Phương pháp thu, bảo quản và vận chuyển mẫu • Các khái niệm ▫ Mẫu ban đầu: Mẫu ban đầu được lấy từ các bao bì chứa đựng hay đơn vị chứa khác nhau, ở các vị trí khác nhau để đảm bảo t
Trang 1PHƯƠNG PHÁP KIỂM TRA
VI SINH VẬT TRONG SẢN PHẨM THUỶ SẢN
Chương VI
Trang 2YÊU CẦU TRONG LẤY MẪU, XỬ LÝ MẪU, TIẾP NHẬN MẪU TẠI PHÒNG
THÍ NGHIỆM
Trang 3Phương pháp thu, bảo quản và vận
chuyển mẫu
• Các khái niệm
▫ Mẫu ban đầu: Mẫu ban đầu được lấy từ các bao bì chứa
đựng (hay đơn vị chứa) khác nhau, ở các vị trí khác nhau
để đảm bảo tính chất đại diện trung bình cho lô hàng Số lượng của mẫu ban đầu tuỳ thuộc vào số lượng đơn vị
chứa của lô hàng
▫ Mẫu trung bình: Mẫu trung bình là lượng mẫu cần thiết
lấy ra từ mẫu ban đầu sau khi đã trộn đều mẫu ban đầu Nó phụ thuộc vào loại và dạng sản phẩm ban đầu
▫ Mẫu phân tích: Mẫu phân tích là lượng mẫu cần thiết
dùng cho quá trình phân tích được lấy ra từ mẫu trung bình Các loại mẫu đều được dán nhãn
Trang 4• Phải đảm bảo 2 điều kiện:
- Mẫu có tính đại diện cho lô hàng, lượng mẫu đủ để phân
tích
- Thành phần & số lượng VSV ko được biến đổi kể từ khi lấy mẫu đến khi phân tích
Trang 5Cách tiến hành lấy mẫu
• Mẫu dạng hạt: ngũ cốc, cà phê,… trong lô hàng có số lượng bao dưới 5 thì bao nào cũng lấy một ít ở vị trí khác nhau Trong lô hàng từ 6 - 100 bao thì lấy ít nhất
5 bao, trong lô có số bao lớn hơn 101 trở lên thì lấy ít nhất 5% số bao v.v Dụng cụ lấy mẫu là xiên lấy mẫu
• Lô hàng sắp theo hình vuông, gạch 2 đường chéo lấy mẫu ở 2 tam giác đối diện bất kỳ
• Mẫu ban đầu phải có khối lượng 3 – 5 kg
Trang 6Mẫu dạng lỏng: rượu, nước mắm
• Sản phẩm trong phy hay bồn lớn thì dùng ống xi phông, ống hút có độ dài khác nhau để lấy mẫu ở các vị trí khác nhau: trên, giữa và ở đáy, rồi trộn đều Lượng mẫu tối
thiểu là 2 lít mẫu trung bình
• Nếu sản phẩm lỏng chứa trong chai lọ, can và lô hàng
có ít hơn 1000 đơn vị chứa thì lấy 2% số đơn vị chứa, nếu
lô hàng có trên 1000 đơn vị chứa thì lấy từ 0,3 - 1% số
đơn vị chứa Sau đó trộn đều tất cả số mẫu ban đầu đã lấy được, để lấy ra mẫu trung bình khoảng 2 lít
• Phần còn lại của mẫu phân tích là mẫu lưu
Trang 7Các sản phẩm khác dạng sánh hoặc bán rắn
lấy lượng lớn hơn
• Lưu ý đối với dầu thực vật, bơ phải trách sự oxy hoá của không khí
Trang 8Nhà máy CBTS: mẫu (kiểm tra vệ sinh công nghiệp) lấy với khối lượng nhỏ, nhiều thời điểm & công đoạn khác nhau trong qt cbiến
Thịt, cá: nơi nhiễm chủ yếu là bề mặt, sd các dụng cụ lấy mẫu để quét trên bề mặt sp hay cắt mẫu với độ
dày từ 2-3 mm
Trang 9Dụng cụ lấy và chứa mẫu
Từ các chất liệu khác nhau: phải thanh trùng
Bình (có mẫu) được niêm phong, ghi số thứ tự mẫu, người lấy mẫu
Trang 10Thông tin hồ sơ mẫu
Người yêu cầu PTN phân tích mẫu: Tên, địa chỉ, điện thoại Nơi lấy mẫu (cửa hàng, khách hàng ), ngày, địa điểm, thời gian lấy mẫu
Miêu tả hoàn cảnh, môi trường nơi lấy mẫu
Bản chất mẫu
1 nhãn dễ đọc ghi rõ tên mẫu
T0 mẫu, kho chứa khi lấy mẫu
Nguyên nhân lấy mẫu
Thông tin thực phẩm được lấy mẫu: chế biến, thời gian sản xuất, dạng bao bì, điều kiện bảo quản
