(Luận văn thạc sĩ) nghiên cứu xác định tỷ lệ nhiễm và tình trạng kháng kháng sinh của vi khuẩn e coli và salmonella phân lập từ thịt lợn tại huyện luangprabang, tỉnh luangprabang, lào

HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAMC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAMN NÔNG NGHIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAMP VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAMT NAM PHONGSAVATH SAYKOSON NGHIÊN CỨU XÁC ĐỊNH TỶ LỆ NHIỄM VÀ TÌNHU XÁC ĐỊNH TỶ LỆ NHIỄM VÀ TÌNHNH TỶ LỆ NHIỄM VÀ TÌNH LỆN NƠNG NGHIỆP VIỆT NAM NHIỄM VÀ TÌNHM VÀ TÌNH TRẠNG KHÁNG KHÁNG SINH CỦA VI KHUẨN NG KHÁNG KHÁNG SINH CỦA VI KHUẨN A VI KHUẨN N E COLI VÀ SALMONELLA PHÂN LẬPTỪ THỊT LỢN TẠIPTỪ THỊT LỢN TẠI THỊNH TỶ LỆ NHIỄM VÀ TÌNHT LỢN TẠIN TẠNG KHÁNG KHÁNG SINH CỦA VI KHUẨN I HUYỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAMN LUANGPRABANG, TỈNH LUANGPRABANG,NH LUANGPRABANG, LÀO Ngành: Thú y Mã số:: 8640101 Người hướng dẫn khoa học:i hướng dẫn khoa học:ng dẫn khoa học:n khoa học:c: PGS.TS Phạm Hồng Ngânm Hồng Ngânng Ngân NHÀ XUẤT BẢN HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP - 2019 LỜI CAM ĐOAN Tơi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng Các số liệu, kết nêu luận văn trung thực chưa cơng bố cơng trình khác Tơi xin cam đoan thơng tin trích dẫn luận văn rõ nguồn gốc Mọi giúp đỡ cảm ơn Hà Nội, ngày tháng năm 2019 Tác giả luận văn Phongsavath Saykoson i LỜI CẢM ƠN Để hoàn thành tốt luận văn tốt nghiệp ngồi nỗ lực thân tơi nhận quan tâm giúp đỡ nhiều cá nhân tập thể Lời đầu tiên, xin trân trọng cảm ơn thầy giáo, cô giáo Khoa Thú Y – Học Viện Nông Nghiệp Việt Nam đặc biệt thầy giáo, cô giáo môn Thú Y Cộng Đồng – Khoa Thú Y tạo điều kiện giúp đỡ tơi hồn thành luận văn Tơi xin bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc tới PGS.TS Phạm Hồng Ngân cô giáo TS Nguyễn Thị Hương Giang tận tình giúp đỡ tơi suốt thời gian học tập thời gian thực đề tài Tôi xin chân thành cảm ơn gia đình, bạn bè động viên giúp đỡ tơi suốt trình học tập Xin trân trọng cảm ơn! Hà Nội, ngày tháng năm 2019 Tác giả luận văn Phongsavth Saykoson ii MỤC LỤC Lời cam đoan i Lời cảm ơn .ii Mục lục iii Danh mục chữ viết tắt vi Danh mục bảng vii Danh mục hình viii Trích yếu luận văn .ix Thesis abtract xi Phần Mở đầu 1.1 Đặt vấn đề .1 1.2 Mục đích đề tài Phần Tổng quan tài liệu .4 2.1 Tình hình ngộ độc thực phẩm 2.1.1 Ngộ độc thực phẩm bệnh truyền qua thực phẩm 2.1.2 Nguyên nhân gây ngộ độc thực phẩm 2.1.3 Tình hình ngộ độc thực phẩm vi sinh vật gây giới nước CHDCND Lào 2.1.4 Một số nghiên cứu ô nhiễm thực phẩm vi khuẩn