Theo Nghị quyết số 49-NQ/TW, sau 2010, Viện kiểm sỏt được tổ chức phự hợp với hệ thống tổ chức của Toà ỏn. Nghị quyết số 49-NQ/TW chỉ rừ, tổ chức hệ thống Toà ỏn theo thẩm quyền xột xử, khụng phụ thuộc vào đơn vị hành chớnh. Như vậy, hệ thống tổ chức của Viện kiểm sỏt trong tương quan với hệ thống tổ chức Toà ỏn theo thẩm quyền xột xử sẽ được xỏc định gồm cỳ 4 cấp như sau:
- Viện kiểm sỏt sơ thẩm khu vực được tổ chức tương đương với Toà ỏn sơ thẩm khu vực, được tổ chức tại một hoặc một số đơn vị cấp huyện. Viện kiểm sỏt sơ thẩm khu vực sẽ được thành lập trờn cơ sở một hoặc một số Viện kiểm sỏt cấp huyện trong phạm vi địa hạt tư phỏp của Toà ỏn sơ thẩm khu vực.
- Cỏc Viện kiểm sỏt phỳc thẩm (cấp tỉnh) được tổ chức tương đương với cỏc Toà ỏn phỳc thẩm. Viện kiểm sỏt phỳc thẩm sẽ được thành lập chủ yếu trờn cơ sở Viện kiểm sỏt nhừn dừn tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương trong phạm vi địa hạt tư phỏp của Toà ỏn phỳc thẩm (cấp tỉnh).
- Cỏc Viện kiểm sỏt cấp cao được tổ chức theo khu vực tương đương với cỏc Toà thượng thẩm.
- Viện kiểm sỏt tối cao được tổ chức tương đương với Toà ỏn tối cao. Cựng với việc nờu rừ Viện kiểm sỏt được tổ chức phự hợp với hệ thống tổ chức của Toà ỏn, cỏc Nghị quyết của Đảng cũng chỉ rừ phải tăng cường trỏch nhiệm cụng tố trong hoạt động điều tra, thực hiện cơ chế cụng tố gắn với hoạt động điều tra. Hoạt động cụng tố phải được thực hiện ngay từ
khi khởi tố vụ ỏn và trong suốt quỏ trỡnh tố tụng nhằm bảo đảm khụng bỏ lọt tội phạm và người phạm tội, khụng làm oan người vụ tội, xử lý kịp thời những trường hợp sai phạm của những người tiến hành tố tụng khi thi hành nhiệm vụ. Như vậy, số lượng Viện kiểm sỏt cỏc cấp khụng nhất thiết phải tương đương với số lượng Toà ỏn cỏc cấp. Hệ thống tổ chức của Viện kiểm sỏt phải phự hợp cả với hệ thống tổ chức của Cơ quan điều tra, bảo đảm khả năng tăng cường cụng tố trong hoạt động điều tra, bảo đảm sự gắn kết chặt chẽ, liờn tục hoạt động cụng tố với hoạt động điều tra của Cơ quan điều tra. Điều đỳ cỳ nghĩa là, tuy Viện kiểm sỏt được tổ chức thành 4 cấp phự hợp với tổ chức của Toà ỏn nhưng điều đỳ khụng phải là cứ ở đừu cỳ Toà ỏn thỡ ở đỳ cỳ Viện kiểm sỏt, nhất là ở cấp sơ thẩm khu vực. Sự phự hợp của Viện kiểm sỏt và Cơ quan điều tra về mặt tổ chức là bảo đảm quan trọng, cỳ tớnh quyết định cho hiệu quả, chất lượng hoạt động cụng tố.