Căn nguyên nhiễm khuẩn huyết ở người bệnh điều trị nội trú và mức độ nhạy cảm kháng sinh của một số vi khuẩn gây bệnh tại bệnh viện vinmec times city năm 2019 2021

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO - BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y TẾ CƠNG CỘNG ĐỒN THỊ THÍA H P CĂN NGUYÊN GÂY NHIỄM KHUẨN HUYẾT Ở NGƯỜI BỆNH ĐIỀU TRỊ NỘI TRÚ VÀ MỨC ĐỘ NHẠY CẢM KHÁNG SINH U CỦA MỘT SỐ VI KHUẨN GÂY BỆNH TẠI BỆNH VIỆN VINMEC TIMES CITY NĂM 2019 - 2021 H LUẬN VĂN THẠC SĨ KỸ THUẬT XÉT NGHIỆM Y HỌC MÃ SỐ CHUYÊN NGÀNH: 8720601 HÀ NỘI - 2022 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO - BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y TẾ CƠNG CỘNG ĐỒN THỊ THÍA H P CĂN NGUYÊN NHIỄM KHUẨN HUYẾT Ở NGƯỜI BỆNH ĐIỀU TRỊ NỘI TRÚ VÀ MỨC ĐỘ NHẠY CẢM KHÁNG SINH CỦA MỘT SỐ VI KHUẨN GÂY BỆNH TẠI BỆNH VIỆN VINMEC TIMES CITY NĂM 2019-2021 U LUẬN VĂN THẠC SĨ KỸ THUẬT XÉT NGHIỆM Y HỌC H MÃ SỐ CHUYÊN NGÀNH: 8720601 NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC PGS.TS ĐOÀN MAI PHƯƠNG HÀ NỘI - 2022 i MỤC LỤC ĐẶT VẤN ĐỀ 11 MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU 13 CHƯƠNG 14 TỔNG QUAN 14 1.1 Giới thiệu nhiễm khuẩn huyết 14 H P 1.1.1 Khái niệm nhiễm khuẩn huyết sốc nhiễm khuẩn 14 1.1.2 Các yếu tố nguy 14 1.1.3 Nguyên nhân 14 1.1.4 Cơ chế bệnh sinh .14 1.1.5 Lâm sàng cận lâm sàng 15 1.1.6 Nguyên tắc điều trị 16 U 1.1.7 Tình hình nhiễm khuẩn huyết 16 1.2 Xét nghiệm phát nhiễm khuẩn huyết kháng sinh đồ 18 H 1.2.1 Xét nghiệm phát nhiễm khuẩn huyết .18 1.2.2 Kháng sinh đồ 18 1.3 Tổng quan nguyên nhiễm khuẩn huyết 19 1.3.1 Đặc điểm số vi khuẩn gây nhiễm khuẩn huyết thường gặp .19 1.3.2 Tình hình nguyên nhiễm khuẩn huyết 24 1.4 Sự nhạy cảm kháng sinh 25 1.4.1 Vi khuẩn kháng kháng sinh 25 1.4.2 Tình hình nhạy cảm kháng sinh 30 1.5 Bệnh viện Đa khoa quốc tế Vinmec Times City 32 1.5.1 Giới thiệu bệnh viện 32 1.5.2 Xét nghiệm nuôi cấy định danh bệnh phẩm máu kháng sinh đồ 32 CHƯƠNG 39 ii ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 39 2.1 Đối tượng nghiên cứu 39 2.2 Thời gian thu thập số liệu địa điểm nghiên cứu 39 2.3 Thiết kế nghiên cứu 39 40 2.4 Cỡ mẫu 40 2.5 Phương pháp chọn mẫu 40 2.6 Phương pháp thu thập số liệu 40 2.7 Các biến số nghiên cứu 41 2.8 Bộ công cụ, tiêu chuẩn đánh giá 41 H P 2.9 Phương pháp phân tích số liệu 41 2.10 Đạo đức nghiên cứu 42 CHƯƠNG 43 KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU .43 U 3.1 Đặc điểm chung người bệnh nhiễm khuẩn huyết 43 3.2 Mô tả nguyên vi khuẩn gây nhiễm khuẩn huyết người bệnh điều trị nội trú Bệnh viện đa khoa quốc tế Vinmec Times City giai đoạn 2019-2021 46 3.2 H Mức độ nhạy cảm kháng sinh số chủng vi khuẩn thường gặp gây nhiễm khuẩn huyết 50 CHƯƠNG 56 BÀN LUẬN 56 4.1 Đặc điểm chung người bệnh nhiễm khuẩn huyết 56 4.2 Mô tả nguyên nhiễm khuẩn huyết người bệnh điều trị nội trú bệnh viện đa khoa quốc tế Vinmec Times City giai đoạn 2019-2021 60 4.2 Mức độ nhạy cảm chủng vi khuẩn gây nhiễm khuẩn huyết thường gặp 63 4.2.1 Sự nhạy cảm đề kháng E coli .63 4.2.2 Sự nhạy cảm đề kháng K pneumoniae 65 