3.2.5 Tăng cường sự phối hợp giữa Hải quan Nội Bài với các banngành liên quan và với doanh nghiệp. ngành liên quan và với doanh nghiệp.
Ngành Hải quan không thể hoạt động được nếu chỉ làm việc riêng lẻ bởi trong quá trình thực hiện các nghiệp vụ thông quan cho hàng hóa XNK của Hải quan có liên quan đến nhiều cơ quan khác như cơ quan thuế, ngân hàng, công an...Nếu không có sự phối hợp goạt động với các cơ quan có liên quan thì Hải quan không thể thông quan nhanh được cũng như không thể hoàn thành được nhiệm vụ mà nhà nước đã giao phó. Chúng ta có thể thấy, theo quy định, với những mặt hàng phải nộp thuế mới được cho thông quan, doanhnghiệp phải nộp thuế tại các ngân hàng thương mại. Tiền sau đó chuyển đến kho bạc (tài khoản thuế của hải quan nằm ở kho bạc). Doanh nghiệp phải chờ kho bạc tổng hợp, gửi thông báo đến cơ quan hải quan và khi hải quan nhận được thông báo mới cho thông quan. Với quy trình như vậy, doanh nghiệp rất mất thời gian chờ thông quan. Tuy nhiên, từ khi hải quan liên kết với ngân hàng, sau khi doanh nghiệp nộp tiền vào ngân hàng, các ngân hàng thương mại ngay lập tức báo cho hải quan để hải quan kịp thời ra quyết định thông quan.
Trong công tác KTSTQ thì sự phối hợp giữa Hải quan với các cơ quan có liên quan lại càng quan trọng hơn vì việc phát hiện vi phạm và buộc thực hiện nộp thuế hải quan cần có sự hỗ trợ đắc lực của ngân hàng và cơ quan công an. Chi cục Hải quan CKSBQT Nội Bài cần phối hợp với công an thành phố Hà Nội, các hãng hàng không hoạt động tại Sân bay Nội Bài, cơ quan thuế tại Hà Nội và các ngân hàng trên địa bàn của mình trong vấn đề chống buôn lậu, gian lận thương mại và thực hiện thu thuế, tiến tới thu thuế qua các ngân hàng và bảo lãnh thuế điện tử.