Đánh giá khả năng kháng kháng sinh của Salmonella trong thủy sản tại khu vực thành phố Hồ Chí Minh.pdf

BỘ CÔNG THƯƠNG TRƯỜNG ĐẠI HỌC CÔNG NGHIỆP THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH BÙI NHẬT TÂM ĐÁNH GIÁ KHẢ NĂNG KHÁNG KHÁNG SINH CỦA SALMONELLA TRONG THỦY SẢN TẠI KHU VỰC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH Ngành: CƠNG NGHỆ SINH HỌC Mã ngành: 8420201 LUẬN VĂN THẠC SĨ THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH, NĂM 2022 Cơng trình hồn thành Trường Đại học Cơng nghiệp TP Hồ Chí Minh Người hướng dẫn khoa học: TS Nguyễn Ngọc Ẩn Luận văn thạc sĩ bảo vệ Hội đồng chấm bảo vệ Luận văn thạc sĩ Trường Đại học Công nghiệp thành phố Hồ Chí Minh ngày 16 tháng năm 2022 Thành phần Hội đồng đánh giá luận văn thạc sĩ gồm: TS Nguyễn Thị Kim Anh - Chủ tịch Hội đồng TS Lao Đức Thuận - Phản biện TS Trần Thị Huyền - Phản biện TS Trần Quỳnh Hoa - Ủy viên TS Mai Bích Dung - Thư ký (Ghi rõ họ, tên, học hàm, học vị Hội đồng chấm bảo vệ luận văn thạc sĩ) CHỦ TỊCH HỘI ĐỒNG TRƯỞNG KHOA/VIỆN CNSH&TP BỘ CÔNG THƯƠNG TRƯỜNG ĐẠI HỌC CƠNG NGHIỆP THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH CỘNG HÒA XÃ HỘI CHỦ NGHĨA VIỆT NAM Độc lập - Tự - Hạnh phúc NHIỆM VỤ LUẬN VĂN THẠC SĨ Họ tên học viên: Bùi Nhật Tâm MSHV:19630571 Ngày, tháng, năm sinh: 15/3/1995 Nơi sinh: Tp Hồ Chí Minh Ngành: Công nghệ Sinh học Mã ngành: 8420201 I TÊN ĐỀ TÀI: Đánh giá khả kháng kháng sinh Salmonella thủy sản khu vực thành phố Hồ Chí Minh NHIỆM VỤ VÀ NỘI DUNG: Để đạt mục tiêu đề tài, thực nợi dung sau: • Phân lập Salmonella từ mẫu cá, tôm, mực chợ địa bàn Thành phố Hồ Chí Minh • Đánh giá mức đợ nhạy cảm chủng Salmonella phân lập với 11 kháng sinh (amoxicillin/clavulanic acid, ampicillin, ceftazidime, chloramphenicol, nalidixic acid, ciprofloxacin, ofloxacin, gentamicin, streptomycin, tetracycline, trimethoprim/sulfamethoxazole) • Xác định nồng độ ức chế tối thiểu (MIC) 11 loại kháng sinh thử nghiệm lên chủng Salmonella đề kháng đa kháng sinh • Phát diện gene đề kháng kháng sinh đối chủng Salmonella đề kháng đa kháng sinh: nhóm β-lactam (blaTEM, blaSHV, blaCTX,), tetracycline (tetA, tetB, tetC, tetD, tetE), aminoglycoside (strA, aadA2), quinolon (gyrA, gyrB, parC), sulfonamide (sul1, sul2), phenicol (cmlA, cmlB) • Phát diện Integron nhóm I, II, III chủng Salmonella đề kháng đa kháng sinh II NGÀY GIAO NHIỆM VỤ: (Ghi theo Quyết định giao đề tài) Ngày 29 tháng năm 2021 III NGÀY HOÀN THÀNH NHIỆM VỤ: (Ghi theo đơn xin bảo vệ) IV NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: TS Nguyễn Ngọc Ẩn Tp Hồ Chí Minh, ngày … tháng … năm 20 … NGƯỜI HƯỚNG DẪN CHỦ NHIỆM BỘ MÔN ĐÀO TẠO (Họ tên chữ ký) (Họ tên chữ ký) VIỆN TRƯỞNG VIỆN CNSH&TP LỜI CẢM ƠN Luận văn tốt nghiệp tiền đề nhằm trang bị kỹ nghiên cứu, kiến thức quý báu lập nghiệp Vì vậy, trình thực nhiệm vụ, để hồn thành luận văn, tơi xin chân thành gửi lời cảm ơn đến: Ban Giám hiệu Trường Đại học Cơng nghiệp Thành phố Hồ Chí Minh, q Thầy, Cơ viện Công nghệ Sinh học Thực phẩm trường Đại học Cơng nghiệp Thành phố Hồ Chí