Đặc điểm dịch tễ, diễn tiến lâm sàng và cận lâm sàng ở người nhiễm sars cov 2 tại thành phố hồ chí minh năm 2020

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƢỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH -oOo - VÕ THANH LÂM ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ, DIỄN TIẾN LÂM SÀNG VÀ CẬN LÂM SÀNG Ở NGƢỜI NHIỄM SARS-CoV-2 TẠI THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH NĂM 2020 LUẬN VĂN TỐT NGHIỆP BÁC SĨ NỘI TRÚ TP HỒ CHÍ MINH – NĂM 2021 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƢỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH -oOo - VÕ THANH LÂM ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ, DIỄN TIẾN LÂM SÀNG VÀ CẬN LÂM SÀNG Ở NGƢỜI NHIỄM SARS-CoV-2 TẠI THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH NĂM 2020 CHUYÊN NGÀNH: TRUYỀN NHIỄM MÃ SỐ: NT 62 72 38 01 LUẬN VĂN TỐT NGHIỆP BÁC SĨ NỘI TRÚ NGƢỜI HƢỚNG DẪN KHOA HỌC: TS NGUYỄN VĂN VĨNH CHÂU TP HỒ CHÍ MINH – NĂM 2021 i LỜI CAM ĐOAN Tôi tên Võ Thanh Lâm, học viên bác sĩ nội trú chuyên ngành Truyền Nhiễm khóa 2018 – 2021 Tơi xin cam đoan nội dung luận văn hoàn toàn ý tƣởng từ thông tin thực tế thu thập đƣợc lâm sàng theo mẫu định sẵn, không chép hay đạo văn khác Ngƣời viết báo cáo Võ Thanh Lâm MỤC LỤC LỜI CAM ĐOAN i DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT ii DANH MỤC ĐỐI CHIẾU ANH VIỆT iii DANH MỤC BẢNG iv DANH MỤC HÌNH v DANH MỤC BIỂU ĐỒ v MỞ ĐẦU .1 CHƢƠNG 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU .5 1.1 DỊCH TỄ 1.2 VI SINH .8 1.3 SINH LÝ BỆNH COVID-19 .15 1.4 LÂM SÀNG .20 1.5 CẬN LÂM SÀNG 23 1.6 CHẨN ĐOÁN 25 1.7 ĐIỀU TRỊ 28 1.8 VẮC XIN CHỐNG LẠI COVID-19: 34 CHƢƠNG 2: ĐỐI TƢỢNG VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 37 2.1 Thiết kế nghiên cứu: 37 2.2 Đối tƣợng nghiên cứu .37 2.3 Địa điểm thời gian nghiên cứu 37 2.4 Cỡ mẫu .37 2.5 Tiêu chuẩn chọn bệnh: .37 2.6 Biến số định nghĩa biến số dùng nghiên cứu .37 2.7 Kỹ thuật đo lƣờng biến số, thu thập số liệu: 46 CHƢƠNG 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 49 3.1 Đặc điểm chung dân số nghiên cứu .50 3.2 Đặc điểm dịch tễ bệnh nhân 52 3.3 Đặc điểm lâm sàng nghiên cứu 54 3.4 Đặc điểm cận lâm sàng nghiên cứu 55 3.5 Mức độ nặng .60 3.6 Điều trị .61 3.7 Biến chứng, kết cục điều trị .62 3.8 Các yếu tố liên quan đến độ nặng bệnh .63 CHƢƠNG 4: BÀN LUẬN 69 4.1 Đặc điểm chung dân số nghiên cứu 69 4.2 Đặc điểm dịch tễ .73 4.3 Đặc điểm lâm sàng bệnh nhân COVID-19 .74 4.4 Đặc điểm cận lâm sàng 76 4.5 Phân độ điều trị 80 4.6 So sách đặc điểm có liên quan đến độ nặng bệnh 81 HẠN CHẾ CỦA ĐỀ TÀI 86 KẾT LUẬN .87 KIẾN NGHỊ 89 TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC Phụ lục 1: Bệnh án thu thập số liệu Phụ lục 2: Bản thông tin dành cho đối tƣợng nghiên cứu ii DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT TIẾNG VIỆT TÊN VIẾT TẮT TÊN ĐẦY ĐỦ TCYTTG Tổ chức Y tế giới TP Thành phố TIẾNG ANH TÊN VIẾT TẮT TÊN ĐẦY ĐỦ ACE2 Angiotensin converting enzym ARDS Acute respiratory distress syndrome CoV Coronavirus Ct value The cycle threshold value COVID-19 Corona virus disease of 2019 MERS-CoV Middle East respiratory syndrome coronavirus PAMPs Pathogen-associated molecular patterns SARS Severe Acute Respiratory Syndrome SARS-CoV-2 Severe Acute Respiratory Syndrome coronavirus 2019-nCoV 2019 novel Coronavirus iii DANH MỤC ĐỐI CHIẾU ANH VIỆT TÊN TIẾNG ANH TÊN TIẾNG VIỆT AIDS Hội chứng suy giảm miễn dịch mắc phải ARDS Hội chứng suy hô hấp cấp BAL Rửa phế quản BMI Chỉ số khối thể CRP Protein phản ứng C CDC Trung tâm kiểm sốt phịng ngừa dịch bệnh Hoa Kỳ COVID-19 ELISA Bệnh vi