C Thời gian Số chu kỳ
3.3. Kết quả điện di khảo sát mẫu trên gel poly acrylamide
Sản phẩm PCR đƣợc điện di trên gel poly acrylamide nhằm khảo sát sơ bộ các mẫu ở từng locus. Bản gel sau khi tiến hành điện di acrylamide đƣợc đƣa vào hệ thống Pharos FX Plus Molecular Imager để quét ở bƣớc sóng 488nm. Kết quả điện di trên gel poly acrylamide đối với từng locus nhƣ sau:
Locus Penta E
Hình 10. Kết quả điện di sản phẩm PCR locus Penta E một số mẫu khảo sát trên gel poly acrylamide
Giếng 1-10: Các mẫu nhân bội locus Penta E (+): Mẫu đối chứng dƣơng; (-): Mẫu đối chứng âm
1 (+) 2 3 4 5 6 7 8 9 10 (-)
11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 (+) (-)
Kết quả điện di cho các băng ADN rõ nét, đặc hiệu. Các mẫu khảo sát có kiểu gen khác nhau thể hiện sự đa hình của locus. Các mẫu có đủ điều kiện để sử dụng cho chế tạo thang alen.
Locus D18S51
Hình 12. Kết quả điện di sản phẩm PCR locus D18S51 một số mẫu khảo sát trên gel poly acrylamide Giếng 1-13: Các mẫu nhân bội locus D18S51 (+): Mẫu đối chứng dƣơng; (-): Mẫu đối chứng âm
(-) 1 2 3 4 5 6 (+) 7 8 9 10 11 12 13
Hình 13. Kết quả điện di sản phẩm PCR locus D18S51 một số mẫu khảo sát trên gel poly acrylamide Giếng 11-22: Các mẫu nhân bội locus D18S51 (+): Mẫu đối chứng dƣơng; (-): Mẫu đối chứng âm
Tƣơng tự locus Penta E, các mẫu đƣợc nhân bội sử dụng mồi cho locus D18S51 cho kết quả tốt, các băng ADN rõ nét, có thể sử dụng chế tạo thang alen.
Locus D21S11
Hình 14. Kết quả điện di sản phẩm PCR locus D21S11 một số mẫu khảo sát trên gel poly acrylamide
Giếng 1-9: Các mẫu nhân bội locus D21S11 (+): Mẫu đối chứng dƣơng; (-): Mẫu đối chứng âm
1 (+) 3 4 5 6 7 8 9 (-)
Hình 15. Kết quả điện di sản phẩm PCR locus D21S11 một số mẫu khảo sát trên gel poly acrylamide
Kết quả điện di trên gel poly acrylamide các mẫu khảo sát locus D21S11 cho thấy các băng ADN tuy vẫn còn băng phụ mờ bên dƣới băng chính nhƣng kết quả nhân bội vẫn đặc hiệu, có sự đa hình về kiểu gen. Các mẫu có thể sử dụng để chế tạo thang alen.
Locus TH01
Hình 16. Kết quả điện di sản phẩm PCR locus TH01 một số mẫu khảo sát trên gel poly acrylamide
Giếng 1-14: Các mẫu nhân bội locus TH01 (+): Mẫu đối chứng dƣơng; (-): Mẫu đối chứng âm
1 3 4 5 6 7 (+) 8 9 10 11 12 13 14
Hình 17. Kết quả điện di sản phẩm PCR locus TH01 một số mẫu khảo sát trên gel poly acrylamide Giếng 2, 15-28: Các mẫu nhân bội locus TH01 (+): Mẫu đối chứng dƣơng; (-): Mẫu đối chứng âm
Locus TH01 là một trong những locus có tính đa hình cao thể hiện trên kết quả điện di. Dựa vào hình ảnh sau điện di đối với các mẫu khảo sát có thể xác định tạm thời locus TH01 có 7 alen. Chất lƣợng của sản phẩm nhân bội các mẫu khảo sát thể hiện ở các băng ADN rõ nét, đặc hiệu. Các mẫu khảo sát trên có thể sử dụng để chế tạo thang alen locus TH01.
Locus D3S1358
Hình 18. Kết quả điện di sản phẩm PCR locus D3S1358 một số mẫu khảo sát trên gel poly acrylamide Giếng 4-15: Các mẫu nhân bội locus D3S1358 (+): Mẫu đối chứng dƣơng; (-): Mẫu đối chứng âm
(+) 4 5 6 7 8 11 12 13 14 15 (-)
Hình 19. Kết quả điện di sản phẩm PCR locus D3S1358 một số mẫu khảo sát trên gel poly acrylamide Giếng 1, 2, 16-25: Các mẫu nhân bội locus D3S1358
Kết quả điện di kiểm tra sản phẩm nhân bội các mẫu khảo sát cho thấy: Sản phẩm nhân bội đặc hiệu, các băng ADN rõ nét, không có băng phụ. Sự phân bố alen cho thấy sự đa hình của locus D3S1358. Dựa trên kết quả điện di, có thể xác định locus D3S1358 có 7 alen. Các mẫu khảo sát trên đủ yêu cầu để lựa chọn cho chế tạo thang alen.
Với kết quả trên, chúng tôi tiến hành lựa chọn đƣợc các sản phẩm PCR mang alen cần thiết để sử dụng cho chế tạo thang alen từng locus.