Sự đa dạng di truyền trong bộ gene thứ cấp cryptomonads doc

Sự đa dạng di truy ền trong bộ gene thứ cấp cryptomonads Nhóm tảo cryptomonads được coi là nhóm tảo kỳ bí trong số các nhóm tảo đơn bào nước ngọt và nước mặn mà plastid của chúng có được thông quá tiến trình "nuốt" và "giữ lại" một thể cộng sinh thứ cấp (tức thể cộng sinh eukaryote). Cùng với nhóm tảo chlorarachniophyte, cryptomonads biểu hiện sự bất thường trong cấu trúc thành ph ần của chúng ở chỗ chúng giữ lại nhân của thể cộng sinh dưới dạng thu gọn tối đa gọi là nucleomorph (nuleo - nhân; morph- hình thái - tạm dịch nucleomorph là nhân thứ cấp dựa trên ngữ nghĩa và cấu trúc tế bào nhóm tảo này). Bộ gene nhân thứ cấp của một lòai cryptomonads Guillardia theta đã được đọc trọn vẹn năm 2001, và với 3 nhiễm sắc thể có chiều dài tổng cộng 551 kb cho thấy đây là một hình m ẫu của sự nét chặt bộ gene trong nhân. Sử dụng bộ gene thứ cấp của Guillardia theta như là điểm mốc, các nhà khoa học Canada đã tiến hành nghiên cứu về cấu trúc và thành phần của 9 lòai cryptomnads khác. Bản thảo của công trình này đã được tạp chí Molecular Biology and Evolution chấp nhận và chờ công bố chính thức (MBE Advance Access published o nline o n November 23, 2005, Molecular Biology and Evolution, doi:10.1093/molbev/msj066) Trong công trình này, các tác giả đọc trình tự của các gene 18S rDNA của 9 lòai cryptomonads và 4 mảnh hsp90, đồng thời sử dụng kỹ thuật điện di trên trường đi ện xung cũng như kỹ thuật lai Southern để ước tính kích thước 9 bộ gene nhân thứ cấp của 9 lòai này. Ngòai ta nhóm tác giả còn sử dụng kỹ thuật PCR dài (long PCR) để khuếch đại mảnh genome nhân thứ cấp của hai chủng Hanusia phi CCMP325 vàProteomonas sulcata CCMP704, hai mảnh này được cho là có liên quan đền vùng cận cuối của nhiễm sắc thể số 1 nhân thứ cấp G. theta. Kết quả cho thấy rằng: a- Bộ gene thứ cấp luôn chứa 3 nhiễm sắc thế, cho thấy đây là đặc tính chung của bộ gene thứ cấp ở cryptomonads. b- Tuy nhiên kích thư ớc của các nhiễm sắc thể này biến thiên mạnh mẽ giữa các lòai cryptomonads dùng trong thí nghiệm. c- Trong số đó chủng không tên CCMP1178 mang bộ gene thứ cấp lớn nhất, khỏang 845 kb, được biết cho đến nay. d- Việc giảm kích thước bộ gene nhân thứ cấp có vẻ đã xảy ra rất nhiều lần và hòan tòan đ ộc lập với nhau trong suốt tiến trình tiến hóa của cryptomonads. e- Mặc dù kích thước bộ gene nhân thứ cấp thay đổi nhưng tr ật tự gene, ít nhất khi xét quan hệ thứ tự 18S rDNA, ubc4 và hsp90, cho thấy là không thay đổi. f- Các tác giả còn lý gi ải rằng sự tái tổ hợp nội nhiễm sắc thể có thể làm thay đổi kích thước và trình tự vùng phụ cận cuối lặp lại nằm giữa locus 18S rDNA và ubc4. Các kết quả này hé mở tính đa dạng di truyền c ủa bộ gene nhân thứ cấp cryptomonads đ ồng thời thúc đẩy nghiên cứu tòan bộ trình tự bộ gene này ở những lòai tương cận xa và gần. . Sự đa dạng di truy ền trong bộ gene thứ cấp cryptomonads Nhóm tảo cryptomonads được coi là nhóm tảo kỳ bí trong số các nhóm tảo đơn bào nước. và ubc4. Các kết quả này hé mở tính đa dạng di truyền c ủa bộ gene nhân thứ cấp cryptomonads đ ồng thời thúc đẩy nghiên cứu tòan bộ trình tự bộ gene này ở những lòai tương cận xa và gần nhiễm sắc thể số 1 nhân thứ cấp G. theta. Kết quả cho thấy rằng: a- Bộ gene thứ cấp luôn chứa 3 nhiễm sắc thế, cho thấy đây là đặc tính chung của bộ gene thứ cấp ở cryptomonads. b- Tuy