rút Corona năm 2019 Xét nghiệm miễn dịch hấp thụ liên kết với Enzyme HIV Siêu vi gây suy giảm hệ miễn dịch ICU Đơn vị chăm sóc tích cực IVIG Globulin miễn dịch tiêm tĩnh mạch PCR Phản ứng chuỗi polymerase RNA Axít ribonucleic RdRp Protein RNA polymerase phụ thuộc RNA WHO Tổ chức Y tế Thế giới iv DANH MỤC BẢNG Bảng 3.1 Đặc điểm dân số nghiên cứu (n= 158) .50 Bảng 3.2: Đặc điểm yếu tố tiếp xúc bệnh nhân (n=158) 52 Bảng 3.3: Đặc điểm phân bố nguồn bệnh (n=158) 53 Bảng 3.4: Triệu chứng lâm sàng bệnh nhân (n = 77) 54 Bảng 3.5: Đặc điểm xét nghiêm máu bệnh nhân (n= 158) 55 Bảng 3.6: Đặc điểm tổn thƣơng Xquang bênh nhân (n=35) .56 Bảng 3.7: Kết CT scan ngực bệnh nhân (n=13) 56 Bảng 3.8: Đặc điểm PCR phết hầu họng tìm SARS-CoV-2 phân bố theo trƣờng hợp có triệu chứng khơng có triệu chứng lâm sàng (n=158) .57 Bảng 3.9 Diễn tiến kết PCR SARS CoV2 theo nhóm ngày bệnh 58 Bảng 3.10 Chu kì ngƣỡng PCR SARS-CoV-2 thời điểm chẩn đốn (n=28) 59 Bảng 3.11: Đặc điểm điều trị bệnh nhân (n=158) 61 Bảng 3.12: So sánh thời gian nằm viện độ nặng bệnh (n=158) 62 Bảng 3.13: Biến chứng kết cục điều trị nghiên cứu (n=158) 62 Bảng 3.14: Yếu tố lâm sàng liên quan đến viêm phổi (n= 158) .63 Bảng 3.15: Yếu tố cận lâm sàng liên quan đến viên phổi (n=158) 64 Bảng 3.16: Hồi quy logistis đa biến yếu tố liên quan đến viêm phổi (n=158) 65 Bảng 3.17: Đặc điểm lâm sàng có liên quan đến mức độ nặng (n= 158) 66 Bảng 3.18: So sánh cận lâm sàng liên quan đến mức độ nặng (n=158) 67 Bảng 3.19: Phân tích hồi quy logistis yếu tố liên quan đến mức độ bệnh nặng – nguy kịch (n=6) 68 v DANH MỤC HÌNH Hình 1.1: Bản đồ số lƣợng ca COVID-19 toàn giới 11/2021 Hình 1.2: Phân loại HCoV CoV khác 10 Hình 1.3: Cấu trúc CoV 12 Hình 1.4 Chu trình nhân lên SARS-CoV 14 Hình 1.5 Đáp ứng miễn dịch sau nhiễm SARS-CoV- 19 DANH MỤC BIỂU ĐỒ Sơ đồ 2.1 Qui trình thực 47 MỞ ĐẦU Hiện nay, toàn giới đối mặt với đại dịch COVID-19, trận đại dịch thứ năm sau đại dịch Cúm năm 1918 Chúng ta ngƣợc lại báo cáo theo dõi bùng phát dịch bệnh, từ chùm ca viêm phổi nặng thành phố Vũ Hán, tỉnh Hồ Bắc, Trung Quốc vào tháng 12 năm 2019 Với triệu chứng nhƣ sốt, mệt mỏi, ho khan khó thở bệnh nhân, bệnh đƣợc chẩn đoán ban đầu viêm phổi Vũ Hán Tác nhân gây bệnh đƣợc xác định loại coronavirus mới, có tên gọi 2019-nCoV (2019 novel Coronavirus), đƣợc đổi tên sau SARS-CoV-2 cấu trúc miền gắn kết thụ thể giống nhƣ SARS-CoV (Severe Acute Respiratory Syndrome coronavirus) khác, theo khảo sát dịch tễ học đặc điểm gen [102] Đây thành viên thứ bảy họ Coronaviridae gây bệnh ngƣời Tên gọi thức bệnh lý SARS-CoV-2 gây đƣợc Tổ Chức Y Tế giới (TCYTTG) đƣa COVID-19 (Corona virus disease of 2019) vào tháng năm 2020 Bệnh COVID-19 có mức độ lây truyền mạnh mẽ Tâm dịch thay đổi từ Trung Quốc giai đoạn sớm, di chuyển đến quốc gia khác số ca bệnh không ngừng gia tăng Châu Á, Châu Âu Châu Mỹ Ngày 31/01/2020 TCYTTG thức cơng bố COVID-19 ―Sự kiện y tế cơng cộng khẩn cấp gây quan ngại y tế tồn cầu‖ Tiếp đến, ngày 28 tháng 02 năm 2020, nguy dịch bệnh đƣợc đánh giá mức độ ―rất cao‖, đến ngày 11 tháng năm 2020 TCYTTG phải tuyên bố là đại dịch toàn cầu [22] Cho đến ngày 03 tháng năm 2020, với ghi nhận bệnh 210 quốc gia có 10 triệu ca bệnh, với 140 000 trƣờng hợp tử vong Tại thời điểm đƣợc viết, tỉ lệ tử vong đƣợc ƣớc tính từ 310%, thay đổi theo quốc gia, nhƣng rõ ràng cao so với cúm mùa 1% [63] Tại có lan truyền mạnh mẽ COVID-19? Các nhà khoa học biết lây nhiễm trực tiếp virus từ ngƣời sang ngƣời chế giải thích bùng phát nhanh chóng dịch COVID-19 Ngƣời bị nhiễm virus chứa Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn