Nghiên cứu áp dụng quy trình xác định phức hợp kháng nguyên bạch cầu người hla độ phân giải cao bằng phương pháp giải trình tự gen

Nghiên cứu áp dụng quy trình xác định phức hợp kháng nguyên bạch cầu người hla độ phân giải cao bằng phương pháp giải trình tự gen Nghiên cứu áp dụng quy trình xác định phức hợp kháng nguyên bạch cầu người hla độ phân giải cao bằng phương pháp giải trình tự gen Nghiên cứu áp dụng quy trình xác định phức hợp kháng nguyên bạch cầu người hla độ phân giải cao bằng phương pháp giải trình tự gen

ỦY BAN NHÂN DÂN BỘ Y TẾ THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH SỞ KHOA HỌC VÀ CƠNG NGHỆ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH CHƯƠNG TRÌNH KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ CẤP THÀNH PHỐ BÁO CÁO TỔNG HỢP KẾT QUẢ NHIỆM VỤ NGHIÊN CỨU KHOA HỌC VÀ CƠNG NGHỆ NGHIÊN CỨU ÁP DỤNG QUY TRÌNH XÁC ĐỊNH PHỨC HỢP KHÁNG NGUYÊN BẠCH CẦU NGƯỜI (HLA) ĐỘ PHÂN GIẢI CAO BẰNG PHƯƠNG PHÁP GIẢI TRÌNH TỰ GEN Cơ quan chủ trì nhiệm vụ: ĐẠI HỌC Y DƯỢC TP.HCM Chủ nhiệm nhiệm vụ: TS BS ĐỖ ĐỨC MINH TP Hồ Chí Minh - 2019 ỦY BAN NHÂN DÂN THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH SỞ KHOA HỌC VÀ CƠNG NGHỆ BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH CHƯƠNG TRÌNH KHOA HỌC VÀ CƠNG NGHỆ CẤP THÀNH PHỐ BÁO CÁO TỔNG HỢP KẾT QUẢ NHIỆM VỤ NGHIÊN CỨU KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ NGHIÊN CỨU ÁP DỤNG QUY TRÌNH XÁC ĐỊNH PHỨC HỢP KHÁNG NGUYÊN BẠCH CẦU NGƯỜI (HLA) ĐỘ PHÂN GIẢI CAO BẰNG PHƯƠNG PHÁP GIẢI TRÌNH TỰ GEN Chủ nhiệm nhiệm vụ: Đỗ Đức Minh Cơ quan chủ trì nhiệm vụ BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỒ HỒ CHÍ MINH CỘNG HOÀ XÃ HỘI CHỦ NGHĨA VIỆT NAM Độc lập - Tự - Hạnh phúc ., ngày tháng năm 20 BÁO CÁO THỐNG KÊ KẾT QUẢ THỰC HIỆN NHIỆM VỤ NGHIÊN CỨU KH&CN I THÔNG TIN CHUNG Tên nhiệm vụ: NGHIÊN CỨU ÁP DỤNG QUY TRÌNH XÁC ĐỊNH PHỨC HỢP KHÁNG NGUYÊN BẠCH CẦU NGƯỜI (HLA) ĐỘ PHÂN GIẢI CAO BẰNG PHƯƠNG PHÁP GIẢI TRÌNH TỰ GEN Thuộc: Chương trình/lĩnh vực (tên chương trình/lĩnh vực): Y TẾ Chủ nhiệm nhiệm vụ: Họ tên: ĐỖ ĐỨC MINH Ngày, tháng, năm sinh: 14/02/1984 Nam/ Nữ: Nam Học hàm, học vị: Tiến sĩ Chức danh khoa học: Nghiên cứu viên Chức vụ: Phó Giám đốc Trung tâm y sinh học phân tử Điện thoại: Tổ chức: 028 38558411 Nhà riêng: Mobile: 0932 999989 Fax: E-mail: ducminh@ump.edu.vn Tên tổ chức công tác: Đại học Y Dược Thành phố Hồ Chí Minh Địa tổ chức: 217 Hồng Bàng, quận 5, TPHCM Địa nhà riêng: 178 Huỳnh Văn Bánh, quận Phú Nhuận, TPHCM Tổ chức chủ trì nhiệm vụ: Tên tổ chức chủ trì nhiệm vụ: Đại học Y Dược Thành phố Hồ Chí Minh Điện thoại: 028 38558411 Fax: E-mail: yds@ump.edu.vn Website: yds.edu.vn i Địa chỉ: 217 Hồng Bàng, quận 5, TPHCM Họ tên thủ trưởng tổ chức: PGS TS Trần Diệp Tuấn Số tài khoản: 3713.0.1057277.00000 Kho bạc: Kho bạc nhà nước Quận 5, Tp.HCM Tên quan chủ quản đề tài: Sở Khoa học Cơng nghệ TPHCM II TÌNH HÌNH THỰC HIỆN Thời gian thực nhiệm vụ: - Theo Hợp đồng ký kết: từ tháng 7/2017 đến 7/2019 - Thực tế thực hiện: từ tháng 7/2017 đến 7/2019 - Được gia hạn (nếu có): khơng Kinh phí sử dụng kinh phí: a) Tổng số kinh phí thực hiện: 1.810 tr.