Minh, tận tình dạy dỗ, truyền đạt kiến thức thời gian qua; Anh Chị, Thầy Cô viện Đào tạo Quốc tế Sau đại học, tạo điều kiện thuận lợi q trình hồn thành thủ tục để tơi thực luận văn Xin gửi lời cảm ơn chân thành sâu sắc đến: TS Nguyễn Ngọc Ẩn hướng dẫn, truyền đạt nhiều kinh nghiệm kiến thức chuyên môn giúp kịp thời giải vấn đề, đợng viên tơi lúc khó khăn TS Phạm Tấn Việt TS Nguyễn Thị Diệu Hạnh quan tâm, bảo ln sẵn lịng hỗ trợ suốt thời gian thực luận văn Tập thể cán bợ Phịng thí nghiệm Trung tâm Dịch vụ phân tích thí nghiệm Thành phố Hồ Chí Minh (CASE), trường Đại học Cơng nghiệp Thành phố Hồ Chí Minh tạo điều kiện tốt nhất cho thực thí nghiệm Tập thể sinh viên làm việc Phịng thí nghiệm Cơng nghệ Vi sinh, viện Cơng nghệ Sinh học Thực phẩm giúp đỡ, hỗ trợ tạo đợng lực để tơi hồn thành tốt nhiệm vụ học tập, nghiên cứu Nghiên cứu hỗ trợ kinh phí từ nhiệm vụ khoa học cơng nghệ hợp đồng số 70/2019/HĐ-QPTKHCN Cảm ơn gia đình bạn bè hỗ trợ, nguồn động viên đồng hành suốt thời gian qua i Cuối cùng, tơi xin kính chúc q Thầy, Cô, Anh, Chị, Em dồi sức khỏe gặt hái nhiều thành công công việc cuộc sống Tôi xin chân thành cảm ơn! ii TÓM TẮT LUẬN VĂN THẠC SĨ An tồn thực phẩm (ATTP) ln vấn đề quan tâm rợng rãi tồn giới, Salmonella mợt nguyên nhân phổ biến gây nhiểm khuẩn đường tiêu hóa lây nhiễm qua thực phẩm Tại quốc gia phát triển có Việt Nam, biện pháp đảm bảo vệ sinh trình chế biến bảo quản thực phẩn chưa thực quan tâm kiểm soát chặt chẽ, việc làm tăng nguy nhiễm khuẩn Salmonella thực phẩm Kháng sinh sử dụng thiếu kiểm soát chăn ni với mục đích phịng ngừa, chữa trị kích thích tăng trưởng tạo điều kiện cho trình chọn lọc vi sinh vật đề kháng kháng sinh, có Salmonella Do đó, nghiên cứu thực nhằm cảnh báo nguy nhiễm khuẩn Salmonella, đặc biệt chủng Salmonella kháng đa kháng sinh từ thực phẩm thủy sản nhóm thực phẩm mà tiêu cịn quan tâm Trong nghiên cứu này, 85 chủng Salmonella phân lập từ 380 mẫu thủy sản bao gồm cá, tôm, mực thành phố Hồ Chí Minh (chiếm tỷ lệ 22.37%) Mức độ nhạy cảm 11 loại kháng sinh (amoxicillin/clavulanic acid, ampicillin, ceftazidime, nalidixic acid, ciprofloxacin, ofloxacin, gentamicin, streptomycin, tetracycline, trimethoprim/sulfamethoxazole, chloramphenicol) 85 chủng Salmonella xác định, với tỷ lệ đề kháng với nhất mợt loại kháng sinh 85.88% Các kháng sinh có tỷ lệ bị đề kháng cao nhất tetracycline (43.53%), sulfamethoxazole/trimethoprim (35.29%) streptomycin (31.76%) Có 6/13 chủng đa kháng từ 6-10 loại kháng sinh có kiểu hình sinh ESBL Các gene đề kháng kháng sinh tỷ lệ xuất chủng Salmenella đa kháng kháng sinh là: β-lactam (blaTEM (53.87%), blaCTX (7.69%)), tetracycline (tetA (92.31%), tetB (7.69%)), phenicol (cmlA (7.69%), cmlB (7.69%)), aminoglycosid (strA (53.85%), aadA2 (76.92%)), sulfonamide (sul1 (61.53%), sul2 (51.53%)) Thêm vào diện Integron I, II, III xác định, đặc biệt chủng đa kháng kháng sinh, với tỷ lệ 100%, 51.53% intIII 100% Sự diện gene đề kháng kháng sinh gene Integron nhóm I, II, III cho thấy khả đề kháng kháng sinh, khả dung nạp khả lan