3. Nội dung nghiên cứu
3.1.2. Thiết kế mồi nhân gen ctxA, rfbQ, IS1358, tcpA và rstR từ V Cholerae
Thiết kế mồi nhân gen gen ctxA
ctxA-F: 5’ TGGGCAGATT CTAGACCTCC TG 3’ ctxA-R: 5’ CGATGATCTTGGAGCATTCCCAC 3’
Trong đó ctxA-F: Mồi xuôi ctxA ctxA-R: Mồi ngược ctxA
Trình tự nucleotide từ 1 đến 22 (Hình 3.4) được dùng để thiết kế mồi xuôi (ctxA-
F). Đoạn trình tự nucleotide từ 541 đến 564 (Hình 3.4) được sử dụng để thiết kế mồi
ngược (ctxA-R).
Thiết kế mồi nhân gen rfbQ từ V. Cholerae
O1 rfbF: 5’AGCGAGTCAATCAACCCATC 3’ O1 rfbR: 5’ CCCAGCATTCGTGACCCGAC 3’ Trong đó O1 rfbF: Mồi xuôi rfbQ O1 rfbR: Mồi ngược rfbQ
Trình tự nucleotide từ 4 đến 23 (Hình 3.6) được dùng để thiết kế mồi xuôi (O1
rfbF). Đoạn trình tự nucleotide từ 173 đến 192 (Hình 3.6) được sử dụng để thiết kế mồi
ngược (O1 rfbR).
Thiết kế mồi nhân gen IS1358 từ V. Cholerae O139
O139 rfbF: 5’ CAGGGAACCGCATGAAGGTCG 3’
O139 rfbR: 5’ AATGAAGCTTCTTGCAAAGCTAACGG 3’ Trong đó O139 rfbF: Mồi xuôi IS1358
O139 rfbR: Mồi ngược IS1358
Trình tự nucleotide từ 1 đến 21 (Hình 3.8) được dùng để thiết kế mồi xuôi (O139
rfbF). Đoạn trình tự nucleotide từ 423 đến 449 (Hình 3.8) được sử dụng để thiết kế mồi
ngược (O139 rfbR).
Thiết kế mồi nhân gen tcpA từ V. Cholerae O1 Classical
tcpA-F: 5’ CAATTATTAAACGCTTTAAGAG 3’ tcpA-R: 5’ TCCACGTGCGTTACGTCTGTTAAG 3’
Trong đó tcpA-F: Mồi xuôi tcpA tcpA-R: Mồi ngược tcpA
Trình tự nucleotide từ 4 đến 25 (Hình 3.10) được dùng để thiết kế mồi xuôi
(tcpA-F). Đoạn trình tự nucleotide từ 596 đến 620 (Hình 3.10) được sử dụng để thiết kế mồi ngược (tcpA-R).
Thiết kế mồi nhân gen rstR từ V. Cholerae O1 EL Tor
rstR-F: 5’AAGATAAGAAGGCTAGCC 3’ rstR-R: 5’TGTACGAAGGAGGCCATC 3’
Trong đó rstR-F: Mồi xuôi rstR rstR-R: Mồi ngược rstR
Trình tự nucleotide từ 1 đến 18 (Hình 3.12) được dùng để thiết kế mồi xuôi (rstR-
F). Đoạn trình tự nucleotide từ 433 đến 451 (Hình 3.12) được sử dụng để thiết kế mồi
ngược (rstR-R).