48. Thẳng ựứng Có một phần Trung bình Xanh nhạt pha sọc tắ mở trên 49.Thẳng ựứng Có một phần Trung bình Xanh nhạt pha sọc tắm ở trên
4.2.2. Kết quả phân tắch ựa hình DNA bằng kỹ thuật PCR-RAPD
để tiến hành phân tắch và ựánh giá mức ựộ ựa hình di truyền của các giống khoai môn- sọ chúng tôi tiến hành phản ứng PCR với các mồi RAPD và SSR sản phẩm PCR ựược ựiện di trên gel agarose 1,5%. Tắnh ựa hình ựược thể hiện ở sự xuất hiện hay không xuất hiện băng DNA khi so sánh giữa các giống với nhaụ 60 mẫu giống ựã ựược chiết tách DNA và sử dụng 5 mồi RAPD và 5 mồi SSR ựể nhân các ựoạn DNA ngẫu nhiên trong bộ gen nôm. Mức ựộ giống và khác nhau của các mẫu giống ựược ựánh giá bởi các ựoạn DNA nhân lên.
4.2.2.1. Mồi OPM12
Kết quả ựiện di sản phẩm PCR-RAPD của 60 mẫu giống với mồi
OPM12 thu ựược 16 vệt băng có kắch thước khác nhau ựược nhân lên. Vệt băng có kắch thước lớn nhất khoảng 1.750 bp, nhỏ nhất khoảng 370 bp (hình 4.4). đa số các giống ựều cho 13-16 vạch. 27 giống có 13 vệt băng, 16 giống có 14 vệt băng, 8 mẫu giống có 15 vạch, 9 mẫu giống có 16 vạch. Về cơ bản ựã có sự khác nhau giữa các nhóm giống. Tuy nhiên một số mẫu giống có số vệt băng và kắch thước giống hệt nhau không thể phân biệt ựược. Trong tổng số 16 vệt băng thì có 14 vệt băng cho ựa hình. Tuy nhiên ựể phân biệt và nghiên cứu một cách hệ thống mối quan hệ giữa các mẫu giống khoai môn Ờ sọ chúng tôi tiếp tục sử dụng các mồi RAPD khác ựể ựiều trạ
Trường đại học Nông nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ 51
Hình 4.4: điện di sản phẩm PCR chỉ thị
1. Marker, 2. Khoai sọ ựồi, 3. Phước, 4. Khoai sọ nương, 5. Khoai sọ tắm, 6. Khoai sọ, 7. Phước ựao, 8. Khoai sọ, 9. Khoai sọ, 10. Khoai sọ trứng dọc tắm, 11. Khoai sọ, 7. Phước ựao, 8. Khoai sọ, 9. Khoai sọ, 10. Khoai sọ trứng dọc tắm, 11. Khoai
sọ trứng dọc tắm , 12. Khoai sọ chân trắng, 13. Phước my, 14. Phứa lanh, 15. Khoai sọ núi, 16. Khoai sọ trắng
4.2.2.2. Mồi OPA12
Kết quả ựiện di sản phẩm PCR-RAPD của 60 mẫu giống với mồi OPA12
thu ựược 13 vệt băng có kắch thước khác nhau ựược nhân lên, trong ựó có vệt băng ựa hình. đa số các giống ựều cho 10-13 vạch. Thống kê cho thấy 60 mẫu giống chia làm 4 nhóm: nhóm 1: Bao gồm các giống có 10 ựoạn DNA ựược nhân lên tương ựương với 10 vệt băng, gồm 15 giống. Nhóm 2 bao gồm các mẫu giống lúa có 11 ựoạn ADN ựược nhân lên, gồm 23 giống và nhóm 3 bao gồm các mẫu giống có 12 ựoạn ADN ựược nhân lên, gồm 12 mẫu giống. Nhóm 4 có 13 ựoạn DNA nhân lên tương ứng với 13 vệt băng, gồm 10 mẫu giống. Thống kê cũng ựã tìm thấy 8 vệt băng ựa hình có nghĩa là 8 vệt băng băng này có có mặt ở giống này nhưng không có mạt ở giống khác. Một nguyên tắc trong khi chọn mồi là chọn ựược mồi càng nhiều ựa hình thì càng có nghĩa trong việc phân loại cũng như nghiên cứu di truyền.
