1.4.1 Điều chỉnh dự án do tư vấn thiết kế không bám sát quy hoặch dẫn đến nhiệm vụ của dự án phải điều chỉnh. Xảy ra tại trạm bơm Nghi Xuyên, tỉnh Hưng Yên thuộc Dự án “Tăng cường quản lý thủy lợi và Cải tạo các hệ thống thủy nông”. Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn đã phê duyệt quy hoạch thủy lợi Hệ thống Bắc Hưng Hải trong đó nhiệm vụ tiếp nguồn của công trình Nghi Xuyên là 20m3/s, hình thức tiếp nguồn là trạm bơm tưới tiêu kết hợp (Quyết định số 1961/QĐ-BNN-KH ngày 13/7/2009 của Bộ trưởng Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn).
Do vậy trạm bơm Nghi Xuyên phải điều chỉnh nhiệm vụ tưới tăng thêm là 20m3/s theo Quyết định số 1961/QĐ-BNN-KH;
1.4.2. Tư vấn lập dự án tính vốn không đầy đủ do chưa tính hết yếu tố trượt giá theo độ dài thời gian thực hiện dự án. Xảy ra ở dự án trạm bơm Hạ Dục, huyện Chương Mỹ, tp Hà Nội dẫn đến dự án bị dãn đoạn hoạt động của dự án chỉ đáp ứng được 50- :- 70% công suất, trạm bơm chưa một giờ hoạt động hết công suất do kênh dẫn tiêu chính chứa được đầu tư.
1.4.3. Tư vấn lập dự án chưa tính hết kinh phí đến bù dẫn đến phải thay đổi hình thức kết cấu công trình cho phù hợp với mặt bằng và điều chỉnh tổng mức do kinh phí đến bù tăng, xảy ra ở trạm bơm Phụng Châu, huyện Chương Mỹ, tp Hà Nội, kênh phải điều chỉnh tư mặt cắt hình thang sang mặt cắt hình chữ nhật thành kênh xây đá hộc, tính thêm phương án đền bù cây cối, hoa màu, vật kiến trúc.
1.4.4. Điều chỉnh dự án do nguồn vốn đầu tư dàn trải, kéo dài, dẫn đến dự án bị trượt giá ngoài tính toán của tư vấn lập dự án, xảy ra ở trạm bơm Vọng Nguyệt, huyện Yên Phong, tỉnh Bắc Ninh, dự án được phê duyệt năm 2003 có tổng mức đầu tư là 11 tỷ, đến năm 2013 sau nhiều lần điều chỉnh dự án tổng mức đầu tư 25 tỷ 1.4.5. Điều chỉnh dự án do tư vấn lập dự án tính toán thuỷ văn thiếu chính xác dẫn đến trạm bơm không có nước để bơm, hoặc máy bơm làm việc không đạt hiệu suất cao nhất, thiết bị máy bơm nhanh xuống cấp, tiêu hao điện năng lớn.
1.4.6. Điều chỉnh dự án do tư vấn lập dự án chọn máy không phù hợp với cột nước địa hình; điểm đấu công xuất không đáp ứng được nhu cầu của máy bơm.
1.4.7. Tư vấn lập dự án chưa đề cấp hết phần khối lượng xử lý nền; xử lý mạch đùn, mạch sủi móng nhà máy, móng bể hút do thiếu tài liệu địa chất, tài liệu địa chất thiếu chính xác hoặc tính toán thuyết minh thiết kế cơ sở trong giai đoạn lập dự án thiếu chính xác
1.4.8. Thiết kế cơ sở không phù hợp với địa hình hiện trạng khu vực đầu mối, hệ thống kênh mương, đường điện cao thế do tài liệu địa hình thiếu chính xác, do cán bộ thiết kế quan liệu không rà soát kỹ thực địa dẫn đến phải thay đổi quy mô công trình, tổng mức đầu tư phải điều chỉnh.
Nói chung, những điều chỉnh dự án do yếu tố khách quan, yếu tố chủ quan mang lại, nhưng đa phần nguyên nhân chủ yếu vẫn là liên quan đến tư vấn khảo sát, lập dự án.
