KTV đưa ra kết luận về tính trung thực và hợp lý của BCTC trên khía cạnh trọng yếu do các nghiệp vụ kế toán xảy ra nhiều trong tời gian dài, KTV không thể kiểm tra toàn bộ nên cần tiến hành kiểm tra chọn mẫu đại diện để đưa ra kết luận về tổng thể. Doanh thu và phải thu khách hàng là khoản mục quan trọng, xảy ra nhiều nghiệp vụ, chứa đựng nhiều sai phạm do ảnh hưởng đến các chỉ tiêu quan trọng như lợi nhuận, vì vậy khi chọn mẫu kiểm toán khoản mục càng yêu cầu tính đại diện của mẫu chọn phải cao.
Hiện nay, KTV tiến hành lấy mẫu dựa trên kinh nghiệm và xét đoán chủ quan chủa mình mà chưa có bất cứ phương pháp nào khác. Với cách chọn mẫu này tiết kiệm thời gian tuy nhiên không phải KTV nào cũng có đầy đủ kinh nghiệm, chuyên môn chọn những mẫu có tính đại diện cao. Những mẫu mà quy mô quá lớn sẽ lãng phí thời gian còn quá nhỏ thì tính đại diện không đủ cho tổng thẻ. Và không chỉ về quy mô, mẫu được chọn phải thể hiện được đặc điểm, tính chất của tổng thể. Ví dụ tại Công ty XYZ, KTV đã chú ý tới khi chọn mẫu phải có đủ các nghiệp vụ của từng cửa hàng và hai hoạt động bán lẻ và bán hàng theo đơn vì có sự khác biệt rất lớn về hoạt động trong mỗi chủ thể.
Như vây, khi mẫu không đại diện được cho tổng thể thì tất yếu kết luận kiểm toán sẽ có sự sai lầm và ảnh hưởng tới rủi ro kiểm toán. Vì vậy, đây là một tồn tại cần thay đổi trong hoạt động kiểm toán của công ty để chất lượng kiểm toán được đảm bảo hơn.