Trang 1 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH NGUYỄN QUANG TRUNGMỐI LIÊN QUAN GIỮA ĐỘT BIẾN GEN PRE-S/S CỦA HBV VÀ UNG THƯ BIỂU MÔ TẾ BÀO GAN LUẬN ÁN TIẾN S
BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH NGUYỄN QUANG TRUNG MỐI LIÊN QUAN GIỮA ĐỘT BIẾN GEN PRE-S/S CỦA HBV VÀ UNG THƯ BIỂU MÔ TẾ BÀO GAN LUẬN ÁN TIẾN SĨ Y HỌC TP HỒ CHÍ MINH, NĂM 2024 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH NGUYỄN QUANG TRUNG MỐI LIÊN QUAN GIỮA ĐỘT BIẾN GEN PRE-S/S CỦA HBV VÀ UNG THƯ BIỂU MÔ TẾ BÀO GAN NGÀNH: BỆNH TRUYỀN NHIỄM VÀ CÁC BỆNH NHIỆT ĐỚI MÃ SỐ: 9720109 LUẬN ÁN TIẾN SĨ Y HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC 1 PGS.TS PHẠM THỊ LỆ HOA 2 PGS.TS HOÀNG ANH VŨ TP HỒ CHÍ MINH, NĂM 2024 i LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan đây là công trình nghiên cứu của riêng tôi, các kết quả nghiên cứu được trình bày trong luận án là trung thực, khách quan và chưa từng được công bố ở bất kỳ nơi nào Tác giả luận án Nguyễn Quang Trung ii MỤC LỤC LỜI CAM ĐOAN i MỤC LỤC ii DANH MỤC VIẾT TẮT- THUẬT NGỮ ANH-VIỆT iv DANH MỤC BẢNG v DANH MỤC HÌNH vii DANH MỤC SƠ ĐỒ - BIỂU ĐỒ .viii ĐẶT VẤN ĐỀ 1 CHƯƠNG 1: TỔNG QUAN 3 1.1 Dịch tễ bệnh nhiễm vi rút viêm gan B và ung thư biểu mô tế bào gan liên quan đến vi rút viêm gan B 3 1.2 Cấu trúc và chu trình sống của vi rút viêm gan B trong tế bào gan 6 1.3 Cơ chế gây ung thư biểu mô tế bào gan liên quan với vi rút viêm gan B 12 1.4 Kỹ thuật chẩn đoán đột biến gen trên vi rút viêm gan B 17 1.5 Các nghiên cứu về đột biến gen của vi rút viêm gan B liên quan với ung thư biểu mô tế bào gan 19 CHƯƠNG 2: ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 35 2.1 Thiết kế nghiên cứu 35 2.2 Đối tượng nghiên cứu 35 2.3 Thời gian và địa điểm nghiên cứu 36 2.4 Cỡ mẫu của nghiên cứu 36 2.5 Xác định các biến số độc lập và phụ thuộc 37 2.6 Kỹ thuật đo lường và tiêu chuẩn chẩn đoán trong nghiên cứu 45 2.8 Phương pháp phân tích số liệu 53 2.9 Đạo đức trong nghiên cứu 53 CHƯƠNG 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 57 3.1 Đặc điểm chung của dân số nghiên cứu 57 3.2 Mô tả các đặc điểm đột biến trên gen pre-S/S 61 iii 3.3 Phân bố đột biến gen pre-S1/pre-S2/S theo các đặc điểm bệnh nhân 68 3.4 Phân bố đột biến gen pre-S1/pre-S2/S theo ung thư biểu mô tế bào gan 76 3.5 Phân tích các yếu tố liên quan đến ung thư biểu mô tế bào gan 82 CHƯƠNG 4: BÀN LUẬN 86 4.1 Đặc điểm dân số xã hội, lâm sàng và cận lâm sàng của đối tượng nghiên cứu 86 4.2 Mô tả các đặc điểm đột biến trên gen pre-S/S 89 4.3 Phân bố đột biến gen pre-S1/pre-S2/S theo các đặc điểm của bệnh nhân 93 4.4 Phân bố đột biến gen pre-S1/pre-S2/S theo ung thư biểu mô tế bào gan 94 4.5 Các yếu tố liên quan đến ung thư biểu mô tế bào gan 102 Hạn chế của đề tài 108 KẾT LUẬN 110 KIẾN NGHỊ 112 DANH MỤC CÔNG TRÌNH ĐÃ CÔNG BỐ CÓ LIÊN QUAN TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC iv DANH MỤC VIẾT TẮT- THUẬT NGỮ ANH-VIỆT Từ viết tắt Tiếng Anh Tiếng Việt Aa Amino acid Axít amin Anti-HBc Hepatitis B core Antibody Kháng thể kháng kháng nguyên lõi của vi rút viêm gan B Anti-HBs Hepatitis B surface Antibody Kháng thể kháng kháng nguyên bề mặt của vi rút viêm gan B APRI Aspartate aminotransferase to Chỉ số tỷ số AST trên tiểu cầu Platelet Ratio index ARFI Acoustic Radiation Force Hình ảnh xung lực bức xạ âm BANC Impulse Imaging Bệnh án nghiên cứu BMI Body Mass Index Chỉ số khối cơ thể CH Chronic hepatitis Viêm gan mạn ER Endoplasmic reticulum Lưới nội bào HBcAg Hepatitis B core Antigen Kháng nguyên lõi của vi rút viêm gan B HBeAg