Tên nhà sx, nhà nhập khẩu
Ngày sx, ngày đóng gói, thời hạn sử dụng, số sx
Phương pháp lấy mẫu
Người lấy mẫu: tên, địa chỉ, điện thoại
PTN: tên, địa chỉ, điện thoại
Các chỉ tiêu phân tích
Trang 11TIẾP NHẬN MẪU TẠI PHÒNG THÍ NGHIỆM
Ghi nhãn
Kiểm tra: nhãn trên mẫu có phù hợp số của hồ sơ mẫu
T0 mẫu, tgian mẫu đến: ghi trong hồ sơ mẫu
T 0 mẫu khi đến
Đo T0 = 1 phần mẫu hay 1 mẫu phụ xlý giống mẫu chính
Đk bao gói
Mẫu giữ ở bao bì gốc (tốt nhất) Nếu chuyển bao bì, mẫu giữ ở
túi vô trùng & bằng các vật liệu không ảnh hưởng tình trạng ban đầu của mẫu
- Mẫu lỏng: kiểm tra bình chứa (rò rĩ, nắp đậy kín, bị nứt
/thủng) có gây nhiễm bẩn vào mẫu
- Mẫu rắn: kiểm tra bao bì (tình trạng chân không- có khí bên
trong?, bị nứt/ lõm?), đk lý tính bên trong ( màu sắc, cơ cấu, mất chất lỏng)
Bao bì/ lớp bọc bị hư hỏng: ghi nhận, báo cáo phân tích
Trang 12Bảo quản mẫu trước & sau khi phân tích
Với mẫu thực phẩm: sau khi lấy- bquản tách biệt nhau, giữ ở
T0 thấp nước đá),vận chuyển ngay về PTN Mẫu mau hư
hỏng: bảo quản đông, đặc biệt trữ dài hạn, giữ mẫu ở tủ đông (-20oC) Ko thể bquản đông, phân tích mẫu trong 36h giữ
Trang 13Xử lý mẫu
Tiền xử lý mẫu theo phương pháp chuẩn:
• Rã đông thực phẩm đông lạnh: ở T0 tủ lạnh (40C) 18h Mẫu thực phẩm nhỏ: đặt nơi ổn định nhiệt (không >370C) 15’
• Đồng nhất mẫu cần duy trì t0 lạnh
• Khối lượng mẫu phân tích 10/ 25gram
• Mẫu thực phẩm hàm lượng muối cao, nồng độ muối dung dịch pha loãng phù hợp nồng độ muối trong mẫu
• Mẫu thưc phẩm hàm lượng đường cao: bổ sung đường
sucrose
Trang 14Mẫu thực phẩm mau hỏng: bảo quản lạnh ngay sau lấy mẫu (T0 0-4oC) ở thùng nước đá, mẫu tránh tx trực tiếp với nước
đá
Mẫu dạng đông (block) không để tan đá trước khi đến PTN Mẫu khó hư hỏng: dùng bao, túi kín; T0 vận chuyển, bảo
quản không vượt 45oC
Mẫu kiểm nghiệm phải đạt các yêu cầu:
Dụng cụ chứa mẫu không rò rỉ, có nắp đậy kín, không bị
nứt /thủng gây nhiễm bẩn vào mẫu
Mẫu dạng hút chân không: không có khí bên trong
Mẫu dạng block hay mẫu nguyên con: còn nguyên vẹn
không bị biến dạng, giập nát
Mẫu nước: phân tích ngay sau khi thu Mẫu bảo quản lạnh
<10oC (>1h), vận chuyển tối đa 6h và bảo quản ở PTN tối
đa 2h
Thời gian, T0 bảo quản và vận chuyển ghi trong hồ sơ mẫu
Trang 15Phương pháp kiểm nghiệm VSV sử dụng kỹ thuật truyền thống
• Ưu điểm: chi phí thấp (ko cần trang bị thiết bị hiện đại)
• Nhược điểm: tgian cho kquả chậm, ko đáp ứng nhu cầu kiểm nghiệm thực tế
Trang 16Tiệt trùng không gian làm việc
Khử trùng dụng cụ như dao, kéo, nhíp, que cấy, que trải,…
Trang 17Pha loãng
• Dung dịch pha loãng thường dùng
Nước muối sinh lý hoặc dung dịch peptone
• Thường pha loãng theo dãy thập phân
1,0ml 1,0ml 1,0ml 1,0ml 1,0ml 1,0ml
Trang 18Tách ròng
Trang 19Trữ vi khuẩn
• Trên môi trường đặc
• Trên môi trường loãng (BHI, TSB… + glycerol, 1:1)
• Trữ khô ở - 80oCA
Trang 20Loại môi trường, chỉ tiêu sinh hoá dùng trong kiểm nghiệm vi sinh sp thuỷ sản
Phân loại môi trường
