(Luận văn thạc sĩ) nghiên cứu xác định tỷ lệ nhiễm và định type salmonella trên các đàn gà thịt nuôi ở các trang trại tại khu vực hà nội

HỌC VIỆN NƠNG NGHIỆP VIỆT NAM HỒNG THỊ LIÊN NGHIÊN CỨU XÁC ĐỊNH TỶ LỆ NHIỄM VÀ ĐỊNH TYPE SALMONELLA TRÊN CÁC ĐÀN GÀ THỊT NUÔI Ở CÁC TRANG TRẠI TẠI KHU VỰC HÀ NỘI Chuyên ngành: Thú y Mã số: 60 64 01 01 Người hướng dẫn khoa học: PGS TS Phạm Hồng Ngân NHÀ XUẤT BẢN ĐẠI HỌC NƠNG NGHIỆP - 2016 LỜI CAM ĐOAN Tơi xin cam đoan số liệu kết nghiên cứu luận án hoàn toàn trung thực chưa sử dụng để bảo vệ học vị Các thông tin trích dẫn luận án ghi rõ nguồn gốc Hà Nội, ngày 25 tháng 09 năm 2016 Tác giả luận văn Hoàng Thị Liên i LỜI CẢM ƠN Trong trình học tập, nghiên cứu, thực hồn thành luận văn, tơi ln nhận giúp đỡ, ủng hộ kiến thức, tài liệu, kinh nghiệm nghề nghiệp động viên khuyến khích tinh thần thầy hướng dẫn, vô trân trọng bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc với PGS.TS Phạm Hồng Ngân Tôi xin trân trọng cảm ơn đến thầy giáo, cô giáo trường Học viện Nông Nghiệp Việt Nam, bạn lớp cao học CH23TYC, anh (chị) đồng nghiệp giúp đỡ, khuyến khích động viên Tơi đặc biệt bày tỏ lịng biết ơn đến bố mẹ, chồng, anh chị em bên tôi, dành điều kiện tốt tinh thần vật chất suốt thời gian học tập nghiên cứu luận văn Trong trình thực trình bày luận văn khơng thể tránh khỏi sai sót hạn chế, tơi mong nhận góp ý, nhận xét q thầy, Kính chúc q thầy, sức khỏe! Hà Nội, ngày 25 tháng 09 năm 2016 Tác giả luận văn Hoàng Thị Liên ii MỤC LỤC Lời cam đoan i Lời cảm ơn .ii Mục lục iii Danh mục chữ viết tắt vi Danh mục bảng vii Danh mục sơ đồ, biểu đồ viii Danh mục hình .ix Trích yếu luận văn x Thesis abstract .xii Phần Mở đầu 1.1 Đặt vấn đề .1 1.2 Mục đích nghiên cứu 1.3 Ý nghĩa khoa học thực tiễn đề tài Phần Tổng quan tài liệu .3 2.1 Một số hiểu biết vi khuẩn Salmonella 2.1.1 Lịch sử phát Salmonella .3 2.1.2 Phân loại Salmonella 2.1.3 Đặc điểm hình thái, ni cấy sinh vật hóa học Salmonella 2.1.4 Các kháng nguyên Salmonella 2.1.5 Những yếu tố độc lực vi khuẩn Salmonella .9 2.1.6 Sức đề kháng vi khuẩn Salmonella 17 2.1.7 Tính kháng thuốc vi khuẩn Salmonella 18 2.1.8 Khả trình gây bệnh Salmonella 18 2.1.9 Chẩn đoán .20 2.1.10 Nguồn gốc lây nhiễm 22 2.1.11 Phòng bệnh 23 2.1.12 Điều trị 23 2.2 Ngộ độc thực phẩm Salmonella 24 2.2.1 Ngộ độc thực phẩm .24 2.2.2 Ngộ độc thực phẩm vi khuẩn Salmonella 24 iii 2.2.3 Tình hình ngộ độc thực phẩm Salmonella giới .25 2.2.4 Tình hình ngộ độc thực phẩm Salmonella Việt Nam 27 2.2.5 Các biện pháp kiểm soát Salmonella thực phẩm .28 2.3 Tình hình nghiên cứu vi khuẩn salmonella giới Việt Nam .28 2.3.1 Tình hình nghiên cứu giới 28 2.3.2 Tình hình nghiên cứu Việt Nam 29 Phần Nội dung, nguyên liệu phương pháp nghiên cứu 31 3.1 Nội dung nghiên cứu 31 3.2 Nguyên liệu nghiên cứu .31 3.2.1 Mẫu xét nghiệm 31 3.2.2 Thiết bị dụng cụ .31 3.2.3 Môi trường 31 3.2.4 Thuốc thử 31 3.2.5 Kháng huyết 32 3.2.6 Chủng chuẩn 32 3.3 Phương pháp nghiên cứu 32 3.3.1 Phương pháp điều tra 32 3.3.2 Phương pháp lấy mẫu 32 3.3.3 Phương pháp nuôi cấy giám định vi khuẩn