSV: 105 3 0108 02 Trang 12 KHOA CÔNG NGH SINH H C Báo cáo khóa lu n t t nghi... 22 1.7 Phòng b nh nhi m khu n huy t[18] 23 2 THU C KHÁNG SINH VÀ S KHÁNG KHÁNG SINH 25 thu c kháng sinh 25 2.2 X p lo i kháng sinh 25 ng c a kháng sinh 26 2.4 S kháng kháng sinh [1] 27 2.5 Ngu n g c c a vi c kháng thu c 28 kháng[ 16] 30 2.7 S kháng chéo 30 2.8 Bi n pháp h n ch n kháng kháng sinh 30 2.9 ESBLs (Extended... l c qua vi c dùng kháng sinh Vì v y vi c phòng ch ng, gi m thi u nh ng v do nh ng vi khu gây nên chính là vi c ch ng nhi m khu n t t t và s d ng kháng sinh h p lý cho nh ng b nh nhân ph - c bi c bi t quan tr B-lactam có s u tr dài ngày n s m nh t trong l ch s kháng sinh u tr các nhi m khu n Hi n nay nhóm ng kháng sinh l n nh t, chi m g n ba ph kháng sinh hi các vi khu n Gram âm Vi khu n sinh kháng toàn... CÔNG NGH SINH H C Báo cáo khóa lu n t t nghi p 2 THU C KHÁNG SINH VÀ S 2.1 GVHD: ThS.BS Lê Qu c Th nh KHÁNG KHÁNG SINH thu c kháng sinh Thu c kháng sinh là nh ng ch n nhân lên b hay nhi ng ch ng l i s s ng c a vi khu n, ng m c phân t , ho n chuy n hóa c n thi t c ng vào m t i s ng vi khu n ho ng vào s cân b ng lí hóa [16] Kháng sinh có tác d c hi t lo i kháng sinh s m t lo i vi khu n hay m t nhóm vi khu... ThS.BS Lê Qu c Th nh Vi c phát hi n các vi khu n sinh ESBL nhanh, chính xác c a phòng xét nghi m Vi sinh t i các b nh vi n là vi c làm h t s c c n thi lâm sàng s m l a ch c kháng sinh thích h p, gi b nh nhân T i Vi u tr , c u s ng u ki n c a t ng b nh vi n, m t s khoa Vi n hành th nghi m phát hi n vi khu n sinh ESBL b ng các SVTH: Nguy n Quang Tín MSSV: 105 3 0108 02 Trang 32 KHOA CÔNG NGH SINH H C Báo cáo... i d ng kháng sinh, các nhà kháng v ng g p t kì gen liên các ch ng vi khu i [16] Trang 27 KHOA CÔNG NGH SINH H C Báo cáo khóa lu n t t nghi p GVHD: ThS.BS Lê Qu c Th nh Hi u loài vi khu n gây b i và là m i quan tâm lo l ng c a toàn xã h i Vi khu n kháng kháng sinh làm gi i h n kh h pd u tr nhi m trùng, m t s n t vong do vi khu n gây b u tr G ng kháng v i h u h t các kháng sinh u còn cho bi t vi khu... s d ng r ng rãi nên t l vi khu kháng các kháng sinh này r t cao, nh t là ESBL s c bi t a kháng chéo v i nhi aminoglycoside, fluoroquinolone, tetracyclin, co-trimoxazol gây u tr do vi c l a ch n kháng sinh b thu h p Nh ng b nh nhân nhi m khu n do vi khu n sinh ESBL có b nh c n ng, t l t vong cao do vi khu SVTH: Nguy n Quang Tín MSSV: 105 3 0108 02 ng kháng Trang 31 KHOA CÔNG NGH SINH H C Báo cáo khóa lu... kháng sinh ch ng lai các tác nhân n , virus, vi n m r t hi u l hi n các vi sinh v t kháng thu c t m ng Nhi m trùng huy t là nguyên nhân gây t trong b nh vi n, mà t l cao nh t là b u các b nh nhân c bi t ngay c các b nh vi n c dù có h th ng trang thi t b ph c v c p c u t l t vong v n r t cao Nguyên nhân không nh d n tình tr ng này chính là chi ng gia c c a các ch ng vi khu n gây NTH Hi n nay, t i Vi. .. còn cho bi t vi khu n có kh kháng v i không ch nh ng kháng sinh m i s d ng mà còn kháng l i các ng n a, các ch ng vi khu n không gây b n tr tính kháng truy n cho nh ng vi khu n gây b nh khác [16] thu Nhi u nghiên c u cho th m khu n huy t, s c nhi m khu n, th m chí b nh nhân b t nh kho ng 70% là nhi m trùng do vi khu n Gram âm Các vi khu n Gram âm gây b ng g p t i các b nh vi n là Escherichia coli, Klebsiella . tài: GIÁM SÁT TỊNH HỊNH  KHÁNG KHÁNG SINH CA CÁC VI KHUN PHÂN LP T BNH PH M MÁU TI BNH VI N NHI NG 1 T 10/ 2013 N 03/ 2014 KHOA CÔNG NGH SINH HC CHUYÊN NGHÀNH VI SINH- SINH. Nguyn Quang Tín MSSV: 105 3 0108 02  tài: “GIÁM SÁT TỊNH HỊNH  KHÁNG KHÁNG SINH CA CÁC VI KHUN PHÂN LP T BNH PHM MÁU TI BNH VI N NHI NG 1 T 10/ 2013 N 03/ 2014 ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ. đánh giá tình trng NTH do vi khun gây ra và mc đ đ kháng kháng sinh ca các vi khun này, chúng tôi xin thc hin đ tài: “GIÁM SÁT TÌNH HÌNH  KHÁNG KHÁNG SINH CA CÁC VI KHUN PHÂN LP