Trang 21Hình Các loại môi trường theo trạng thái vật lý
Trang 22Theo công dụng
• Môi trường tiền tăng sinh: giàu dinh dưỡng, ko có chất ức chế đặc hiệu tạo đk hầu hết các loại VSV ptriển
• Môi trường tăng sinh: có kn ức chế sự sinh trưởng 1 số nhóm VSV
nhưng tạo đk ptriển VSV khác
• Môi trường chung: ko chứa các chất ức chế, dùng phân lập hầu hết
các loại VSV (là mt lỏng hoặc mt đặc)
• Môi trường phân biệt (mt đặc trưng) (mt đặc): chứa các thành phần
thuận lợi cho sự phát hiện các giống hay loài VSV từ một mẻ cấy
thuần chủng hoặc hổn hợp
• Môi trường thử phản ứng sinh hoá: dùng để xđịnh 1 vài tính chất
sinh hoá các dòng VK được phân lập Yêu cầu phải sd dòng thuần,
nếu ko kquả dễ cho hiện tượng dương tính giả (kquả sai)
Trang 23Những điều cần lưu ý trong sử dụng môi trường
• Phòng kiểm nghiệm: sd mt nhập khẩu có sẵn (dạng khan)
Ưu điểm: giảm đáng kể sự sai lệch giữa các lần pha chế mt
• Bảo quản: Mt khô bquản nơi khô thoáng,T0 (15 – 25oC), đậy kín (tránh bị hút ẩm do hơi nước trong ko khí), nếu
không mt xhiện hiện tượng: thay đổi pH, vón cục Lưu ý:
Ko dùng mt bị vón cục, quá hạn sd
• Pha chế: Nước pha mt khô là nước cất (các mt có hướng
dẫn lượng mt và lượng nước) Các mt nhạy cảm với T0 (ko
đun mt quá tgian cần thiết)
Trang 24• Điều chỉnh pH: MT khô khi hoà tan, đun và khử trùng
đúng cách có pH phù hợp cho ptriển VSV 1 số trường hợp cần điều chỉnh pH phù hợp (sd NaOH / HCl)
Lưu ý: MT đặc, điều chỉnh pH khi T0 mt ở khoảng 45oC và dụng cụ đo pH có chế độ bù nhiệt MT lỏng đo pH ở T0
phòng
• Khử trùng môi trường: Thiết bị dùng khử trùng mt - nồi
hấp tiệt trùng (Autoclave), ở T0 (121oC) với tgian 15’ ko kể thời gian nâng nhiệt
Trang 25Chỉ tiêu sinh hoá trong kiểm nghiệm vi sinh
a Nhuộm Gram
• 1884 Hans Christian Gram (nhà khoa học Đan mạch)
(1853 – 1938) phát hiện pp
• Dựa trên đặc tính hóa lý của thành tế bào
▫ Vi khuẩn Gram dương: lớp peptidoglycan dầy 20 – 80 nm, chiếm 90% khối lượng
▫ Vi khuẩn Gram âm: lớp peptidoglycan dầy 7 - 8
nm, chiếm 10% khối lượng và có thêm lớp màng lipopolysaccharide bên ngoài
Trang 26Phương pháp nhuộm Gram
Làm tiêu bản mẫu cần nhuộm
Cố định mẫu bằng ngọn lửa đèn cồn
Dùng thuốc nhuộm kiềm, tím tinh thể nhuộm trong 1 phút
Rửa nước tối đa 5 giây
Thêm dung dịch Lugol (1% I, 2% KI) trong 1 phút
Rửa nước
Phủ lên mẫu với ethanol 95% hoặc hỗn hợp aceton:ethanol 95% 5:95
Rửa nước
Nhuộm tiếp với Sanfranin hoặc fuchsin 1 phút
Rửa nước và để khô
Kết quả: quan sát lame dưới KHV
▫ Vi khuẩn Gram dương: xanh đen hay tím
▫ Vi khuẩn Gram âm: đỏ vàng hay đỏ tía
Trang 28Thử nghiệm khả năng lên men nguồn Carbohydrate
Loài VK khác nhau khả năng sử dụng các nguồn carbohydrate khác nhau
Ví dụ
• Loài VSV lên men kỵ khí glucose
• Loài VSV sd glucose = con đường oxy hoá
• Loài VSV sd glucose = cả 2 pp
• Loài VSV ko có kn sd glucose
Nguyên tắc: Xác định khả năng lên men 1 nguồn carbohydrate
đặc hiệu (có trong môi trường nuôi cấy) tạo acid (hay acid & sinh hơi) của VSV làm đổi màu chất chỉ thị
Các sp cùng đặc trưng trong lên men:
