Kết quả phân tắch ựa hình DNA bằng kỹ thuật PCR-SSR

Một phần của tài liệu Nghiên cứu đa dạng di truyền cây khoai môn - sọ bằng chỉ thị ADN (Trang 62 - 64)

48. Thẳng ựứng Có một phần Trung bình Xanh nhạt pha sọc tắ mở trên 49.Thẳng ựứng Có một phần Trung bình Xanh nhạt pha sọc tắm ở trên

4.2.3. Kết quả phân tắch ựa hình DNA bằng kỹ thuật PCR-SSR

RAPD là chỉ thị nhân ngẫu nhiên các ựoạn DNA trong genome trên cơ sở phương pháp PCR dùng một ựoạn mồị Các mồi này sẽ bắt cặp một cách ngẫu nhiên vào DNA khuôn ở vị trắ bất kỳ nào mà tại ựó có trình tự bổ sung với nó. Với chỉ thị RAPD phát hiện tắnh ựa dạng ựáng tin (sự mất ựoạn nhiễm sắc, sự

Trường đại học Nông nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ 54 thay ựổi, thêm bớt nucleotit, xen ựoạnẦựều làm thay ựổi kắch thước ựoạn nhân bản). Tuy nhiên phương pháp rất nhạy cảm với yếu tố tham gia phản ứng như: thành phần tham gia phản ứng, ựiều kiện thắ nghiệm, lặp lại nhiều lần, ựặc biệt là nhiệt ựộ gắn mồi cần tuân thủ nghiêm ngặt quy trình, khoảng cách giữa 2 ựiểm bắt cặp mồi cần thắch hợp, không chắc chắn các ựoạn có cùng kắch thước từ 2 mẫu DNA khác nhau thực sự tạo ra từ cùng một vị trắ trên hệ gen hay không. Chắnh vì vậy ựể ựánh giá mối quan hệ di truyền một cách chắnh xác chúng tôi tiếp tục sử dụng chỉ thị SSR ựể nghiên cứu ựa dạng di truyền các mẫu giống khoai môn - sọ. đây là chỉ thị dùng ựể nhân hoặc lai những ựoạn DNA lặp ựi lặp lại trong genome ựể tìm sự ựa hình. Người ta cũng áp dụng chỉ thị này trong phân tắch ựa hình giữa các loại cây trồng với nhau từ ựó tìm ra sự khác biệt giữa chúng. So với chỉ thị RAPD chỉ thị SSR có ựộ chắnh xác cao hơn.

4.2.3.1. Uq 75-100

Kết quả ựiện di sản phẩm PCR-SSR của 60 mẫu giống với mồi Uq75-100

thu ựược 5 vệt băng có kắch thước khác nhau ựược nhân lên. đa số các giống ựều cho 4-5 vạch, 2 vệt băng ựa hình ựược tìm thấỵ Trong số 5 vệt băng thì 32 giống có 5 vệt băng, 15 giống có 4 vệt băng, 13 mẫu giống có 3 vạch.

Hình 4.8: điện di sản phẩm PCR chỉ thị Uq 75-100

1. Marker, 2. Khoai sọ ựồi, 3. Phước, 4. Khoai sọ nương, 5. Khoai sọ tắm, 6. Khoai sọ, 7. Phước ựao, 8. Khoai sọ, 9. Khoai sọ, 10. Khoai sọ trứng dọc tắm, 11. Khoai sọ trứng dọc Phước ựao, 8. Khoai sọ, 9. Khoai sọ, 10. Khoai sọ trứng dọc tắm, 11. Khoai sọ trứng dọc tắm , 12. Khoai sọ chân trắng, 13. Phước my, 14. Phứa lanh, 15. Khoai sọ núi, 16. Khoai

sọ trắng.

Trường đại học Nông nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ 55

4.2.3.2. Uq90-102

Kết quả ựiện di sản phẩm PCR-SSR của 60 mẫu giống với mồi Uq90- 102 thu ựược 6 vệt băng có kắch thước khác nhau ựược nhân lên. đa số các giống ựều cho 4-6 vạch, 4 vệt băng ựa hình ựược tìm thấỵ Trong 6 vệt băng ựược nhân lên có 28 giống có 6 vệt băng, 28 giống có 5 vệt băng, 4 mẫu giống có 4 vạch.

Hình 4.9: điện di sản phẩm PCR chỉ thị Uq90-102

1. Khoai sọ ựồi, 2. Phước, 3. Khoai sọ nương, 4. Khoai sọ tắm, 5. Khoai sọ, 6. Phước ựao, 7. Khoai sọ, 8. Khoai sọ, 9. Khoai sọ trứng dọc tắm, 10. Khoai sọ trứng dọc tắm Phước ựao, 7. Khoai sọ, 8. Khoai sọ, 9. Khoai sọ trứng dọc tắm, 10. Khoai sọ trứng dọc tắm

Một phần của tài liệu Nghiên cứu đa dạng di truyền cây khoai môn - sọ bằng chỉ thị ADN (Trang 62 - 64)