iii 4.2.3 Sự nhạy cảm đề kháng S aureus 67 4.2.4 Các chủng đa kháng phân lập ICU khoa khác 68 4.3 Hạn chế nghiên cứu 70 KẾT LUẬN 71 KHUYẾN NGHỊ 73 TÀI LIỆU THAM KHẢO 74 PHỤ LỤC 81 PHỤ LỤC 89 H P PHỤ LỤC 105 PHỤ LỤC 117 PHỤ LỤC 119 H U iv DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT A baumanii Acinetobacter baumanii AMR Antimicrobial Resistance (Kháng thuốc) CAP College of American Pathologists (Tiêu chuẩn đánh giá chất lượng phòng xét nghiệm Mỹ) CLSI Clinical and laboratory standards institute (Viện chẩn hóa xét nghiệm lâm sàng Hoa Kỳ) DNA Deoxyribonucleic acid E coli Escherichia coli E faecium Enterococcus faecium ESBL Beta-lactamase phổ mở rộng (Extended-spectrum β- H P lactamases) FDA U.S Food and Drug Administration U (Cục quản lý Thực phẩm Dược phẩm Hoa Kỳ) I Intermediate (Kháng sinh trung gian) ICU Intensive Care Unit H (Khoa điều trị tích cực) K pneumoniae MBC Klebsiella pneumoniae Minimal Bactericidal Concentration (Nồng độ kháng sinh tối thiểu giết chết vi khuẩn) MDR MIC Multidrug resistant (Vi khuẩn đa kháng) Minimal Inhibitory Concentration (Nồng độ kháng sinh tối thiểu ức chế phát triển vi khuẩn) MRSA Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus (Tụ cầu vàng kháng methicillin) v MSSA Methicillin-susceptible Staphylococcus aureus (Tụ cầu vàng nhạy cảm methicillin) NKH Nhiễm khuẩn huyết P aeruginosa Pseudomonas aeruginosa (Trực khuẩn mủ xanh) PCR Polymerase Chain Reaction R Resistance (Kháng sinh bị đề kháng) S Sensitivity (Kháng sinh nhạy cảm) S aureus Staphylococcus aureus (Tụ cầu vàng) S pneumoniae Streptococcus pneumoniae (Phế cầu) WHO World Health Organization (Tổ chức Y tế giới) H P H U vi DANH MỤC CÁC BẢNG, SƠ ĐỒ BẢNG Bảng 1 Danh sách 14 vi khuẩn đa kháng thuốc ưu tiên (WHO) (44) 28 Bảng Danh mục kháng sinh thử nghiệm với E coli 35 Bảng Danh mục kháng sinh thử nghiệm với K pneumoniae 36 Bảng Danh mục kháng sinh thử nghiệm với S aureus .37 Bảng Phân bố người bệnh nhiễm khuẩn huyết theo tuổi 43 Bảng Biểu lâm sàng thường gặp bệnh nhân nhiễm khuẩn huyết 44 H P Bảng 3 Các bệnh lý bệnh nhân nhiễm khuẩn huyết 45 Bảng Thời gian lưu viện bệnh nhân nhiễm khuẩn huyết 45 Bảng Các nguyên vi khuẩn gây nhiễm khuẩn huyết 46 Bảng Phân bố số vi khuẩn thường gặp theo khoa phòng 47 Bảng Phân bố vi khuẩn thường gặp theo ổ nhiễm khuẩn tiên phát .48 Bảng Các vi khuẩn gây bệnh sốc nhiễm khuẩn 49 U SƠ ĐỒ H Sơ đồ 1 Quy trình ni cấy định danh hệ thống tự động bệnh phẩm máu 33 Sơ đồ Sơ đồ nghiên cứu 40 vii DANH MỤC CÁC BIỂU ĐỒ Biểu đồ Phân bố người bệnh nhiễm khuẩn huyết theo giới 44 Biểu đồ Mức độ nhạy cảm đề kháng kháng sinh E coli năm (2019-2021) .50 Biểu đồ 3 Xu hướng E coli kháng kháng sinh từ 2019 - 2021 51 Biểu đồ Mức độ nhạy cảm đề kháng kháng sinh K pneumoniae năm (2019-2021) .52 Biểu đồ Xu hướng K pneumoniae kháng kháng sinh từ 2019 – 2021 .52 Biểu đồ Mức độ nhạy cảm kháng kháng sinh S aureus năm (20192021) 53 H P Biểu đồ Xu hướng S aureus đề kháng kháng sinh từ 2019 – 2021 54 Biểu đồ Chủng đa kháng khoa ICU vòng năm (2019-2021) 55 Biểu đồ Chủng đa kháng khoa ICU năm (2019-2021) 55 H U viii DANH MỤC CÁC HÌNH ẢNH Hình 1 Khuẩn lạc E coli thạch UTI thạch máu .19 Hình Khuẩn lạc K pneumoniae thạc máu UTI .20 Hình Khuẩn lạc S aureus thạc máu 22 Hình Các chế vi khuẩn kháng thuốc kháng sinh (42) 27 H P H U 121 Sự đề kháng Là kết đề kháng Biến phân loại Thu kháng sinh kháng sinh chủng phiếu thu K K pneumoniae phân lập pneumoniae theo năm: tỷ lệ nhạy, kháng, trung gian thông thập thập tin bệnh nhân với loại kháng sinh khác Sự đề kháng Là kết đề kháng Biến phân loại Thu kháng sinh kháng sinh chủng S phiếu thu aureus S aureus phân lập theo thập thập năm: tỷ lệ nhạy, kháng, thông trung gian với loại bệnh nhân H P tin kháng sinh khác Chủng E Là số chủng E Biến định tính Thu thập coli K coli, K pneumoniae phân phiếu pneumoniae lập có thu U sinh ESBL chủng sinh ESBL và chủng MRSA số chủng S aureus phân lập có bao H nhiêu chủng MRSA thông thập tin bệnh nhân 122 BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y TẾ CÔNG CỘNG Biểu mẫu BIÊN BẢN GIẢI TRÌNH CHỈNH SỬA CÁC GĨP Ý ĐỀ CƯƠNG/LUẬN VĂN/LUẬN ÁN/CHUYÊN ĐỀ LUẬN ÁN Họ tên học viên: Đoàn Thị Thía Tên đề tài: Căn nguyên nhiễm khuẩn huyết người bệnh điều trị nội trú mức độ nhạy cảm kháng sinh số vi khuẩn gây bệnh bệnh viện Vinmec Times City năm 20192021 Nội dung góp ý Phần giải trình học viên (Liệt kê nội dung góp ý theo thứ tự phần đề cương/luận văn/luận án/chuyên đề) (Nêu rõ chỉnh sửa nào, phần nào, trang Nếu khơng chỉnh sửa,giải thích lý khơng chỉnh sửa) TT …… H P Định hướng chuyên ngành luận văn/luận án Không cần chỉnh sửa Tên đề tài luận văn/luận án/chuyên đề U -PB2: Xem xét bỏ phần “ở người bệnh điều trị nội trú” nội dung nêu cụ thể mục tiêu nghiên cứu H Kết luận sau HĐ không cần chỉnh sửa -PB1: Sắp xếp lại câu từ theo góp ý cho phù hợp Tóm tắt -Bỏ tên luận văn -Điều chỉnh nội dung kiến nghị logic với kết nghiên cứu Đặt vấn đề -Bỏ phần mục tiêu cuối, viết lại câu mục đích chung -Học viên sửa lại theo ý kiến góp ý trang 10 Tổng quan -Học viên chỉnh sửa theo góp ý trang 12 123 -Cấu trúc lại phần tổng quan rõ ràng hơn, logic với mục tiêu NC -Học viên cấu trúc lại phần tổng quan theo góp ý gồm phần: 1.1.Giới thiệu nhiễm khuẩn huyết 1.2.Xét nghiệm phát NKH kháng sinh đồ 1.3.Tổng quan nguyên nhiễm khuẩn huyết 1.4.Tình hình nhạy cảm kháng sinh -Cần có phần kỹ thuật xét nghiệm xác định NKH -Bổ sung nguồn trích dẫn ảnh/ hình, bảng kèm thích Chú ý độ phóng đại ảnh -Hình 1.4 cần có trích nguồn TLTK H P -Học viên lấy nguồn ảnh tự chụp hình 1.1,1.2,1.3 - Hình 1.4, bảng 1.1 học viên thêm nguồn trích dẫn H -Học viên bổ sung thêm theo góp ý vào mục tiêu Khung lý thuyết/cây vấn đề -Sơ đồ nghiên cứu cần có số liệu cụ thể, vẽ cho mạch lạc mũi tên -Học viên trình bày mục 1.2 trang 18 U Mục tiêu -Mục tiêu bổ sung động từ mô tả 1.5.