Ứng dụng kỹ thuật realtime pcr phát hiện đột biến kháng clarithromycin của helicobacter pylori trên bệnh nhân viêm dạ dày tại bệnh viện đa khoa trung tâm tiền giang, năm 2020 2021

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y DƯỢC CẦN THƠ ĐÀO THANH ỨNG DỤNG KỸ THUẬT REALTIME – PCR PHÁT HIỆN ĐỘT BIẾN KHÁNG CLARITHROMYCIN CỦA HELICOBACTER PYLORI TRÊN BỆNH NHÂN VIÊM DẠ DÀY TẠI BỆNH VIỆN ĐA KHOA TRUNG TÂM TIỀN GIANG, NĂM 2020 -2021 LUẬN VĂN THẠC SĨ Cần Thơ - 2021 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y DƯỢC CẦN THƠ ĐÀO THANH ỨNG DỤNG KỸ THUẬT REALTIME – PCR PHÁT HIỆN ĐỘT BIẾN KHÁNG CLARITHROMYCIN CỦA HELICOBACTER PYLORI TRÊN BỆNH NHÂN VIÊM DẠ DÀY TẠI BỆNH VIỆN ĐA KHOA TRUNG TÂM TIỀN GIANG, NĂM 2020 -2021 Chuyên ngành: Kỹ thuật Xét nghiệm Y học Mã số: 8720601 LUẬN VĂN THẠC SĨ KỸ THUẬT XÉT NGHIỆM Y HỌC Người hướng dẫn khoa học: PGS.TS.BS.TRẦN ĐỖ HÙNG Cần Thơ – 2021 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng tơi, kết nghiên cứu trình bày luận văn trung thực, khách quan chưa công bố nơi Tác giả Đào Thanh LỜI CẢM ƠN Trong suốt trình học tập, nghiên cứu hoàn thành luận văn nỗ lực thân nhận nhiều dạy, giúp đỡ tận tình từ q thầy cơ, bạn bè, người thân, Để hồn thành luận văn tốt nghiệp xin bày tỏ lịng biết ơn đến: PGS.TS.BS.Trần Đỗ Hùng tận tình hướng dẫn, động viên, trực tiếp giúp đỡ trình thực luận văn Ban Giám hiệu Trường Đại học Y Dược Cần Thơ, Phòng Đào Tạo Sau Đại Học, tồn thể q Thầy, Cơ Bộ môn tạo điều kiện tốt đề hồn thành chương trình học Thạc sĩ Kỹ thuật Xét nghiệm y học Ban Giám Đốc, Khoa, Phòng Bệnh viện Đa khoa Trung tâm Tiền Giang nhiệt tình giúp đỡ, tạo điều kiện cho tơi q trình nghiên cứu để hồn thành luận văn Q Thầy Cô Hội đồng thông qua đề cương, Hội đồng chấm luận văn tốt nghiệp đóng góp cho nhiều ý kiến quý báu để luận văn hồn thành Với tất tình cảm sâu sắc nhất, tơi xin dành cho những người thân gia đình, chỗ dựa vững chắc vật chất tinh thần, nguồn động lực giúp đỡ vượt qua khó khăn để đạt kết khố học hoàn thành luận văn Xin chân thành CẢM ƠN! Tác giả Đào Thanh MỤC LỤC Lời cam đoan Trang Lời cảm ơn Danh mục chữ viết tắt Danh mục bảng Danh mục biểu đồ, hình ĐẶT VẤN ĐỀ Chương TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1.Helicobacter pylori 1.2.Tình hình đề kháng kháng sinh Helicobacter pylori 1.3.Một số yếu tố liên quan đến đề kháng kháng sinh clarithromycin Helicobacter pylori 11 1.4.Phương pháp PCR phát đột biến đề kháng kháng sinh clarithromycin Helicobacter pylori 12 1.5.Một số nghiên cứu đề kháng kháng sinh clarithromycin Helicobacter pylori giới Việt Nam 16 ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 19 2.1 Đối tượng nghiên cứu 19 2.2 Phương pháp nghiên cứu 20 2.3 Đạo đức nghiên cứu 36 Chương KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 38 3.1 Đặc điểm chung đặc điểm lâm sàng, cận lâm sàng đối tượng nghiên cứu 38 3.2 Tỷ lệ đột biến đề kháng kháng sinh clarithromycin Helicobacter pylori 45 3.3 Một số yếu tố liên quan đến đột biến đề kháng kháng sinh clarithromycin vi khuẩn Helicobacter pylori 48 Chương BÀN LUẬN 56 4.1 Đặc điểm chung đặc điểm lâm sàng, cận lâm sàng đối tượng nghiên cứu 56 4.2 Tỷ lệ đột biến đề kháng kháng sinh clarithromycin Helicobacter pylori 62 4.3 Một số yếu tố liên quan đến đột biến đề kháng kháng sinh clarithromycin vi khuẩn Helicobacter pylori 66 KẾT LUẬN 73 KIẾN NGHỊ 75 TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC Chữ viết tắt CDC DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT Tiếng Anh Tiếng Việt Centers for Disease Control Trung tâm Kiểm sốt Phịng and Prevention ngừa bệnh tật HSSV Học sinh-Sinh viên ĐH Đại học SĐH Sau Đại học THCS Trung học sở THPT Trung học phổ thông OR Odds ratio Tỷ số Odds PCR Polemerase Chain Reaction Phản ứng khuếch đại chuỗi gen Ref Reference Tham khảo SD Standard Deviation Độ lệch chuẩn WHO World Health Organization Tổ chức Y tế Thể giới Ct Cycle threshold Chu kỳ ngưỡng SPSS Statistical Package for the Social Sciences Minimum Inhibitory MIC Concentration DNA Deoxyribonucleic Acid CA Chocolate agar Nồng độ ức chế tối thiểu DANH MỤC BẢNG Trang Bảng 3.1: Đặc điểm tuổi giới đối tượng nghiên cứu 38 Bảng 3.2: Tỷ lệ trình độ học vấn đối tượng nghiên cứu 38 Bảng 3.3: Tỷ lệ nghề nghiệp đối tượng nghiên cứu 39 Bảng 3.4: Tỷ lệ đặc điểm nơi sống, hút thuốc lá, uống rượu bia, tuân thủ điều trị đối tượng nghiên cứu 40 Bảng 3.5: Tỷ lệ triệu chứng lâm sàng đối tượng nghiên cứu 41 Bảng 3.6: Tỷ lệ số triệu chứng lâm sàng đối tượng nghiên cứu 42 Bảng 3.7: Tỷ lệ vị trí tổn thương nội soi đối tượng nghiên cứu 43 Bảng 3.8: Tỷ lệ dạng tổn thương dày nội soi đối tượng 44 Bảng 3.9: Tỷ lệ đột biến đề kháng kháng sinh clarithromycin Helicobacter pylori đối tượng nghiên cứu 45 Bảng 3.10: Tỷ lệ dạng đột biến đề kháng kháng sinh clarithromycin Helicobacter pylori theo giới tính 46 Bảng 3.11: Tỷ lệ dạng đột biến đề kháng kháng sinh clarithromycin Helicobacter pylori theo nhóm tuổi 46 Bảng 3.12: Liên quan giữa giới tính đột biến đề kháng kháng sinh clarithromycin 48 Bảng 3.13: Liên quan giữa nhóm tuổi đột biến đề kháng kháng sinh clarithromycin 48 Bảng 3.14: Liên quan giữa nơi sống đột biến đề kháng kháng sinh clarithromycin Helicobacter pylori 49 Bảng 3.15: Liên quan giữa học vấn đột biến đề kháng kháng sinh clarithromycin Helicobacter pylori 49 Bảng 3.16: Liên quan giữa nghề nghiệp đột biến đề kháng kháng sinh clarithromycin Helicobacter pylori 50 Bảng 3.17: Liên quan giữa hút thuốc đột biến đề kháng kháng sinh clarithromycin Helicobacter pylori 50 Bảng 