Một trong những yếu tố có vai trò quan trọng trung tâm quyết ựịnh thành công của việc trển khai hải quan ựiện tử ựó là công tác ựào tạo nhân lực, cán bộ. Vì vậy, ựể có thể áp ứng ựược công việc trong môi trường hải quan ựã ựược tự ựộng hóa thì ngành hải quan cần phải có chiến lược, kế hoạch trang bị những kiến thức cần thiết cho cán bộ (những người từ trước tới nay vốn chỉ quen với xử lắ công việc theo phương pháp thủ công) trong ngành. Trong ựó trình ựộ và khả năng về công nghệ thông tin của mỗi cán bộ sẽ có ảnh hưởng lớn. Sự thiếu hiểu biết, những nhầm lẫn nhỏ cũng có thể là những rào cản tiến trình này và thậm chắ có thể gây những hậu quả to lớn. Trên thực tế có rất nhiều phương pháp ựể thực hiện việc trang bị kiến thức, kĩ năng phục vụ cho triển khai hải quan ựiện tử cho cán bộ hải quan, nhưng ựào tạo là phương pháp hữu hiệu và quan trọng nhất. Như vậy, công tác ựào tạo trong ngành cho cán bộ hải quan phải ựược tiến hành thường xuyên và liên tục từ lúc tuyển dụng, dưới nhiều hình thức huấn luyện, ựộng viên cũng như bắt buộc. Từ những vấn ựề cơ bản nhất như tin học văn phòng, sử dụng chương trình cho tới các vấn ựề mang tắnh kĩ thuật cao cấp cho ựối tượng trong ngành. Từ cán bộ lãnh ựạo cho tới nhân viên thừa hành ựội ngũ chuyên gia công nhệ thông tinẦ Bên cạnh ựó chắc chắn phải có sự hợp tác chặt chẽ tốt ựẹp với cộng ựồng doanh nghiệp, nên cũng cần phải tăng cường mối quan hệ hải quan - doanh nghiệp và có những chương trình tập huấn, ựào tạo cho cộng ựồng doanh nghiệp ựể họ nhận thức ựược rằng một cơ quan hải quan hiện ựại sẽ ựem lại nhiều lợi ắch chắnh bản thân họ, từ ựó tắch cực tham gia vào việc xây dựng hải quan thành một hải quan hiện ựại.
2.3..3. Hệ thống chắnh sách, pháp luật
Hệ thống chắnh sách pháp luật có ảnh hưởng to lớn tới việc ứng dụng hải quan ựiện tử. Chúng ta cần xây dựng một hệ thống chắnh sách, pháp luật sao cho minh bạch, rõ ràng và phù hợp với thông lệ quốc tế, lực lượng hải quan có trình ựộ chuyên sâu. Chỉ có như vậy thì mới tạo ựược ựiều kiện thuận lợi cho các doanh nghiệp kinh doanh xuất nhập khẩu và các hoạt ựộng có liên quan khác. Hơn nữa hệ thống chắnh sách, pháp luật về hải quan sẽ tạo môi trường ựầu tư thuận lợi cho các nhà ựầu tư, thu hút ựược vốn ựầu tư nước ngoài, phát triển kinh tế ựất nước.
2.3..4. Yếu tố tâm lắ của doanh nghiệp khi làm thủ tục qua hải quan ựiện tử
Mức ựộ tham gia của doanh nghiệp thực hiện hải quan ựiện tử hiện nay vẫn còn khiêm tốn bởi một số nguyên nhân như nhận thức của doanh nghiệp, dư luận xã hội, ựiều kiện của doanh nghiệp và hệ thống.Vì vậy, trong giai ựoạn ựầu triển khai thủ tục hải quan ựiện tử, không ắt doanh nghiệp còn ngần ngại tham gia thủ tục hải quan ựiện tử. Một phần là do doanh nghiệp chưa ý thức ựược nhiều lợi ắch khi tham gia thủ tục hải quan ựiện tử. Một phần là do khi thực hiện thủ tục hải quan ựiện tử sẽ ảnh hưởng ựến quyền lợi của một số cá nhân của doanh nghiệp, nên họ cũng không nhiệt tình với việc tham gia thủ tục hải quan ựiện tử. Tuy nhiên, một lý do cũng rất quan trọng là mặc dù một số doanh nghiệp ựã nhận thức ựược lợi ắch thủ tục hải quan ựiện tử nhưng chưa mặn mà tham gia vì ngại tốn kém vì khi tham gia thủ tục hải quan ựiện tử, doanh nghiệp phải ựảm bảo một số yêu cầu về cơ sở hạ tầng công nghệ thông tin, ựào tạo lại cán bộ am hiểu về thủ tục hải quan v.vẦđối với doanh nghiệp có quy mô và kim ngạch xuất nhập khẩu lớn thì không thành vấn ựề. Nhưng ựối với doanh nghiệp tư nhân, doanh nghiệp vừa và nhỏ và thì ựây cũng không phải là vấn ựề ựơn giản.
Bên cạnh nguyên nhân chủ quan từ nhận thức của doanh nghiệp thì nguyên nhân khách quan là việc thực hiện thủ tục hải quan ựiện tử ựòi hỏi
khối lượng công việc triển khai rất lớn trong khi cơ sở vật chất, kỹ thuật, hệ thống mạng, ựội ngũ cán bộ còn hạn chế. Tiến ựộ xây dựng phần mềm hệ thống ựối với thủ tục hải quan ựiện tử chưa ựáp ứng ựược yêu cầu ảnh hưởng ựến việc triển khai mở rộng ựối với các loại hình xuất nhập khẩu cũng như ựối với các ựối tượng doanh nghiệp,.v..v..