Do thời gian tiến hành nghiên cứu có hạn, chúng tôi chỉ lựa chọn phân tích, nhận dạng một số protein từ các kết quả điện di 2-DE thu được. Sau khi tiến hành so sánh trên 2 bản điện di 2 chiều 2-DE đã loại bỏ các ảnh hưởng của Tris, bản gel có dải pH 4-7, kích thước 17cm được chúng tôi lựa chọn. 7 vùng protein bền nhiệt phù hợp được đánh dấu, lựa chọn, thủy phân bằng trypsin và nhận dạng bằng hệ sắc ký lỏng nano một chiều kết nối trực tiếp khối phổ liên tục (1DnanoLC-ESI-MS/MS). Phổ MS/MS của các mảnh peptide thu được so sánh với phổ MS/MS lí thuyết trên cơ sở dữ liệu NCBInr dưới sự hỗ trợ của phần mền Mascot v1.8.
Kết quả là trong 7 vùng đã lựa chọn, có 7 protein đã được nhận dạng là Alpha-1 acid glycoprotein, Haptoglobin, Haptoglobin alpha2 chain, Apolipoprotein A-I, Alpha1 antitrypsin, Alpha 2- HS- Glycoprotein và Transthyretin. Kết quả nhận dạng các protein chịu nhiệt đã được đánh dấu trên bản điện di 2-DE được thể hiện trong bảng 9.
Bảng 9 : Kết quả nhận dạng các protein chịu nhiệt bằng phương pháp 2DE-LC-MS/MS
STT Tên protein GI Number Swissprot ID KLPT pI
1 Transthyretin gi|1181953 P02766 13,8 kDa 5.0-5.23
2 Haptoglobin alpha 2 chain gi|229323 P00738 16,8 kDa 5.13-5.4
3 Apolipoprotein AI gi|37499465 P02647 23,1 kDa 5.56
4 Haptoglobin gi|4826762 P00738 45,9 kDa 6.13
5 Alpha1 antitrypsin gi|1942629 P01009 55 kDa 4.8-5.0
6 Alpha 2- HS- Glycoprotein gi|4502005 P02765 55,4 kDa 4.5-4.7 7 Alpha 1 acid Glycoprotein gi|1197209 P02763 45 kDa 4.0-4.2 Tất cả 7 protein được nhận dạng bằng hệ 2DE-1DnanoLC-MS/MS trên cơ sở dữ liệu NCBI được xác nhận tính hợp lệ trên cơ sở dữ liệu protein Swiss-Prot của viện tin sinh học Thụy Sĩ với các thông số như tên protein, số đăng ký, khối lượng phân tử, pI, trình tự axit amin và vị trí trên bản điện di 2DE chuẩn. Danh sách các protein thu được hoàn toàn phù hợp với nghiên cứu về protein bền nhiệt trong huyết thanh đã công bố của Goufman [22].