E.coli Salmonella gây giới nước CHDCND Lào .12 2.2 Các nguồn ô nhiễm vi khuẩn vào thịt 13 2.2.1 Nhiễm khuẩn từ động vật 13 2.2.2 Lây nhiễm từ khơng khí 13 2.2.3 Lây nhiễm từ nước .14 2.2.4 Lây nhiễm từ đất 14 2.2.5 Nhiễm khuẩn trình giết mổ, chế biến bảo quản thịt 14 2.2.6 Lây nhiễm trình lưu thông phân phối 14 2.3 Một số đặc điểm vi khuẩn E.coli 15 2.3.1 Đặc điểm hình thái, ni cấy, đặc tính sinh hóa sức đề kháng vi khuẩn E.coli 15 2.3.2 Cấu trúc kháng nguyên .16 iii 2.3.3 Đặc tính gây bệnh 18 2.3.4 Ý nghĩa việc xác định tổng số E.coli thịt 19 2.4 Một số đặc điểm vi khuẩn Salmonella 19 2.4.1 Đặc điểm hình thái .20 2.4.2 Đặc tính ni cấy 20 2.4.3 Đặc tính sinh hóa 21 2.4.4 Sức đề kháng vi khuẩn Salmonella .21 2.4.5 Cấu trúc kháng nguyên .22 2.4.6 Yếu tố bám dính 23 2.4.7 Các yếu tố gây bệnh Salmonella 24 2.4.8 Ý nghĩa việc xác định có mặt vi khuẩn Salmonella thịt 26 2.5 Những hiểu biết thuốc kháng sinh 26 2.5.1 Khái niệm .26 2.5.2 Phân loại thuốc kháng sinh 26 2.5.3 Cơ chế tác dụng thuốc kháng sinh 28 2.6 Hiện tượng kháng thuốc vi khuẩn e.coli Salmonella 28 2.6.1 Tính kháng thuốc vi khuẩn 28 2.6.2 Cơ chế gây tượng kháng thuốc vi khuẩn 30 2.6.3 Khả kháng kháng sinh vi khuẩn E coli 31 2.6.4 Khả kháng kháng sinh vi khuẩn Salmonella 32 2.6.5 Phương pháp xác định độ mẫn cảm vi khuẩn gây bệnh số thuốc kháng sinh 34 Phần Vật liệu phương pháp nghiên cứu .36 3.1 Đối tượng, địa điểm nghiên cứu 36 3.2 Thời gian nghiên cứu 36 3.3 Nội dung nghiên cứu 36 3.4 Vật liệu nghiên cứu 36 3.4.1 Vật liệu nghiên cứu 36 3.4.2 Trang thiết bị, dụng cụ 37 3.5 Phương pháp nghiên cứu 37 3.5.1 Phương pháp điều tra 37 3.5.2 Phương pháp thu thập mẫu 37 iv 3.5.3 Phương pháp phân lập vi khuẩn E.coli Salmonella 38 3.5.4 Phương pháp kiểm tra tính mẫn cảm với kháng sinh chủng E.coli Salmonella phân lập 40 3.5.5 Phương pháp xử lý số liệu .42 Phần Kết thảo luận .43 4.1 Kết điều tra tình trạng sử dụng kháng sinh, phương thức giết mổ, vận chuyển bày bán thịt lợn địa bàn huyện Luangprabang,tỉnh Luangprabang, Lào 43 4.1.1 Tình hình sử dụng kháng sinh chăn nuôi lợn địa bàn huyện Luangprabang, tỉnh Luangprabang, Lào .43 4.1.2 Thực trạng giết mổ vận chuyển thịt đến bán số chợ thuộc huyện Luangprabang, tỉnh Luangprabang, Lào 44 4.1.3 Kết điều tra thực trạng vệ sinh an toàn thực phẩm quầy thịt lợn địa bàn huyện 46 4.2 Kết phân lập vi khuẩn E.coli Samonella thịt lợn sở nghiên cứu 48 4.2.1 Kết phân lập vi khuẩn E coli thịt lợn số chợ thuộc huyện Luangprabang, tỉnh Luangprabang, Lào 48 4.2.2 Kết phân lập vi khuẩn Salmonella thịt lợn số chợ thuộc huyện Luangprabang, tỉnh Luangprabang, Lào 