2. Mục tiờu và nội dung nghiờn cứu
1.5.2. Cấu trỳc hệ gen virus HIV
Hệ gen của HIV-1 nằm trong phần lừi của virus và bao gồm hai sợi ARN (+) đơn, mỗi sợi cú chiều dài khoảng 9,8 kb và cú 9 gen mó húa cho 15 protein khỏc nhau (Hỡnh 1.2).
Trờn mỗi sợi ARN cú 3 gen cấu trỳc là gag, pol và env; trong đú gag cú nghĩa “group-antigen” (khỏng nguyờn nhúm), pol là “polymerase” và env là “envelope” (vỏ). Cỏc gen gag và env mó húa cho nucleocapsid và glycoprotein của màng virus; gen pol mó húa cho 3 enzym: reverse transcriptase, integrase và protease. Ngoài ra, HIV-1 cũn cú 6 gen (vif, vpu, vpr, tat, rev và nef) ở vựng ARN khoảng 9 kb [35].
Cỏc hỡnh chữ nhật là khung đọc mở cho cỏc gen: gag (màu nõu), pol (màu vàng), và envi (màu xanh). Phức hơp cỏc gen quy định và phụ trợ HIV-1 mó húa (thể hiện trong màu hồng). Tat và Rev intron đƣợc mụ tả nhƣ đƣờng ngang. Cỏc lĩnh vực Gag lớn ma trận (MA), capsid (CA), nucleocapsid (NC), và p6 và bề mặt MT (SU) và màng (TM) glycoprotein (gp120 và gp41, vựng lặp dài (LTR). (Nguồn: http://openi.nlm.nih.gov/faq.php#copyright)
Chức năng gen gag là nhúm polyprotein chịu trỏch nhiệm khỏng nguyờn (goup antigens-ag); gen pol là enzym chịu trỏch nhiệm phiờn mó ARNse H và cú
chức năng intergrase. Gen env là protein vỏ, nằm trong lớp màng lipid, xỏc định ỏi tớnh của virus. Protein điều hũa (Tat, Rev, Nef) và protein sinh trƣởng (Vif, Vpu, Vpr). Cỏc thành phần của gen đƣợc gọi là cỏc đoạn lặp dài (long terminal repeats- LTR). Cỏc LTR cú chứa cỏc yếu tố đỏp ứng điều hũa đặc biệt sự biểu hiện gen khi sao chộp virus nhƣ promoter, yếu tố tăng cƣờng và cỏc yếu tố cần cho sự polyadenylate húa ARN thụng tin hiệu ứng [9], [10], [14], [24].
Do tốc độ sinh sản nhanh của HIV – 1, cú khoảng 10 triệu hạt virus mới đƣợc tạo ra mỗi ngày và tỷ lệ sai sút rất cao của enzym reverse transriptase (1/10.000 base) dẫn đến tỡnh trạng khỏng thuốc phổ biến ở những bệnh nhõn nhiễm bệnh thậm chớ khi chƣa dựng thuốc. Cuối mỗi chuỗi ARN là cỏc trỡnh tự đƣợc gọi là trỡnh tự lặp lại dài (LTRs) đúng vai trũ trong việc kiểm soỏt sự nhõn lờn cũng nhƣ điều hũa quỏ trỡnh tổng hợp protein của virus (Hỡnh 2).
- Khả năng tồn tại trong mụi trƣờng bờn ngoài: HIV là virus dễ bị tiờu diệt bởi cỏc tỏc nhõn lý hoỏ ở mụi trƣờng bờn ngoài cơ thể. Cỏc nghiờn cứu của Trung tõm kiểm soỏt bệnh tật Hoa Kỳ đó chỉ ra rằng, trong giọt mỏu hoặc dịch cơ thể khụ, HIV chỉ cú thể tồn tại đƣợc từ vài phỳt đến vài giờ tuỳ thuộc vào mụi trƣờng. HIV cũng rất dễ bị tiờu diệt bởi tỏc động của nhiệt độ và chất sỏt khuẩn, nú bị tiờu diệt sau 30 phỳt ngõm trong cồn 70o, dung dịch Cloramin 1%, nƣớc Javen 1%. Trong bơm kim tiờm cú chứa mỏu khụng bị khụ, chỳng cú thể tồn tại thậm chớ đến vài ngày, trong xỏc chết bệnh nhõn AIDS, chƣa rừ HIV cú thể tồn tại bao lõu nhƣng một số nghiờn cứu cho rằng chỳng tồn tại trong vũng 24 giờ. Tuy nhiờn, ở nhiệt độ dƣới 0oC, tia X, tia cực tớm khụng giết đƣợc HIV [1], [22].
Virus HIV lõy truyền qua cỏc phƣơng thức: quan hệ tỡnh dục khụng an toàn, dựng chung kim tiờm chớch ma tỳy, đƣờng truyền mỏu và phụ nữ nhiễm HIV cú thể truyền virus cho con.