đ, đó: + Kính phí hỗ trợ từ ngân sách khoa học: 1.810.tr.đ + Kinh phí từ nguồn khác: tr.đ b) Tình hình cấp sử dụng kinh phí từ nguồn ngân sách khoa học: Theo kế hoạch Thời gian Kinh phí (Tháng, năm) (Tr.đ) 08/2017 900 Thực tế đạt Thời gian Kinh phí (Tháng, năm) (Tr.đ) 08/2017 900 07/2018 724 08/2018 07/2019 186 Số TT Ghi (Số đề nghị toán) 724 c) Kết sử dụng kinh phí theo khoản chi: Đối với đề tài: Đơn vị tính: Triệu đồng Số TT Nội dung khoản chi Trả công lao Theo kế hoạch Tổng NSKH 359,50 359,503 ii Nguồn khác Thực tế đạt Tổng NSKH 359,503 359,503 Nguồn khác động (khoa học, phổ thơng) Ngun, vật liệu, lượng Thiết bị, máy móc ác có điện ữa nhỏ Chi khác Tổng cộng 1.254, 957 1.254,95 1.254,9 57 195,54 1.810 195,540 195,540 195,540 1.810 1.810 1.254,9 57 1.810 - Lý thay đổi (nếu có): Đối với dự án: Đơn vị tính: Triệu đồng Số TT Nội dung khoản chi Theo kế hoạch Tổng NSKH Thiết bị, máy móc mua Nhà xưởng xây dựng mới, cải tạo Kinh phí hỗ trợ cơng nghệ Chi phí lao động Ngun vật liệu, lượng Thuê thiết bị, nhà xưởng Khác Tổng cộng - Lý thay đổi (nếu có): iii Nguồn khác Thực tế đạt Tổng NSKH Nguồn khác Các văn hành q trình thực đề tài/dự án: (Liệt kê định, văn quan quản lý từ công đoạn xét duyệt, phê duyệt kinh phí, hợp đồng, điều chỉnh (thời gian, nội dung, kinh phí thực có); văn tổ chức chủ trì nhiệm vụ (đơn, kiến nghị điều chỉnh có) Số TT Số, thời gian ban hành văn Tên văn 658/QĐ-SKHCN, 27/07/2017 Quyết định việc phê duyệt nhiệm vụ nghiên cứu khoa học công nghệ 101/2017/HĐSKHCN, 27/07/2017 Hợp đồng thực nhiệm vụ khoa học công nghệ 1041/TTr-ĐHYD, 20/09/2017 Tờ trình phê duyệt kế hoạch lựa chọn nhà thầu gói thầu phục vụ nhiệm vụ khoa học công nghệ 982/QĐ-SKHCN, 17/10/2017 Quyết định việc phê duyệt kế hoạch lựa chọn nhà thầu gói thầu phục vụ nhiệm vụ khoa học công nghệ 1557/TTr-ĐHYD, 05/12/2017 Tờ trình việc đề nghị phê duyệt kết lựa chọn nhà thầu gói thầu “ Bộ Kit HLA Trusight kèm phần mềm” 1225/QĐ-SKHCN, Quyết định việc phê duyệt 12/12/217 kết lựa chọn nhà thầu gói thầu “ Bộ Kit HLA Trusight kèm phần mềm” 1093/TTr-ĐHYD, 14/09/2018 Tờ trình việc thay đổi thành viên tham gia thực nhiệm iv Ghi vụ khoa học công nghệ 2261/SKHCNQLKH, 10/10/2018 Quyết định việc đồng ý thay đổi thành viên tham gia thực nhiệm vụ khoa học công nghệ 1328/QĐ-ĐHYD, 13/05/2019 Quyết định việc thành lập Hội đồng khoa học nghiệm thu sở đề tài KHCN cấp Thành phố Tổ chức phối hợp thực nhiệm vụ: Số TT Tên tổ chức đăng ký theo Thuyết minh Tên tổ chức tham gia thực Nội dung tham gia chủ yếu Sản phẩm chủ yếu đạt Ghi chú* - Lý thay đổi (nếu có): Cá nhân tham gia thực nhiệm vụ: (Người tham gia thực đề tài thuộc tổ chức chủ trì quan phối hợp, khơng 10 người kể chủ nhiệm) Số TT Tên cá nhân đăng ký theo Thuyết minh TS BS ĐỖ ĐỨC MINH Tên cá nhân tham gia thực TS BS ĐỖ ĐỨC MINH Nội dung tham gia Điều hành chung Nghiên cứu áp dụng quy trình định típ HLA phương pháp giải trình tự hệ giải trình tự Sanger Sản phẩm chủ yếu đạt Quy trình định típ HLA giải trình tự hệ Quy trình định típ HLA giải trình tự Sanger Số liệu giải v Ghi chú* Phân tích kết So sánh quy trình định típ HLA phương pháp giải trình tự Sanger