3.18: Liên quan giữa uống rượu bia đột biến đề kháng kháng sinh clarithromycin Helicobacter pylori 51 Bảng 3.19: Liên quan giữa tiền sử điều trị Helicobacter pylori đột biến đề kháng kháng sinh clarithromycin Helicobacter pylori 51 Bảng 3.20: Liên quan giữa thói quen tuân thủ điều trị kháng sinh đột biến đề kháng kháng sinh clarithromycin Helicobacter pylori 52 Bảng 3.21: Liên quan giữa số triệu chứng lâm sàng/bệnh nhân đột biến đề kháng kháng sinh clarithromycin Helicobacter pylori 52 Bảng 3.22: Liên quan giữa vị trí tổn thương nội soi đột biến đề kháng kháng sinh clarithromycin Helicobacter pylori 53 Bảng 3.23: Liên quan giữa dạng tổn thương nội soi đột biến đề kháng kháng sinh clarithromycin Helicobacter pylori 54 Bảng 3.24: Phân tích đa biến số yếu tố liên quan đến đột biến đề kháng kháng sinh clarithromycin Helicobacter pylori 55 DANH MỤC BIỂU ĐỒ, HÌNH Trang Biểu đồ 1.1: Ước lượng tỷ lệ mắc Helicobacter pylori ung thư dày quốc gia Đông Nam Á Hình 1.1: Cấu trúc phân tử clarithromycin Hình 1.2: Mơ hình vùng peptidyltransferase domain V gen 23S rRNA 10 Hình 1.3: Tóm tắt chế hoạt động Taqman probe Real-time PCR 14 Biểu đồ 2.1: Tỷ lệ dạng đột biến đề kháng kháng sinh clarithromycin Helicobacter pylori đối tượng nghiên cứu 45 2.3 Chán ăn Khơng Có 2.4 Ăn mau no Khơng Có 2.5 Đầy bụng, khó tiêu Khơng Có 2.6 Bụng chướng Khơng Có 2.7 Buồn nơn Khơng Có 2.8 Nơn ói Khơng Có 2.9 Ợ Khơng Có 2.10 Ợ chua Khơng Có Triệu chứng cận lâm sàng: nội soi thử nghiệm urease 3.1.1 Viêm sung huyết Khơng 3.1.2 Viêm xuất huyết Khơng Có 3.1.3 Viêm trợt Khơng Có 3.1.3 Viêm trợt phẳng Khơng Có 3.1.4 Viêm phì đại Khơng Có 3.1.5 Viêm teo Khơng Có 3.1.6 Viêm trào ngược Khơng Có 3.2 Vị trí Tổn 3.2.1 Viêm hang vị đơn Khơng Có thương 3.1 Tổn thương Có 3.2.2 Viêm thân vị đơn Khơng Có Khơng Có 3.2.3 Viêm hang vị thân vị 3.3 Kết thử nghiệm urease Âm tính Dương tính 3.4 Kết ni cấy Mọc Khơng mọc 3.4 Kết MIC clarithromycin Nhạy Kháng 3.5 Kết PCR Đột biến Không biến Các yếu tố liên quan Đang hút thuốc lá: Khơng Có Đã hút thuốc lá: Khơng Có Tiền sử mắc bệnh Khơng Có Đã dùng thuốc điều trị H.pylori Khơng Có đột PHỤ LỤC MỘT SỐ HÌNH ẢNH MINH HỌA ... THANH ỨNG DỤNG KỸ THUẬT REALTIME – PCR PHÁT HIỆN ĐỘT BIẾN KHÁNG CLARITHROMYCIN CỦA HELICOBACTER PYLORI TRÊN BỆNH NHÂN VIÊM DẠ DÀY TẠI BỆNH VIỆN ĐA KHOA TRUNG TÂM TIỀN GIANG, NĂM 2020 -2021 Chuyên... Realtime – PCR phát đột biến clarithromycin Helicobacter pylori bệnh nhân viêm dày Bệnh viện Đa khoa Trung tâm Tiền Giang năm 2020 – 2021? ?? với hai mục tiêu: Xác định tỷ lệ đột biến đề kháng kháng... sinh clarithromycin Helicobacter pylori bệnh nhân viêm dày kỹ thuật Realtime – PCR Bệnh viện Đa khoa Trung tâm Tiền Giang năm 2020 – 2021 Xác định số yếu tố liên quan đến đột biến đề kháng kháng