Hepatitis B e Antigen Kháng nguyên e của HBV HBsAg Hepatitis B surface Antigen Kháng nguyên bề mặt của HBV HBV Hepatitis B virus Vi rút viêm gan B HCC Hepatocellular carcinoma Ung thư biểu mô tế bào gan HSBA Hồ sơ bệnh án LHBs Middle HBV surface protein Protein bề mặt lớn của HBV LC Liver cirrhosis Xơ gan MHBs Middle HBV surface protein Protein bề mặt trung bình của HBV MHR Major hydrophilic region Vùng ưa nước chính ORF Open reading frame Khung đọc mở PCR Polymerase Chain Reaction Phản ứng chuỗi polymerase ULN Upper limit normal Giới hạn trên của bình thường v DANH MỤC BẢNG Bảng 1.1: Bảng thống kê đột biến của vi rút viêm gan B liên quan đến HCC…….33 Bảng 2.1: Cặp mồi khuếch đại toàn bộ vùng gen S của HBV………………… 49 Bảng 2.2: Thành phần và chu trình nhiệt phản ứng PCR……………………… 50 Bảng 2.3: Thành phần cho phản ứng cycle sequencing………………………….50 Bảng 2.4: Chương trình PCR cycle sequencing………………………………….51 Bảng 3.1: Đặc điểm dân số xã hội (n=300) 57 Bảng 3.2: Đặc điểm tiền căn về thói quen (n=300) 58 Bảng 3.3: Đặc điểm tiền căn lây nhiễm và tiền căn gia đình (n=300) 58 Bảng 3.4: Đặc điểm lâm sàng (n=300) 59 Bảng 3.5: Đặc điểm liên quan với vi rút viêm gan B (n=300) 59 Bảng 3.6: Các chỉ số xét nghiệm máu (n=300) 60 Bảng 3.7: Đặc điểm phân bố đột biến vùng pre-S1 và pre-S2 61 Bảng 3.8: Đặc điểm phân bố đột biến vùng gen S 64 Bảng 3.9: Phân bố đột biến gen pre-S1/pre-S2/S theo nhóm tuổi 68 Bảng 3.10: Phân bố đột biến gen pre-S1/pre-S2/S theo giới 69 Bảng 3.11: Phân bố đột biến gen pre-S1/pre-S2/S theo tình trạng xơ gan 70 Bảng 3.12: Phân bố đột biến gen pre-S1/pre-S2/S theo tình trạng HBeAg 71 Bảng 3.13: Phân bố đột biến gen pre-S1/pre-S2/S theo kiểu gen của HBV 72 Bảng 3.14: Phân bố đột biến gen pre-S1/pre-S2/S theo tải lượng HBV DNA 74 Bảng 3.15: Phân bố đột biến gen pre-S1/pre-S2/S theo HBsAg định lượng 75 Bảng 3.16: Phân bố đột biến gen pre-S1/pre-S2/S theo tình trạng đồng hiện diện HBsAg và anti-HBs 76 Bảng 3.17: Phân bố đột biến gen pre-S/S và HCC 76 Bảng 3.18: Liên quan giữa đột biến gen vùng pre-S1 và HCC 77 Bảng 3.19: Liên quan giữa đột biến gen tại vùng chức năng pre-S1 và HCC 78 Bảng 3.20: Liên quan giữa đột biến gen vùng pre-S2 và HCC 79 Bảng 3.21: Liên quan giữa đột biến gen vùng S và HCC (n=297) 79 Bảng 3.22: Liên quan giữa đột biến tại vùng chức năng gen S và HCC (n=297) 80 vi Bảng 3.23: Phân tích đa biến các đột biến điểm gen pre-S/S liên quan đến ung thư biểu mô tế bào gan (n=284) 81 Bảng 3.24: Liên quan giữa đặc điểm chung và HCC 82 Bảng 3.25: Liên quan giữa đặc điểm tiền căn và HCC 82 Bảng 3.26: Liên quan giữa đặc điểm lâm sàng và HCC (n=300) 83 Bảng 3.27: Liên quan giữa các xét nghiệm máu và HCC (n=300) 83 Bảng 3.28: Phân tích đa biến các yếu tố liên quan đến HCC (n=284) 84 vii DANH MỤC HÌNH Hình 1.1: Phân bố tỷ lệ nhiễm vi rút viêm gan B trên thế giới 3 Hình 1.2: Cấu trúc một virion của vi rút viêm gan B 6 Hình 1.3: Cấu trúc và tổ chức bộ gen của vi rút viêm gan B 7 Hình 1.4: Cấu trúc gen pre-S/S của vi rút viêm gan B 8 Hình 1.5: Các vùng chức năng pre-S của vi rút viêm gan B 10 Hình 1.6: Cấu trúc các protein vỏ của vi rút viêm gan B 10 Hình 1.7: Chu trình sống của vi rút viêm gan B 12 Hình 1.8: Cơ chế gây ung thư gan do nhiễm vi rút viêm gan B 16 Hình 1.9: Cấu trúc e-pre-S trong biến thể mối nối spPS1 25 viii DANH MỤC SƠ ĐỒ - BIỂU ĐỒ Sơ đồ 3.1: Quy trình xác định đột biến gen trên vi rút viêm gan B…………………….48 Sơ đồ 3.2 Sơ đồ thực hiện nghiên cứu…………………………………………………….……… 55 Sơ đồ 3.3 Sơ đồ phân tích trong nghiên cứu…………………………………………………… 56