, 11 Khoai sọ chân trắng 12 Phước my 13 Phứa lanh 14 Khoai sọ núi 4.2.3.3 Mồi Uq95-
4.2.4. Phân tắch kết quả phần PCR-RAPD bằng phần mềm Ntsyspc2
Từ kết quả của RAPD và SSR chúng tôi nhận thấy tất cả 5 mồi RAPD và 5 cặp mồi SSR ựều xuất hiện vệt băng DNA (allen) với kắch thước khác nhaụ đối với chỉ thị RAPD kắch thước trong khoảng từ 100 bp ựến 900 bp. Kết quả thu ựược tổng số 67 allen/5 locus với giá trị trung bình 13,4 allen/1 locus. Số băng ựa hình là 47 (chiếm 70,1%). Số lượng allen trên 1 locus dao ựộng từ 9- 16, Với locus OPM12 biểu hiện số allen lớn nhất 16 allen. Locus OPO 07 tỷ lệ băng ựơn hình cao nhất (bảng 4.5). Số allen ựa hình càng cao thì việc phân loại mối quan hệ di truyền chắnh xác càng caọ đối với 5 locus tỷ lệ allen ựa hình cao, dao ựộng 61,1- 87,5% ựiều này ựã chứng tỏ sự khác nhau giữa các vùng trong genome của các giống khoai môn - sọ.
Bảng 4.8. Số allen nhân lên bằng sử dụng mồi RAPD và SSR
Mồi RAPD Tổng số allen Số allen ựa hình Tỷ lệ số băng ựa hình
OPM-12 16 14 87,5 OPA-12 13 8 61,5 OPN 07 18 11 61,1 OPN 14 9 7 77,8 OPO 01 11 7 63,6 Tổng 67 47 70,1
Mồi SSR Tổng số allen Số allen ựa hình Tỷ lệ số băng ựa hình
Uq 75-100 2 40% uq95-219 4 2 50,0 uq77-174 2 66,6 uq82-117 4 1 25,0 uq90-102 50,0 Tổng 20 9 45,0%
Trường đại học Nông nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ 57 Trong 5 chỉ thị SSR sử dụng tổng số allen nhân lên là 20, trung bình mỗi chỉ thị nhân ựược 4 vùng. Tổng số allen ựa hình là 9 chiếm 45%, số allen ựơn hình là 11 chiếm 55%. Locus Uq 75-100 nhân lên ựược số allen cao nhất, tuy nhiên chỉ có 2 allen ựa hình. Locus Uq 82-117 allen ựa hình thấp nhất (1 allen).
Từ kết quả sử dụng 2 chỉ thị RAPD và SSR trên trường ựiện di chúng tôi tiến hành ghi ựiểm (0) và (1). điểm 0 tức không có allen, ựiểm 1 có allen ở một vị trắ trên các giống. Bằng phần mềm chuyên dụng NTSYSpc 2.1 chúng tôi ựã tắnh toán ựược hệ số tương ựồng di truyền và sơ ựồ hình cây quan hệ di truyền của tập ựoàn 60 mẫu giống (hình 4.10). Dựa và kết quả này chúng ta có thể biết ựược mối quan hệ giữa các mẫu giống, từ ựó nhóm chúng thành từng nhóm ựể có hướng sử dụng và bảo tồn hiệu quả. Qua hình 4.10 chúng tôi nhận thấy rằng các giống có hệ số tương ựồng di truyền giao ựộng từ 0,61 ựến 1,00. Ở ựây có 5 nhóm giống có hệ số tương ựồng di truyền là 1,00 tức giống hệt nhau về mặt di truyền. Nhóm 1 gồm 4 mẫu: Khoai sọ Bắc Giang, Khoai sọ Hà Nội, Khoai sọ Hòa Bình và Khoai sọ Hà Bắc. Nhóm 2 gồm 2 mẫu: Khoai sọ trứng dọc tắm Bắc Giang và Tuyên Quang. Nhóm 3 gồm: Khoai sọ trắng Bắc Kạn, Khoai sọ trắng Hòa Bình và Khoai sọ trắng Bắc Giang. Nhóm 4 gồm: Khoai sọ Sơn La và Khoai sọ Quảng Ninh. Nhóm 5 gồm: Cỏ hát hang Hòa Bình và Sơn Lạ Trên thực tế, theo dõi ựặc ựiểm nông sinh học của các giống trong cùng một nhóm ở trên thấy chúng giống hệt nhau về kiểu hình. Có lẽ các giống trong cùng một nhóm ở trên chúng là một giống nhưng ựược trồng ở nhiều nơi khác nhaụ điều này rất có ý nghĩa vì thay bằng bảo tồn nhiều giống chúng ta chỉ cần bảo tồn 1 giống chuẩn là ựủ, giảm ựược chi phắ và công sức bảo tồn.
Xét về tổng thể 60 mẫu giống khoai môn sọ ựược chia ra làm 2 nhóm chắnh, nhóm 1 có duy nhất một mẫu giống là Khoai môn, nhóm 2 gồm 59 mẫu giống còn lạị Tuy nhiên xét ở hệ số tương ựồng là 0,8 chúng tôi phân loại 60 mẫu giống khoai môn- sọ thành 6 nhóm:
Trường đại học Nông nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ 58 - Nhóm 1 bao gồm 31 mẫu: Khoai sọ ựồi, Khoai sọ tắa, Phước mán, Hâu pun chỏ, Phước, 2 mẫu Khoai sọ trứng dọc tắm Bắc Giang và Tuyên Quang, Khoai sọ dọc tắa, phước ựanh, Co cay, Khoai tròn, Cò trơ, Khoai sọ Lạng Sơn, Khoai sọ Bắc Giang, Khoai sọ Hà Bắc, Khoai sọ Hà Nội, Khoai sọ Hòa Bình, Khoai sọ Sơn La, Khoai sọ Quảng Ninh, Tằm a quay, Khoai trại, Khoai sọ muộn, Khoai sọ chân trắng, Hậu, Hậu vàng, Phước hỏm, có lằng, Khoai sọ nương, Phước bơn bet, Phước hỏm Lạng Sơn, Phước my 2.
- Nhóm 2 bao gồm 6 mẫu giống: Khoai sọ tắm, Hậu rão, Hậu ựành ựao, Khoai sọ trắng Bắc Kạn, Khoai sọ trắng Hòa Bình, Khoai sọ trắng Bắc Giang.
- Nhóm 3 gồm 15 mẫu: Phước ựao, Mặc phước nành, Mắng phứa, Phước my 1, Mặc phước kịp, Phước lành, Hậu xiền, Hậu zan, Hậu hòi ựang, Khoai chân chó, Co co chu hang, Cỏ hát hang Sơn La, Cỏ hát hang Bắc Giang, Khoai bế em.
- Nhóm 4 có duy nhất 1 giống: Khoai sọ nương.
- Nhóm 5 gồm 6 mẫu giống: Khoai sọ núi, Khoai muộn, Khoai ấp ựen, phước pép, Phước lớn, Srôclock.
- Nhóm 6 có duy nhất một giống: Khoai môn.
Khi theo dõi ựặc ựiểm nông sinh học các mẫu giống sau ựó so sánh
với kết quả chỉ thị phân tử chúng tôi nhận thấy các mẫu giống trong cùng một nhóm về cơ bản có ựặc ựiểm nông sinh học giống nhau, từ kiểu cây, màu sắc dọc, thời gian sinh trưởngẦ Tuy nhiên chúng khác nhau về hình dạng củ, dải bò và hình dạng lá.
Trường đại học Nông nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ 59
Trường đại học Nông nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ 60