- Bệnh phẩm phõn được cấy trờn mụi trường ức chế chọn lọc cho cỏc vi khuẩn đường ruột như Endo, Mac- Conkey, DCL, SMAC. Việc xỏc định
E.coli dựa vào cỏc tớnh chất sinh vật húa học, nhưng chỉ khoảng 90% số
chủng E.coli lờn men đường lactose, một số chủng DEC (Diarrheagenic
Escherichia coli: E.coli gõy tiờu chảy) chủ yếu là cỏc EIEC khụng cú khả
năng lờn men đường này. Test indole dương tớnh ở 99% chủng E.coli. Đõy là test đơn giản nhất để phõn biệt E.coli với cỏc thành viờn khỏc trong họ vi khuẩn đường ruột. Tiếp theo, định loại E.coli bằng khỏng huyết thanh mẫu
đặc hiệu với cỏc yếu tố khỏng nguyờn O, H, K. Tuy nhiờn phương phỏp này thường chỉ cú giỏ trị phõn biệt E.coli với cỏc thành viờn khỏc trong họ vi khuẩn đường ruột. Nú hầu như cũng khụng thể phõn biệt giữa cỏc DEC với nhau và DEC với cỏc E.coli trong hệ vi khuẩn chớ ở đại tràng của người do cỏc tớnh chất sinh vật húa học của nhiều DEC giống nhau và giống E.coli
khụng gõy tiờu chảy [14, 35].
Trước khi cú phương phỏp định loại E.coli gõy tiờu chảy dựa trờn yếu tố độc lực đặc hiệu, phương phỏp định týp bằng cỏc khỏng huyết thanh mẫu với cỏc yếu tố khỏng nguyờn O, H, K là một phương phỏp chiếm ưu thế. Tuy nhiờn ngày càng xuất hiện nhiều týp huyết thanh ở cỏc nhúm DEC khỏc. Hơn nữa, cỏc huyết thanh nhiều khi khụng cú đủ để xỏc định cỏc chủng DEC.
Đồng thời người ta cũng thấy với cựng một týp huyết thanh cú thể gõy ra cỏc bệnh cảnh lõm sàng khỏc nhau thuộc hai nhúm DEC gõy tiờu chảy khỏc nhau. Vớ dụ: bệnh cảnh lõm sàng do ETEC (tiờu chảy phõn toàn nước khụng cú mỏu) và EIEC (tiờu chảy phõn nhầy mũi) là hoàn toàn khỏc nhau nhưng cú thể cú chung một týp huyết thanh gõy ra: O124: H9, O167: H9 [35].
Do sựđa dạng về cấu trỳc khỏng nguyờn nờn đó hạn chếđộ nhạy và độđặc hiệu của phản ứng này. Thờm vào đú phương phỏp này cũng tốn kộm và mất rất nhiều thời gian do cú quỏ nhiều týp huyết thanh của E.coli. Đồng thời một số
chủng vi khuẩn gõy bệnh đường ruột khỏc cú thể phản ứng chộo với khỏng huyết thanh của E.coli như Shigella, Samonella, V. cholerae non 01 [35].