TRƯỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM TPHCM KHOA KHOA HỌC SINH HỌCỨNG DỤNG KỸ THUẬT REALTIME PCR TRONG PHÁT HIỆN VÀ ĐỊNH LƯỢNG ASFVNhóm thực hiện: Nguyễn Hồ Minh Thư... Mục tiêu: phát hiện và định lượ
Trang 1TRƯỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM TPHCM KHOA KHOA HỌC SINH HỌC
ỨNG DỤNG KỸ THUẬT REALTIME PCR
TRONG PHÁT HIỆN VÀ ĐỊNH LƯỢNG ASFV
Nhóm thực hiện: Nguyễn Hồ Minh Thư
Trang 3Mục tiêu: phát hiện và định lượng ASFV bằng qPCR.
Hiện trạng chăn nuôi
Trang 4Sơ đồ thành phần và cấu trúc của ASFV sinh không đảm bảo.
African Swine Fever Virus
4
Trang 5Một số triệu chứng lâm sàng của ASFV
a) Lợn hôn mê có biểu hiện tím tái ở tai, bụng; b) Các chấm xuất huyết ở thận; c) Xuất huyết hạch bạch huyết ở gan.
5
Trang 63 Vật liệu và phương pháp
Mẫu máu toàn phần, huyết thanh
dịch mũi-họng, cDNA dương tính ASFV.
Thiết kế primer bắt đặc hiệu vào trình tự mã hóa cho protein nhận diện đặc thù của
6
Trang 9Sự kết hợp giữa kỹ thuật PCR truyền thống và kỹ thuật phát hiện tín hiệu huỳnh
Trang 12Kết quả của realtime PCR
(A) Biểu đồ khuếch đại tín hiệu huỳnh quang (B) Biểu đồ đỉnh chảy Melting Curve.
4 Kết quả dự kiến
12
Trang 13Tài liệu tham khảo
1 Nguyễn Thị Thu Phượng (2022) Bệnh Dịch tả heo Châu Phi (African Swine Fever) Tiểu luận Công nghệ sinh học, Trường đại học Nông Lâm TP Hồ Chí Minh.
2 Andrés., Germán., Tsai., Billy (2017) African Swine Fever Virus Gets Undressed: New Insights on the Entry Pathway JournalofVirology, 91(4), e01906-16- doi:10.1128/JVI.01906-16
3 Kubista, M., Andrade, J M., Bengtsson, M., Forootan, A., Jonák, J., Lind, K., Sindelka, R., Sjöback, R., Sjögreen, B., Strömbom, L., Ståhlberg, A., and Zoric, N (2006) The real-time polymerase chain reaction Molecular aspects of medicine, 27 (2-3), 95-125 https://doi.org/10.1016/j.mam.2005.12.007
4.Neilan J.G., Zsak L., Lu Z., Burrage T.G., Kutish G.F., and Rock D.L (2004) Neutralizing antibodies to African swine fever virus proteins p30, p54, and p72 are not sufficient for antibody-mediated protection Virology 319:337-42 DOI: 10.1016/j.virol.2003.11.011
5.Njau, E P., Machuka, E M., Cleaveland, S., Shirima, G M., Kusiluka, L J., Okoth, E A., and Pelle, R (2021) African Swine Fever Virus (ASFV): Biology, Genomics and Genotypes Circulating in Sub-Saharan Africa Viruses, 13(11), 2285 https://doi.org/10.3390/v13112285
6.Qi C., Zhang Y., Wang Z., Li J., Hu Y., Li L., Ge S., Wang Q., Wang Y., Wu X., and Wang Z (2023) Development and application of a TaqMan-based real-time PCR method for the detection of the ASFV MGF505-7R gene Front Vet Sci 10:1093733 doi: 10.3389/fvets.2023.1093733
7.Ramírez-Medina E., Vuono E.A., Velazquez-Salinas L., Silva E., Rai A., Pruitt S., Berggren K.A., Zhu J., Borca M.V., and Gladue D.P (2020) The MGF360-16R ORF of African Swine Fever Virus Strain Georgia Encodes for a Nonessential Gene That Interacts with Host Proteins SERTAD3 and SDCBP Viruses 12 DOI: 10.3390/v12010060
8.Wong, W., Farr, R., Joglekar, M., Januszewski, A., and Hardikar, A (2015) Probe-based Real-time PCR Approaches for Quantitative Measurement of microRNAs Journal of visualized experiments: JoVE, (98), 52586 https://doi.org/10.3791/52586
Trang 14Thankyou