Trường đại học Nông nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ 52
Hình 4.5: điện di sản phẩm PCR chỉ thị A
1. Marker, 2. Khoai sọ ựồi, 3. Phước, 4. Khoai sọ nương, 5. Khoai sọ tắm, 6. Khoai sọ, 7. Phước ựao, 8. Khoai sọ, 9. Khoai sọ, 10. Khoai sọ trứng dọc tắm, 11. Khoai sọ, 7. Phước ựao, 8. Khoai sọ, 9. Khoai sọ, 10. Khoai sọ trứng dọc tắm, 11. Khoai
sọ trứng dọc tắm , 12. Khoai sọ chân trắng, 13. Phước my, 14. Phứa lanh, 15. Khoai sọ núi, 16. Khoai sọ trắng
4.2.2.3. Mồi OPN07
Kết quả ựiện di sản phẩm PCR-RAPD của 60 mẫu giống với mồi
OPN07 thu ựược 18 vệt băng có kắch thước khác nhau ựược nhân lên. Trong 18 vệt băng thì có 11 vệt băng cho ựa hình. đa số các giống ựều cho 16-18 vạch. 26 giống có 16 vệt băng, 14 giống có 17 vệt băng và 20 giống có 18 vệt băng (hình 4.6).
Hình 4.6: điện di sản phẩm PCR chỉ thị N07
1. Marker, 2. Khoai sọ ựồi, 3. Phước, 4. Khoai sọ nương, 5. Khoai sọ tắm, 6. Khoai sọ, 7. Phước ựao, 8. Khoai sọ, 9. Khoai sọ, 10. Khoai sọ trứng dọc tắm, 11. Khoai sọ trứng dọc Phước ựao, 8. Khoai sọ, 9. Khoai sọ, 10. Khoai sọ trứng dọc tắm, 11. Khoai sọ trứng dọc tắm , 12. Khoai sọ chân trắng, 13. Phước my, 14. Phứa lanh, 15. Khoai sọ núi, 16. Khoai
sọ trắng
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16
Trường đại học Nông nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ 53
4.2.2.4. Mồi OPN 14
Kết quả ựiện di sản phẩm PCR-RAPD của 60 mẫu giống với mồi OPN 014 thu ựược 9 vệt băng có kắch thước khác nhau ựược nhân lên. đa số các giống ựều cho 5-9 vạch. Tuy nhiên số vệt băng ựa hình khá cao, chiếm 7/9 vệt băng nhân lên. Trong số 9 vệt băng thì 6 giống có 5 vệt băng, 20 giống có 6 vệt băng, 8 mẫu giống có 7 vạch, 10 mẫu giống có 8 vệt băng và 16 mẫu giống có 9 vệt băng (hình 4.7)
Hình 4.7: điện di sản phẩm PCR chỉ thị N14
1. Marker, 2. Khoai sọ ựồi, 3. Phước, 4. Khoai sọ nương, 5. Khoai sọ tắm, 6. Khoai sọ, 7. Phước ựao, 8. Khoai sọ, 9. Khoai sọ, 10. Khoai sọ trứng dọc tắm, 11. Khoai sọ trứng dọc Phước ựao, 8. Khoai sọ, 9. Khoai sọ, 10. Khoai sọ trứng dọc tắm, 11. Khoai sọ trứng dọc tắm , 12. Khoai sọ chân trắng, 13. Phước my, 14. Phứa lanh, 15. Khoai sọ núi, 16. Khoai
sọ trắng, 17. Phước ựanh
4.2.2.5. Mồi OPO 01
Kết quả ựiện di sản phẩm PCR-RAPD của 60 mẫu giống với mồi OPO 01 thu ựược 11 vệt băng có kắch thước khác nhau ựược nhân lên. đa số các giống ựều cho 8 -11 vạch và 7 vạch ựa hình ựược tìm thấỵ Trong ựó 27 giống có 8 vệt băng, 15 giống có 9 vệt băng, 10 mẫu giống có 10 vạch, 8 mẫu giống có 11 vạch.