Địa bàn nghiên cứu - Học viên chỉnh sửa theo góp ý trang 40 mục 2.3 Đối tượng phương pháp nghiên cứu -Thời gian NC sửa lại cho logic với thời gian phê duyệt HDDD - Cỡ mẫu thuận tiện tồn theo tiêu chí lựa chọn -Biến số gồm nhóm biến: thơng tin người bệnh, nguyên gây NKH, nhạy cảm kháng sinh -Học viên sửa lại theo góp ý mục 2.2 trang 39 -Học viên sửa lại phương pháp chọn mẫu theo góp ý mục 2.5 trang 40 - Học viên sửa biến số nghiên cứu theo góp ý mục 2.7 trang 41 124 -Bộ cơng cụ, tiêu chuẩn đánh giá: Thiếu, cần bổ sung nội dung Cần làm rõ sở khoa học cơng cụ chuẩn hố chưa - Phương pháp phân tích số liệu: Bỏ bớt phần khơng cần thiết, test phân tích -Học viên bổ sung mục 2.8 trang 41 theo góp ý -Học viên chỉnh sửa mục 2.9 – Phân tích số liệu, bỏ câu đầu không cần thiết, bổ sung test phân tích trang 41 Kết nghiên cứu -Tách riêng phần mô tả thông tin chung NB với phần mô tả nguyên -Bảng số số liệu cần mô tả đoạn văn -Bảng 3.1 sửa lại số thập phân dấu phẩy, kiểm tra tuổi thấp -Học viên tách riêng phần mô tả thông tin chung NB với phần mô tả H P -Bảng 3.9,3.10 số liệu học viên bỏ mô tả số liệu câu - Học viên sửa lại bảng 3.1 theo nhận xét, bỏ tuổi lớn nhất, nhỏ U -Các bảng sửa dấu phẩy theo Tiếng Việt -Bảng 3.3 nên chia nhóm có bệnh nhóm khơng có bệnh H -Xem lại kết bảng 3.2, 3.5 cho xác Sắp xếp lại bảng 3.10 -Bảng 3.8 in màu không rõ 10 -Học viên sửa lại số liệu bảng chứa dấu phẩy theo TV -Bảng 3.3 học viên chia làm nhóm theo góp ý Và cập nhật lại số liệu Do việc xuất liệu từ bệnh án điện tử bệnh nhân bị thiếu, học viên kiểm tra lại ghi nhận lại kết -Học viên sửa lại kết làm tròn phần trăm bảng kết - Biểu đồ 3.8,3.9 lỗi thiếu sót khơng in màu, học viên kiểm tra lại cẩn thận trước nộp lại lần tới Bàn luận -Có bàn luận hạn chế nghiên cứu -Bàn luận thẳng vào mục tiêu nghiên cứu Chỉ bàn luận thơng tin chung có -Học viên bổ sung bàn luận hạn chế nghiên cứu trang 70 -Học viên chia mục riêng giảm bớt phần bàn luận thông tin chung đối tượng NC 125 liên quan đến nguyên NKH tỉ lệ kháng kháng sinh -Học viên tiến hành rà sốt lỗi tả, hành văn, tên vi khuẩn phần -Rà soát lại văn 11 Kết luận … 12 Không cần chỉnh sửa Khuyến nghị Khuyến nghị cần bổ sung cho sát với kết 13 Tài liệu tham khảo Kiểm tra lại cho quy định nhà trường 13 Học viên đưa khuyến nghị sát kết nghiên cứu H P Học viên tiến hành rà soát, sửa lại phần tài liệu tham khảo với quy định nhà trường Công cụ nghiên cứu … 14 U Các góp ý khác Lưu ý: - Có dịng kẻ góp ý phần giải trình thẳng hàng với góp ý - Học viên/NCS giải trình theo thứ tự phần (nếu có) đề cương/luận văn/luận án/chun đề, khơng nêu tên chức danh người góp ý - Đối với giải trình Hội đồng bảo vệ luận án cấp sở cần có thêm xác nhận phản biện chủ tịch hội đồng - Đối với giải trình Hội đồng luận án cấp trường, cần có thêm xác nhận chủ tịch hội đồng Ngày 22 tháng 11 năm 2022 Học viên H (ký ghi rõ họ tên) Đồn Thị Thía 126 Xác nhận GV hướng dẫn Xác nhận GV hướng dẫn (nếu có) Xác nhận GV hỗ trợ (nếu có) (ký ghi rõ họ tên) (ký ghi rõ họ tên) (ký ghi rõ họ tên) PGS.TS Đoàn Mai ThS Nguyễn Thị Thanh Nhiệm Phương Ý kiến thành viên HĐ/chủ tịch HĐ (Nếu phân công): ………………………………………………………………………………………… …… ………………………………………………………………………………………… …… H P Ngày 06 tháng 12 năm 2022 Đại diện hội đồng (ký ghi rõ họ tên) H U 127 H P H U 128 H P H U 129 H P H U 130 H P H U 131 H P H U 132 H P H U 133 H P H U 134 H P H U 135 H P H U