* Về khâu hạch toán ban đầu: Chưa lập chứng từ phản ánh phế liệu thu hồi, và nguyên vật liệu thừa sử dụng không hết sau quá trình sản xuất.
* Do công ty áp dụng mô hình tổ chức bộ máy kế toán tập trung nên đòi hỏi các phần hành các nhân viên thống kê phải thu thập, xử lý chứng từ và định kỳ
chuyển về phòng kế toán của công ty để tập hợp và hạch toán. Trên thực tế thì các chứng từ này được chuyển về phòng kế toán vào cuối tháng, khi đó các kế toán viên bắt đầu xử lý số liệu do vậy một khối lượng lớn công việc của kế toán thường dồn vào những ngày cuối tháng dẫn đến việc hạch toán thiếu chính xác.
*Hạch toán chi tiết nguyên vật liệu: Công ty đang sử dụng phương pháp thẻ song song để hạch toán chi tiết nguyên vật liệu. Phương pháp này tuy đơn giản, dễ làm nhưng công việc ghi chép trùng lặp về mặt số lượng, việc kiểm tra đối chiếu số liệu giữa kho và phòng kế toán chỉ tiến hành định kỳ nên hạn chế tác dụng kiểm tra kịp thời. Mặt khác, tình hình nhập xuất diễn ra hàng ngày, nhu cầu của công ty về NVL ngày càng lớn vì thể sử dụng phương pháp này là không phù hợp, tốn nhiều công sức.
* Việc lập hệ thống danh điểm và sổ danh điểm NVL: Công ty hiện nay đang sử dụng một số lượng lớn NVL, đa dạng về chủng loại, quy cách, mà không lập danh điểm NVL cũng như chưa sử dụng sổ danh điểm NVL để thống nhất chung về mã vật tư, tên gọi, quy cách,… của vật tư. Do đó đã gây khó khăn cho việc theo dõi NVL, không có sự thống nhất giữa thủ kho và kế toán vật tư trong việc ghi chép tên các loại NVL, làm cho công tác quản lý còng nh hạch toán còn gặp nhiều khó khăn.
* Về hệ thống chứng từ sổ sách công ty vẫn áp dụng những chứng từ bắt buộc về hàng tồn kho như phiếu nhập vật tư, phiếu xuất vật tư..Tuy nhiên còn một số phiếu còn thiếu phần định khoản, ngày tháng nhập xuất( phiếu xuất kho kiêm vận chuyển nội bộ) dẫn đến khó lắm bắt tình hình nhập xuất tồn của vật liệu.
* Tài khoản sử dụng: do đặc thù của công ty là có nhiều chủng loại lên kế toán chi tiết đến tài khoản cấp 4 mới được rõ ràng lên trong quá trình hạch toán vẫn còn nhiều nhầm lẫn do hạch toán nhiều chủng loại.
- Công việc kiểm kê tiến hành 6 tháng một lần đã mang lại không ít hạn chế : không kịp thời ngăn ngừa những ảnh hưởng xấu như hao hụt, mất mát, kém phẩm chất của NVL từ những tháng trước mà 6 tháng sau mới phát hiện ra thì khó khăn trong việc tìm ra nguyên nhân, ảnh hưởng trực tiếp tới quá trình sản xuất của Công ty.