Salmonella spp 34 3.4 Tiến hành xét nghiệm 36 3.4.1 Chuẩn bị mẫu .36 3.4.2 Cách tiến hành 36 3.4.3 Khẳng định sinh hóa 38 3.4.4 Khẳng định huyết & type huyết 41 3.4.5 Đọc kết 41 3.4.6 Giữ giống Salmonella 42 3.5 Kiểm soát kết xét nghiệm 42 3.6 Xác nhận định danh Salmonella 42 3.6.1 Nguyên liệu 42 3.6.2 Phương pháp tiến hành 43 3.7 Phương pháp xử lý số liệu 46 iv Phần Kết nghiên cứu thảo luận 47 4.1 Tình hình chăn ni gà thịt khu vực Hà Nội 47 4.1.1 Khái quát điều kiện tự nhiên, kinh tế- xã hội ảnh hưởng tới chăn nuôi gà thịt khu vực Hà Nội 47 4.1.2 Tình hình phát triển chăn nuôi gà thịt khu vực Hà Nội 49 4.1.3 Tình hình nhiễm Salmonella spp tronng chăn nuôi gà Hà Nội 53 4.2 Tỷ lệ phân lập kết giám định số đặc tính sinh vật, hóa học chủng Salmonella spp mẫu phân gà thịt 55 4.2.1 Tỷ lệ phân lập vi khuẩn Salmonella spp mẫu phân gà thịt .55 4.2.2 Kết giám định số đặc tính sinh vật, hóa học chủng Salmonella spp phân lập từ mẫu phân gà thịt 58 4.3 Kết xác định serotype chủng vi khuẩn Salmonella spp phân lập 62 Phần Kết luận, đề nghị .67 5.1 Kết luận 67 5.2 Đề nghị 67 Tài liệu tham khảo 68 v DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT BHI Brain Heart Infusion FAO Food and Agriculture Organization HE Hektoen enteric LPS Lipopolysaccharide MKTTn Muller Kauffmann Tetrathionate-novobiocin MR Methyl red NA Nutrient agar RVS Rappaport Vassiliadis Soy TSI Triple sugar iron VP Voges proskauer WHO World Health Organization WTO World Trade Organization XLD Xylose lysine deoxycholate vi DANH MỤC BẢNG Bảng 2.1 Một số phản ứng sinh hóa đặc trưng phân biệt Salmonella với Arizona Citrobacter Bảng 2.2 Nhóm huyết Salmonella kháng nguyên O Bảng 3.1 Cấu trúc kháng nguyên kháng huyết đặc hiệu cần ngưng kết để định type số chủng Salmonella gây bệnh quan trọng 36 Bảng 3.2 Giải thích phép thử sinh hóa 40 Bảng 3.3 Giải thích kết phép thử khẳng định 42 Bảng 3.4 Kháng huyết ức chế Kháng nguyên H pha 45 Bảng 4.1 Số lượng trang trại khu vực Hà Nội từ năm 2012-2015 49 Bảng 4.2 Số lượng gia cầm khu vực Hà Nội từ năm 2012-2015 49 Bảng 4.3 Kết phân lập vi khuẩn Salmonella phân gà 56 Bảng 4.4 Đặc tính sinh vật, hố học chủng Salmonella spp phân lập từ mẫu phân gà thịt số môi trường 60 Bảng 4.5 Biểu đặc trưng Salmonella phản ứng sinh hóa .60 Bảng 4.6 Kết thử phản ứng lên men đường chủng Salmonella phân lập 61 Bảng 4.7 Kết xác định nhóm kháng nguyên O chủng vi khuẩn Salmonella spp phân lập (n=22) 63 Bảng 4.8 Kết xác định serotype chủng vi khuẩn Salmonella spp phân lập (n=22) vii 64 DANH MỤC SƠ ĐỒ, BIỂU ĐỒ Sơ đồ 3.1 Sơ đồ phân lập vi khuẩn Salmonella .35 Sơ đồ 3.2 Sơ đồ phân type kháng nguyên O 43 Sơ đồ 3.3 Sơ đồ phân type kháng nguyên H 44 Sơ đồ 4.1 Các kiểu mơ hình trang trại gà thịt Hà Nội 52 Sơ đồ 4.2 Serotype S typhimurium S enteritidis theo chuỗi sản xuất thịt gà .55 Biểu đồ 4.1 Kết phân lập vi khuẩn Salmonella phân gà 56 Biểu đồ 4.2 Kết phân lập vi khuẩn Salmonella phân gà 57 Biểu đồ 4.3 Kết xác định nhóm huyết Salmonella spp 63 Biểu đồ 4.4 Kết định chủng Salmonella từ mẫu phân gà thịt khu vực Hà Nội.64 viii