•Acid lactic
•Acid formic và acid acetic
•Acid lactic và ethanol
•Ethanol
Sd thuốc thử phenol red (pH 6.4 – 8)có màu vàng trong mt acid & màu đỏ trong mt kiềm
Trang 29• H2O2 (hydro peroxide) (sp cuối mang tính oxh của quá trình biến
dưỡng đường kiểu hiếu khí) khi tích tụ nhiều gây độc tế bào
• Men catalase có trong VSV hiếu khí/ kị khí tuỳ nghi (ngoại trừ
Streptococcus spp) Men catalase xtác pứng oxh - khử của 2 phân
tử hydro peroxide (H2O2)
• Trong pứng phân giải: 1 phân tử H2O2 hđộng như 1 cơ chất, 1
phân tử H2O2 hđộng như chất cho cơ chất bị khử bởi nguyên
tử hydro chất cho => cơ chất bị khử và chất cho bị oxy hoá
• H2O2 + H – O – O – H catalase 2 H2O + O2
Thử nghiệm Catalase
Nguyên tắc: Xác định sự có mặt của enzyme catalase ở VSV
Trang 30• Hoá chất sd là ddịch H2O2 30% (Superoxal) giữ lạnh trong chai sẫm màu, tránh ánh sáng (Do H2O2 rất dễ bị phân huỷ nên cần phải kiểm tra chất lượng của H2O2 trước sd)
• Ktra = các chủng VK (+) tính và (-) tính với pứng catalase /hoặc sd mt thạch máu & mt chocolate agar (hồng cầu đã
bị phân huỷ)
• PP thử pứng catalase của VSV: sd lame, cho trực tiếp ddịch
H2O2 vào ống nghiệm chứa VSV cần thử (VSV đã thuần) hoặc sd ống mao dẫn để thử kn phân giải H2O2 của VSV
Phương pháp thử
Trang 31Phản ứng catalase dương tính
Trang 32Thử nghiệm Citrate
Xác định khả năng sd citrate như 1 nguồn carbon duy I cho hđộng trao đổi chất của VSV
Hình 3 Phân tử Citric
Cơ sở sinh hóa: NL ccấp cho VSV trong mt
ko có nguồn ng liệu sd cho qt lên men hay tạo
sp lactic VSV sử dụng citrate như là nguồn carbon duy nhất
Trang 33Thử nghiệm Decarboxylase (LDC, ODC) và dehydrolase (ADH) của các a.amin
Nguyên tắc: Xác định khả năng tổng hợp các enzyme khử nhóm carboxyl hay tách hydrogen từ các a.amin: lysine, ornithin
và arginine, qua đó làm kiềm mt nuôi cấy
Cơ sở sinh hóa: khử nhóm carboxyl(-COOH) của 1 a.amin để giải phóng các amin hay diamin & CO2
Trang 34Mỗi loại men decarboxylase tác động lên 1 cơ chất
3 nhóm enzyme decarboxylase quan trọng thường sử dụng lysine, ornithin và arginine
Là các enzyme cảm ứng
Chúng chỉ được tổng hợp khi mt nuôi cấy có pH acid và có
cơ chất đặc hiệu
Các sản phẩm của chúng làm môi trường chuyển sang kiềm
Phản ứng tách carboxyl xãy ra điều kiện kị khí, là phản ứng không
thuận nghịch và cần coenzyme chung pyridoxal phosphate (vitamin B6)
Sử dụng chất chỉ thị Bromcresol purple (pH 5.2-6.8) hoặc cresol
red
Trang 35Nguyên tắc: Phát hiện khả năng của VK có thể tạo Indol
trong mt canh trypton
Tryptophan là a.amin bị oxy hoá bởi VSV nhờ hệ thống
enzyme - tryptophanase tạo 3 sp biến dưỡng
Indol
Skatol (methyl indol)
Indolacetic acid (IAA)
Sp trung gian: indolpyruvic acid (IPA)
▫ Tryptophan IPA
▫ IPA (tách amin) Indol
▫ IPA (tách carboxyl) Skatol
Thuốc thử Kovac
Thử nghiệm khả năng sinh Indol
Trang 36Hình Phản ứng Indol
Trang 37Thử nghiệm Methyl red
sản phẩm acid bền trong môi trường từ quá trình lên men glucose
Sử dụng methyl red (4.4-6.2 đỏ sang vàng) làm chất chỉ thị để xác định nồng độ ion H+ hiện diện khi 1 VSV lên men glucose
