3. Kết quả và thảo luận
3.3.5. Phổ tương quan 2 chiều HMBC, COSY
30
Các tương quan phổ 2 chiều: HMBC, COSY được trình bày ở hình cho thấy tín
hiệu proton H ở 1.2 ppm (t, J = 7.3 Hz, 6H, 2CH2-CH3) tương quan với C1’, proton H ở 3.4 (q, 4H, J = 7.2, 2CH2-CH3) tương quan với C1’, C2’, C7, C ở 2.51 (s, CH3),
proton H-5 phù hợp với C4.
Hình 3.6: Phổ tương quan 2 chiều COSY của hợp chất Cou-Br
31
Hình 3.8. Các tương quan phổ 2 chiều: HMBC và COSY 3.4. Kết quả đánh giá docking phân tử
Bảng 3.2. Kết quả tính tốn quan trọng trong mơ hình docking của ligand, Cou-Br
với dịng tế bào ung thư vú MCF-7 (6VNN:PDB), ung thư gan Hep-G2
(2G33:PDB), ung thư vân cơ RD (1P9M:PDB), ung thư phổi LUNG (4ASD:PDB),
enzyme α-glucosidase (4J5T:PDB), nấm Candida albicans (6AKZ:PDB), khuẩn
Escherichia coli (6VYL:PDB), kháng viêm (4WCU:PDB).
Dịng tế bào, mã số PDB ΔG (Kcal/mol) Ki (µm) Số liên kết hydro Đặc tính và độ dài liên kết hydro Ung thư vú, MCF-7 6VNN -7.32 4.32 0 -
Ung thư gan,
Hep-G2 2G33 -7.17 5.58 0 -
Ung thư vân
cơ, RD 1P9M -5.8 56.14 0 -
Ung thư phổi,
LUNG 4ASD -8.1 1.16 0 - Khuẩn Escherichia coli 6VYL -6.43 19.52 0 - Enzyme α- glucosidase 4J5T -7.11 6.17 2 A: VAL446: N-: Cou- Br:O (2.92 Å) A: VAL446: N-: Cou- Br:O (2.96 Å) Nấm Candida albicans 6AKZ -7.95 1.48 1 A: SER431: OG-A: GLN171: O (2.69Å)
Kháng viêm 4WCU -7.53 3 1 C: ASN321: N-: Cou-
Br:O (3.13 Å) 3.4.1. Tế bào ung thư vú, MCF7:6VNN:PDB
32
Hình 3.9. Ligand cấu dạng bền nhất, Cou-Br tương tác với protein đích của dịng tế
bào ung thư vú, 6VNN:PDB.
Hình 3.10. Các tương tác thuốc quan trọng giữa ligand cấu dạng bền nhất, Cou-Br
và protein đích của tế bào ung thư vú, 6VNN:PDB được trình bày trên sơ đồ 2D. Cấu dạng bền của ligand Cou-Br sau khi tính tốn được chọn lựa là cấu dạng lần 23/200 lần chạy, cấu dạng này phân tích tương tác giữa ligand và receptor 6VNN:PDB. Trong hình 3.9 là cấu dạng bền của Cou-Br được nhúng vào trong
receptor 6VNN cho thấy nĩ đã được bao phủ bởi các chuỗi protein đích. Những tương tác đĩ được đánh giá là rất mạnh vì các giá trị năng lượng tự do của liên kết,
33
đã được tính tốn -7.32 Kcal /mol và 4.32 µM. Năng lượng Gibbs càng nhỏ thì hằng số ức chế Ki càng nhỏ, sự liên kết giữa ligand và receptor càng bền.
Hình 3.9 là ligand cấu dạng bền nhất, Cou-Br tương tác với protein đích của
dịng tế bào ung thư vú, MVCF-7:PDB. Cịn trong Hình 3.10, các tương tác đáng kể
đã được hình thành từ các vị trí hoạt động đến phối tử bền nhất như tương tác
halogen từ ARG 394, LEU 391 tương tác với bromo của vịng phenyl, MET 388,
LEU 387 và LEU 391 tương tác với nhĩm methyl, các tương tác alkyl từ PHE 404, LEU 387 liên kết với nhĩm phenyl vịng thơm. Tĩm lại, phối tử Cou-Br đối với tế
bào ung thư vú, MCF-7 là thuốc phân phối tiềm năng vì nĩ xác định tốt các nhĩm chức năng (thơng qua liên kết hydrophilic, liên kết halogen), các tương tác Alkyl,
Pi-alkyl và các tương tác Van Der Waals khác liên kết yếu với thành tế bào.