Kể từ khi thực hiện Luật Quản lý thuế, công tác miễn, giảm thuế đã thực hiện tương đối kịp thời, tạo điều kiện thuận lợi cho NNT. Tuy nhiên, công tác quản lý miễm, giảm chất lượng còn thấp, nhiều doanh nghiệp đã lợi dụng sơ hở của chính sách ưu đãi đầu tư để kê khai miễm giảm thuế không đúng thực chất, gây thất thu cho NSNN.
Bảng 2.8. Một số doanh nghiệp NQD kê khai sai doanh thu năm 2012
Đơn vị: Tỷ đồng
Tên DN Doanh thu theo quyết toán
Doanh thu xác
định lại Chênh lệch
Công ty CP Gạch
ngói Nam Giang 0.032 0.034 0.002
Công ty TNHH
Tân Bình Mạnh 0.026 0.031 0.005
Công ty TNHH
Thắng Hanh 0.012 0.013 0.001
... ... ... ...
Nguồn: Chi cục Thuế huyện Nam Đàn
Để xác định được số thuế TNDN mà doanh nghiệp NQD phải nộp thì cần phải xác định chính xác doanh thu tính thuế để tính thu nhập chịu thuế. Căn cứ để xác định doanh thu là hoá đơn, chứng từ, sổ sách kế toán.
Trong thời gian qua, Đội Kiểm tra - Quản lý nợ đã phối hợp cùng phòng kiểm tra của Cục thuế tiến hành kiểm tra một số doanh nghiệp NQD trên địa bàn huyện. Qua công tác kiểm tra, cán bộ thuế đã phát hiện nhiều doanh nghiệp kê khai doanh thu thấp hơn so với thực tế thu tiền về.
Một số doanh nghiệp kinh doanh trong lĩnh vực thương mại, do chủng loại hàng hoá phong phú, đa dạng nên việc điều tra doanh số rất khó khăn. Các doanh nghiệp NQD này không phản ánh đúng giá cả hàng hoá khi tiêu thụ, hàng hoá tiêu thụ nhiều phản ánh ít, có những trường hợp bán nợ chưa thu tiền không kê khai thuế mà ghi là hàng tồn kho để có thuế âm. Hoặc nhập hàng về đã bán với gia thực tế rất cao nhưng phản ánh trên hoá đơn thì chỉ phản ánh với giá thấp hơn nhiều.
Thông qua công tác kiểm tra 6 doanh nghiệp NQD trên địa bàn đã tăng doanh thu 0.8 tỷ đồng, tăng tương ứng 0.022 tỷ đồng tiền thuế TNDN. Cụ thể: Công ty TNHH Tân Bình Mạnh tăng doanh thu 0.005 tỷ đồng, công ty CP Gạch ngói Nam Giang tăng doanh thu 0.002 tỷ đồng …
Đội Kiểm tra - Quản lý nợ đã thực hiện tốt công tác kiểm tra các doanh nghiệp để quản lý tốt việc kê khai doanh thu để tính thuế TNDN, nếu không thực hiện kiểm tra mà chỉ thu theo tờ khai thì số thuế thất thu sẽ rất lớn.
Nhìn chung, kết quả thu thuế những năm qua là khá tốt. Đạt được các kết quả đó trước hết phải kể đến nỗ lực đổi mới, khắc phục những thiếu sót trong công tác quản lý thu thuế của cơ quan thuế. Bên cạnh đó, công tác quản lý NNT đã được tăng cường hơn. Chi Cục Thuế đã quan tâm khai thác triệt để nguồn thu trên cơ sở thực hiện đúng pháp luật. Chất lượng công tác quản lý doanh số thuế cũng đã được nâng cao. Về phía doanh nghiệp, hoạt động sản xuất kinh doanh trong những năm vừa qua đã có bước phát triển về quy mô, doanh số và lĩnh vực hoạt động. Việc áp dụng chế độ kế toán, sổ sách, hóa đơn, chứng từ ở các doanh nghiệp được thực hiện ngày càng chuyên nghiệp hơn đã tạo điều kiện thuận lợi cho cơ quan thuế trong công tác quản lý thuế.
Tuy nhiên, bên cạnh những con số khả quan nêu trên thì vẫn còn tồn tại một số vấn đề bất cập cần sớm xem xét khắc phục, như: trình độ tổ chức cũng như quy mô của nhiều cơ sở kinh doanh chưa cao; trình độ chuyên môn cũng như sự hiểu biết về luật thuế còn nhiều hạn chế nên trong quá trình thực hiện còn nhiều sai sót hoặc là vô tình hoặc cố ý, làm giảm tổng thu NSNN; một số doanh nghiệp lợi dụng quy trình tự tính, tự khai thuế, gian lận trong việc kê khai nhằm mục đích trốn thuế. Về phía
cán bộ thuế, tuy đã có nhiều cố gắng nhưng ở khâu kiểm soát vẫn chưa thật kịp thời, vẫn còn tình trạng thất thu thuế, nhiều doanh nghiệp vẫn nợ dọng thuế kéo dài.