truyền yếu tố đề iii kháng kháng sinh Salmonella Vì vậy, tình trạng nhiễm Salmonella thực phẩm vấn đề cần quan tâm nhiều hơn, đặc biệt nhóm thực phẩm thủy sản Ngồi ra, cần có thêm nhiều nghiên cứu, khảo sát tình trạng nhiễm khuẩn Salmonella khả kháng kháng sinh Salmonella thực phẩm mợt cách định kì với quy mô lớn để hỗ trợ cho q trình vệ sinh an tồn thực phẩm sử dụng kháng sinh chăn nuôi nước ta iv ABSTRACT Safety food is a world wide major concern, Salmonella is one of the causes of foodborne illness in human, especially in developing countries where safety food practice are incorrected Antimicrobial properties have been using for the preventing, treating disease, also growth factors in livestock The misuse of this is accelerating the selection of antibiotic-resistance microorganisms including Salmonella In this study, from 380 samples of aquaculture in Ho Chi Minh city, eighty-five strains of Salmonella were isolated, accounting for 22.3% Antibiotic susceptibility of this isolation with 11 antibiotics (amoxicillin/clavulanic acid, ampicillin, ceftazidime, nalidixic acid, ciprofloxacin, ofloxacin, gentamicin, streptomycin, tetracycline, trimethoprim/sulfamethoxazole, chloramphenicol) were assessed, approximately 85.66% of Salmonella strains resistant to at least one antibiotic The highest proportion of antibiotic resistance was tetracycline 43.53%, followed by sulfamethoxazole/trimethoprim and streptomycin with 35.29%, 31.76% respectively The prevalence of genes coding antibiotic resistance as well as integrons of multidrug-resistant Salmonella strains were detected: β-lactam (blaTEM (53.87%), blaCTX (7.69%)), tetracycline (tetA (92.31%), tetB (7.69%)), phenicol (cmlA (7.69%), cmlB (7.69%)), aminoglycosid (strA (53.85%), aadA2 (76.92%)), sulfonamide (sul1 (61.53%), sul2 (51.53%)) and the Integron I, II, III were 100%, 51.53% and 100% respectively The results of this study evaluated the prevalence and antibiotic resistance of Salmonella in aquaculture products in Ho Chi Minh city In addition, the antibiotics susceptibility and genes encoding multi-drug resistance and Integrons in these strains were also detected v LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu thân Các kết nghiên cứu kết luận luận văn trung thực, không chép từ bất kỳ một nguồn bất kỳ hình thức Việc tham khảo nguồn tài liệu (nếu có) thực trích dẫn ghi nguồn tài liệu tham khảo quy định Học viên Bùi Nhật Tâm vi ... sinh: 15/3/1995 Nơi sinh: Tp Hồ Chí Minh Ngành: Cơng nghệ Sinh học Mã ngành: 8420201 I TÊN ĐỀ TÀI: Đánh giá khả kháng kháng sinh Salmonella thủy sản khu vực thành phố Hồ Chí Minh NHIỆM VỤ VÀ NỘI... vi khu? ??n đề kháng với kháng sinh, có Salmonella Sự diện tính nhạy cảm kháng sinh Salmonella thực phẩm thủy sản đóng mợt vai trị quan trọng an tồn thực phẩm Việt Nam, đặc biệt thành phố Hồ Chí. .. tối thiểu (MIC) 11 loại kháng sinh thử nghiệm lên chủng Salmonella đề kháng đa kháng sinh • Phát diện gene đề kháng kháng sinh đối chủng Salmonella đề kháng đa kháng sinh: nhóm β-lactam (blaTEM,