Tất cả VK thuộc nhóm Enterobacteriaceae đều cho phản ứng
MR (+) tính sau 18 – 24 giờ ủ Sau khoảng thời gian (>48 giờ), VSV
MR (+) tính tiếp tục sinh các sản phẩm acid (acid lactic, sucsinic,
acetic và formic) làm giảm pH- vượt quá khả năng ổn định pH của
hệ dung dịch đệm và duy trì tính acid của môi trường (<=4,3)
Các VSV MR (-) tính sau lên men glucose làm acid hoá mt
ttục biến dưỡng các sp này bằng phản ứng tách carboxyl sinh các acetoin trung tính Sự giảm các sp acid và tăng các sp trung tính đẩy pH mt tăng dần về hướng trung tính
Trang 38Sự chính xác của phép thử MR phụ thuộc:
dưỡng glucose
pH và VSV MR (-) tăng tối đa pH mt
Trang 39Hình Phản ứng Methyl red
Trang 40Voges – Proskauer (VP)
Nguyên tắc: phát hiện khả năng tạo sản phẩm trung tính
là acetoin (acetylmethylcarbinol) của VSV trong quá trình lên men glucose
QT biến dưỡng: biến glucose thành a.pyruvic - chất trung
gian chủ yếu trong qt biến dưỡng glucose Từ chất này, VSV
có thể biến đổi theo nhiều con đường sinh hoá khác nhau
Sd thuốc thử là -naphtol
Trang 41Hình Phản ứng VP
Trang 42Nguyên tắc:
Xác định khả năng phân giải urea 2 phân tử ammonia + CO2
do tác động của enzyme urease và làm kiềm hoá môi trường của
VSV
• Cơ chất urea là một diamide của acid carbonic gọi là carbamide
• Enzyme đặc hiệu - urease xúc tác sự thuỷ phân urea tạo 2
phân tử amonia
• Urease là enzyme quan trọng ở VSV liên quan đến sự phân giải các hợp chất hữu cơ
• Enzyme thuộc loại enzyme sẵn có do sự hình thành enzyme
không phụ thuộc có mặt của cơ chất urea
• Cơ sở của phản ứng: tạo các phân tử amonia trong pứng làm
mt bị kiềm hoá và làm chuyển màu thuốc thử
• Sử dụng thuốc thử phenol red có vùng chuyển màu từ pH 6,8 – 8,4 màu chuyển từ vàng đỏ
Urease
Trang 43Hình 7 Phản ứng Urea
Trang 44Khả năng sinh H 2 S
Nguyên tắc: Xác định khả năng sinh H2S từ hợp chất hữu cơ và
vô cơ chứa lưu huỳnh trong qt ptriển của VK tạo các vệt màu đen trên mt nuôi cấy
Sử dụng men - Cysteine desulfurase
Chất chỉ thị pứng là các muối sắt II hoặc sắt III
Pứng H2S với các muối này tạo muối FeS kết tủa màu đen
Trang 45Tính di động
Đánh giá khả năng di động của VSV
VSV chuyển động chủ yếu nhờ các tiên mao (ở VK hình que, 1 số
VK hình cầu) Vi khuẩn di động nhờ 1 hay nhiều tiên mao và vị trí các lông thay đổi tuỳ loài và đk nuôi cấy
1 số VSV có thể chuyển từ trạng thái di động sang trạng thái ko di động (do mất tiêm mao) nhưng đa số ko có khả năng ngược lại
Sử dụng môi trường thạch mềm (nồng độ agar 4 – 5 g/l)
T 0 là yếu tố rất quan trọng, VSV di động ở các T0 khác nhau
Cơ quan di động của VK có bản chất là protein, bị biến tính ở T 0
cao
Có xu hướng mất đi tính di động: VSV trữ tgian dài
Trang 46VK ko di động ở 37 o C sau 48h cần được ủ tiếp ở T 0 21 – 25 o C
trong tgian 5 ngày để khẳng định kết quả Cần quan sát tính di
động ở các tế bào non <24 h nuôi cấy
Trang 47Hình Khả năng di động của vi khuẩn trên môi trường thạch mềm
Trang 48PHƯƠNG PHÁP MỚI TRONG KIỂM NGHIỆM VSV