Trong những năm qua, phân bón vi sinh vật ựã thể hiện vai trò quan trọng trong sản xuất nông nghiệp.
Tuy nhiên do hệ vi sinh vật rất ựa dạng và mỗi vi sinh vật trong ựất ựều chịu nhiều tác ựộng qua lại của các vi sinh vật khác cũng như ựiều kiện môi trường nên hiệu quả của các sản phẩm vi sinh trong các ựiều kiện khác nhau không giống nhau. Tại nhiều quốc gia như Ấn độ, Trung Quốc; đức; Nhật, Mỹ, Anh, Úc... người ta ngày càng chú ý nhiều ựến các sản phẩm phân vi sinh vật hỗn hợp bao gồm tập hợp các nhóm vi sinh vật cố ựịnh nitơ, phân giải lân, kắch thắch sinh trưởng thực vật, ựối kháng vi sinh vật gây bệnh vùng rễ cây trồng do tác dụng tổng hợp của nó ựối với ựất, cây trồng và môi trường sinh thái. Các sản phẩm phân bón vi sinh vật chuyên tắnh như cố ựịnh nitơ hay phân giải lân ựang dần dần ựược thay bằng sản phẩm vi sinh vật hỗn hợp. Thực tế sử dụng ở nhiều nơi cho thấy, phân vi sinh vật ựa chủng trên nền hữu cơ ựang là nhân tố quan trọng trong sản xuất nông phẩm hữu cơ. Việt Nam là ựất nước nông nghiệp có nhiều lợi thế về ựiều kiện khắ hậu, ựất ựai, sự ựa dạng sinh học cũng như nhân lực sản xuất. Nông nghiệp Việt Nam ựã có nhiều phát triền vượt bậc, song lợi nhuận do sản xuất nông nghiệp mang lại vẫn còn rất thấp. để phù hợp với cơ chế thị trường nông sản Việt Nam cần nâng cao chất lượng nhằm ựáp ứng nhu cầu ngày càng cao của thị trường trong nước và quốc tế. Nông sản hữu cơ ựang là sản phẩm ựược người tiêu dùng ở các nước công nghiệp ưa chuộng và có tiềm năng mở rộng thị trường ngày càng lớn. Quản lý dinh dưỡng tổng hợp cây trồng kết hợp với quản lý dịch hại tổng hợp là ựiều kiện tiên quyết cho sản xuất bền vững các nông sản an toàn. Kết hợp các tiến bộ kỹ thuật về phân bón vi sinh vật, phân bón sinh học và kiểm soát sinh học dịch hại cây trồng, tạo ra giải pháp tổng hợp chăm bón cây và ựất trồng là xu hướng phát triển chắnh của nền nông nghiệp hữu cơ bền vững, trong ựó phân vi sinh vật là yếu tố cơ sở quan trọng.
Sản phẩm phân bón vi sinh vật trong tương lai không xa sẽ ựược tạo ra từ tổ hợp các vi sinh vật nhiều hoạt tắnh. Khi ựó vi sinh vật trong phân
bón vừa có nhiệm vụ cung cấp, chuyển hóa chất dinh dưỡng, tạo ựiều kiện cho cây trồng sử dụng dinh dưỡng hiệu quả hơn, vừa có tác dụng nâng cao ựộ phì của ựất trồng, giảm thiểu các tác ựộng sinh học và không sinh học bất lợi ựối với cây và ựất trồng