49 4.2.3 Phân tích số yếu tố nguy ảnh hưởng đến tỷ lệ nhiễm vi khuẩn E.coli Salmonella thịt lợn .52 4.3 Kết xác định tình trạng kháng kháng sinh vi khuẩn E.coli Salmonella phân lập mẫu thịt lợn sơ nghiên cứu 54 Phần Kết luận kiến nghị 59 5.1 Kết luận 59 5.2 Kiến nghị 59 Phụ lục 65 v DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT Chữ viết tắt Nghĩa tiếng Việt BGA Brilliant green agar BhI Brain Heart Infusion E coli Escherichia coli EHEC Enterohaemorrhagic E Coli EIEC Enteroinvasive E Coli EMB Eosin – Methylene Blue EPEC Enteropathogenic E Coli ETEC Enterotoxigenic E coli FAO Food and Agriculture Organization FDA Food & Drug Administration Gr (-) Gram âm Gr (+) Gram dương IMViC Indole, Methyl Red, Voges Proskauer Citrat lT Heat labile enterotoxin MKTTn Muller Kauffman Tetrathionate MPN Most Probable Number MR Methyl red PBW Pepton Buffer Water RV Rappaport – Vassiliadis Soya Pepton SS Salmonella – Shigella ST Heat stable enterotoxin TcVS Tiêu chuẩn vệ sinh TSI Triple sugar iron VP Voges proskauer WHO World Health Organization XlD Xylolysin deoxychocolat XLT4 Xyloze – Lyzine – Tergitol vi DANH MỤC BẢNG Bảng 3.1 Bảng đánh giá mức độ mẫn cảm với số loại kháng sinh vi khuẩn 41 Bảng 4.1 Tình hình sử dụng loại kháng sinh chăn nuôi lợn địa bàn huyện Luangprabang, tỉnh Luangprabang, Lào Bảng 4.2 43 Kết điều tra phương thức giết mổ vận chuyển thịt lợn chợ địa bàn huyện Luangprabang, tỉnh Luangprabang, Lào 43 Bảng 4.3 Kết điều tra điều kiện an toàn vệ sinh thực phẩm quầy thịt lợn.47 Bảng 4.4 Kết phân lập vi khuẩn E.coli từ mẫu thịt lợn .50 Bảng 4.5 Kết phân lập vi khuẩn Salmonella từ mẫu thịt 49 Bảng 4.6 Kết phân tích số yếu tố nguy dẫn đến thịt bị nhiễm E.coli .52 Bảng 4.7 Kết phân tích số yếu tố nguy dẫn đến thịt bị nhiễm Salmonella .53 Bảng 4.8 Mức độ kháng kháng sinh chủng E.coli phân lập từ số chợ thuộc huyện Luangprabang, Lào 54 Bảng 4.9 Mức độ kháng kháng sinh chủng Salmonella phân lập từ số chợ thuộc huyện Luangprabang, Lào (n=18) 58 vii DANH MỤC HÌNH Hình 4.1 Tỷ lệ phương thức giết mổ lợn cung cấp cho số chợ thuộc huyện Luangprabang, tỉnh Luangprabang, Lào 45 Hình 4.2 Tỷ lệ phương thức vận chuyển thịt lợn đến số chợ thuộc huyện Luangprabang, tỉnh Luangprabang, Lào 46 Hình 4.3 Tỷ lệ mẫu thịt lợn nhiễm vi khuẩn E.coli số chợ địa bàn huyện Luangprabang, tỉnh Luangprabang, Lào 48 Hình 4.4 Tỷ lệ mẫu thịt lợn nhiễm vi khuẩn Salmonella số chợ địa bàn huyện Luangprabang, tỉnh Luangprabang, Lào 50 Hình 4.5 Mức độ kháng kháng sinh chủng vi khuẩn E.coli phân lập 56 Hình 4.6 Mức độ kháng kháng sinh chủng vi khuẩn Salomonella phân lập 58 viii