hệ TS BS MAI PHƯƠNG THẢO TS BS MAI PHƯƠNG THẢO Xây dựng quy trình định típ HLA phương pháp giải trình tự hệ Phân tích kết So sánh quy trình định típ HLA phương pháp giải trình tự Sanger hệ TS BS HOÀNG ANH VŨ TS BS HỒNG ANH VŨ Xây dựng quy trình định típ HLA phương pháp giải trình tự Sanger Phân tích kết TS BS TS BS Xây dựng quy vi trình tự hai phương pháp báo chun đề Quy trình định típ HLA giải trình tự Sanger Số liệu giải trình tự phương pháp Sanger báo chuyên đề Quy trình định típ HLA giải trình tự Sanger Số liệu giải trình tự phương pháp Sanger Quy trình HUỲNH THANH TUẤN HUỲNH THANH TUẤN trình định típ HLA phương pháp giải trình tự Sanger định típ HLA giải trình tự Sanger TS NGUYỄN HỒI NGHĨA TS NGUYỄN HOÀI NGHĨA Thu thập mẫu Mẫu DNA Tách chiết DNA CN NGUYỄN THẾ VINH CN NGUYỄN THẾ VINH Quy trình định típ HLA giải Tiến hành định trình tự típ HLA hệ giải trình tự Số liệu giải hệ trình tự phương pháp giải trình tự hệ Thu thập mẫu Mẫu DNA Tách chiết DNA CN LƯƠNG BẮC AN THS LÊ GIA HỒNG LINH Quy trình định típ HLA giải Tiến hành định trình tự típ HLA Sanger giải trình tự Số liệu giải Sanger trình tự phương pháp Sanger Thu thập mẫu Mẫu DNA Tách chiết DNA Quy trình định típ HLA giải Tiến hành định trình tự típ HLA hệ giải trình tự Số liệu giải trình tự hệ phương pháp vii KTV NGUYỄN HUỲNH MINH QUÂN KTV NGUYỄN HUỲNH MINH QUÂN Thu thập mẫu giải trình tự hệ Mẫu DNA Tách chiết DNA Quy trình định típ HLA giải Tiến hành định trình tự típ HLA Sanger giải trình tự Số liệu giải Sanger trình tự phương pháp Sanger - Lý thay đổi ( có): Do CN Lương Bắc An không thu xếp thời gian tham gia nhiệm vụ nên ThS Lê Gia Hoàng Linh đảm nhiệm thay phần công việc nhiệm vụ khoa học công nghệ đăng ký Tình hình hợp tác quốc tế: Số TT Theo kế hoạch (Nội dung, thời gian, kinh phí, địa điểm, tên tổ chức hợp tác, số đoàn, số lượng người tham gia ) Thực tế đạt (Nội dung, thời gian, kinh phí, địa điểm, tên tổ chức hợp tác, số đoàn, số lượng người tham gia ) Ghi chú* - Lý thay đổi (nếu có): Tình hình tổ chức hội thảo, hội nghị: Theo kế hoạch Số (Nội dung, thời gian, kinh phí, TT địa điểm ) Thực tế đạt (Nội dung, thời gian, kinh phí, địa điểm ) Ghi chú* - Lý thay đổi (nếu có): Tóm tắt nội dung, công việc chủ yếu: (Nêu mục 15 thuyết minh, không bao gồm: Hội thảo khoa học, điều tra khảo sát nước nước ngoài) viii  Bổ sung 400 µl Column Wash Solution (CWC) vào cột lọc  Ly tâm tốc độ tối đa tong 30 giây  Chuyển cột lọc vào ống tube 1.5ml mới, bổ sung 30µl Elution buffer nước cất lần, ủ phút  Ly tâm tốc độ tối đa 30 giây  Thu dịch chứa plasmid, trữ -200C Plasmid thu đưa vào phản ứng PCR với đoạn mồi nhiệt độ bắt cặp phản ứng PCR trước cloning D Lưu ý quan trọng:  Chỉ sử dụng T4 DNA ligase kèm theo kit  Buffer 2X ligation có chứa ATP, tránh rã đơng nhiều lần, nên chia nhỏ thành ống đơn cho lần sử dụng  Nên để hỗn hợp lai qua đêm 40C để tăng tối đa lượng sản phẩm PCR gắn vào plasmid  Sản phẩm PCR dùng để lai không nên để 1h kể từ lúc kết thúc phản ứng PCR nên kiểm tra với gel agarose trước tiến hành lai để đảm bảo có sản phẩm PCR sau phản ứng 22 23 24 25 SẢN PHẨM ĐÀO TẠO SẢN PHẨM BÀI BÁO 10 11