3. Kết quả và thảo luận
3.4.4. Tế bào ung thư phổi, 4ASD:PDB
Hình 3.15. Ligand cấu dạng bền, Cou-Br tương tác với các tâm hoạt tính trên
receptor, protein đích, cấu trúc tinh thể của dịng tế bào ung thư phổi, 4ASD:PDB.
Hình 3.16. Các tương tác giữa các amino acid của protein của dịng tế bào ung thư
36
Hình 3.17. Các tương tác quan trọng của ligand cấu dạng bền nhất, Cou-Br và
protein của dịng tế bào ung thư phổi LUNG, 4ASD:PDB được trình bày trên sơ đồ 2D.
Cấu dạng bền của ligand Cou-Br sau khi tính tốn được chọn lựa là cấu dạng lần 69/200 lần chạy. Trong hình 3.15 là cấu dạng bền của Cou-Br được nhúng vào
trong receptor LUNG, 4ASD cho thấy nĩ đã được bao phủ bởi cac chuỗi protein
đích. Liên kết này cĩ sự thay đổi năng lượng tự do Gibbs, G=-8.1 kcal/mol và hằng số ức chế (in silico) Ki = 1.16 μM.
Hình 3.16 cho thấy các amino acid hoạt động của protein của dịng tế bào ung thư phổi, 4ASD: PDB hình thành xung quanh ligand cấu dạng bền Cou-Br. Hình 3.17 là các tương tác trong liên kết là tương tác Carbon Hydrogen Bond, Pi-alkyl,
Pi-Pi T-shapped, Pi-Sigma và van der Waals. Cho thấy các tương tác đáng kể đã được hình thành từ các vị trí hoạt động đến phối tử bền nhất như tương tác Pi- Sigma chuỗi A của LEU 1035, tương tác Pi-Pi T-shapped chuỗi A của PHE 1047, tương tác Pi-Alkyl chuỗi A của VAL 916, VAL 899, VAL 848, ALA 866, LEU
840. Tiếp đến nhận diện được nhĩm Alkyl qua tương tác Carbon Hydrogen Bond của ASP 1046 với CH2-CH3-N. Tĩm lại, phối tử Cou-Br đối với tế bào ung thư
phổi, 4ASD:PDB là thuốc phân phối tiềm năng vì nĩ xác định tốt các nhĩm chức
năng (thơng qua liên kết hydrophilic, liên kết halogen) và các tương tác Van Der
Waals khác liên kết yếu với thành tế bào.